result

Gene information

Detail information of AfisC6G05766

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC6G05766	chr6	1011590354	1011600926	+

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC6G05766
ATGGAGAAGCGGGAATATCCGAGTCGAGCGGAGGATTATGAGCTATATGAGATGATCGGAGATGGAGGAAGTGCAGTTGTGCATCGAGCTAGATGTATTCCTTTTGATGAGATCGTGGCTATCAAGATTCTTGATATTGAGAAGAATAGCGATTTGGTAAGCTTGATTATTGCTAAGTTGGTGAAAATTGTTTTATTCCTTCTTCTTCCTATGTTTTTCATTGAATTCAGTTTGCTTGGGTTTTTGGTAATTAATATAGTTTGATAATTTGATTAGTTGTTGCATGGTTATCTTTTTATTTATAATTACTGGCTAATAAGTTTTATGTTCCGATAAAATAATTTCAAATGAGAGTAACATAGACAGGTAACCGATGTAAGCAATTTAGAGACTGCTTCCAAAGTGAAAGCCGAGTATACTGGAAGTCTGGAATAATCGTCGTGTAATTTTTTTTATAGTACTGCGTATTATCCTTAGGTAGACTAAGGTGGAACCCAATGCACGAGGCTCTCGCAAGATAGCAGGTTCTGCGGAGTCAATAATGTACGCAGTTTTTCCTTCGCATTCCGAAGACCCTGTTTTTGGACTCGAAACTGAACGCTCAGATCACCATGCATGTGACCTAACCGTTGCGCCAACGCTTCACCTCATTTGCTAGACTAGGTTAAAAAAAATATATGAAACAAAATAAGAACTAGTACCATGTCAATTTTGTATATATGTACGTGCAATGGTTTCGTTATTATAATTCTAAACTTATTTGTATGGAAGAAACTAAACAAAAATGATTATTAACATGCCCTAATGTAATGTATGATGCTTATTTATTTTTGATGTTTCGCACACACACTATTTTCATAAAACCAAGAGACCATGATATTCAAAGTGTGTTTTTTCAAGTTCTGTGAAAGTTCAGGTTTGAAGTTCTGGTATACATGGTACTTGCATATTTTTGCAGTAGTTACCAAATTGCTATTGAAATTGTGTACATGCCCACGGTGCACATGAAGGGTGACTTAAATTTTTATGTCTCCGTTAATTCTCATACAAAAATCCATTCATAATACTATAAGCTGGCATTTAATTTATTTCTTCTATCAACTTCAGTTCGATTTTGATAAAAAAATAAAGTTTGTTCTTACAAACTATAATGTGCTCCCATATGATTAGGAATAGCGTATTTGCATATTTAAATATAGTTTCAAGTTCTAATAAAAAGTCATACGTCTCTAATAAGTAGGTTTTTGATTTGTGTACTAACTACAAGCATGAAAGAATAACTTGCTTGATCCTGCCATGGTTATTGTGAGGGAAAATTTAATCCTGTAGATCATACCAGTTAATATTTGTTACACGATACAGAAAATTACTAATAATTTTTTTTCTTGTCGTGCAGACTAACATATGTCATGAGGCTCAGACCATGAAAAAGATTAACCATAGAAATGTACTCAAGTCTCATTGTTCCTTTGTGAATGATCATGACCTGTGGGTTGTCATGCCATATATGGCTGGTGGATCTTGTCTTCATATTATGAAGTCCGCATATCCAAATGGTTTTGAGGAAGTCATCATTGCAACTATTTTGCGTGAAGTATTGAAAGGCTTAGAATACCTTCATGAGAATGGGAATATTCATCGGGATATAAAGGTGATATACCAATGATATAATATATCTTTATTCTGTTATCTTGTTTTGATCCAGTCTAAAATTCATAAATGAGTATATGGGCAAACTTACATATTTCAGTGTGTATTAACTGAACGTATATGTGCAATATTCCATATTTTCCAGGGAAAATGTTAGGATTTACTGGGAAACCTATACATACTCTCAATTCCTCTTACGGTTTCCGATAGTAATCTTATTTAGGTACCGAGGTACATTTATTTGTTGGCAAACAATACCCTCTTATCCTTAACCTATATTTCTGATTGTAGCTTCCACCGTGTTTTTAGAGATCAACTAACTGGTTGAAATTACACTTCTCTTAAGGCTTAGTATTATGAGAGTTGAGATTCCTGCAGTTCAAATTTCACTATCATGACAGTTAAAGGTTACTGAACCTGTAAACTGCTAACGCATACGCTTTGGAAATAATTATTTCTTAGCATGAGGTTGTACCTCTAACTTTCAATGGCCTGCAGTCACAGCTAAAGTGAATAATGAATTCTACAGTGTAAAATTGCTATAACATAACAAGATTAGCAGCAAGAGAGATATGAAAGACATTTGATTTGCTAGTTAGACTTGCATCTAGGAGGGGAGACAATATATAGAATATATTTCATTTCATTTGCTTTTTCTGTTTCAAGTTTTCAACCTCTAGCACAAACAATACTTGAGGATGAGATTCCTAACTTGCCAACAAGCTAGGAATAGTTATTGATGCCAACATGCACAACACTTTCTTTAGTTTAGTTGCATGAATATCAGGTTTGTTCAACTATGATAAAAGTTCTATATTTTGGATTGGTATATAGCTTATGTTGAAATAGTTTACTGTACTCTTTTTTCTTTTATGAACGGTATAATTCTGAATTCTTCAGGGACATGTATATTTTAGATCATTTTTTAAATAAGTTTGTCCAGAATATTCATATATTCATCAAATATATACAACGTAGAGGAGATCGACTCCTACCAGCGCGACATTAACATTTACATATATCTAATGCTAGGAAATCAGAGCTATGTTTTACAGGAATATTACATAAATAATTAAATAATATACATTTTCACTATCACAATGTCAAGATGATTTCACAAGAAAGTTTCAGTTCTTTTGTTAATGCATGTGATATCTCACTTTTTAGTTGTTCATTCACAAGAACAGAAAGAATAACTGAACCTTAAACAATTAAAGATGTCCTAGGGAATTAGAGCTACCTCTCACATGCATATTACATGTTTGTTTACAAAAGCCAATCAGTGTTCTTTTTTCTTCTTCTTAGTTTAGGTTGTAGATTCTAAATGTGTTTGTGAATTAGAGACTAGAGGGAATAAATACGAGTGCCCTACGTTTTTCAAGTAACATCTTATTCTCCTAAAAATATTCATAGTTTTGTTCTTAGCACAATTTGTTTACTTACCTAGCTTGATTTAAATTAGCTTAGTACCACTACCACTTGCTTTGTATGTACCCTTTAAACGAAGGAAAATATCAAGTTTTAGCACATCAATTAGGTACACACATGGCAGGAGACAGATTGTTGACAGTTGACACACATCATTGTGAAAGAGATAGCTCAGCATTTTTCTGTGAATCATAGGTAGAAATCATAGTTCAAACATCCAGATCTCAAATTCTGTCTTTAAGCTAGTATCAACTTTTAAGGAGTGGTGTCAAATGCACCGCATTTTATACTTCATATTGCCCAGCCTTTATTTCACCCCGCTTATTCTACTGCCTACTTCGTATTATTCTTTTTATTTCTACTTTTTTTTTAAAATTGAGAATAAAAACATGTTACTAAGAAAAACATGTTACTCAATTGAACTGTACTTGGACATTATGTGGCCGACCAAATGTGTTGACTTTCAATATTATATTGCCGTATTAGTTTTATTTTTTCAATATGCAATATATTACTGGCCGGTTATATATTACACTGATTGGTGGTAGTATATTGCTGACAGATTGAGTAAAATGAAGCAATGAACCACCTTCTTTTTCCTTTTTTCAACAGGTAAAATAGAGTCTATATGGTTGTGTATTTAGCACAACTCCTTTTAAGGCAAAGAATTGTTATATGACATAATATAGTGTTGGATTTGATTTTCTTAATCTGCCAAAAATCAAGGAATTTAATGAACATGGATGTCTTCATGAGGGATTCTTGTTAAAATTTGTATGTCAAGAGAAATTAATCACTATTTGGTTAACATACTAATAAGTAGTACTGTTATAGTTCAGTCTCCGAATTTCATATGCTTTTAGCTAACCCTGTTTTTTTACTAGGCTGGTAATATCTTAATTGATTCACATGGGGGTGTAAAACTTGGAGATTTTGGTGTTTCCGCTTCACTTTTTGATTCAGGAGATAGGCAGCGCAGAAGAAATACATTTGTGGGAACACCATGCTGGTGCATTTTTTTTTCCAAATATAACATTGTATTAGTGGTTTAGTGTTTACACGGTATGTCTTGCTTTAGATGTTTTGCAAAAGTGAAATCCTGTTTTTTCTGTTATCTTCTTTTTCCAGGATGGCACCAGAGGTTATGGAGCAAGTCCATGGATATGATTTCAAGTATTTTCTTTTAACATTTTTCTCGTTGAACCCTAGCAAAGGCATCAAGCTTACATGATTTTGCTGGCTATTTTGTGTAGGGCGGATATCTGGTCATTTGGAATAACAGCTCTAGAGCTTGCTCACGGGCATGCTCCTTTTTCTTCACAGCCTCCTGTGAAGGTACTGTGTTACTAAATTTGTTGGACTCCATTGCAGTGTTTACTGCTTCTGCCTAATAATTAATCAATTGTGTGCACTCTGCCCTATTCAGTTTTGGTTATGTGGTAGAATAATTACCCAATTTGCTCCCTTTGCAGGTATTGCTGATGACTTTGCAAAATGCTCCTCCATCACTTGAGTCTAGTAAGGACAAGAAGTTTAGTAAGGTTGATTTTCTAAACTCAGCGTAGATTAATAATTTTTTATTCCAAAAAATTCTTATTTCTCTCAATGCCTTTATAGTCCTTTAAACATATGATTGCTACGTGCTTGGTGAAAGATCCATCAAAAAGGCCTACTGCACATAAGCTATTAAAGCAACCTTTCTTCAAGCAAGCAAAATCTGATGAGTACATCGAGAAGAAAATTTTGGTTGGTTTACCCGCTTTGGAGTACCGGTTTCATATTCTGAAGGTAATTTATTTGCGAGAGTAACTTTTTATGATAATAATTAAAGGATCAAACACTTAATATGTATTCAATTTATGTTTATGTACAAATGTAGACAACTGAAGCAGAGTTGCTTGCGGACAAGAAAATGCTTGATG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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020269811.1	6.4e-211	serine/threonine-protein kinase BLUS1-like
Swissprot	Q551H4.1	3.7e-94	STE20-like kinase fray2
trEMBL	A0A5P1FN50	1.7e-197	Protein kinase domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT1G79640.1	55.61	3e-167	585		Protein kinase superfamily protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC6G05766	AT1G79640.2	561	216	9	1	544	1	545	55.61	3e-167	585
AfisC6G05766	AT1G79640.1	561	216	9	1	544	4	548	55.61	3e-167	585
AfisC6G05766	AT5G14720.1	349	109	3	3	349	6	351	67.34	1e-144	510

Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g274984.t1
Allium fistulosum	AfisC6G05766
Allium sativum	Asa8G01578.1
Arabidopsis thaliana
Oryza sativa	LOC_Os02g08240.1

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00069.22	Pkinase	Domain	13	273	203.8	2.7e-60

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0000139	C	Golgi membrane
GO:0000287	F	magnesium ion binding
GO:0019898	C	extrinsic component of membrane
GO:0001933	P	negative regulation of protein phosphorylation
GO:0005829	C	cytosol
GO:0004702	F	receptor signaling protein serine/threonine kinase activity
GO:0005524	F	ATP binding
GO:0005730	C	nucleolus
GO:0005798	C	Golgi-associated vesicle
GO:0005813	C	centrosome
GO:0008217	P	regulation of blood pressure
GO:0016323	C	basolateral plasma membrane
GO:0016324	C	apical plasma membrane
GO:0042981	P	regulation of apoptotic process
GO:0018105	P	peptidyl-serine phosphorylation
GO:0018107	P	peptidyl-threonine phosphorylation
GO:0019901	F	protein kinase binding
GO:0030033	P	microvillus assembly
GO:0030336	P	negative regulation of cell migration
GO:0032414	P	positive regulation of ion transmembrane transporter activity
GO:0032874	P	positive regulation of stress-activated MAPK cascade
GO:0036438	P	maintenance of lens transparency
GO:0036481	P	intrinsic apoptotic signaling pathway in response to hydrogen peroxide
GO:0042803	F	protein homodimerization activity
GO:0046777	P	protein autophosphorylation
GO:0048471	C	perinuclear region of cytoplasm
GO:0048680	P	positive regulation of axon regeneration
GO:0050727	P	regulation of inflammatory response
GO:0050891	P	multicellular organismal water homeostasis
GO:0051683	P	establishment of Golgi localization
GO:0060562	P	epithelial tube morphogenesis
GO:0061404	P	positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to increased salt
GO:0070062	C	extracellular exosome
GO:0071476	P	cellular hypotonic response
GO:0090168	P	Golgi reassembly
GO:0090188	P	negative regulation of pancreatic juice secretion
GO:0097194	P	execution phase of apoptosis
GO:1901017	P	negative regulation of potassium ion transmembrane transporter activity
GO:1902456	P	regulation of stomatal opening
GO:1903205	P	regulation of hydrogen peroxide-induced cell death
GO:2000021	P	regulation of ion homeostasis
GO:2000687	P	negative regulation of rubidium ion transmembrane transporter activity

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K08835	OXSR1, STK39; serine/threonine-protein kinase OSR1/STK39	EC:2.7.11.1	-	-
K11912	ppkA; serine/threonine-protein kinase PpkA	EC:2.7.11.1	Bacterial secretion system	ko03070
K11912	ppkA; serine/threonine-protein kinase PpkA	EC:2.7.11.1	Biofilm formation - Pseudomonas aeruginosa	ko02025

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network