result

Gene information

Detail information of AfisC7G00097

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC7G00097	chr7	15725039	15732197	+

Sequences

CDS

>AfisC7G00097
ATGAGCTGCTGTGAGGAGTATAAGAGATCGAGCAACGGTAGAGTGGTTGATGAAAACTTGCAATACTCGAGGAGGTCATGTAGTAACGGGAAGAGTGAATCAAGTCAAAAATGTAAAAGTGAAGGGGGTCAAAGTAATGTTTGTGGGGTTGACGAGAAAGTTTTAATTAATCCGAAGTTACTTTTTATTGGTGCGAAAATTGGAGAAGGGGCTCATGGAAAAGTTTACGAGGGGAAGTATGGTGAGGAAATCGTAGCAATCAAAGTTCTTAATAAAGGTGACACTCCTGAAGAAATATCAACACTCAAAAGTCGTTTTATTCGGGAAGTTAATATGCTATGTCGAGTGAAACATGAAAACCTTGTTCAGTTCATTGGTGCGTGCATGGACCCTTTCATGGTGATTGCTACCGAGCTATTACCTGGAATGTCATTGAAAAACTATTTGGCCAGTATTCGTCCTAAACAACTTGATCTGAGAACAGCAACCAGCTTTGCACTTGATATTGCACGTGCAATGGATTGCCTACATGTTAATGGCATTATCCATCGAGATTTAAAACCCGATAATCTGTTACTTACGGCCAATCAAAGGAATGTTAAACTTATTGATTTTGGACTTGCAAGAGAAGAAACTGTAACTGAGATGATGACTGCAGAAACTGGGACATATAGATGGATGGCTCCTGAGTTATACAGCACTGTAACATTGAGACGAGGTGAAAAGAAGCATTACACAAACAAGGTTGATGTATATAGCTTTGGGATTGTCTTTTGGGAGCTTTTAACCAATCGTATGCCATTTGAAGGCATGTCCAACTTGCAAGCTGCGTATGCCGCTGCCTTTAAGCAAGTTCGCCCTCCTCTACCCGACGATGCACCACCCGAGCTTGTATTTATAGTACAATCATGTTGGGTCGAGGAGCCGAATTCAAGGCCAAGTTTCAGTCTAATTGTCCGAATGCTCAACGAATTTCTGTTTACCCTTCCACCTCCATCTCCTCCACCAGAGTCTCACGCTATAAAGACATCTCCCATTTTGACAAACAGTAACGGGTCTAGCAGTAACGGGTCGGGTTCAGGAACCCCTACTTCATCATCCTCTTCTCCACGTAGTAAAGGAAACAAGCTTTCTTTTCTTAAACAGCTGTTTGCAGCAAAGAAGGCGGTGAATGGCAAAACGTCTTGA

Protein

Gene

>AfisC7G00097
AGTTCGTTTTTCACTCAAAGGGGAATCAGTGCAATAAGCTAGGGTTAGGGTTCCAAAGCGTCCTCTTTTGGTTATTTCTTTATTTGGGGTCGCGCCTATCTGCAGATAAGCTTGTAAATTTTGTGAAATGTTATGAATTTGTAAATTTTGTGAAGAAATTTGCGACTTTGTGCGTTTGGGTTGTGAAAATGAGCTGCTGTGAGGAGTATAAGAGATCGAGCAACGGTAGAGTGGTTGATGAAAACTTGCAATACTCGAGGAGGTCATGTAGTAACGGGAAGAGTGAATCAAGTCAAAAATGTAAAAGTGAAGGGGGTCAAAGTAATGTTTGTGGGGTTGACGAGAAAGTTTTAATTAATCCGAAGTTACTTTTTATTGGTGCGAAAATTGGAGAAGGGGCTCATGGAAAAGTTTACGAGGGGAAGTAAGTTTATTGTTCTGTTTCAGTTTTTTTATGTCTAATTGATTGTTTATGATTGAGCTTTATGTTGGAATAAATCAATAAAACAGTTTGTAAAAGATGCTACTTTGCTTATGCCATCCATAATTATTATTAATATTAACAAAATATTCGATTTGTGGTAAATATTGTGTTTTTGGGATATGTTGTTGCCGTAGCTTTATGCAAGCATGTATATTTACATGTTAGATGCAAGTTTTTCTCTGATCATATCAACAACTATCAGCTACGAACAAACTGATATATGAATGATGTTCTACATGCTATTGATTTATCTCAACATGGAAGGTTGGAGAATTTTTTTAATTTTAAATGACCACTTTGGTTATAAATTGCTTCAAGCTTTTTTTTGTTAAGTTGCCTATACTTTGTAGAAGATTGTGAATCAGTTGCAGCATTCCAGCAATAATGTTTTGTGTATGCTGTTCTGAAGAAAACACTGGTTAGTTAAAGTATTAGTACCATAGCTAGTTGTTAGATGTATCCAGTCAGAGCATTGCCTTAGGGCAGTATTTAGCTCAATGCATACCCGGTCACGTTTAATTTTGTTATTTAAACGAGTTCTTTGGTTTTCTAAACCCAAATAAGTCTACTAAGGTTAGTTTGAGATAGTTTTTAAATGAATATTAGGCTTAGGTCCCTAATAAGTTTCAAAATACACAAAAACCCCAATAAAAAAAGTATGTAAATTAGGTCCCTAGAATTAAGTTACTAAGTAATTGCATATAGTTATGCAATTATTCACTGAATAATTGCAGACATTTATGCAATTATATCCAAAATTTGCATAAATTTATGCAATTTTTTCGGTGAATAATTGTGGAAATTTCCGCAAATTTTTTGGTGAATAATTGCGGAATTTTCCGCATTTTTTGGTAAATAATTGCGGAAATTTCCGCGATTTTTTGAAAAAATTGCAGAAATTTCCGCAATTTTTCAATGAACAAATGTGGAAATGTCTGCAATTTTTTGATATAATTGCATAAATGTCTGCAATTATTCACTGAATAATTGCATAAGTGTATGCCATTATTCGGTAACTTAATTCTAGGGACCTAATTTATAAACTTTTTTTACTGAGGTTTTTGTGTATTTTGAAACTTATTAGAGACCTGTGCCAAACTGTCCCTAGTTTTAATTTGTATGGTAGTTCGATTGGTTAGTGCTGGTCTATAGGAAGTTAATCTTAATATCAACTCTAGGCCAATTATGTTTTCCATTTTTTATTTGAAGTCATTGCAATATGTTACTGATCACTTATCACAAGCATAGGCCCGTTTTTGTGTTACAATTTCTTTGCTTTTATTTTTTATTGGAGAAGTACATGTTTACCTGCCATAATTTCAAATTCTAGCTTATATGGGGTAGATATTTGTTAAATTTTGTCAAGCAAGGTTTTTTCATTTTGTTAAGTTCAAACTTCAAAACGAAACAGGATATAAATTGTAAATCGTATATTCAAAAAATCCATATTTGAAGGTTTGTACACACAGAGGACTTGATTTGATGTTAGGGTTTCTACATATAAATTAAAACTCAAAGTTCTCTCCTGTTCCATCCTTAATATTTTTTGGAAAACATTATAATTGAAAAATGTTGGATTATGGATTGAATGATTTTTCTTAATTGTGGTTTTAACTGAGTTTGAATTGAAATGTTAATCGAATCGTAAGGAGTGAATCGATCTGAAACGGGATTCAAATCGTATATGTGAAAATATGAAAGGTTGTGAAAATAAATCTTTTAAATGATAACTTGGGCTATAAATTGCTTCAAGCCCTATTTTTGTTAACTTTGCTATACTCTAATGAGTCAGTTGCAGAACTCCAGTAATATTGTTTTGTGTGTGCTGTTCGGAGGAAAAAATTGGGAAGTTAAAGCATTAACATCATAGCTAGTTGTTACATGTATCCAGTGGAGCATTGCCTTTGGATAGTATTGAGGAGAACCCGGATGACCAGTAAACTCCTGAGAGGAATGAAGTTAGGCATGTCCGCTTCAACTCATGACACCTATAACTCCCGGGTTCTATTTTGTAATTTAACCGAGTACTTTGGTTTTCTGAACCCAAATGAATTAATTAATGCCGAGGCTTATTCGAGATAATTTAGTATGTTACGAAATTCTATTGGTAACTGCTGGTCTATAGGAAGTTAATCCTAACGCCAACTCTTGACAAGTTATGTTTTCCATTAATTTGTAGAGTCATTGTAATATGTTACTAATCATTCATCACAAGCATTGGCCCGTTTTTATGTTATAATTTCTTCTCTTTTTTTCTTTAAGAAATACAAGTTTACCATCCATACATTTTAATTTCTAGTCTCCAGTGATGAAATATTTATTAAATTCTCTCGAGCTGCCAGGTCATAATGGACTGCTTATAGTGTCCACTTTGCCGTTTTCATTTTTGTATCAGTTTTGAAAAAAAGTGGTTTGAACTCTAAAAATGTTATACTTTGATGATCACGGTCTATGTTTATAAGTTTTTCAATATGACAAACCTATGTGGAGACCTTGGCATATTGCCAAGCAAAAACCATTGTATTCCTACTTGATATGGTTCCATGCCCTGTATCCTGGAACACATTTTTTTTTtGGAACATCCACGATCCATTGGCCAAAAATGATTCCTCCCATACCTTGTTCTGAAAGATGCATGAACGCTTGCTGCTCATTCCTAGTTTACAATATATCCCTTGTATGTTTCATCGTAAAGCTTTTGAAATGTAAACAGTTTATTATTGGACACCATATCCATTTCTTATATCATTGATTTCTTTTTTTTTAACAGCTGATACAATGCCTAATTTTTTCGTATTGAGTTGTTTTGCTTATACCCATTATTGTAAAACTCGTATTCAACTAGGTATGGTGAGGAAATCGTAGCAATCAAAGTTCTTAATAAAGGTGACACTCCTGAAGAAATATCAACACTCAAAAGTCGTTTTATTCGGGAAGTTAATATGCTATGTCGAGTGAAACATGAAAACCTTGTTCAGGTAAATTTCCTACCATCTTCTAATGTTGTATGCACATTTTAATTTGGTGTGTCTTGGTATCGCTAAATGAAGATTTTGCACTTGTTAAAAGAACTTAAAAAGAAACCTATTATTTACACTACTCTATGCCGATTCGCATATTAGTACTTTTACATGCCCATCTTCTTGTAATTCTTAAAAAAATGAGACATGCATTACTATAAGTTAAACAGATAACGTTCATACTTCATGCTTAAATTCTTGAGTGTTATGTCCGTCACATTTTGCATTTAGTCAATTGTTAAATTGCTGGTCAACTTTATCACTTCTGCAGTTCATTGGTGCGTGCATGGACCCTTTCATGGTGATTGCTACCGAGCTATTACCTGGAATGTCATTGAAAAACTATTTGGCCAGTATTCGTCCTAAACAACTTGATCTGAGAACAGCAACCAGCTTTGCACTTGATATTGCACGTGCAATGGATTGCCTACATGTTAATGGCATTATCCATCGAGATTTAAAACCCGGTATATATATATGTCGATGCAATTTCTGATTATAGTATATTGTGATGTTTTCGGAATAGGGATTGTATAAATATCTGATTTGTCCTCCAAAATGCAGCTATGCATTCTAGCAGAACTTTTAGGACATACCTTTCTAGACCACCCTGATTCGTAGGCTCCTGGAAGCATTTCAGTTTGGCTTATTTTTGTAAACACGTAACTGATGCAATCTGAAAAGTGGAATATATAATTTAATTGCTATATTTTTCTCCTAATTAAGATTTCAGAAGTTTTTGGCGCCTAATTGCAACTGAATCTTATTCCGCAGACCTGATTATCAGTTGTTTATCTGGCCATAATGTAAAATTTGTGAACTTAAAGAAACTGTTTGATTCATACTGTGTAGCTGACTGAGTTATGCAATAACCAACTTGAATGCACCACTAAGTAAAGCTGAATCTGCAGATAATCTGTTACTTACGGCCAATCAAAGGAATGTTAAACTTATTGATTTTGGACTTGCAAGAGAAGAAACTGTAACTGAGATGATGACTGCAGAAACTGGGACATATAGATGGATGGCTCCTGAGGTACTGTAAACCAAACCTTTTTAGTTTACTTGTACAGGTACTTTATTTTTCGTGTGTACTAGCGGATTATATTTTCTAGTTTTTCTGTTAACAATATGAAACATCAATCTCTGTTGTGTTACTGGACAAGCTTTGCGTGTTTTTTCTTTATTATTTTTTGTCTCTACCTTTTTCTCTGTGGGTTTTTAAAAAGGGGCATATGAGTTGAGTTACTAATTTGTTTTCAAATGCTATAAGCTATAATAAAATACGGTTATTTTTATGTTGCATTGATTGTTTATGCTGTATTATGCTTCATATACTGTGAGTACCGCCCCCGTCTTCTTTTCCAACTTCAAAGATCAAATTACTAGGCACTAAAACATGAACTGTTAATCTTAAAATGATGAATATATCGCTACTGGTGTTATTATTTGTTATGATTGTTAATGATGTTATTCATGTGCTGTCTCCATATTATTTCCAACTTTTAAGATATATGTTGTAACTGGTAAAACGTGGACTCGATGGGCTCTTCTGTTATTTTCGTAATAACTTAAAAATGATAGATGTATTGATGCCATGTCACCATGTTTAATGACATTTCTTTTATCCATGGATACAATTTAAGGCCCAACTTAACAGTTGCACAGACCCAAGTACACATTCATCAAAACAGTAAATAAATTGCCATCAAAGATAAATGTTTTACAACTGCACAACTGTCTGGTTCTTCACTAATACTGTGATAACATGTTTTATATTTGCCGGCGTTCAATGTCTTGGGGAAATACTTAATAGTATCCCTTTTTTTCATATAACAGTTATACAGCACTGTAACATTGAGACGAGGTGAAAAGAAGCATTACACAAACAAGGTTGATGTATATAGCTTTGGGATTGTCTTTTGGGAGCTTTTAACCAATCGTATGCCATTTGAAGGCATGTCCAACTTGCAAGCTGCGTATGCCGCTGCCTTTAAGGTGAATCCTTATGCTGTAAAATCGACACCTCAAATATTAAAAATAACAATGAGAACAATATAGTTATAGATCACAGTACAATTGTATGTTTTGACTATTGGCAAAATTTCACAAGATAGTTAACATGCTTCCAGACATGTACAGTGTCTACCTATATTGATAGAGATATCTTGAACTGTGTGTAGTTTTGATCAAATGTTGATAATATTATGAGAACATCTATGTGATATCCTATCTATGTTAATTAGTTCCAAACCTGTTTGATTATATATAGGGGTGCTCATTTGGTTTGTTCGGTTGGTTATCCGATTTAACCAAACTAAAATAGATTCATATTTTATGATTGGAATATTCATTATAATTTAAAATAAAACAAAATATATGATAAAGCATTCTCATTAGTATTAATATATGCTTTTTAATAGTAATTCTGACACATATATGATAAACAAAATCTATTTAGACTACTGAAATAGTCTAAAAAAATCATTATAACATTAGTAATTTTGAAAATATAACAAAAGTTCGGTCAATTTGGTTAAATCGATAACCAAATATAAAAATTACGGGCCAATTAGAAACCAATCTAGTTTCAAAACCAAACCAAATCAACCGAAATAAACTGGTTTGGTTGGTTTATTTGGTTTAACCAAAGATTGCTCACCCCCAATTATGTATAATTATATTATGTTTGTCTTGTAACCAATCTTGTTCTGCTGAGCTATAAATAATTCTCCACCTTGTCCGCTATATACTTGTACACCTTGGTATTCATCACAACCTTGTCAATGCAACATCAATACATACAAATTGTGAACATGCTTTTACCAATGCCATTACTTTGAGGTGGGAGTAGGGGTCCTCATAGTCTAGTGGGTACCACTACTTAAAATGTACACATTGTGCTAAAATGCACCGAGTGGTATCTTTGAAAGCTAAAATGAATTGGTTTTTGGTTTTCAAAAAACCCAAAAGTAGCTTATTTATGTCCATCGGACTGCAAGAGTAGCTTTGCTCTAATCCTCTACCAGAGTAGGAGATCTCATTCTGTAACTAATTATCTTCATTCATGTGAAATATTTACAGCAAGTTCGCCCTCCTCTACCCGACGATGCACCACCCGAGCTTGTATTTATAGTACAATCATGTTGGGTCGAGGAGCCGAATTCAAGGCCAAGTTTCAGTCTAATTGTCCGAATGCTCAACGAATTTCTGTTTACCCTTCCACCTCCATCTCCTCCACCAGAGTCTCACGCTATAAAGACATCTCCCATTTTGACAAACAGTAACGGGTCTAGCAGTAACGGGTCGGGTTCAGGAACCCCTACTTCATCATCCTCTTCTCCACGTAGTAAAGGAAACAAGCTTTCTTTTCTTAAACAGCTGTTTGCAGCAAAGAAGGCGGTGAATGGCAAAACGTCTTGAAACTGTAGCATAAATTTATGTACACTTGGATTATGTTTAAAGAATGTTTAAAGGATGGTGATTTATATAGAAAAGTATTCAGAAAATGAAAGAAAATATTATCTCCATTTAGTTTACATGGAGTTTTCCTTCTGTTTTCTTTATTTTTCTGTTATTTCAATCATGTAGGAATCAGTTGAGATCTAAATCTGTAATTACAGCCATTCGAAAATGAATAAACTACTCATCTGAG

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020252776.1	8.6e-156	serine/threonine-protein kinase HT1-like isoform X1
Swissprot	Q9ZQ31.2	3.6e-58	Serine/threonine/tyrosine-protein kinase 13
trEMBL	A0A5P1FFK1	6.2e-156	Protein kinase domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT5G01850.1	66.67	2e-133	472		Protein kinase superfamily protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC7G00097	AT5G01850.1	342	98	2	50	391	7	332	66.67	2e-133	472
AfisC7G00097	AT3G27560.1	340	130	4	50	378	15	353	58.24	7e-114	407
AfisC7G00097	AT5G40540.1	289	100	2	42	329	6	293	64.71	3e-111	398

Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g119477.t1
Allium fistulosum	AfisC7G00097
Allium sativum	Asa3G04927.1
Arabidopsis thaliana	AT5G01850.1
Oryza sativa	LOC_Os03g60150.1; LOC_Os03g60150.2

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF07714.14	Pkinase_Tyr	Domain	63	322	194.3	2e-57

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0000166	F	nucleotide binding
GO:0000186	P	activation of MAPKK activity
GO:0000187	P	activation of MAPK activity
GO:0002229	P	defense response to oomycetes
GO:0005829	C	cytosol
GO:0004709	F	MAP kinase kinase kinase activity
GO:0005783	C	endoplasmic reticulum
GO:0005730	C	nucleolus
GO:0005769	C	early endosome
GO:0005802	C	trans-Golgi network
GO:0005815	C	microtubule organizing center
GO:0042802	F	identical protein binding
GO:0009414	P	response to water deprivation
GO:0009658	P	chloroplast organization
GO:0009723	P	response to ethylene
GO:0009743	P	response to carbohydrate
GO:0009788	P	negative regulation of abscisic acid-activated signaling pathway
GO:0010119	P	regulation of stomatal movement
GO:0012510	C	trans-Golgi network transport vesicle membrane
GO:0019901	F	protein kinase binding
GO:0043065	P	positive regulation of apoptotic process
GO:0043168	F	anion binding
GO:0043507	P	positive regulation of JUN kinase activity
GO:0046777	P	protein autophosphorylation
GO:0048513	P	animal organ development
GO:0050793	P	regulation of developmental process
GO:1900150	P	regulation of defense response to fungus
GO:1900424	P	regulation of defense response to bacterium
GO:2000031	P	regulation of salicylic acid mediated signaling pathway

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network