result

Gene information

Detail information of AfisC7G00199

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC7G00199	chr7	34672491	34678326	+

Sequences

CDS

>AfisC7G00199
ATGGAGAAGTTGAAGTTGCTTTGGCTGTTCGTGCTGTTTGCTCAAAGTTTGATTCTTTGCGCTTCAATCAATGACGAAGGTAGAGCTTTATTGAGATTTAAAGAAAGCATAGTATTTGATCCATATGGAGCTATGTTGAACTGGAATGAAGAGTCCGATGCTCATTGTTCTTGGTTTGGAGTTGCGTGCAATAATCATGGAAGAGTTGTGGCTTTGAATTTACAAAATCTTCTTCTTGAGGGAACACTTGCACCTGAGCTGGGGAAGCTTCTTCACTTAAAATATCTTATCTTGCACAATAATTCTTTTCATGGGACTATCCCAAAAGAGATTGGTGAACTACAAAAGCTCGAAGTACTTGACTGTGGATATAACAATTTGAGCGGCCCATTTCCATTGGAAATTAAAAATATCTTATCCCTAAAGACAATTGTATTAAGAAGCTATCAGCAGACTGGCCATGTACCACCTGAACTCCACGAAGTACAATTGCCTTCTAACCACTTTGATATAGAAAGGCAAAGCAAAAGAGCAACTATAAGGAGATTTCTTCGACAAAGCAACCATAGAAAACACAAGCACCATAAACATCATAACCATAAATACATGTCCCCAGTACCATCACCATCAACATTGCCCTCCACCATAATGCATACTCGTCATAAATCTAAAGGAACCACTTTGAATCCTTTGCCCTCTATTGATCACAACACAGAAGTATCACCTACGAGGAACAAGCGTGGGAGTAAACTGATAATTATATTGTCAGTTTCAATTGGAGTGGCCTTTCTTCTACTCCTGGTTGGTATATACTTCTTTATTTCAAGGAAAAACGGAGTTACTGTTGTGCCTCGGAGAACTGGTCTCACTGAGCAGTTGCAGAAAGCATTTGTAACAGGTGTGCCTTCTCTGAAACTCTCAGAAGTTGAATTGGCATGTGAAGATTTTAGTAATGTAGTTGGCTCTTTATCAGACTGCATTTTGTACAAAGGAACTTTATCCACTGGAGTTGAAATAGCTGTAACCTCCTGTATGATTACTTCTGCCAAAGACTGGTCAGACTATAATGAATCTCAGTTCAGGAGTAAGATCGCAACACTTTCCAATGTGAACCACAAGAACTTTATGAATCTTATTGGCTATTGTGAGGAAGAAGAGCCTTTTACTAAGATGATGGTTTACGAGTACGCTCCTAATGGAACACTCTTTGAACACTTACATATTAAAGAAGCTGATCATTTGGACTGGCCTGCTCGCTTAAGAATAATAATGGGAGTAGCATACTGTTTAGACTACATGCACCAACTAGACCCACCGGTTATTCTGAATAATTTAACTTCCTCTTCCATCTACTTATGCGACGACAATGCTGCCAAAATATCAAATCTTCCATTCACAGATGAAGAAAAAGAGACAAATAACGAATTATCTTTTGAATGCTCTAGAATACTGGATTCTAAACTATCAACTTTGGAAGGCAATGTGTACAAATTCGGAATTTTATTATTGGAAATAATTTCGGGTAGGGTACCATATAGCAAAGACGATGGTTTACTCGTGCTTTGGGCTTCGAGTCACTTAATGGGCAAAAGGCCATTAATGGAAATGGTTGATACTACCCTCGAGTCTTTTGGTGCAGAAGATGTAACTGCATTGAGTGAAATAATCAAAATGTGTATTCATAGTGATCCAAAGAAAAGACCGAAAATGAAAGAGGTTGTTGCCAAGTTGAGGGAAATTACAAAAATGCCACCGGTTGCAGCTAGCCCTAAGCTCTCGGCTTTGTGGTGGGCAGAGCTTCAGATCATTTCTACAGAGGGTGATAGCTTAGAATAG

Protein

Gene

>AfisC7G00199
ATGGAGAAGTTGAAGTTGCTTTGGCTGTTCGTGCTGTTTGCTCAAAGTTTGATTCTTTGCGCTTCAATCAATGACGAAGGTACGAGCTTTTCAGTGTTTCCTATATGGATTTTTTTAGTGGCTGTTATGTGTTATTTTGTTTAACTAATGTATCCATTTTTATTCGTTTTAGGTAGAGCTTTATTGAGATTTAAAGAAAGCATAGTATTTGATCCATATGGAGCTATGTTGAACTGGAATGAAGAGTCCGATGCTCATTGTTCTTGGTTTGGAGTTGCGTGCAATAATCATGGAAGAGTTGTGGCTTTGTAAGTTCTAATTTCAACTAATTTCGTTATTATTGGGTGACTTTTGGTCCTTATGAGAGTGTTATAATTGCTTTCAACTAATATTTACTTATCCCGGAATCCACATGTCACATGATAAAAATTGTTGTATAAACACACAAAATTCAGCAAAAGAACAAAGGAAAAAAAAAAGCCAGGAAAAACACGAAGAAATGCAAGAAGGTAAAAACTTGAAGGAAAAAAATGAAGTCCTGGCATAATACATGAGTTTGGTACACAACTACTTAGGATCCATTCTTCGGAAAGAGAAAGGGATATGTGTTAGGCATCTGAACGGTGCATGGAAAGAGGAAGAGAAAAAAGGAGACTATTGTGTTTGTATACACTTGAGCGTGGAAAAGAGATTGAAAAATTGATTGTTATTTTAATAATTAAGTGTTATAGTGATTAGTTAATGTTATTAGTATTATTTATGCATTTTAATAGTTTAATGTTATATTTTAATTAATTGTCATTAGCAAGTAATGCAAAAAAATTATCAGTTAATGCGATAAAATTTAAAAATACGTTATAATTTTGACTAAATAATATAAACAAAAAACATAATAATGCTACTAAATTAAACTAAATAAATGAAAATTTAACCAATTTCTAGAGACAGTGATATGATAAATCCATGGAAGATACTTTATTAAACCTCTCGCATCCATCATCCAAAATTTTGAATCATCCAAGTTCAGAAGTGCATTTCGGAGGACCATTCGGACCTTCCATTTTGCATTATCGTCATCGTCTCTTAACCACCATACACCAGTTGATGGTATTTCTGAAGCGTTACGAAGCATACACATCAAAATACATTAAACTAAGTAGTTACTAATCTAATTTTTAAATCAATTAATTGTTAAACTAGTTAATCTTTTTCCAACAACTTTTCCAGCTCCGCTTTGGTGCACGCAAGCACAATACTTTGGTTACTTTCTTTTTCCTATGTCAAGTCCACTCAAGTGCCTCTTTTGCATTGCCCTTTTGGAAGCTTTTGCTTCCCAAAGAATGCACCCTAAACCATCGCTGAACTATATCTAGATCCAATCAAGCTACCGACGAGCAATCAAGCTACCGACGAGAATCACCAAAACTATTTTTGAAGTAGCTCTGAAATTAATAAGCTGTTAGTTATAGTCTTCAAGTTCAAAATGTGGAATTGCAATGGTTAGGTTTGATCAATGGACTGTAAATTTTAATCTAATTTACTTGCCAAAGGGCTAAAACATATTTCTTAAATCCCTTTTTGAATTATAAGCTCACTATCTCGCATATATCATTTAACTTTAGTAGATTTTATTATATTTTATTTCCCTCATGGGTTGATATATTGTTATTTCTCTCGAAGAGGCTAGAGCATGATATTTTTGTAGGAATTTACAAAATCTTCTTCTTGAGGGAACACTTGCACCTGAGCTGGGGAAGCTTCTTCACTTAAAATATCTGTAAGTACCAAACATAGTGCATCTCGTTAGATGATGAACTACAGTCAAAGTAAATTTGGTCTCTATGTGCTTGTCTATATATTGAATACCTAAAACTGATGTTTCTGTTCTCTAAATCAATTTATTATCTCAAGGATATTTATATATTCTAAGTATTGCACATCAAATTAATTAGTCAAACATTTTGATTATTTTTTCTGAGCAATTATTTTTGCACTTGTACGATCAGTATCTTGCACAATAATTCTTTTCATGGGACTATCCCAAAAGAGATTGGTGAACTACAAAAGCTCGAAGTACTTGACTGTGGATATAACAATTTGAGCGGCCCATTTCCATTGGAAATTAAAAATATCTTATCCCTAAAGACAATGTGAGCAAGAATAATTTTTAAATTTTACACGCAACCGGCAATTGGTTTCTTCACTATATAACTTTTTCCCCTTATATGTCGATTTTACTTCAGTGTATTAAGAAGCTATCAGCAGACTGGCCATGTACCACCTGAACTCCACGAAGTACAATTGCCTTCTAACCACTTTGATATAGAAAGGTAACAACTCATGTATCAGCTAATCCTCTAGGTGTAATATAAATTCTGCACAAATATGTTGTTACTTTATTTTATTTTTTTAGCTTCAAAGCAAAACTATAGATCTTACATCTTCTAGCTATGTAACACACATTATATATATAATGTGTATGTACGTGTGCATGTGTAGTTTTGTTGGTAGTTTTCAAATTGGTTCAAATATGAAAAATGTTTCAAAAAGTGGTCAAAATCAGGTCATGTATTTATCACTTAGGCTATGGATATTAATCCCAAAAGTCAATTCATATCCAAACAGGCAAAGCAAAAGAGCAACTATAAGGAGATTTCTTCGACAAAGCAACCATAGAAAACACAAGCACCATAAACATCATAACCATAAATACATGTCCCCAGTACCATCACCATCAACATTGCCCTCCACCATAATGCATACTCGTCATAAATCTAAAGGAACCACTTTGAATCCTTTGCCCTCTATTGATCACAACACAGAAGTATCACCTACGAGGAACAAGCGTGGGAGTAAACTGATAATTATATTGTCAGTTTCAATTGGAGTGGCCTTTCTTCTACTCCTGGTTGGTATATACTTCTTTATTTCAAGGAAAAACGGAGTTACTGTTGTGCCTCGGAGAACTGGTCTCACTGAGCAGTTGCAGAAAGCATTTGTAACAGGTTTATTTTTGGTACCTCTTTTGTTCTTGTGAATGTTCTTAACATAACCATGGAACTGCTATCGAGCTTTCTTATTTGCTATACTTGGCTATAAGCCGTATATTAGACTCCATACTCATTTCTAATATACATATTCAAATACTGAGGCATAGAACATAGTATGTAGTATACACTTATTGAGGTTATTTGGTATTTATTGTATATATAAACACTTATTGGGATTATTTGGCATTAATTGTATGTATTCAGAAAAAAAAGATATACTACTAATTTTTCAAATGATCTTAGTAAGACTAATTAGAATATCTTACACTTAAAAGTAGGGCATTTCTATGTACACCCAAAAAAGCACTTACTTTAATCCGGGCCAAATTCTTATGAAAGTCTTCTGCACCATAGATTTAGGCCTTCAGGGTCAACCCGGCAGCTTTTATTAGGAAGGCGAGGCAAAAGATGCTCGAGGGCTTGTTAAGGAAGGTGGTAAGGGCCGGGGAGAAAACAAAAGGCTTTTCTCTGGCCATTTAAGTTAAGAGAATACATGTTATTATTTCATTTTATCACCATACAATCAAATAATTTGTTCTCAAGCTTTCACACTTCTGAGTTCTTTTAAAAATTGGTAAAATCAAATACGTGAGGCGTGTATTATTATTAATTATTTTCTTTCAATTGCGTAAAAGAAACTTGGAAAATTAAGCACATGTTGATTTTCCGGAGCAGGGAAAAGTTAATATTAAATGGGGTTTAATACAGACATGCTCTAAAAAATTTAGTATCAAATAACAGATAATATTTGTTGCAACTTATTTTATATTTTGTACAGTGGTAGTTGGTAGTTCAAAGTCTGCAGGGTTAAAAATGCATGAACTTGCATATTGGTAGCATATGCATGATAACTTGTTATGGTGATTTCTGTAGTAAAATGGCTTATCAAATATTTATAATCGCAGGTGTGCCTTCTCTGAAACTCTCAGAAGTTGAATTGGCATGTGAAGATTTTAGTAATGTAGTTGGCTCTTTATCAGACTGCATTTTGTACAAAGGAACTTTATCCACTGGAGTTGAAATAGCTGTAACCTCCTGTATGATTACTTCTGCCAAAGACTGGTCAGACTATAATGAATCTCAGTTCAGGAGTAAGGTAACTTGATAAAATACTCTGAAGAGAAATAAATCACATATGGAACAAAAATAAACTAAAGAACTATACTGAAAATTTTGCTATGGTTTAGATCGCAACACTTTCCAATGTGAACCACAAGAACTTTATGAATCTTATTGGCTATTGTGAGGAAGAAGAGCCTTTTACTAAGATGATGGTTTACGAGTACGCTCCTAATGGAACACTCTTTGAACACTTACATAGTGAGTATATCTTTTATATTTTAAAAGTTATTATTTATATTGATTACTAACATGGCTTTATATATTCCTTTGACATGTTTCCAAAAAAAAATTGTTCCATGACATTGGATTATGTTCAGTTAATCTCGTTGTTCATAAAAATGAATCAGTACTATAACACTAAGTTTCATATGTTATACTGCAAAAAATACTATTATATCCGTATTTAGGGATGGACTTAGGGTAAGTCAAGCAAGTCAATTGGTTGAAACAACCCAAAGAAGTGGTTTCGTGGTTATAACTTTGCACTTTAATAGAAGTTCAAGCCTTGTTAGCTTCATCTTAATTATCACTCCTTATATTATGTCAAATGTAATCAATTTTTACTACAATTAGAAGCAACTTATATATTGTTTGTCTAATACAACCCAAATGATAGGATTGACACTATCGATATCTAGAATGAAATAAATGAATTAAGGATGGAAACAAAAGCAATTTCTAAGGCACAAGGTAGGATAGTGAACTCTGTGATAAAGACATTCATTTTCTCTTAGTTTCATAACCTCTCTATCTTATGATTTACAATTTTCTACATCATTCCTTTTCCTAATCTTCGAAAATTACCAGTTAAAGAAGCTGATCATTTGGACTGGCCTGCTCGCTTAAGAATAATAATGGGAGTAGCATACTGTTTAGACTACATGCACCAACTAGACCCACCGGTTATTCTGAATAATTTAACTTCCTCTTCCATCTACTTATGCGACGACAATGCTGCCAAAATATCAAATCTTCCATTCACAGATGAAGAAAAAGAGACAAATAACGAATTATCTTTTGAATGCTCTAGAATACTGGATTCTAAACTATCAACTTTGGAAGGCAATGTGTACAAATTCGGAATTTTATTATTGGAAATAATTTCGGGTAGGGTACCATATAGCAAAGACGATGGTTTACTCGTGCTTTGGGCTTCGAGTCACTTAATGGGCAAAAGGCCATTAATGGAAATGGTTGATACTACCCTCGAGTCTTTTGGTGCAGAAGATGTAACTGCATTGAGTGAAATAATCAAAATGTGTATTCATAGTGATCCAAAGAAAAGACCGAAAATGAAAGAGGTTGTTGCCAAGTTGAGGGAAATTACAAAAATGCCACCGGTTGCAGCTAGCCCTAAGCTCTCGGCTTTGTGGTGGGCAGAGCTTCAGATCATTTCTACAGAGGGTGATAGCTTAGAATAGTTAGTCTGCAGATGTTTATAAGATCTCAATTTATGTATCTTGTTTGCATGTAATTTTTAAACGGTGGGATTTCTGCTTAGTTTTCCGACAATGGTGTACAGTGTAAGCATAACATTGCAAATGTACTCTGTCTTGCTGAGTCTACCTAACTTTACCAACTGAAAGAGTTTGTTTTAGCTTAGTTGTTGTAAATGTTACGAGGATGGAAATGCAAAATATAATCCAGTGAGAGTATTAGAAGAA

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020241117.1	2.7e-164	inactive receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g40270
Swissprot	Q9SIZ4.2	6.3e-102	Inactive receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g40270
trEMBL	A0A5P1FFC4	6.9e-154	Protein kinase domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT5G45840.1	40.74	8e-124	441		Leucine-rich repeat protein kinase family protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC7G00199	AT5G45840.1	648	303	18	27	607	34	667	40.74	8e-124	441
AfisC7G00199	AT5G45840.2	683	318	16	27	607	34	705	36.90	5e-114	408
AfisC7G00199	AT4G18640.1	682	333	17	8	607	11	677	36.95	9e-112	401

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF08263.9	LRRNT_2	Family	24	64	45.1	7.8e-12
PF07714.14	Pkinase_Tyr	Domain	330	577	77.1	1.2e-21

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0000166	F	nucleotide binding
GO:0005515	F	protein binding
GO:0003677	F	DNA binding
GO:0003723	F	RNA binding
GO:0016020	C	membrane
GO:0006952	P	defense response
GO:0005576	C	extracellular region
GO:0004674	F	protein serine/threonine kinase activity
GO:0016491	F	oxidoreductase activity
GO:0006468	P	protein phosphorylation
GO:0006970	P	response to osmotic stress
GO:0006996	P	organelle organization
GO:0007166	P	cell surface receptor signaling pathway
GO:0007623	P	circadian rhythm
GO:0010038	P	response to metal ion
GO:0009507	C	chloroplast
GO:0010467	P	gene expression
GO:0012505	C	endomembrane system
GO:0016070	P	RNA metabolic process
GO:0044249	P	cellular biosynthetic process
GO:0044711	P	single-organism biosynthetic process
GO:0048316	P	seed development
GO:0048437	P	floral organ development
GO:0048507	P	meristem development
GO:0048765	P	root hair cell differentiation
GO:0090406	C	pollen tube
GO:1901576	P	organic substance biosynthetic process

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network