result

Gene information

Detail information of AfisC7G00649

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC7G00649	chr7	126015336	126021973	-

Sequences

CDS

>AfisC7G00649
ATGGAAAGTAGAGGTAATAATCATAATCTGCAAGGGCAGCAGATTAATAATCAAGAGAAACAAATTTCTTTTGGGATGATGCAGCCTTCTTCTTCCATGCAAGGAAATTTCAACATAAACAAGGAATCGGGTGCGTATGATCTGGGAGAACTAGACCAAGCCTTGTTTATGTATCTTGATGGCCAAGATCAATCTTCAGTTCAAGAACAAAGACAAACTTTGAACATTTTCCCATCTCAGCCAATGCACGTAGAGCCATCAACCAAGGTTGGAATAAGTTTAGGGTCGTCAGCAAGTAGTGGGTCTAAAAGAGCATTGGAGCCATCAATGGAGTTAGGAAACTCAAGAAATGGCATTCTGAATTCATCGACTTTATCCGAACCAGCGAAAGAAACGAAAGCAGCCATCAAGAAGGAAGGGAGCAAAAAGGGTGCACAGTCAAGTTCAGAACATGAAGGGCCTAAAACACCAGATCCAAAAACATTGAGAAGGCTGGCACAGAATAGAGAGGCGGCTAGGAAAAGCAGGCTTAGAAAGAAGGCTTATGTTCAGCAACTAGAGATAAGTAGAATCAAATTAACTCAGCTTGAACAAGAGCTTCAGAGGGCAAGAGCGCAGGGAGTACTCTTTGGTGGTGGAGCTCTTCTTGCAGACCAAGGACTTCAAGCAGGCTTAGGTGGTCTTACCTCTGATGCGGCGGTGTTCGATATGGAATATGGGAGATGGCTTGAGGAACACCATCGACTAATGTGCGAACTTAGAGCAGCTGTTCAAGAACATCTACAAGAAAACGAGCTTCGAATGTTTGTGGACAACTGCTTGCATCACTATGATGAAATGTTCAATTTAAAGAGCATGGCTGCAAAATCCGATGTTTTCCATCTTATTTCTGGAATGTGGAAAACTCCAGCCGAGAGATGTTTCATGTGGATGGGAGGTTTTCGGCCCTCTGAACTAATTAAGATAATTCTGGGCCACATCGAACCTTTAACGGAGCAACAAATACTAGGGATATGTGGATTGCAACAGTCAACACAAGAAACTGAGGATGCGCTTAGCCAAGGGCTTGAATCTCTAAACCAATCTCTTTCTGATACAGTGGCATCAGATGCATTGAGCTGCCCTTCCAACATGGCCAATTATATGGGGCAGATGGCAACAGCCATCAACAAACTTTCCACTCTCGAGGGCTTTGTTAGACAGGCGGATAATTTGAGGCAACAAACACTCCACAGACTACACCAAATCTTGACCACGCGCCAAACTGCCCGTTGCTTTTTAGCAATTGCTGAATACTTCCATCGCCTGCGTGCACTGAGCTCACTCTGGCTTGCTCGACCAAGGCAGGAATAA

Protein

Gene

>AfisC7G00649
ATTTAATACTTAGTCTCCACCTTCTTCTTTCTCCTAATATTATTATTGTTACATTAGCTAACTACTGCCTTAAATTTTCAAATAGCTACAAGCATATGTCACAAAATAAAAGAGGAAGGAGAGATTGAATTTGCTAGTTATTTCTTTTCGATCTTTCAAGTTATATATTCAGACAAGCAGCTTGTTTTGCTATTAATGGATATTTGAGAGATTGAATTCATATATCATTTGATTATTTAGAAGGTTGGAATAGAATTTCAATGGAAAGTAGAGGTAATAATCATAATCTGCAAGGGCAGCAGATTAATAATCAAGAGAAACAAATTTCTTTTGGGATGATGCAGCCTTCTTCTTCCATGCAAGGAAATTTCAACATGTAATCAGTTTTCAATTTTTTTCATTCAGTTCCTGTTATAATTTTTTAATTTTGTTGCTTTTATTTCTTTTCTTTTTTAGCATGAGATGAGATCAAGTGCAATCTAGCATAGAGAAAACTTATGTCATGGATTATTATTTTCTTACTTCATGCATGGTTTTTAATCTTGCTACTGTAATTTAGCTAGGTCATCATCCATACTTTATTTTTTATTTTTCTTATTCACAACTCAACCAAGTGATCATTTCATTTCTTTCTTTTCTTTTTAATTTTATTTTATTTCACATACATCTTTGTGAAAGCATACATAGACATAGATGAAAGGTTATGCCTTGATCACCATATATGTATTTATATAACTTTTTGATCCAAAGAAATAAAGAACTATGTTATCTATCAAATTCACTATTTCTTAAAACAATAATACAGTTAATTAGATTCTTTTAGAATACCTTTTCAGTAAAGAAATTTGGAATTTTGGTTTATTCATAGTTAACTAAGATATCAACAATAATAATAGGTAAAACATTAATTATAAAAGGAGTTCCACGTAACTCACTGTTTGACTATCTTTGTTTATGGAGCTATATGATCCAAGATACATCGCTCTTCATGTTTTAAATTTAAACTTTCAACTCCGCATAGGTATCACATCATACTGCATATACATATGATGAACAAAAACCTTCAATCATGAAATAAAATTTACATTAGAAGTATAATATGTCATTGAAAATACTATACTTATTATAAGCTTAATCATATCTCATTCAAATAAGAAAATTACTAACTATTTTAGTTCATTTATATTTTTCCGTCAAACAAAAGCAGAAACAAGGAATCGGGTGCGTATGATCTGGGAGAACTAGACCAAGCCTTGTTTATGTATCTTGATGGCCAAGATCAATCTTCAGTTCAAGAACAAAGACGTGAGTTTAGCATATATTATATAAAGACGTGCATATATACATGCATATGTATATAACTTGAAATATTTTAACAATAAGTAATCGTGTTTGATTAGCTTTATATACATATAACCAGAGACACAGTAAATATACATCAGTAATTAGCTGCTGAGATTATCCAGTAAAAGTTTCTTTGCAGTCACGATAATATCATGTCTAACAAATCCATGTACATAATTTGACCACAAAAGTACAGAATCTGAAATCTGATTTTTTGGAATATGGGAACCAGTGAGTAGTAGTAATGTATGTTTATTCATTTACAAATTTTGTACAAATAAAAATGTTATCAACTTTTTAAACAGTAATAATATTCTCTTGTGCTAGACTGTGACATGTAACAAACTAGAGAGGACACTCCATATCATGATCTCTCTGAAAAATTCTTCAAAATGAAAATACAGCATATATTCTGTTTTGTATGGCAGAGAAGCTCCAAATGCATGATGACTTTCCTCTTTTCTCTCTCTGTCCTTTATATGAATATTATATTTTATTAATGTAAGAGAATGGTGGTGGCTTCAAATACATCAATTTTGTGTATGTGTATATAAGCTAAACTCAATAAATGCATTGGGCTTTATATGGCAGAAATTAATGCAGTCAATATTTCATGTATGCAGAAACTTTGAACATTTTCCCATCTCAGCCAATGCACGTAGAGCCATCAACCAAGGTATATTATTTCGTAATACGACTATACTATTGCATCCATCTCTTGATAAATATTGTATAAGTTGATTAATATTTGGGCTGTTTATTAATTTTAGGTTGGAATAAGTTTAGGGTCGTCAGCAAGTAGTGGGTCTAAAAGAGCATTGGAGCCATCAATGGAGTTAGGAAACTCAAGAAATGGCATTCTGAATTCATCGACTTTATCCGAACCAGCGAAAGAAACGAAAGCAGCCATCAAGGTTTTTTTTTCTTTCCTTCTTTCTTCTTTTTTTCTTGTTTTTCTTTTATTTTTTGAGAATAGAAACTCCAGTTAAATTGATTTTGTTGCAAGTTATTAAATGTTTATATGGTATTTATGCTTACAAAATGCAGAAGGAAGGGAGCAAAAAGGGTGCACAGTCAAGTTCAGAACATGAAGGGCCTAAAACACCAGATCCAAAAGTTAGTGCGTTTTCAATTTATAAAAGATACTTACATAAATTATAGAATAAGCTTTATGTGTTCATCTACAACTTCATGATGTGCAGACATTGAGAAGGCTGGCACAGAATAGAGAGGCGGCTAGGAAAAGCAGGCTTAGAAAGAAGGTTACATGGTGTTCTTCTTCACACACACACACACACTATAACCTATCCGAAGATAGGTATAACAGTTTATCTATTTTGTGCAAAATCAGGCTTATGTTCAGCAACTAGAGATAAGTAGAATCAAATTAACTCAGCTTGAACAAGAGCTTCAGAGGGCAAGAGCGCAGGTATATTTCCATGTAGTATTAACAAATAGAATTATAATATGTAACTATTAAACTAATTTTCAACCACAGATGAAACATTCAAATTGAATAAACATGGAAACTATACCAGACATATAGTATTAAAAATGTTTAAAATGCATATGTCAGGGAGTACTCTTTGGTGGTGGAGCTCTTCTTGCAGACCAAGGACTTCAAGCAGGCTTAGGTGGTCTTACCTCTGGTATGTATAAATACTTCATTTTTACATATGGGGATATGTTCATAACATATATATTTAAACTAATACTTTTGTGGTACAAATAATTTGAAAGATGCGGCGGTGTTCGATATGGAATATGGGAGATGGCTTGAGGAACACCATCGACTAATGTGCGAACTTAGAGCAGCTGTTCAAGAACATCTACAAGAAAACGAGCTTCGAATGTTTGTGGACAACTGCTTGCATCACTATGATGAAATGTTCAATTTAAAGAGCATGGCTGCAAAATCCGATGTTTTCCATCTTATTTCTGGAATGTGGAAAACTCCAGCCGAGAGATGTTTCATGTGGATGGGAGGTTTTCGGCCCTCTGAACTAATTAAGGTCATTTTTATACCCTCCAACTTAGTTATTAATATGTAAAGAATCAAATAATAAAAGCAGCATATGCGTGTATGTGTATAAGACTATATTAGCTATATGAATACACGCGTGCTTAACATTTTTCTTTGGATTTTTATGTGAATTATTAATAGATACCCAATAATCTTCATTTAATATATTAAGTTATTAACTGAAAGTATATTGAATATATATTACTGTTTATAGTATAAAAATAATATCTACCAATTATGTTTAATCTAAGGCAAGTCAATTAATATATGTATATTTTTTCAAAGGCCATTCTTTATTTTAACTGTTTATAGTATAAAAATTATAATTTACCATTTATGTTTAATCTAAGGCAAGTCAAGTTATAATATATGTATATTTTTTTAAATGCCATTCTTTATTTGGAAAAACTTAGAAGTAAAAACGTAGCTAATTAAGAAATTGAAAAGCTTAGCAGGATTACGTATCAGAATAGCTTCTTGACCCTTTTATTAAGTCATACATGAAAGAGCATAAAGTACATTATCTATTGTCTTTAAATGTATTATGAACAAGAATTTAAAATGTACCGACTTTAATTAGCTAACAGTCTTACCTAATTCATCCAAACGCATTGCAAGTGTAACTTGCTTATGTTGAATTCCTACTAATGAGATAATTAAAAACAAGTGTACCCTTCATAAGTTAATTCATTAAACGTTATAAATAAAAAAACACTAGGAAGAAAAAAAAATAAAGTGTCCAAATTGTGGAAATGACAAATGAAAAATATTGTACAGCCAGCAGTTTGTTGGAAAGTCCCTATTAATGGAGAAGGTATAAATGTTTCAATCTTTTAATAGAGACAAGTCCATGTTTACTTAAATGGTTTGCTACACAAAAGACTTGACATGATCATTCTTTCTTTCTTAATTTTCATAAAGTAATGTTATGGAAGAAGAGCTGGATGGAGAAAGCTTTCCTCATACAGATACTTATAGGCCATACCTTAACATTTTCAAAATAAAAGTGATGTTTAATTCTGCATGAAAATGGAATATTGATGAACTACAATTTAAATTGATGTACTATTTAATAGGTATGGTCCTTTAGCCAACTTTGAAATCTTTGGTGCACAACATTGATATAAATGATTCATAGGATAATATATACCATCTATCCATTTATATATGCATGAAAAGATACAAACTTACAAACATGTATGTATATACGTAAAATACATACATACATGTATGTATGTATTTGATATTAACACGCATGCATACTTGGTAAATTTTATATAGCTTTAGCATTTGCTAATTTGTAGTATTATATATCTTATTGTACAGATAGATAAGGTTTTATCTTCATAAATTTTGTTAGTTTATGCTAAATTTAGTGTCATTTACAAAGTCAACCAATTACCAAGAATAATAGAATCATAACGGATGAAAATGAATTTGATTTTCTTGTTATATGTCCTCTTTTATTAATTTTTTAAGAACAGTAGATAAGCCTTGTATTAGGAACAAAAGCATACTCTACAAATTTTACGTCTATGAAATAAATCTCTCCAACAAATTAGGCTTACAAGAATGCAGTAAATCCATTCTAAGAAACTTAATTATGTTTACACTATGGATTTTCTCTGCTATAAAGAATCTGCATGCATACTCATTTATTTCCATGTTTACTAATATATATGTTGACAAAATGTAGATAATTCTGGGCCACATCGAACCTTTAACGGAGCAACAAATACTAGGGATATGTGGATTGCAACAGTCAACACAAGAAACTGAGGATGCGCTTAGCCAAGGGCTTGAATCTCTAAACCAATCTCTTTCTGATACAGTGGCATCAGATGCATTGAGCTGCCCTTCCAACATGGCCAATTATATGGGGCAGATGGCAACAGCCATCAACAAACTTTCCACTCTCGAGGGCTTTGTTAGACAGGCAAGATTTATTTTACTTTCATAACACACTATTATATTCATCAAATTAAGTATCTTTTTTGTTCATGATATAAAAAGTAGAAAAAAAATTAGTTGATATCCTGCAATTAGTAGGTGATTGACCTAGCAAACAATAATGAATTTGTGAACTAATTCACAATAAATAGTTGTTAATCATATGGTCATTTTTCTGAGAATATTAATTTTATGATTATTACTCAATGCCTGTAAAACAAAAACCAGATATAATTTGTTTTAATTAAGAAATCTGTTAAGGTTTTTTATGTAAATATAAATGTAATGTCATACAGCTCATGAATTTTGTTTGGGTAGAAATATAAACATTGTTCTAGATTAGTTTATATATAGCTGACTAAACTTACCTACTCCATGATCACATATAGCAGCTACAGAATAAACATATGAAGGTTGTTATCAAACTCATAAAAGATGAATATTTTGATATATCATCTGATTCACCAAATACCAATTTCGTGATGGCCTTGGTGAACATCATTTAGTGGCCAAAAATATCATATCAATAATATTATCTTCTAGAACCCGGAACCTGATCGTCAACATTTACAATGCTTCTTCTAACAAAACATCGCGCTACTTTAATTTCAACATTCATCCCCTAATGTCTTTATGTTTAGGTAAAGTTAAGCTCAATGATTCCAATAAAGTCAATAAGGGTTTCACTATTTCAATACAGATATTGACAGTATTATTTTCCAGTTCATACTTGAACAATGTGAACATCTCTAAATTTTAAGATTCTATTAAGTATACATACATGTAAACAATGACCTTACCGAATGCAGGCGGATAATTTGAGGCAACAAACACTCCACAGACTACACCAAATCTTGACCACGCGCCAAACTGCCCGTTGCTTTTTAGCAATTGCTGAATACTTCCATCGCCTGCGTGCACTGAGCTCACTCTGGCTTGCTCGACCAAGGCAGGAATAATAATGCATATACTCATGTATCATCCAATCCAACACGTACACAAAAAACAGAAAAAAAAATTATCGTGAGATACTGTTAATTTAGTTATTTTCCATATTACTAGCTGAACGCAAAACTCTCATCCAGCTAATTTGGATCTTGTTGATGTTTAAAGTGCTGCTGAGAGTTGTATGTAGCATTAAATATATACTCCATGCTATTTTGGTGGAGATGAGATGTGTACATTATAGTGAGATGTTGATTACCATAGAGAGTCATAGACATAGTAACATTAAATTGGGTTGTATTATCAATCAGATTAGTGGTTCATCTGCTTACTCTCCTCTTTCCTTGATCTCCTTGTTTATATACTATCATTGTTT

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020267914.1	6.9e-202	bZIP transcription factor TGA10 isoform X2
Swissprot	Q52MZ2.1	1.0e-170	Protein TGACG (TGA) motif-binding protein 10
trEMBL	A0A6I9SGY0	5.2e-183	bZIP transcription factor TGA10 isoform X1

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT5G06839.3	61.42	1e-151	532	bZIP65;TGA10	bZIP transcription factor family protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC7G00649	AT5G06839.3	451	128	10	34	450	21	459	61.42	1e-151	532
AfisC7G00649	AT5G06839.1	444	106	8	34	450	21	416	59.23	2e-143	506
AfisC7G00649	AT5G06839.2	445	106	9	34	450	21	417	59.10	5e-142	501

Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g299673.t1
Allium fistulosum	AfisC7G00649
Allium sativum
Arabidopsis thaliana	AT5G06839.1; AT5G06839.2; AT5G06839.3
Oryza sativa	LOC_Os09g10840.1; LOC_Os09g10840.2; LOC_Os09g31390.1; LOC_Os09g31390.2; LOC_Os09g31390.3

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00170.18	bZIP_1	Family	160	199	33.4	3.2e-08
PF14144.3	DOG1	Family	250	323	115.5	8.2e-34

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005515	F	protein binding
GO:0003700	F	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0005634	C	nucleus
GO:0005737	C	cytoplasm
GO:0009410	P	response to xenobiotic stimulus
GO:0009862	P	systemic acquired resistance, salicylic acid mediated signaling pathway
GO:0009909	P	regulation of flower development
GO:0045893	P	positive regulation of transcription, DNA-templated
GO:0045892	P	negative regulation of transcription, DNA-templated
GO:0043565	F	sequence-specific DNA binding

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K14431	TGA; transcription factor TGA	EC:-	Plant hormone signal transduction	ko04075

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network