result

Gene information

Detail information of AfisC7G00789

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC7G00789	chr7	158991292	158997519	+

Sequences

CDS

>AfisC7G00789
ATGGAAAGAGAAGCTCCTATTTTTCTTCATCAGCCAATTCCAATCCGATTTCATGAAGCTCCAGTATTAGTTAAAAAGAGAGATTTTCCATGGCAATCACAAAATATTAATCATAGTAATACCCCACAAGCTAGTCACTGGATTGCGAATCAGAACACGTGGAACCAAAATTTATGGGAATGGGACAGCCAGAAATTTGTTGCGAAACCCGCTTCCGATTCACCAGAACTACCAGACAAATCTGTAAAAGTTCAAAATATGTCTAAAAAATTGGAAGTTGAAGGCCAAAATCTAGCACTGAAGCTTGGAGTAGCTGAGGAACCGGTTGTGAGGCCATGTAAGAGAGTACGAGCAGGCTCACCAGGCAGCTCTGGCAATTACCCAATGTGTCAAGTGGATGACTGTAAAACAGATTTATCAAATGCGAAAGATTATCATAGAAGACACAAAGTGTGTGATATTCATAGTAAGTGTAGTAAGGCGGTTGTAGGGAATCATGTGCAGAGATTTTGTCAACAGTGTAGCAGATTTCATCCCCTCTCAGAATTTGATGAGGGCAAAAGAAGCTGTCGACGTAGATTAGCGGGGCATAATAGGAGAAGGAGAAAGACACAACCAGAAGATGTTTCCTCTAAAAATGCACCTCCAATTAATAATGTCAACAATAATATCACCAATTCAAACTTGGATATTGTCAATTTGTTGTCTATCATCACTAATTTACAGGGTAATAATGCAATCAAGCAGACAGATTCCACTGCTCTTCCTGATAAAGAAAGTCTAATCCAACTTATTAGTAAAATAAACACAATATCTAATAGTTCTTCACAGAAATCGACTGGGTTGGATCTAAATGTTGCACTACCACAAGAATGTGTTGACCAATCCTGTAAAACCAATGAACATCCAACTGCTGCTTCAACAGTTGACTTACTTACAGTTCTATCGGCTGCTGTATCAAATCCTAATGCTCTTACTTCTTTATCTCAAGGGAGCAGTTATAGCAGTGGCGACGACAAAGCAAAAACATCTACTGATGCCAACATGACTATGAAACAACCCCCTAAACAGAATTTGCCGCTACAACTATTTGGTTCTGGTGAAGACACCAGTCCTCCAAAATTTGCTGCTTCTGTAAAATATTTCTCTTCCGAGTGTAGCAATCCAATGGAAGATGGATCACCTTCTTGTTCCCCTCCTGCAGTACAAAAGCTGTTTCCAATACATTCTACTATTCATGAAAAGCATGAAAGAATGTCTGTTTGTCGGGAAGATGATGATAATATGGTTGAAACAAGCACAAGTCAAGAGTGGAATACTCGTTTAGAGCTTTTCAATGAGTCAAATAGACGAGCAGAGAATAATGCAGGTCATAATAATCAATATCAAGGGGGCGGTTATGCATCATCTTCTCTATCAAATCATTCACCATCCAGTTCAAGTTCCGATGCTCAGGATCGAACTGGAAGAATCATTTTCAAGCTTTTTGACAAAGATCCGAGTAAAATACCTACTATTCTACGGACTCAGATAGTAAATTGGCTAGCCCATAGTCCATCTGAGATGGAAAGCTATATACGGCCAGGATGTGTTGTTTTATCCATTTATGCATCAATGCCATCTATTGGGTGGGATGAACTTGAAGAAGATCTTCATCAACGTGTCTCGTCACTAGTTGAGGATTCTCAGTCAGAATTCTGGAAAAAAGGGAGGTTTTTAGTTCGGACGAGTAAACAACTTGCATCTCATAAAGATGGGAAAATACGTCTTTGTAAGTCATGGAAAACATGCAGTGCTCCTGAGGTTGCTTCTGTATCGCCTATTGCAGTTGTTAGTGGGCAAGAAACTTCACTTGTTCTTAAAGGTCGCAATTTAACTGTTCCTGGAACCAAAATACATTGTACTTTTATGGGGAGATATACTTCAAAAGATGTTCTTGGTCCAGTGCATCCTGGTACAGTTTATGATGATTCTAGCTTCGAGAGTTTCACTTTTCCTGGAGGATTTCCATCTGAATTTGGTCGTTGTTTTATCGAGGTGGAAAATGGTTTCAAAGGAAACAATTTCCCCATCATTATTGCTAATTCAATGATATGCCAAGAGCTAAGATCCCTTGAATCTGAATTCAAAGATGGAACTAGAACCAGTGATGTGAATTCTGAAGATCAAATCCAATATACTGGTCAACTAAGATCAAGAGAAGATCTTTTGCATTTTCTTAACGAACTAGGATGGCTTTTCCAAAGAAAGAGCAGTCAAGACCCTCACTCTCTAGAATTCTCTGCTACACGGTTCAAGTTCCTACTTACATTCTCAGTCGAGCGAGACTGGACAGTACTGATCAAAAAACTCTTAGATACACTCGTCGAGAAAAGTTTGAATTGTGAAGCCTTGACTCAAGAATCATTAGAAATGCTTCTGGAAACACAGTTATTAAGCCAAGCTGTGAAAAGAAAGTGCAGGAAAATGGTGGACTTGTTACTAAATTATTATGTAATAAAGGATAGTAATTCAAGAGTGCATTTATTTACTCCCTCCTCAGTTGGTCCAGGTGGTTTGACTCCTTTACATATTGCTGCATCCATGGATGATTCAGAAGATATAGTTGATTCCCTAACAAATGATCCGGAAAAGATTGGCATGAACCGCTGGGATTCAATATTGGACGAGAGTGGTCAGACTCCGTACATGTACGCTTCACAAAGAAATAACCACTCTTATAACAAGCTCGTGTCCAGAAAGCTTGCTGATAAAAAGAACGGACAAGTATCGATAAATATTGGAAATGACACATCCATGGACAAATCATGGATTGTGCCCGATTCAAGGAGACTTAAAGTAGGGTGTTCAAAATGTGCATTTATGCAGAAGGTACAAGGAAGGCCAATGGCACGGGCACGAGGGCTTTTAGGACGGCCATATGTGCATTCCATGCTTGCCATAGCTGCTGTATGCGTTTGTGTCTGCTTATTATTTAGAGGCTCGCCTCAAATTGGCTCTGTTGCACCCTTTAAGTGGGAAAATCTGGATTTCGGTCCAAGCTAA

Protein

>AfisC7G00789
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Gene

>AfisC7G00789
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TGATTGAGTTTCTTCTATTTTTTTTCTCTGGATCACACACGTATGCATGTACATATGTTGGTACTAGGAGGAATCTAAGATCCCCTCTTATTTACCACCTTTGTCTTTTTGTGCAATTTTTTTTCCCAATTGAAGTAGGTTTTTGTAGATATTCGTAGTTCATTAGCATATCATTTATGCTAAATTTGAAATCGTTCCTACACTTCTATCCCCTTCAAAATTACATTTCAAATTGATGGTTAGATAAATATTTTCAATGTTTATAATGAGCATAGAGGATCTTGGTAATGAGTAAAAAAATTAACTTATGTACAAAAACTCACTTCGATCTGGAATTTTTTTGCACTAAAGGATGGGGAGGGATTTACAAGAAAGGGGATATTGATCCTTCTCATGTGTGTGTATGTGTATGCGCATGCGTGCCTGTGTGTATATACATAAGAGCGTGTCTATACACACATTTATACAATCCAAAGAACCAAGTTTCTTTAGTAAACTCCGAGAAAGTGTGCTTCCAACTGTCAAGTGACAACCCTACATAATCCATTATCTTATTAACACAAGGTTACTATATTCAGATTGGCATGAACCGCTGGGATTCAATATTGGACGAGAGTGGTCAGACTCCGTACATGTACGCTTCACAAAGAAATAACCACTCTTATAACAAGCTCGTGTCCAGAAAGCTTGCTGATAAAAAGAACGGACAAGTATCGATAAATATTGGAAATGACACATCCATGGACAAATCATGGATTGTGCCCGATTCAAGGAGACTTAAAGTAGGGTGTTCAAAATGTGCATTTATGCAGAAGGTACAAGGAAGGCCAATGGCACGGGCACGAGGGCTTTTAGGACGGCCATATGTGCATTCCATGCTTGCCATAGCTGCTGTATGCGTTTGTGTCTGCTTATTATTTAGAGGCTCGCCTCAAATTGGCTCTGTTGCACCCTTTAAGTGGGAAAATCTGGATTTCGGTCCAAGCTAATCGAGTAAATAGTATTGTGTTGTTTTATTTTTTGCGATTGCATGCTTAATATCTTCTTTTTCTTGGACATAGCGTTTTTATTTGCGATGTTTTTACATGTGTCAACATTACATAGTGATAAGAGTAAAGTTCCTTCTTTTTTGTTTGATGTGTATTTTGGTATAGGTTGGATTGTTTTGACTCCGACCTATTCGTTTGTTGTTTGCATATGCATATCTTCGCACTTGTGTACTTTTGCC

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020268251.1	0.0e+00	squamosa promoter-binding-like protein 15 isoform X2
Swissprot	A2YX04.1	3.5e-214	Squamosa promoter-binding-like protein 15
trEMBL	A0A6I9RTI9	0.0e+00	squamosa promoter-binding-like protein 15 isoform X1

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT1G20980.1	44.94	0.0	819	ATSPL14;FBR6;SPL14;SPL1R2	squamosa promoter binding protein-like 14

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC7G00789	AT1G20980.1	1088	455	28	5	1012	10	1033	44.94	0.0	819
AfisC7G00789	AT1G76580.1	1017	461	24	51	1012	6	986	45.72	0.0	793
AfisC7G00789	AT2G47070.1	550	310	14	484	1014	357	881	35.64	6e-90	329

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF03110.11	SBP	Domain	130	203	98.4	1.8e-28

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0003677	F	DNA binding
GO:0003700	F	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0005634	C	nucleus
GO:0006355	P	regulation of transcription, DNA-templated
GO:0010321	P	regulation of vegetative phase change
GO:0048653	P	anther development

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network