result

Gene information

Detail information of AfisC7G00958

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC7G00958	chr7	193271850	193278321	+

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC7G00958
ATGCTGACGCTTATAAGCGTTGGTAAATTTTAATTGCCAACGCTTATAACGCTGAAATATTTTCATTCTCAATATAGTCAATTTTTTTAACATTAATAAACAATTAATAACTAACATGATATGCATTATTATACTACATTCAATAGGAACCCAAAATTTACAATATTTGTGATCAAATAACAACATAAATTTCATAGTCAACTACTTCATAACAATGTCAACTACTTCATAACAAGTACAATACATAATTTGGTTAATTCAATACATAATCAACTACTTCATAACAATGTCAAATTAGAATACAAAAGACAACGTAAATTTCATAGTGAAATTCTACAAATACCGAATACGAAACTCCGGCCATATAACGAAACCTCCATCTGAAAAATCACATAACTTGTACATTCAAGATACTAAAGGTAGAGTTTGGGGTTATGGAATATGCGCATTTGCCATTGTTTTGGAGCTGCTTGCGTTCTTGGCAGGCATAAGGAAATATCGATATAAAAAGTTGGCCCGAAGTCTGTTAACTCAAATTGCCACGGTGGTATCTGCAGCATGGAGACAGAGAAATAATGAACTGCCATCAGATTTGTCTCTGCTGTATGATGATGATAAAGTAGACAGTAAAGGCAAACAAAGGCTTCCTCATACCAAGCAGTTCCGGTACGTAAAAACAGATTGATTATGCGTGCAAACAGAATAACAGTTAAAACATCTTATATCAAGAATTCGTGGTCTCCTAAATATGCATTAAGTCAATAATATCAAGAATAAAACATCTGATGAGTGATTATTCACTACAAAAATGAAACTGCAGTGAAAAAACTTCACCTAGTACATTTTTGTAGATTGCCTCGCGTAGAATAAAGAAAAGGTGGAGTAACAGATGCAAAATTTGGTAGATATAGTAGGGTAAGTTTAAATCAATGTCACTACAAGAAAAAGCACTATTAATAGCATTAGGAAATATTGAAAAATAGCGTTTTAATTTTAACTGCAGTTGAATCCTGTATTAGCGAAATAACATGAAAATAAAAACGCTATTTACAAAACTCTCACCACATTCCCAAGGCGGGATAAAAATTTATTTTAGCCGCCAAAGTTTTACTAAAATATCATTCTCCGTCTGGCAAAGTGAAAACTATCAAAATCTTAAATTCGTTCTTCGTCTCGCTCAAATAAGTCTCAAAATCCTATCTTTTCATTGTTTGGTAGCTCCTCAAGTTATAATCAATGGCCGCATCGCAACAATTTGGATTTGGAACGAGTGTACAATCAATTGATGGGCTCCGAATTTTGCCTTTTATTTCTAGGGTTTTGCTTACTGTAAGAACGCTTGCGTTGGATATGGTAAGAAAACTTATGAAGGATTATGTGTAAAGATAACAACTATAGTTGCAGGTAAGTATACCACGGTAGATATCCAAATTCACCAATTGCAAGGCTAAGGTAGATATCCAAATTCAGGTAATTGCTAGGCTCATATAAAGTTAATCATGAATTTGGTAAGTATAGTTGATCAATGTAGTTCAATAGACTAATTTCAAATATATGAGAGGGTACAACATGTCAAATGTGTGATTAAACTAATGAGACGACTTATTGCCATTCTTGCTCACTAGTAACAAGATTTATTTATTTGATTTTCTTTAAATAAGTACATCTTAAGACTTAGGATGTAAAAGCCAATGAGTCTATATCTGTGTGTGTTGTTAAAACCTACAAATTATCTTTTGAAAATGCTTAGGCTGGGTCTGTTTTGCACTTATGAAGTATTTAATACTGAATGGAATCATCCTTGTTGCAGTAGGAATTTTCTAATGATTGGGAACTATTAAGCATTAAACACTTTTTATGACATCGGATATTTTAAGTTTGTTGATTATCAAGTATTAAATTCTTGATAAGCAAAATTGTTTGAAACAGATTGGCCTTTATCAATCTTTGTTCCTTATTGCAAACAAATACTGCCTTACTCAAGTTATTCACCATATACTTGTCACTTTTAACTCAATTTTTCCACCTTGATGTAGATGGGATCAAAAATTGTGTACTCTAAGCATTTAGGAATAGAATTGGAACTCAATGGCTGCAACCATCTTCTTCTGAAGGAAGATGACATAGTCGATATTCTCCATAATGACGATGTGAAGGATCTCAAACTTCTCAACGATCGAGTTCTGATCAATATTGCCGAAGTCAAAGAGAAAACTGTAGGTGGCCTACTGCTCACTAAAGCTATTAAAGAAAAACCTTACATTGGAAAGGTGAAATAATTTGCATGATGTGTACGTATTTTATTTCTGCTACTACACTTATTCCACTTATTGCAAACCTGAAATAGTAGTAGCATTTATTGTACTCGTTCACCACTCTCACAAATAAAGAGTTTAATATTTATTAATGGGAAATATATCATGAAATTGACCAAGGGAATGCACCTAGTTTAGAGTATTACTAGTTTTTTGGAACTTTAGAGACTCAAACAGGTGACATTTTCATCCTTTTTATATTCCATATTAATTTACTTTATAATATGCATTTATAAAAAAAATAGTCAAGCCTAAGGACCATAAGCTAGAGCATCCATTCATAAAAGCAATTACTTCTTATTAACATTATATCTTTTAGACAAGATGATGATTACGGGTTGCACCGTCTGTTGGATGTTGTGAATAATATATAACATTGGCTGACTTTAAACATTAGACTTTATAATGAAGATAGTGATAGCACAAGGTTCTAACGGATATCTACTTTCAAAACAATTTAACATACTTTTTTTGAACCTTGCCTTTCACTTGTAACTTCCTTTTTATTATCAAAACGGAAGAGGCTAGATAGTCTTAGATTCGTAGCAATAAGAACATCAATTCCTTTGCTGCATTACAGTTTGAAAAGGAACCTTCAAATATACCAAGTCAAAATTTTATGTGTGTGTATAAAATTCCTTATTATACGCTTAATCTTAATGCATCCAAAACCATGTTGTATCTCAGTTTCTTTCTTCAACATAATGCTAGCATTATTAAAAAATGAACTTGGTTACAGTTTTCTTTCGTTTTATTCAAACAAACATTCTCTTTTGGATAAATTTATTTTTGTTTCCTTTTTTATTTTACTATATAAACAAGATAAATTTTTCTGAAGTCTTGTGCATGGAGCTCACAAGAGTAAACATGCTTAATTTCCTCACTTATACTGTCCCAGTTTGTGAAGCCACAAAACATAAATATAGTTAACCTATATGTATGTATGTATGAATGTATGCATGTACGCATGTATATGATCGACGGTTCATTATTTCTATCATCTTTAAACATTACTGTTTTTACATAAAAAATTATATATTAGACTGTAGAAATCACATTATTATATTTACTGGTTATTAGGTTGAAATATTTAAAATGAAAAAACTGCAATAAAATTAAAATTCAAGGTGGAGCTTACCTGCGTTACAAGTTTGTCAAGTCTCTTTTAATGTTAACATATTTAATAATGGTGGGTAATCTGTCTTACCATGTAGTACTGATAATCGTAATTTCATCTTAATGTAGTTTTCTGATTTGATGAATAGGAGCGTTGACAGGTAGCAATTTTTGTATTTACTTTTGATACATATGATACCTCATTAATGATATGTTTACTTTTTATGTCTTATTTGATGTTATGAAATTTCATCTCCTACTTATCCAAAATTACATTTCTAATTCTCAACAGTTATCATCTTCTTTTAATTATGTAAACGTGTATAGATTAAGATACCATGTGTTACTTATGCTTCACATACAATATCCGTTTAAAATTCAAAACCCTCACTGTTTCAATTTCGTTTTGAAATTAACTTAGATTTATTAACAATAAAAATGTCCAGTACAAATAGTTCATACAAATATAGGCCATGCAAGCATGCCATAGCACAAGGAAGACAATAAATGATTATTGGCCTATATCTCCATAAGAAAAATGGAGAACCCCACACAACACTTGGGAGCATTATATTAAAAACAAATTCATGAAAAGCAGTATGGAAATTTCCAAAGACCGAAACACAACAAGCTTGTACTGAACAACTTATAATAGCAGACTTTTTGTGCAGCAACTGATAATGCAACACTAATAATCTGCAAGCTGCTAGTTTAATTCAATTGATTGTAAGTAGAAGACCTAAAATGATCGAACTGCTAGCATGATGATGATTGGCTAAGTAGAGCAGCAGTGTAAGCTTACTATAGTAGCATGCAGTTGGCTTCCTGAAACTCATCAAGCTTTAGGCTTCATTTTTAAACTACAACAGCATCCGACTGAAAAAAAAATTCCTAGATCACTTCACCAGATTACTATAGAGCGTACTCATAGTTGTAAGAGAATAAAATTGACGTTTGTAGTCCATAGCCATATTGGAATTCACTAGCATGGCAGCTGCAACTAATCTGCTATGCTATGGAGGCATTGTAAAGCATTTCAGGTAGCCTGATTTATTACAATAACAATGTACACAACTTGTATCTTTTATGTACAAATTCTTCTTCGTGTGTATTATTGACAATGTACAGAATTGAATTGTCATACTTTATTACAATGTGAAGTCAAGTTCTTAACAAGCCTGACTTATTTATAATTTTATCGAGACATCGCTTTTATTATTTAATATTTTGTTTTTTTTAGTAAAGAATTAAAAAGGAAAATATATTTCGTTTTGAGGGTTGACTTTATTTTAACTTGTTCATGCATGCAGGAACAGTTTTTTAAGGAGTAATTGATACCAAATATGAAACTATATCAAGGATGAAAACAAGGATATCAACTTTTATAAAATCACCGTCTAGCTATTCCAAAGGTATGTTAGATTTGTATAAAATTATTTGGGTTATTTGGTGATTAATTTACTATCGAAGAACAGCTTAAATGAAATTACAAAGTCAATGCATGCATAAACTGTTCGAAAATTTTCTAGATGCCTAATAACTTACTACAAGCAACTGTGAATTGAATTATTTTGTAGTTTAAAATAATATGATTTATATCTGGTTTGAATTTGAAGTTTGTAACTCATCTTCCTTTCAATATATGTATTAGTTTGTTTAATCATTAAGGTTAAGAAAACTTTTACAAGATTTTAAACTCCGACTACAAGTAACTAAACACTCGATGGTAAATATATTTTTTATGCGAGATTAAAGATTGAGATATTATGGCAATTAGTTGCTATAGTTTTCTAATTTGCATCAAATATTTTATGATGCTATAATAACATGTGTTATTAAGGCTATTCTGTCTGCTAAATATTGTCTTATGTGTGCCCTTGATATGCTAGTGTGGATTCAGCGAAAATTTTATAAAAAAAGCAAATTAGTTATGATGAAATATATGGAAATGATTTGTGTTTCAGGAGTTGTGCATGGAAAAAAATAAATATTTATCACTTATTATATCACTTGTAGATTGAGTTACTCTCTCAACTGTTTTCAAGACAGGCAATTCTGTATAATCTTCATCCTTTTGAATTGGTTGATGTTGGCTTTTGTTTATCTCCTCTATGAATATTCGTGTTTCTTCATTATGATCCCCTGTATCTAAATGTTGATGCAACTCCATCTTCTGTAAAATTTCGCATTGGTTGGTGCCTCTGTTAACGACAGTATGAAATTTACTGAACTTCACTTAGCCTTTTCATTTCATTTTATGTTAGTCATGAATATCTCTAAATTTCCTTTGGTGGGTGTTGTATCATTTAAAATACTAAAAGGAATTGTCATTAGAAATCCCCTGGCAAATTTTGTCCTAGTACCGAAATATTCAAAACTGTCACCAATTATACTTTCTTGCACTATAATTTTGCATTAATCATGTAGTTTGATATTTCTATTAAAGATGATGCGATAATATGTTTGTAGACGGGAATGAGAAAAATGATTAAAAAAGATGGCTGGTGGGTTATCTCAAATTTTACCGCCAGACGTGAAAAAAAACCTGCCAGATGTGAACAAAAAATTAAACGACAGGAGAGGTGTTTATATTTAAGGTAATAGAAATCATTAGGGGCTAATTAATATGTTATAGGGGGGCTTTTTTAGTGGCCTTGTTATTTATTTGTACAGGCTGATATGAAATCAGCCCCAAATAAGTTAATGTTAGGGGCTAAACATTTAATCTGCCTCTAGTTTAATGCCCTTAATATCTTCAAATTTGGTAGTGTCACTAACAAACAGAACATCAAAAAGGCTTCGGTCTTCTCCAAATTCTTTGAGAAATGGCAATGTTGGTGAGCAGGCAGGGGCAAAATGGGAACAATCAGCAGCAGATAGACGCAGGAAAGTACGTTAGGTACACACCTAAGCAAGTAGAAGCTCTCGAAAAGGTGTACAGTGAGTGCCCAACACCTAGCTTAATTCGAAGACAACAACTCATTCGAGAGTTTCCTATCCTGTCTAATATCAAGCCAAAACAAATCAAAGTTTGGTTCTAG

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	KAB9322352.1	2.8e-22	hypothetical protein FH972_027024
Swissprot	Q05085.1	3.2e-23	Protein CHLORINA 1
trEMBL	A0A5N6L5R9	2.0e-22	Protein NRT1/PTR FAMILY 6.3-like

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT1G12110.1	60.22	7e-26	114	AtNPF6.3;ATNRT1;B-1;CHL1;CHL1-1;NPF6.3;NRT1;NRT1.1	nitrate transporter 1.1

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC7G00958	AT1G12110.1	93	32	1	8	95	213	305	60.22	7e-26	114
AfisC7G00958	AT5G20720.3	91	40	0	107	197	120	210	56.04	3e-24	108
AfisC7G00958	AT5G20720.2	91	40	0	107	197	120	210	56.04	3e-24	108

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00854.18	PTR2	Family	8	97	34.3	1e-08
PF00166.18	Cpn10	Domain	148	217	26.6	4.2e-06
PF00046.26	Homeobox	Domain	210	258	34.4	1.3e-08

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0005515	F	protein binding
GO:0003700	F	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0005634	C	nucleus
GO:0006355	P	regulation of transcription, DNA-templated
GO:0008289	F	lipid binding
GO:0009880	P	embryonic pattern specification
GO:0008284	P	positive regulation of cell proliferation
GO:0009636	P	response to toxic substance
GO:0009414	P	response to water deprivation
GO:0009536	C	plastid
GO:0009733	P	response to auxin
GO:0009944	P	polarity specification of adaxial/abaxial axis
GO:0009965	P	leaf morphogenesis
GO:0010067	P	procambium histogenesis
GO:0010072	P	primary shoot apical meristem specification
GO:0010075	P	regulation of meristem growth
GO:0010089	P	xylem development
GO:0010167	P	response to nitrate
GO:0015112	F	nitrate transmembrane transporter activity
GO:0015706	P	nitrate transport
GO:0070887	P	cellular response to chemical stimulus
GO:0043167	F	ion binding
GO:0043565	F	sequence-specific DNA binding
GO:0045597	P	positive regulation of cell differentiation
GO:0048263	P	determination of dorsal identity
GO:0048364	P	root development
GO:0080060	P	integument development

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K04078	groES, HSPE1; chaperonin GroES	EC:-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network