result

Gene information

Detail information of AfisC7G01204

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC7G01204	chr7	239731259	239738555	-

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC7G01204
GGATCAGCGTATGTACTTTTATTCTCTACATCTCTTTATTTCTTATAAGTTATTGGTTATTTTATGGGCTGCACTTGTTAAAATACTGATTTGTAGCACTTGATGATATGTACAATTCTTGCGATTTAGGTTTTGTAAAGTTCAGTTTTGCTGATTCTAGTTTGTTTATATTACTGGAAGATTATTTCTTATTTTCATTTGGGTGATACATATAACTATATAAGTTGTGTATTCAATTGTCAACCATGATTTACCCTGAAATATTAATATATCATCCATTATGATCATCATACAGTTGAGTCGATACTTTGAGCTGAATTAGTGTTTAGCAAAAACAATTGTCTGGAAAAATGGGAATAAATAATGAGGCAAACAATCAAAATAGTACTGGAATGTCATCAAGGCAGCGATTGCGATGGACAAATGAGCTTCATGAACGATTCGTTGATGCAGTTGCGCAACTTGGTGGACCAGATAGTGAGTGCTCCTGATTTAAATGCAACTTTTTTCTTTTAATTGATTGACTACCATGATTCTTGGATTTGGATCGTGCTAAAAGTAGCTAAACTAGTCGATTTGAACCGCTAGATCTTTTAACAGTAATGCTTAATTTTTTTGTTGAACTTCTGACAGAGAAACTGACCCAAATTCCATGATTGTACAACCATTATTAAGACAGAAATGCTATGAACATTTGAACTGCCATATCCAATATTTAATTCAAGTAATGCTGCCACAGCAAATTGTGATGTTTGATAATTATAATTTGAAACTCCATATAGAATTGGGGCACTTGGTTTGTTGGACTGCATCACTTTGTTCCTGTGATATTACCATTAGCAGCTTAGTGCTATATGCCACAACACAAATGTTATATTAAGTACATTTTGCCATTTTTGAGAATGGTTTTGACATTATATGAACCTTGTATGAAGGTTCATCGAGAAAAGAATGATAGTTTGGTAGATCAAAAGAGCTATCATCATGCATCTGTGAATGTGTCGAAAGTGGAGAATGATATGTAATAAAAATTCAATTAGACATAGGTATATCATACAACACAAGTGAAGATTATTAATGTGCGATATGTGTTTTTTGATTCGAACATTCAGACCCCCTAAAATCGAACAAATGATAATTGATTACCATTTGGGCAGGAGCGACTCCTAAAGGGGTTCTCAAAGTCATGGGAGCACCTGGGTTGACAATCTACCATGTCAAAAGCCACCTACAGGTATTCTTTTTGACATTTTGTGCACAATTTTGTAGTTTTCAAAATTTATTACTGTGTGCTTATGCGATCTGATACGTCGATTGCAGAAATATCGTCTTGCCAAAGTTCTTCCTGAGTCTTCAACTGATGGTAAGCATCTATTGTTTAGCAGATACAAATGTTTCATTTATATCCATCCTGGTCAATTTCTGTGTATGCAGGTAATAAGGTTGAAAATGAAGAACACGGTGACCTGTTTTCAAGCATGGAAAATTCTTCGTAAGTGCATAGCAGCCTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTCCTTTTATGAATAATAAATAGATATTCTTAAATATGGAAAGGCAATTACCTATGTATCACAGTTATTTCACGACAGTAACAGCATTTTCTTCTACTAGTGTTTCAGCAATTAAACTTTCCAAATTAACTACTTGAGCAATTAGACTTTACAAATTAATTACTGACTTTATCCTTTGCTTAATGGAAATCACAAGTAAACTTAAAGATACGAGTGAAACCATAAATTTACATGAATGTTATATTATCTAAAAATCAGCCTTATATATGGAAACTAATGATTGTATCATGAAAAATAGTTTTGTTCTTTTGTTTCTCTCAGCGGGATGCAAATAAATGAAGCTTTGAAGTTGCAAATGGAGGTGCAAAAGCGGTTGCATGAGCAGTTAGAGGTAAGCATATTTTAACAACACTCAAATTTGATCTTTTTGACAAGCTTCAAGAATCAAATATAAGTGATATTCATATGGTACATTGATGTTCTGTATTAATTATTCCATAACAAATCTGTATTTTATAAATTTAACAATGATAACATTTAATTATTTCTTTCAAACTCGTTTTGAATGTTGCATATCCCTTCATTATCGCCTCAGACAATCCCAGTAGTTAATTAGGTAGCTTTTCAATCGATGTTATGGTGTTGTAAATTTTCTTAGCTAGCCCAGTGGAGGGTATTAACATGGGGAGTTACCGATGTTTGGAACATCGGGTTGGTACTCCCAGATGTTCTTTTTCCCTAATTTCTTTTTTTTTTTCTTTTCACTTTTACTTTTACCTCCACCGTTAAAAATGGGAAATGAGTAAAACAGTGCTCAAATTGAAAATCAAAACCAGAATCCAGTTTAAAACCAAAAAATCATGTCGATGTTCGAAATGCAATCATTGCTAGAATAAGGTTGAATACGTATCAGTTTAAAGATATTTTTGCATATGTTGTGTGTTAATAAGTCAAACCAAAGTCAATGAGGAGTTCAATATTGCTGCAAGAGCGAAATAAAGATGTGAAATTAATAATTAATGTAATTTTTATTGTTTAAGAATAATGTACTGTTTTTATATAATGTTGCATTTTATTTAGTTTCTTTGTAGTTTAAATCATATCGTCTATTTTTATTTCATTCAATGTTGTGCTTTATTTCATGATCTGATATTTATCTATATTGTTTTTTCCATATGCTTACAAATAATGATAGCTTAAACATATAAAATGAACCATATACAACAAACATATATATCATATACATACATGTGTGTGTACCACGGAAATATACATAGACATATTTGGGAAATAAAATAATAAAGCATGTATAGAAAACCATTTACATTTATAATTAAAAGATAAAATACAATTTATTTATGTGCAATATTTAACTGAAGTATAGAAACTATACAAATATAAATAAATAATAGGCGATGAATTAATCATTTACACATGGTTATAGAAAATAATTTAAATACATGATTTACATATGATTATAAGAAATTGACGTATGTTCATTCACTATTGTTTTGGAAAATATAATTTAATACATTGAAAAATTAAAATAAATATAGGGGGCGGCTATCGCTTAAGATGGTTGGCCTATGTTGTATGGTGCAGAATGTTGGCCTACTAAAAGCCAACACGTCCAAAAGATAAGCGTAGCAGAGATGCGTATGCTGCGAGGGAGCTGCGGTCATACAAGAAGAGACCGAATTAGAAATGATGATATACGTAATAAACTTGGAGTAGCACCAATTGAGGAGAAGCTAATTCAACATCGCTTAAGATGGTTTGGACATCTTCAATGAAGGCCGTCCGAGGCGCCTGTACGTGCTGGAATTATATGGCGCGTTGAATGCTCAAAGAGAGGTAGAGGTCGACCAAGGTTGACATGGGAGGAAGTAGTAAAAAGAGATTTGAAGGATTGTGGTATATCCGAAGAGCTGGTGACGAATCGAAGCGAGTGGAAGTTAGCGATTCACGTACCAGAACCATGAGTGTTGAGTTCTATAAGTTTTAGATTATAAAATTGGGTCAAGAGCCTAAGGCGTAGGTTTGGTCTTTGACCAATATTACTGTTAGTATCATTATCGCTATTAGTATTAGTATTATCACTCCTCTTATATATATACATATATTTTTTACTTGGTTATTATTATTAATTTACTTATTTGACTTTATTTTATTATTGTTAGTATTATAACTTTTAAATTGGTTTTGTCATTTAGTTTTGGATTCCATCTCTAGCCAACCCCAACTTGTTTGGGAATAATGACTTAGTTGTTGTTGTTGTTGCTGTATAGGGGGTGGCTATCGAGATACAAAATAAAACACTAAATGAAGACACAATGAATGTTGGTGGTTGAATCTCATTAGAGGTTGAATTCAGTGGAAGATCTAATGGTTGATATTTCCTGTGTCACCAATTGTATCGTCTATTTGTATCCAAATAGATTTTTCCATAAATATAATTAGGGGTGACCAAATGGTTGGTTCGGTTTGAAACTTATAAAAAATGTTGAAATGAAAATAGTCATTTAAAAGTTAAAAAACCAAACCAAACCAAACCAAATCGTTATTTCCCAAAACTGAATCCATCCGAACAAAAAATATTTGGTTCGGTTAATTTAATTGGTTTTTCTTAAAATAAATTGGATTTTATCGTTTCTAATATAATATTGGATTGGAACAATTAATCGAGTCCGTACGATGCTATCATTTTGAAAAACGAACTCCTTTTCTGAAAATATTAATATGAATTTAAATAAAAATAATATAGTTTAGATTATAATGTAAATAATAACATTGACATTAGTAATTATGTTATTTTAAAATAACATAGATTTAAAATTTGATATAATTGATTGGTTCGGTTTTCAATATTTAAAAATCAAAACCGATTAATAAGCCGAATAAATACGGAAACAAATCCAAACTCAACCAATTAAGTAACAAAATCAAACCAAACCAACCAAACTTATTTGGTTTGGTTTGTTTATTTGGTTTGAATAAATGCTCACCCCTAAATATAATATCATCATTTACCAATGTCCTGGACATTGGATGAGTAATTGCTACAAGTTGTTACCTGGTAGCACTCAAAATATACCAATGTTGTGATGCTCTTACACCAAATAGTTATTATTAGCGGTAGTTTATAATTACAATAATCCACATCATTTTATGCTTGAGCAACAATTCACTCGGTATCCCATTAAATATATAAAGGATATCAGTTTTTTTTAAACAAGATACGCATTTGTCTCGATAATTACTGGTCAAAATTATAGATTTATCATAATATATTATACATTAAATCATTTATTGTTGTAATTAATGGTGTTTCCAGTACCGGCTAGTTAGGTATATGGGTGTAAATCGGTCGGACCGGACCGGACGGAGGTGTGTTCAGTTTCTGTCCTAAATGAAATCGGACCGGACACGGACCGGACGAGATTTATGATCGGACAAATTTTGTTGTCCTAATT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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020264290.1	2.6e-52	myb family transcription factor PHL7-like isoform X1
Swissprot	Q9SJW0.1	1.3e-40	Protein PHR1-LIKE 7
trEMBL	A0A5P1EYR5	1.8e-52	HTH myb-type domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT2G01060.1	59.76	5e-70	260		myb-like HTH transcriptional regulator family protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC7G01204	AT2G01060.1	251	81	6	6	238	2	250	59.76	5e-70	260
AfisC7G01204	AT2G01060.2	203	70	5	53	238	1	201	56.16	2e-48	189
AfisC7G01204	AT3G04450.1	217	104	4	12	218	232	442	44.70	4e-45	177

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00249.28	Myb_DNA-binding	Domain	20	71	39.4	4.3e-10
PF14379.3	Myb_CC_LHEQLE	Family	104	150	83.4	5.8e-24

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005515	F	protein binding
GO:0000719	P	photoreactive repair
GO:0003700	F	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0003913	F	DNA photolyase activity
GO:0005634	C	nucleus
GO:0006355	P	regulation of transcription, DNA-templated
GO:0007623	P	circadian rhythm
GO:0009536	C	plastid
GO:0009555	P	pollen development
GO:0009567	P	double fertilization forming a zygote and endosperm
GO:0009650	P	UV protection
GO:0010628	P	positive regulation of gene expression
GO:0016036	P	cellular response to phosphate starvation
GO:0043565	F	sequence-specific DNA binding
GO:0055063	P	sulfate ion homeostasis
GO:0071486	P	cellular response to high light intensity

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network