result

Gene information

Detail information of AfisC7G01225

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC7G01225	chr7	244573225	244576786	+

Sequences

CDS

>AfisC7G01225
ATGGATTCTATAAGTAATAGGTCTCGTGTTGAAAGTGGTAGAGGGTCAGACGCTGATTACGTTGAAATTGATCCAACTGGAAGGTATATCCGGAATGATGAAGTTCTAGGGAGAGGGGCATTCAAGACGGTCTACAAAGCATTTGATGAAATTGATGGGATTGAAGTTGCTTGGAATCAAGTGAAGATTGATGATATGCTGCAGTCTCCTGAGAATCTTGAGAGGCTGTATTCTGAAGTTCATCTGTTGAAATCTGTTAGACATGATAACATAATCAGATTTTATAATTCATGGGTGGATGACAAGAAAAAAACTATAAACATCATTACAGAGCTATTCACTTCTGGAAGTCTGAGACAGTATCGTATAAAGCATAAAAAAGTCGATTTGAAGGCTATAAAAAATTGGGCAAGGCAAATTCTTAGAGGCTTATCGTATCTTCATAGCCATGATCCTCCAATTCTTCACAGAGATTTGAAATGTGACAATATTTTTGTTAATGGAAATCACGGCAAGGTTAAGATTGGAGATTTAGGATTGGCCACAGTAATGCAACAGCCTAAAGCACATAGTGTTATTGGCACTCCGGAATTTATGGCTCCTGAACTTTATGAGGAAGAATATAATGAATTGGTTGATGTATATTCTTTTGGGATGTGCATGTTAGAAATGGCTACTTTTGAGTATCCGTATAGTGAATGCAAAAATGCTGCTCAAATTTATAAAAAAGTCACAAAAGGTGTAAAGCCTGCTGCACTTGCTAAAGTCACGGATCCTGAAGTAAAACAATTTATCGAAAAATGTTTAGTTCCTGCTTCAGAAAGATTATCTGCAAAAGAACTGCTAAAAGACCCATTTCTCCAATGCAGCAATGGAATTGTTACCGGTCCAAGTGAACAATGCAGTATTACACAAAATACTACATATTTGCAGAATTCACATATGGTTATAGACTCTAATTGTGGGCCGCTCAGCACCAGCACAGAAAATAGTTCTATGAACAAAAACTTACAAGTATCAGAATTTGAAAGGATTATTGGAAGCAATAAATTCAAATTGAAAGGAGACAGAGTCGAAGAAAACTGTATTCCACTCGTTATGACAATCACTTATCCTTCTGAAACTGGTGGGCAAGTAAGGAATGTTCATTTTAATTTTTACTTGGACTCTGATACGGCACTTTCCATTGGTAAAGAAATGGTTGAACATTTGGAGTTGCCTTATGACGAGGTTGTATTCGTAGCTGATTTTATCGATTCCGTAATAATGAAACTCGTTCCTGGTTGGAAACCTTCTACAAACCACACTTGTACTAGTGGAACGGTCAGCCCTTGTTACGAAAATGGTGAAAACAGTACATATGGGTTCTCATGGAATTCTTTACCATCATGTTTTGATAGTATAAGTCTTGACAACAATAACCACTCTCAGATGATGAATCATGTTGGGTCAGCCACAGAATTTGTGCCTGTAGAAAATAACACAGTCAAGAAGTTGGATGCGTTAATGGAGTCGAGTTCCTCACAAACGGATTACAAGTCTACTTCCAGTCATAGTGGAGAAGGTAAACATTCCAATGGATCGACTATGTCATTTCTGATGAGTGAGAGCTATAAAAGTTTTAGCGGATATACAACCGATGATTACAGTATTTTCGATTATGTTGGATTCAAAGATGGCATAGGTACCAATGAAAAAGATCAGAATGGATTGAAGGCTGAAATCGAAGCGATCGATGCTCAATACAAACACTTGTTCAGTGATTTGTTGAGAAAGCGGGAGGAGGATATGGAGAACGTTAAAAGAAAATGGTCGACAAAGAAGATTTAA

Protein

Gene

>AfisC7G01225
ATGGATTCTATAAGTAATAGGTCTCGTGTTGAAAGTGGTAGAGGGTCAGACGCTGATTACGTTGAAATTGATCCAACTGGAAGGTATATCCGGGTATGATTTCTTCCATTTTTAGCTGATACATTACATCGTCAAGTTTGCTGTCAATGCCAGAGTTGTATTTGCAGATTAATCAATTTTTAAGTCAGTACAAAAATGTAATTTCTGCTACTTATTATTTTTACCAGTTGTCTTGAAAGTTCATGACTCTGAGGTAGTATTTAAAAGAGCTGCGAATATTTCTTGTTATTATGTTCAATCTCAGATGTTTGTATAGATAGCTCATCAGTGTGTTTGGGTAGGTTCAAGTAAAATTGCTATGGAAGTGTACATTTTAGAGGACCCTATATAATATAATAACAAATTTAGAGAAAAGCAGCAATTGCACGTTTGCATACACAGTCCATAACTCACACGATGCTCCTTTTCGAGTTGCATCATACTTTGTGGAGCTGTGGTAGAAGATATGCTCATAAATCGTATGTTTCATGTACTTGTGTCAATTTAATTATTAATTTGAAATAAACATGTTATGTTGAAAAATAATTTCCACTAAAATGTAAATACCCTGTATTTCAATTTTCATGTCAATTATGACTTATTATGAAATATGATTTTTCTAAAGGGATCATTACATTACCTTATAACAATTAGGCTACAATCATCAACCCTTAATGGGATTGTTTATTCCATTTGTATGCATTCGTAGCCACTATCAAAGTTATCAAATAAGCAATGTTTATAGTCAAGTTTGAGTTAACAAGTCTGATCACCCAAACCTAATGTCATCTTTATTCATATTGGAGCACATGGTGAATTCATTTTGTGCATTTATCAACTCTTAGTGTGCACCAACTTTTCTTAATACCATGTTAGTACTATTCTCCACGATAAACATCAATCGCTAAACTCAAATAATGTGATTGCAGTTAGAAAATAAAACAGCCTTTTGAAGGTCAGTAAATACACGCATTAAGAACTTTGAAGAATTGGGCAATGTTGGTTTACATTGTAAAATACTGTGAACATTACAAATTTTTATTGACCATGGTGTGATGATAATTGATAACATCCAGCATTTATTAGAATTTCTATTTTTGTGGCAATTAGACACACATTTATTTATTGTTTTTATGATATATATACAGAATGATGAAGTTCTAGGGAGAGGGGCATTCAAGACGGTGTATGTTTTCTGAACTTACTGTACATTTTCTTATCATAAAATATTGCTTTATGATATTTTAATCAGTTATTTTTGCTTTGTGGTATCAAACCATTTATTTTGCTTCATGATATTTTAGTCATCTACTTGTGGCTTCATGATATTTTAGTCATCTACTTAAGGCTTCATGATATTTAATCACTATTTTTTTCATGATAAATTAATCTGTGTTTACATTTGTGCATCATTCTATTATATAGCTACAAAGCATTTGATGAAATTGATGGGATTGAAGTTGCTTGGAATCAAGTGAAGATTGATGATATGCTGCAGTCTCCTGAGAATCTTGAGAGGCTGTATTCTGAAGTTCATCTGTTGAAATCTGTTAGACATGATAACATAATCAGATTTTATAATTCATGGGTGGATGACAAGAAAAAAACTATAAACATCATTACAGAGCTATTCACTTCTGGAAGTCTGAGACAGTAATTTCCTCCTTTTTATCGTTTTGCTGTTCAAGTGTATGTATGCATCCATATAAGCTTTATGTTTGAACTGGTTGTATTTCAGGTATCGTATAAAGCATAAAAAAGTCGATTTGAAGGCTATAAAAAATTGGGCAAGGCAAATTCTTAGAGGCTTATCGTATCTTCATAGCCATGATCCTCCAATTCTTCACAGAGATTTGAAATGTGACAATATTTTTGTTAATGGAAATCACGGCAAGGTTAAGATTGGAGATTTAGGATTGGCCACAGTAATGCAACAGCCTAAAGCACATAGTGTTATTGGTAAATTACCATAATCGCTCGTTATTTAAAAATTTTACTATCCAAAATTTATGGATAAACATGTGATATCAGTTAATTGTTAGGCACTCCGGAATTTATGGCTCCTGAACTTTATGAGGAAGAATATAATGAATTGGTTGATGTATATTCTTTTGGGATGTGCATGTTAGAAATGGCTACTTTTGAGTATCCGTATAGTGAATGCAAAAATGCTGCTCAAATTTATAAAAAAGTCACAAAAGTAAGTGTTATTATTTTTTAATCTTTTTCAACCAGTTTTAGTTGCACAAGTAAATTCAGTCATTGTCGCAAAATTCTAGGGTGTAAAGCCTGCTGCACTTGCTAAAGTCACGGATCCTGAAGTAAAACAATTTATCGAAAAATGTTTAGTTCCTGCTTCAGAAAGATTATCTGCAAAAGAACTGCTAAAAGACCCATTTCTCCAATGCAGCAATGGAATTGTTACCGGTCCAAGTGAACAATGCAGTATTACACAAAATACTACATATTTGCAGAATTCACATATGGTTATAGACTCTAATTGTGGGCCGCTCAGCACCAGCACAGAAAATAGTTCTATGAACAAAAACTTACAAGTATCAGAATTTGAAAGGATTATTGGAAGCAATAAATTCAAATTGAAAGGAGACAGAGTCGAAGAAAACTGTATTCCACTCGTTATGACAATCACTTATCCTTCTGGTGAGTTCGAGATTTACAAAATGTATAAAAATTGTAATGTTATTTATGTTTTACTGTTTGCTTGCAGAAACTGGTGGGCAAGTAAGGAATGTTCATTTTAATTTTTACTTGGACTCTGATACGGCACTTTCCATTGGTAAAGAAATGGTTGAACATTTGGAGTTGCCTTATGACGAGGTTGTATTCGTAGCTGATTTTATCGATTCCGTAATAATGAAACTCGTTCCTGGTTGGAAACCTTCTACAAACCACACTTGTACTAGTGGAACGGTCAGCCCTTGTTACGAAAATGGTGAAAACAGTACATATGGGTTCTCATGGAATTCTTTACCATCATGTTTTGATAGTATAAGTCTTGACAACAATAACCACTCTCAGATGATGAATCATGTTGGGTCAGCCACAGAATTTGTGCCTGTAGAAAATAACACAGTCAAGAAGTTGGATGCGTTAATGGAGTCGAGTTCCTCACAAACGGATTACAAGTCTACTTCCAGTCATAGTGGAGAAGGTAAACATTCCAATGGATCGACTATGTCATTTCTGATGAGTGAGAGCTATAAAAGTTTTAGCGGATATACAACCGATGATTACAGTATTTTCGATTATGTTGGATTCAAAGATGGCATAGGTACCAATGGTAAGGTTTCATTTAAAGAAAATATTATGCATCAAGTCTAATTAGCATAAAATAATCATTTGTTGTCACCTTTTCATTCATGTAGAAAAAGATCAGAATGGATTGAAGGCTGAAATCGAAGCGATCGATGCTCAATACAAACACTTGTTCAGTGATTTGTTGAGAAAGCGGGAGGAGGATATGGAGAACGTTAAAAGAAAATGGTCGACAAAGAAGATTTAA

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020249669.1	2.3e-208	serine/threonine-protein kinase WNK8-like
Swissprot	Q6EU49.1	7.3e-159	Protein kinase with no lysine 4
trEMBL	A0A1R3L7N0	1.7e-208	non-specific serine/threonine protein kinase

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT3G18750.1	60.28	8e-153	537	ATWNK6;WNK6;ZIK5	with no lysine (K) kinase 6

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC7G01225	AT3G18750.3	433	145	5	17	430	15	439	60.28	8e-153	537
AfisC7G01225	AT3G18750.1	433	145	5	17	430	15	439	60.28	8e-153	537
AfisC7G01225	AT1G49160.2	431	149	4	17	430	15	438	59.86	4e-152	535

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00069.22	Pkinase	Domain	32	287	186.1	6.7e-55

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0000166	F	nucleotide binding
GO:0003700	F	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0005829	C	cytosol
GO:0004674	F	protein serine/threonine kinase activity
GO:0035556	P	intracellular signal transduction
GO:0005634	C	nucleus
GO:0006355	P	regulation of transcription, DNA-templated
GO:0007623	P	circadian rhythm
GO:0042802	F	identical protein binding
GO:0009911	P	positive regulation of flower development
GO:0046777	P	protein autophosphorylation
GO:0048573	P	photoperiodism, flowering

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K08867	WNK, PRKWNK; WNK lysine deficient protein kinase	EC:2.7.11.1	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network