result

Gene information

Detail information of AfisC7G01331

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC7G01331	chr7	269697998	269701906	-

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC7G01331
ATGGCAAAACACAAAGTTAAAACTTTGATTTACTCAAGTACTTGTGTAACATATGGGGAACCTGATAAGATGACAATTACCGAAGATACTCCTCAGGCTAGTCTTTTAAGGAATAGTAACAAGAATTTGTATGAGAGAAGTTGCTAAAATGTTAAATTATGATTTCATATAATGATATGTAATTGACTTATACAGGTACCTATCAATCTGTATGGTAAGGCAAAGAAAATGTCCGAGGATATAATTTTGGATTTTTCGAAGAGATCAAACATTGCTGTCATGATTTTAAGATGCCTACAATAGTAACCAGTATAGTAGAGTTGTAATAATGTGAAATACACTATTACAGTAACTAATGTTAGAATCCTATCAATTTACCTTTAGGTATTTCAATGTAATTGGATCAGATCTAGAAGGATTGCTAGGCGAATCACCTAAACCTGAACTGAGGGAGCATGGGCGTACATTAGGTGCTTGCTTTGATGCAACATTAGGAATCATTCTAGGCCTAAAGGTAAATTATGCAAAGGTAGCAAAGTTGGATTTATGATCAAATGCTATAATACTGTTTTTTGTTGTATTTTTGGTTAAAGGAACATATTATGAAACAAGTGATGGAACTTGTATCAGAGATTATATTAACGTTGCAGATTTGGTTGATGCACACGTTAAAGCTCTTGCCAAAGCTAAGCCTAACTGAGCTGGAATCTGTAACGTTCAAACTGGTCAAGGTTTTTATTTGTCTGTCATTATTAATCATGTTTCATTTTAACATAGGAGCGAAAACTGTTACAATTTTGAGTCCTATTAAAGAATAATTTAGGAAATATTTATCATGTTCATAATTAAAAATGGAGGGTAGAAGAGTGGGGACACTGGAATTTAACATTCTCTTGGATAAAGAGATAGTAAAAGTTGGAGTCCTGTTAATCGTCTTTTTTGATCCTATATCGTATTTTTTTCAAGTACAGAAAAGGCGAATATATGACATTACAAATGTTTTAGAAGGAATTGGACTGATAGAAAAGACACTCAAGAATAGAATACGTTGGAAGTAAGATGTTATCACTTACCAGTTACTTCCAGTCTTATACTAAGAACTATGTAGCCTGTACTTAGATCCTCCTCCATTTATCTCTTTGAATGATAACTTTTGAGCTTGAACATGATATCTAACAAAGTTAATTAATTTTTATAAAATTAATTAAGTTTTATAATAATTAACTAACTAACTAAGTTTATTAAAATGAAATAAGTTATAAAGTTTCTAAGTTTCATAAAAATTAACAAGTTTATAACAATCGACGTGCAATTATTGAGTAAAGTATTTAAAATAAAATATAACATTAACAAAGTTATCTAAGTTTTATAAAAATTAAATAAATTTAAAATTAACCTAATTTATAAGAAATAACTAATTCTTATAGAAGTTAACTAAGTTTTATAGAAATTAAGTAAGTTTAAGTTTTCAAAATAAACTATATTTATAAAAATTACAAAGTTAATAAAATTTAACTAAGTTTTATAAAAGTTGACCAAGTTTTATAAACATCCGATTAAATTAATTAAGTTTGTAAAATTTAACCAAGTTTTATAAAATGCTAACTATGTTTTATAAAAATTTAATTAATTTTTGTAAAATTAAACTAAGTTAGATAAATTATAAAAATTAATTAGGTTAACCAAGTTTTATAAAAGGTAAATAATTTTCTACCTTTAGAAAACTAAAAATAAATTTATAAAAATTAACTAAGTTGTATAAAAATTTAGATAAGTTAAACAAGTTGTATATAAATTAAATAATTATCTAAATATTGACAAAAATTTGTAAAAGGTAAGAAAATTTATAAAATAATAACTAAGTTTATAAAAATTTAACAAATTTATCAAAGTTTTATAAAAATTAAATAAATTTATAAAAATCAACCTAATTTATAAAAATTAACTAATTTCTATAGAAGTTAACTAAGTTTTATACAAATTAAGCAAGTCTATAAAAAATAACTAAGTTTATAAACTTTAATTAAGTTTTTAAATTAAGTTTATAAAAATAAAAAGTTAATAAAATTTAACTAATTATTATAAAATTTAACCAAGTTTTATAAACATCCGACTAAATTAATTAAATTTGTAAAATTTGTCCAAATTTGATAAAAAAAAATTAATTGTGTTTTATAAAAGTTTAACTAAATTAACAAAGTTTCTATAGAATTTATTAAGTACCATGAAGATTTTGCTAAGTTAATTAAGTTGCCAAAAATTAAACTGGTATTACAGAAATAAATCAAGTTTTATAAAAATTAAATAAGTTTTAAAAAATTAATGGTATATGTACTCATTTAAATACAATAGTGGTAATTGAATAAGTTCATAAACATCATATATTGTTGTTCAAAAGTGTCACTTTATATGCATATTTTTCATGAATCATGTTTATTACGACTAATTATTGAACTTTTTCTTTAGAGGTAACTAATACATTTGGTGCTAGCAAGTAGCAACAAGGTGATTTGAAGTAATATATATATGTGTATCTTTAGTGTTTGAATACTTCTATGTATCATTTTAGTAAATTTGCTTGCGTATAATATTAGTTTTGTTTACTTGCATTCATAATCTTGATACGTAGTTATGAAATATAATGAACACATGTTGTTTTGGTATAATTTTATTTGTTTACATATAACGTATTGGTAATCAAATGTGATCTTAGTGATATTTAAATTCGTTATACATATATGCGTTGAAACGTCAAAAAGAGGCACAAAAAATCTTAAGCAATAAGATGATAGCATAAAAAAATGCTATAAAAGGCTATAATAGCGTTTTTAAAGCGGTAGAATATACAACTGTTGATAGCAGTCCAAAAATGCTATGTTAAGAGTTTTGATAGCGTTGGTAAAACGTTATTGTTAGGAACTTTTTATAGCTTTTTGTTCTTGCTGTCTAATAACCCTTCCTATTTATAACATGTTTTTTTACAGTGTGTGCAAAAACGCCATTAAAACAATTTACAGCAATTTCCAAACGCTATTAAAAGAACTCATTTATAGCATTTTTGTTGTTCCTAGCGTAGGTCACAGACATATAACAACATGTTGGTATAGAGCGTTTATAAAAACGCTGTAAAAGCCTTTAATAGCGTTTTTTTAATGCTAAAAGTCCAAATTGTTGTAGTGAATCCAATTTGCGTTGCGAGTTTATTTTTGTAATCTTAACATGAAAAGAGCACTTTTCTCATGTAAATATAAATAGTCTACTACTGTAAAAATTTCTTGGCTGATCATGATCTTAGGGTTCATGTAAAATACTAGTGTAGAGTAAATTTTATTTAGTGTCATAGTTTGTAAACATGTTTTCCTCGTGCAGTTTCCAACTACTTTATTTGTATGATTTATGCTTGTGTAGTCTAACATTTGTGCAACACTTAAAAAAATAGTATTAGCAGTAATAATAAATAAATAAATAAAAAGATTCCAAAAACAATTTCAAACTAACTTGCATATTTTATGTGAGACATGTCTCATATACATTTTCATATTTGGAAAACTTAACTGTATAAAATAGATATGTAACACGTGTTTTTGCATAAGTTTATATTGTCTGTTAATACGTAAAGTTTGCCAGCTATGACTTAAATTTGATTTTAGTTTTCTGAATTGCAGTAAATGGCATTGTTGAGCAACTCATCTTTGTGTTATGCAGACATTGCAGTTTTCTTATTTGGGCTAGTATAGTTTACAAGAAGTTAATAGTTCTTCAAATGCACATTTTGATTTGAAATCATGTATGTTGTAGCTATATAGCACAAATATTTGAATTTTCTAATTGATTATAAGCATAGTTCTGAAGGTGAACCGTGGAAAAAAAGGGGCCGCTGTTGCAAATCAGGAGCACATAAAAAAATAA

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020256217.1	6.4e-24	probable UDP-arabinose 4-epimerase 2
Swissprot	Q8H930.2	5.7e-25	UDP-galactose 4-epimerase-like protein 1
trEMBL	A0A5P1F9L8	4.6e-24	NAD(P)-bd_dom domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT1G30620.1	56.07	1e-26	116	HSR8;MUR4;UXE1	NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC7G01331	AT1G30620.2	107	28	2	1	88	183	289	56.07	1e-26	116
AfisC7G01331	AT1G30620.1	107	28	2	1	88	183	289	56.07	1e-26	116
AfisC7G01331	AT1G30620.3	107	28	2	1	88	182	288	56.07	1e-26	115

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF02319.17	E2F_TDP	Domain	120	162	51.5	7.1e-14

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0000083	P	regulation of transcription involved in G1/S transition of mitotic cell cycle
GO:0000122	P	negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0000790	C	nuclear chromatin
GO:0000978	F	RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific DNA binding
GO:0001077	F	transcriptional activator activity, RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific binding
GO:0002064	P	epithelial cell development
GO:0003714	F	transcription corepressor activity
GO:0005667	C	transcription factor complex
GO:0005794	C	Golgi apparatus
GO:0006884	P	cell volume homeostasis
GO:0006977	P	DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest
GO:0046983	F	protein dimerization activity
GO:0009887	P	organ morphogenesis
GO:0008015	P	blood circulation
GO:0008134	F	transcription factor binding
GO:0009225	P	nucleotide-sugar metabolic process
GO:0009832	P	plant-type cell wall biogenesis
GO:0019567	P	arabinose biosynthetic process
GO:0019904	F	protein domain specific binding
GO:0042127	P	regulation of cell proliferation
GO:0044458	P	motile cilium assembly
GO:0045944	P	positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0050373	F	UDP-arabinose 4-epimerase activity
GO:0071339	C	MLL1 complex
GO:0098534	P	centriole assembly
GO:1903251	P	multi-ciliated epithelial cell differentiation
GO:1990841	F	promoter-specific chromatin binding

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network