result

Gene information

Detail information of AfisC7G02477

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC7G02477	chr7	496750283	496776070	+

Sequences

CDS

>AfisC7G02477
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Protein

Gene

>AfisC7G02477
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020247099.1	6.9e-256	lysine-specific demethylase JMJ25-like isoform X1
Swissprot	Q9SSE9.1	3.6e-185	Protein JUMONJI 25
trEMBL	A0A059AW35	2.3e-229	JmjC domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT1G11950.1	47.57	0.0	671		Transcription factor jumonji (jmjC) domain-containing protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	bit score
AfisC7G02477	AT1G11950.1	740	323	10	66	799	193	873	47.57	671
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Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

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PF02373.19	JmjC	Domain	641	746	56.7	2.6e-15

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0000976	F	transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
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GO:0031490	F	chromatin DNA binding
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GO:0032776	P	DNA methylation on cytosine
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GO:0046293	P	formaldehyde biosynthetic process
GO:0048366	P	leaf development
GO:0050681	F	androgen receptor binding
GO:0051573	P	negative regulation of histone H3-K9 methylation
GO:0060969	P	negative regulation of gene silencing
GO:0070919	P	production of siRNA involved in chromatin silencing by small RNA
GO:0080188	P	RNA-directed DNA methylation
GO:2000036	P	regulation of stem cell population maintenance
GO:2000736	P	regulation of stem cell differentiation

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K15601	KDM3; [histone H3]-dimethyl-L-lysine9 demethylase	EC:1.14.11.65	Thermogenesis	ko04714

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network