result

Gene information

Detail information of AfisC7G02613

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC7G02613	chr7	522518165	522539080	+

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC7G02613
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020251948.1	1.1e-41	myb family transcription factor EFM-like
Swissprot	Q9FPE8.1	9.6e-32	Protein HRS1 HOMOLOG 3
trEMBL	A0A5P1FV78	7.6e-42	HTH myb-type domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT1G25550.1	41.34	5e-43	171		myb-like transcription factor family protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC7G02613	AT1G25550.1	254	116	7	2	225	20	270	41.34	5e-43	171
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Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g158367.t1
Allium fistulosum	AfisC7G02613
Allium sativum
Arabidopsis thaliana
Oryza sativa

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
-	-	-	-	-	-	-

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0000160	P	phosphorelay signal transduction system
GO:0003700	F	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0005634	C	nucleus
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GO:0031667	P	response to nutrient levels
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GO:0043565	F	sequence-specific DNA binding
GO:0044444	C	cytoplasmic part
GO:0048519	P	negative regulation of biological process
GO:0048576	P	positive regulation of short-day photoperiodism, flowering
GO:0099402	P	plant organ development

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network