result

Gene information

Detail information of AfisC7G02623

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC7G02623	chr7	523924319	523935016	+

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC7G02623
AGCTATTCAACATTCCTAGCTTTGTAGCCTCACATTTTTATTTTTTGAAAAACCGAAACCCTAACCCTGATTCCCAATTCAATCGTCTCCATCCCGTATCACAATCTCAAAGCTATATCGATTCTTTATCATCTAATTCAAGCGGAAGGTCTGTTACCTAACCTAAATCATAAATAACTTGTTTTGATCTAGCAATTCATTCACGAATTTTATGGGCAAAAAGCATTTTCTTGTTAAACACCTGCTATGTTAAAAATCCATTGGATTTATTGAGTCGTGTTTTGTAATATTTTGTTCTGATCAGTTTTTATGTTTATAGGGATTTTTCTTAGTTCAACGATTCAGTCTGAATAATTTTGATAACGATTGTGCATATGGTCAACATAGTTTAATTTCTTGTTTATTGCATGTGTTTTTGGTCATTGAATATTAGCGCTTAAGTTTGCACTATCCGATTGCTAGTTTTTCAAGTTTCAGAGTTCATTGTTGTTATAAGTAGAATCAATCATCTGCATCACTTCACTTGAATAGTATTTAAATTTGGGTACGCCACACTCAATAACCAAAATTTATCATATTGATTCATTCAACACAATATACAACTGAGGAATAAAATGTTTATAGCTTATGAAAATGACTGGTTTTGATTATTTTGTAGCATGTTTGATTGATGCAGAGGCAATTAAAGTTGCTTTTCTATCATTGTCAAAACAGTGGTGTATATACGAAAAATGTTAAATATTTCTTATGGAGCTTAATATTATCAAGTTTTTATCAAATTTCCTTATTTTTTTTGTTTTCGAATAAATCAAAACTAATTGATTATTCATGTTTCGTGTATATTATTATTTTGGCTTAAATATGCATAAAGTTGTAGCATATTTGTGTGCATGCATAAATAATCAGTGAGAAGCGTGTGGCATGCATCTTAAGAGCTAACAAGCAGGTATTTTGCACACATGCAACAGGAAAATTACTATTAATGTTTATATGCACATAGCACTTATAGGCTGTAACTTTTAACATGTAAGCTTTCATCTTGTTAATATAATAATTATTTTCTAATTTATATATTATTTTAAGATACTTTTCAGGGTGTTTCTTTATGGGTGCTCCCAAACTAAAATGGACTGCAGAAGAGGAGTATGCGCTCAAAGATGGAATAAAAAAACATGGTGCTGGTAAATGGCGAACAATCTTGAAAGATCCGGAATTTAGCAGCATCTTAAGTTCCCGTTCCAATGTTGATCTTAAGGCATGAATATTTTTGCATGTTGTATCGAGTGCATGCCTTTTATATATTGCCAAATGCATAACTTCAACGCTGTCCATACAACAACAGGATAAATGGAGGAATATGTGTGTGGTAGTGAATGGATGTGGATCAAGAGAGAAGTCTAGGGCAGCCGTGAGAAAGAATCGAAATTCAAGCAACGAAGATAATTCGATGGCTCTTAGCAATGAATATGCATATAATTCTGATGAGATTGCCGATGTGAAGCAGCTTGCAGTGTCAAATGTTACACCTATGCCTAACAGAACTCATGAAAAGTTAGTCCAGTTATTGTAATGAGAGCTAATATGATTTTTTTTCTGTGTTGTTTATATGCAACAGACTTTCAGATGTGAATCTGATTTGTTCATTGTTAGATTTTTCTATTAAACTTGAATCTTTTAAATTATCCAGGGCTAGGCTGGATATTCTTATATTGGAAGCAATAAATAACATGAAGGAACCAGCTGGTTCTGATAAGTCTTCTATTGCTAAGTATATAGATGTGAGAATTGATTTTGTGCAATTTTTTGTTGATCTTTAATAGGTTAATTGTCTCGTGTTCTATTATCACCCACATATGTGCAATTGTGGATTGGCTAGTTTAGTTGTATTTTCTGACACCATCTGCCTTGTGACAAATAGACACCATCATATCTTACTCAGTTCTTCCTTCACTTATACCGAATTTGGGCAGCAATTTTAGATGTGCTTTCAGATAATAAATTTGTTATAACTAGACTATCAATGTTTGAGGTTTTTGATCTTATCAAAAGTATCTGAATGATTTATCCTTTGTTTAAGAAACCAGCTTTTGTTTTTTCACCAGTGTTCTAAAGAAATAAACCTCAGTAATCATTGTTTAGTACATAAGAATCTTTCAGTGCATTCAGTTTGTTTTTATGAAAAAATAAATCTATGATGTGCTGGTGTTGCTATAAGTGTAATTTATAATTATTGTGCGTGCTATCACAGTTTTCTTTTTTTACAATTTTCTGTGTAGGACCAATATGAGGCTCCTCCGAATTTCAATCAGATACTTTCTGGGAAACTGAAAAGGATGACTGAAAGCAGAAAACTGATTAAGGTAATTTTTCCTGACGTAACCATTCCATAATTATATTGATGTTAGCAAGAAGAAACAGATAAAAATTTCTACTAAATTAATTGCTTTACCATGTTAAAAGTTTGTGCATTTATCCAACATAAACCCCTGGGATATCACCTTTGACCCGAGTCTGTTGTTTGTTAGGTTTCCTAGCAACAATATAAATTGATACTCTAACCAACAACAAACTAGTAAGAGTTTACATGGCAGATAAAAATATCAAACGAAGCCCATAAAGTCAGCGAAATGTGTAACAAATGTGTGTATGCAATGCTGAAGCTGCTCTATTTTGAATGTATTAGACACGATTTTGGAGTATGATTGACAATAAATTACTAATTGAAGAGGATATCGAAACCTTCTTTTATATAAGTTTAACGTTGTCATCCAAATTTCTTACAATTTGCAGTTACGTTTAATTATTCCAATTAATCCTCAAAATATATCTCTTGTCACATGTTTATGAGAAATAGTTATGTAGTTTTTCCTTTCAGAGTATTGTAAATTCTTTTTTAACTTTCCCATTAAGAGCTGACTTGATATTCCCCTTCCTCCTTTCTTTTCCTCCTAATATAATCCATTGGATTAATGTGATCAATGACCATGTCATCATTATTTATATATATTCAACTATAATTTGCATTTATTCAATGGATTATGTCACGGAGCTAATGGGAGCTGGATTATGTATGTATGTGCATATATATTACTCATATGTAAGTGAACCATTGCATGTTTTGCTTCTAAAATATTAAAAAAAAAAACCGCTAACAATCCCTAGCTTCATTGCCCATCCATTTTTACATTTCAACTTCACTATTCTACTAACAAAATCTGATTTTTTTAGACATATCAGTTACAATATAGTTGTATTAAGATATCAAAAGATCAAATTTTGTTGGATGTTCATTAAGATATTGCATTTTTGTACTTCTATCTTTTCAAAATTCCTAAAGCTCTACTAGTTAACCTTCGTGGTGACGGTAATTTCATTGCCTTCTTTTTACAGGTGAAACAAAAATATAGGATAGCACCAAGCCCAGATTTTTCACAAGGAAGAAATGCCAACTCGTCACTCACTGAAAGGCTTGCTAGAGATCCCATTCGAATAAAGAGAGAAAATATGAAATATATTGATAAACCTCAAGTTGATTCCGACTTAGCACGGATCAGAAATATGAATGTAGAAGAGGCAGCAGCATCTGCTGCCAGGTTTGTTGCAGAAGCTGAAATAGCCATGGCTGAAGCTGAAGAAGCTACAAGGGAGGCTGAAATTGCAGAAGCTGATGCGGAAGAAGCTAAGGCTTTTGTTCAGGCACTTGAAAAGCGAAGCGCAGCTAATAAGGTACAATTTCCGAGTTTGCAATAAATATTTGTGTTAATTTCCTTACTTCCCTACTTACAATAGCTTGCTCATTGGTGCTTAATATATTTGCACTTGCACTCACAGATGAAATTTTCATTAGATATGATCCTTTTGTTATTTGGCTTTTTGTTTTGACTCTCTACCGTCTTCTTTTAGATGTTTTGGGGATAATGCTACGTATTCCCAACTTAAATCAGAAGAAAATTTCTGTTTCCATGTTTGTGGTCTTGGGATATGTTTTCTTTGGTAAAATGTGGGTTTGTTTTTCTTGGAAAATTATTGAACATGGTGATCTTTTTGCTAAAATCAGAAACTCAGGCAGAAAAACTTACAAAGCAATATATATCTACATAATGAAGGAAAGAGAACACCATAACATCTCTATCTACATAATGGCCGAAGGTTTTTCTACCTTAGAATTTTTATTAAATATGTCATGTATTTGTCTTTTTTTTTTCATAAATGCCAAAAGCTTTTGTAAGAACGAGGCCTAATGGTAAGCTCTTCGCTCGTACAAAACAAAATAATTAGTACATTGAGTGCATATTCATCCATAGAATGCAAAATAAGTAATGCAAATGATATGCACTTTGCGTATGAAAGACAATAAATAGTATAAAACTCCACACGTGAAATATAAAAGGTTATAATTTAAAATTCAAAAGCTTAAATGTCAGTTTTGGACATCTTAACAATAATTCAATATATGTAAAACTTATAGAGAGTTTATCATAACCAATATAAGGGTTCAACACGTATCAAGTATCATTTTAACAATTGTGATTTCTTCTTCTTTTTCGGATTACGCATTAATGTTAATAGCAAAAAAAATATGCATGGAGAAGTTGAAAACCTTATTTTGATGTAATTTACAGTGCTAATCAGACTACTTGACTTAACAATTTTTATTAATTTTATTAGATTTAGTTCATAGTTTGTCATTTTTTACTTATCTTATAATCAAAAACTAATTTGATTGGAAATTGTTTATTGATGAAACTGAAAGATAGTTAATATTTTTTATTAGGTTGTGAAATGAGTACTTTTGACACATGCATTGCAAGTGCTTGTAAAATGTTACCTTTAAAAAAATTTACTCGAGCATTGCAAGTGCTTAATAATATTCCAAACTTCACAAATAATAATAAAGACAGTGAGCAGGATTCGAACTCATGACCTACCTCATGGTCCTCATCTCTATAAAGTAAGGGTATTATTATTGCAAGTTCACGGTCGGACTAAAAGTTTGTGTT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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	ONK81569.1	2.8e-71	uncharacterized protein A4U43_C01F30650
Swissprot	Q8VWK4.1	9.5e-56	MYB transcription factor
trEMBL	A0A5P1FWD7	2.0e-71	MYB transcription factor

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT1G49950.1	48.97	4e-58	221	ATTRB1;TRB1	telomere repeat binding factor 1

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC7G02623	AT1G49950.1	243	116	5	1	238	1	240	48.97	4e-58	221
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AfisC7G02623	AT1G49950.3	243	116	5	1	238	1	240	48.97	4e-58	221

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00249.28	Myb_DNA-binding	Domain	5	55	33.2	4e-08
PF00538.16	Linker_histone	Domain	125	180	36.1	5.4e-09

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0051276	P	chromosome organization
GO:0000781	C	chromosome, telomeric region
GO:0000785	C	chromatin
GO:0003691	F	double-stranded telomeric DNA binding
GO:0005730	C	nucleolus
GO:0006357	P	regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0009651	P	response to salt stress
GO:0009723	P	response to ethylene
GO:0009733	P	response to auxin
GO:0009737	P	response to abscisic acid
GO:0009739	P	response to gibberellin
GO:0009751	P	response to salicylic acid
GO:0009753	P	response to jasmonic acid
GO:0046686	P	response to cadmium ion
GO:0033613	F	activating transcription factor binding
GO:0042803	F	protein homodimerization activity
GO:0043047	F	single-stranded telomeric DNA binding
GO:0070491	F	repressing transcription factor binding
GO:1990841	F	promoter-specific chromatin binding

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network