result

Gene information

Detail information of AfisC7G02744

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC7G02744	chr7	539420194	539430379	-

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC7G02744
ATGGGTAACAGGAATGTCCTCCCATCATCCAACCAACCTATCTCTGACCCCGATTCTAAATCAAATTCAAATTCAGATTTAAATTTGACCAGCACTAATAGTAATGATTCCGCCGCCTCCTCAAAGACAGAATCGCGACCTTCTCCTTCTCCTCAACAGCAGAAGCAACAAATAGGGCGCATCCTGAAGAAACCCATGGCCGACGTCCGCTCCTTGTACACCTTCGGTCGTGAGCTGGGACGTGGTCAATTCGGCGTCACTTATCTGGTGACGGACAAGAAAACCAAAGAGCAGCTCGCTTGCAAGTCCATTCCGACCCGCAAACTAATCAATCGCGACGACATCGAAGACGTCCGCCGCGAGGTCCAGATCATGCATCACCTCACCGGTCACCGCAACATCGTGGAGCTCAAAGGCGTTTTTGAGGACAGGTACTCCGTCAACCTCGTCATGGAGCTATGTGAAGGCGGAGAGCTTTTTGATAGGATTATAGCCAAAGGGCATTACTCTGAGAGAGCTGCTGCCGCGCTCTGTAGGGAGATCGTTTCTGCAATCCATAGCTGTCATTCTATGGGCGTAATGCACCGTGATTTGAAGCCTGAGAATTTCTTGTTCTTGAATCAGGAAGAGAATTCTCCTCTCAAAGCTACTGACTTCGGCCTGTCTGTCTTCTACAAGCCTGGTACGTACACATGTTTATTTCATCTTGATCATTAATTTATATAGCAGCGGAAGAAGTTGGAATTTAAGATGAAAAATTAGAAAGATCTGCAGTAGGTACTACTGATTGAATACTGACGATGATGATGAGCAGGACAAGTATTCAGTGATGTGGTTGGAAGTGCATATTACGTGTCGCCCGAAGTGCTGAAGAGGAACTATGGGTTGGAGGCTGATATTTGGAGCGCTGGAGTTATACTTTACATTCTGCTGTCAGGTGTCCCTCCTTTTTGGGCGGATAATGAGCAGGGAATCTTCGATGCTGTTTTAAGAGGGCACGTCGATTTTTCCTCAGATCCCTGGCCTTCCATTTCTAGTGGTGCAAAAGAGTTGGTTAAGAAGATGCTTAGACAAGATCCTAAAGAGAGGCTCACTGCTGTTGAGATTTTAAGTGAGTACTCTTGTTTTATTATTGTTCATAATGGGCAATGTTCTACATGAGTGGTAGCAGTAATGATTCATTAATATTCTGCACTTGCTGCTGTTTAGATCATCCTTGGATTAGAGAAGATGGAATTGCATCAGATAAACCTATTGATATTGCTGTTCTATCAAGAATGAAGCAGTTCAGAGCAATGAACAAGCTTAAGAAAGTTGCTTTGAAGGTGACATTTATTGTTTTCTTCAATACAAATCCTCACCTAACTTGTAATTGTTTAGCTTCCACCACTGATAGGTGATTGCTGAAAATCTATCTGAAGAGGAAATTGTGGGTTTGAAAGAAATGTTCAGATCTATGGACACTGATAATAGCGGCACTATAACCTTTGAAGAACTCAAAGCTGGTCTACCTAAGTTAGGCACCAAGCTTTCAGAATCTGAAGTCAGGCAGTATATGGAAGCGGTATCATTTCCAAAGTAGCAAATTTACAATTTGTTTTCAGCAATTTTCCTCTCTTCTGCTACTTTTAGCACAGTTTATGGCCAAAGCTTTAGTAATTGTTTACATAGCCTTCATCTATCTCGCTTGTTTGAATAGATAACCAAATATATATTTATATTTCCAGGTTAAACTAATAGACCGATTAAATTCTGCTGGATCCCTCCAATCTTTAGTCAGTGCCATCCAAATAATTTCACTGGAATCAAACTGTGATTTAATTAATCATTTCACCTAACGTGTAGAATCATTGGATAATTTTTTGCCATAAATGCTTTCGTCATGGGACTTTAATAGAGCAAAGTCGATCATCATTAGAAACTTTCTTAGTTTTATGTTGTGGTAACTTTGACATTAGAAAGTTGACCATAAATAAATAAACATGGTGCTCAGTAATATTGCTTAACCAGGAAGCCTATATTCTACTTGTCGGCAATTGGTTATTGTCATTGTGGTCATATATGCATTATCATGTCAAATATATTGTGCGACTGCTTACAGGCTGATGTAGATGGAAATGGGACCATTGATTACATTGAATTCATAACGGCTACCATGCATATGAATAAATTGGAGAAAGAAGATCATTTATTTAAGGCTTTTGAATATTTTGACAAGGACAATAGCGGGTAACTATTCTATTCATCAAAAATTTCTTCGGTTCCTTCTCTTCTTAAAATTTACAGTTTTAGTGATTGTTGTTTGTACATATGTTCTTTGCTCAGCTACATAACAGTGGAGGAACTGGAGAATGCATTGACCAAGTATAATATGGGTGATGCGAGGACAATAAAAGAAATTATTGCAGAAGTTGACACTGATCATGTAAGCTACTCTCACTTTGTTTACTTATCCAATTTTAGGAATTATTTGCTGTGGTTGTCATTCTTTGAGTCTGAAAACGGCACCAATATCTATTGCTTAAACTTCTAAAAACCAAGAATGCTTGTGTGACATCACATGTTTTCTCAATTTTTTATTTCTAGCCCTCTTATTAATTCACTTTACTTATCCAGTTTTCAGAATTACTTGCTATGATTGTCATTCTTTGAGTCTGAAATCAGCACTAATATCTATTGCTTAAACTTAGAAAAACCAAGAATGCTTACGTGACCTCGCTTGTTTTCTCAAATTTTTATTTCTTGCCCTCTCTTAATGCTTTCTTATCAATTTTTTTTTAATTTCTCTCTCAATTAATCTATTATCAAAATAACCTATAGATTTTCACATTTTTTTAAAATTTGAATCTCTAACAATTTCCAGAATAATAAATTTGTTCATGAAAAAGAACATTTCACATATATAAACTCTACAAATAGCTAATTTTAAAGTTTAGAAAACCTCCATTTTTCCGGAAACAATTTTTTAAATCACAAGAAAATTAACAAGAGAACAAAAATTCATATATTAATGTTGAAGATATGCGACACAATATTTGTTTTATATATTAGCTAATTTGTTGGTTGACTAATTAACTATCGAAAATATTAGATTTGACTTAGTAAGAGATATTTGTGCATGTAATCTCTCAAATATCTTCATTTCTATGGAAATCATATATATATATATATATATATATATATATATGGTCAAATATATTTATTTATTTGACTGATTATGAGAGATATGCTATTTTTTGGTAGTAGCTATAAATATGTATGTTAAGAGAGTCATTTTTTTACTAAGGGTTTTTGTATTGAGATTGGTTCTCAATTTTTAGTTTTTTCTTGTAATTTTTTGGTGAATTAATAAAGGGTTTGCTTGGAGGAAAAAAACATTTTTTTTACTTCATATTTCTTCTAAAATCTAATTGTGTAGAGATTCTAGAAAAAAAACCCTAACAATTAAAAGTATTCTTATGCAAAATAAATTAAAAGAATCACATGATTTATTTTGTGAACTGTAATATTTATAATGACATTAGCTTAGTCGTAAAAGATTGGCACTTTAATATTGTTGAAGTCACAATGTTTTCGATGTCCACTTACCAAGGAAACAATTTCAAGCTACACAAAATGTACAATTAGTTAATGAATGTGGACATACCTATACTTTCAAATCATTTCTTTAACTTTCTTCGCAATCTATCTCTTATCAGCATAATCTACAAATTTTCACATATGTGAATATCAAATGTCGGTACAATTTTCAAACAGCAATTTTTTTTAAAAAAGTGGTTTGCATGTTAAAACTATAACAACTAGCTAGTTTTAAAATTTTGAGAAACACTTTTTTTCCCTTACAAAAGAGAACTAATTTCAAGCAAATCATAAAAAAAAGTTGAAAACCAGACCCTACCAAAGACCTTTTGTAAGTGGATTTACAGTTTTGGAGACATGAACTCAATTTAAGAAATAATTAACCAATAAAGTTACTCAAGTTAAACAAACTAAAAATAAAAGTTGAATTTCAAATTAATTAAACTGAATTTGAAAAAAAAAAGATTTTGATATCATATTAGAAAGAGGTGCTTTAATCACAACAAAAAAAAAGAATAAAGAAAGATGTGAAAGGGAAGGCAGAGAAGGGAGAAAAACTTCAAGTAAAGAACCAAGGAGACTCAAAGAATTTGCATCATGGATCCTAGTACGTTCTTTGTACTCTCTTATAGAATATAATGGAAAAGCGAGACTCATGATATCCAAGATCCTGTTATAGATTTATACTTCAATTCATGAATCATAAGTTCATGCTCGATCAGAAAGCTAGATATGAATGTTGATATATGATAATGTAACACGGAAGATAAACCAAAAAATTATCAATCATAGTAAATCCAAATGCACAATCGCTTGATGCCATAGTCAATGACACACGGTACGAAAAGAAGCAAAATTTTCTAGAGCTTTGGTGCACGATACGACAAATAGCATGGCTTGCGACTTTTTGATTCACTGTCCATGTACCAAAAAAATTTACGTTCTGGTTATACATTGTAATTAATTAAACTAGATTAATATAACTTATATATTTTTACTGATAGATATCAAAAAATGAAGTTTTTCGTTGTCATTCCAAAAAAATATCATTAAACATTATGGCATCGGCATAGAATACCATTTAGTTATATTGCATCGTTCAATGTTTAAACATTTGTTTAGAAGTTATATCAAATTAAAATCTTATAGTTATTGTTTAGCTATTAAATTTTAAGTAAAGTTCATAGTTGATTTTGTATGCCTTAACTCTTAAGTGAGGAAAAATGAAGAGATATGCCATTTCATTATATTTTGCTTCATGTCATGTTATTTTGGTAAATTTTATTTTGTTTCGTTTGTCTGTTCATTTCATATTGTATTATTTTTTACTTCATAATTCTTTGTTATGATTGTTTAGCATATTTTGATCACTTCAAACTATGACAATTTATGACTTAATCTTATGTCAATTTATCATCTCA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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_008792394.1	3.3e-203	calcium-dependent protein kinase 1-like isoform X2
Swissprot	Q6I587.1	1.8e-198	Calcium-dependent protein kinase 15
trEMBL	A0A8B7C5V6	1.1e-203	calcium-dependent protein kinase 1

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT4G23650.1	77.45	0.0	791	CDPK6;CPK3	calcium-dependent protein kinase 6

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	bit score
AfisC7G02744	AT4G23650.1	470	104	2	56	525	61	528	77.45	791
AfisC7G02744	AT5G12180.1	509	153	3	18	526	19	524	69.35	748
AfisC7G02744	AT5G19360.1	479	133	2	48	526	43	519	71.82	731

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00069.22	Pkinase	Domain	73	332	245.6	4.9e-73
PF13499.3	EF-hand_7	Domain	380	440	40.9	1.9e-10
PF13499.3	EF-hand_7	Domain	450	512	49.1	5.1e-13

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0005509	F	calcium ion binding
GO:0005739	C	mitochondrion
GO:0005773	C	vacuole
GO:0005829	C	cytosol
GO:0004683	F	calmodulin-dependent protein kinase activity
GO:0004713	F	protein tyrosine kinase activity
GO:0035556	P	intracellular signal transduction
GO:0005516	F	calmodulin binding
GO:0005524	F	ATP binding
GO:0005634	C	nucleus
GO:0009506	C	plasmodesma
GO:0009507	C	chloroplast
GO:0009651	P	response to salt stress
GO:0009738	P	abscisic acid-activated signaling pathway
GO:0009931	F	calcium-dependent protein serine/threonine kinase activity
GO:0010119	P	regulation of stomatal movement
GO:0010359	P	regulation of anion channel activity
GO:0018105	P	peptidyl-serine phosphorylation
GO:0019903	F	protein phosphatase binding
GO:0046777	P	protein autophosphorylation
GO:0080092	P	regulation of pollen tube growth

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K13412	CPK; calcium-dependent protein kinase	EC:2.7.11.1	Plant-pathogen interaction	ko04626
K13448	CML; calcium-binding protein CML	EC:-	Plant-pathogen interaction	ko04626

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network