result

Gene information

Detail information of AfisC7G02799

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC7G02799	chr7	555802566	555811480	+

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC7G02799
ATGATAATCAAGCGCGGACTCAACGCCGATATGCAAACCCTAAATCGCTGCTCGACGTCCGAAATCCCAATTCGCAAAAAGCGCAAAAAGTCGAAGGATTTCTTCCCATTAGAAGCACTGGGTAACCTCACTGCTACTTCGATTGCTTATCTCCCAATTGAGCACCGGAAAAAGCTTTTCTCGCACGTGGTAATGCTGAGTGCGGATACGCCGTCGGAGTCTACGACGGAGGATGATGCTCCGGCGCCGGTGGTGAGAAGCTCGCGAGGTAGAACTCAGTTTTTGCCGAAGAAGTTTAAAGATTCGGTTTTGATTGACCCGTTTAAGAAGGAGAGAACGAAAAGCAAAGAGGTTGATGATGAGTTTAACTGTGAACTTAGCAATAGCAGTGATTTTAGCTACAAAGAAAGAAATGTTGAGAATTTGGAGAGTTCAAGAGATAAGGACAGTTATAGAGCATGTAGAAACTTAAAAGCCAAAAAGTATTTTAACTCGGAACATGGTAATGAAAATGTGAAGAACGTTGAGAGGAAGAAAGACAACTACTTCACACAAGAATTTGTTTCTGGAGACATTGTTTGGGCGAAGTTAGGAGTAAAGTTTCCAGCTTGGCCGGCCATGGTTGTCGATCCAATGAAGAATATATCAGATATGGTGGTGGATATGCGTGTACCTGGCACAATGTGTGTAAAGTTTTTTGGATGTCCTCAAAATGGAGATGACAAGGTATGATTTTATGTACCCCTTTCCCTTGTATCTGTTATATTTTGTAAATTAGAAAGCTCAACTAAGTTTGGCTTAACTTTTTGAGAAGCTAAGTTACAGCTGACAGTTGGGGTTAATGTATCAGCTAAGTAAATCACAGTTTTACCCTTGTGAATTTTAAGCCAAACCGAGTATAAATTTTGTACCAGTATGATAAAGGTTTGATTATGTTAGCTGGTCTGGACAGAGCATATTTCATCATGGCTATATTTAGGTTATGATTCATGTTTAGTTACATATGTTTGTGTTCTTATGGGTTGCAATGCTTGTATGAGCAGGACTATGCATGGGTGAAACAAGAGATGACATTTCCATTTATGGATAATCTAGAGAGGTTAGTGGCATATCATTGTAAACGAAGTGATCATTCAATTTTTTAGAATGGAGTTGCTTTAAATTAACATTTAATATGTTAGGTTTCAGGGGCAGACTGAGTTATACAAAAACATTCCTGCTGATTTACAGATGGCTGTAGAGGAAGCAATTTTAGCTGATAGTGGTTTTGTAGGAACCCCAGTTGATGAAACAGACATGAAAGAGAATCAGGAAGCCTCTGATTCGAACCGCGATCAAGAACTCCAATCGCAAGAAAACCAGGCAAGTTATGCAAATTTTAAGTTTATATCTCTGTATTGTTGTGTGTTGCCCTGAACCAAAATAAAATCTCAGTTACATCTGTAATGCAAACTTAGAAATTGGTGTGGTTGAATCAATGCAAATAGGCAGAAAGTAATAAATTTGTTGATACCAATGCAAAAGCAAAAAAATAAGGAAAAAAAAAAGAAAAAGGAAAATAAAAAAAAGAATACTTTTCTGTATACATACATGAAGGGTAACTTTTATTTTTATTCAGGTTTGTTTGATATCAAAGTTTTTGTATGAGACATTGCTAACCAAGTTCCTACAAAAAGATGTATGTCTATCCATAACATTCGTCCGTGTGGATAAATATGGTTTATGCTGTAGCTAAGGCTCAAACTATGTACTTTTTCAGTTTTCAATTTCGGTCTCAATCACTGCGCTAATAATTGAGTTCTTTTTTTTACTTCAAAATTTAACCTTTCGCTCTATTTTAACACATATTATTGAATATTGCAAATGCATTAAATTTTCTTTTGGTTAATGTTTGCATTATGTACCAATACAGCATATTTATATGGTTTTTTTGGTCATGTTCAATGCAGGACATAAATCACTATGTCCCACGTTGTGAAAGCTGTTGGTTAAGTCTTCCATCTAAAAGGGCAATGAAAATAAAGCATGAATCACAACAATTATTCTGTGGACACTGCACCAGGGTTTGTATCAGCGTACCATATCAGTCATTTTGAAGCTGAACATGTTTTAAACATAATTTGCAGCGAACTTTAACTGTTATTTATTTAATCACAGTTATTGAAGTCTAAGCAATATTGTGGCATTTGTAAAAAAATTTGGCGCCATACAAATAATGAAACCTGGGTAAGTGAGAGGACATACTACGTATTCTTCCATTAAGTATCTTTACAAGGTTTTATCCTGATTACCGCTCAATCAGGTTTGTTGCGAAGAGTGTCGAGTTTGGGTTCATACAGAATGTGATATAGTTGGAGCAAAACTTCAGGTATATGTCCTGCATTTCTCACATTATTATAAGTTTGGATTGTCACTGACAAATTTAATCTCTTAAAGGATATTGAAGGTTCTCCTTATTTCTGTCCACACTGCAAACCAAAGTATAGATATCAAATGGTCGAAGCAGTGAAGAAGCAGAAACAGTCACAAGTTAGGTACACATAGTGCTATTGAATGTTTTACTGTATCGAATTTTTGAGCTGTTTTTCTAGTTATGTAACTATCTGTGCAATATTTTCACGTTTACTTTCGTATTTCAACAGATGTGGAAATAGTCTTTGGCAAGACCAAGGATCAGACAGGGTTACTGTCTGGTGTTTTGGAATGGAAGGGACGTATATACCCGATGAGCATGTGTAAGCATCCATTGCTTCAATATTGTTAACCACAGAACAAAATCATCTATAGTTATCTTGTGTAGCTGACTTGATTTTATCTTACATTTACAGGGTTTCTTGTCACTGTGGTCCTTGCAAGGGGCAATTACTACCCCTTATTGAGTGGGAGAGACATACAGGTTGCAAAAGCAAAAATTGGAGAAGTAGTGTTAAAATCAAAAGCACTATGCTTTCACTTGGGAAATGGGTCTGTAGTCAAGCTTTCTGATAATCTGTCCTTTTGTTTTTCGTTTCATATAGCACTACTTGTTACCTTAAGTCAGCCTACCGTTTTTCTGCAAAGTGGTTTGATTGTTGAAAGTTAACTTAAGCCAGTAATTTTTTAATATACATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAATACACCATGTTTCATTATACGGATGAAAAATGTATACCTTTTGGTTAACATGTTCAGAGTATTACGTTTGCTCAACCTTAATCTTTTAAATGCAGATTGAGCGTAACGCTGCTGTTTCTGCTATCAATGTAAAACGTCCCTCACCGAAGGTTGGGAAGCGGAAACTTTTTTCCTTTCTGCAAGGTATATTTCCCATCATTTTGGGGTCTAATTTTTTTTGCTTCTACTGTTGACACCGAAGCGAATTTAATTCTCTAAACAAGTCTGTATGATATCACTAAATTGATTTCTTTAAACTAGCAGAAGCATATGAGCCAGTACATGCTAAATGGACAACAGAAAGATGTGCAGTTTGCCGGTGGGTTGAAGACTGGGATTACAACAAGATATTAATTTGTATAAGGTAATCCATCCCAGTGTGATTAGGTTTACAAATATAATCATAATATGATATCAGACTAACGCTTAGCATAGTATGAGTCATAAGCTTGTCATTATGATAAACTGGCAATATTTTATATTATATCACTCAAACTCTTTGTCTTATTGGAGATTCACTGTAATATGTACTTTACATGTTATTAGGTAACATATTTTTGATACAGGTTTTAAGACATTATTGGTTTTGTGAATATTATATTTGGAGTAATCTGAATAAGTGGAGGTTCTGACTAAAATAACGAGGTGGATGTCCTGTTTAAATATGTTTTAAAATATGTATGATATGACTATTGTTAAACTAATAGAATAAATACTTTTAAATGGAGTTTCAAATTTATATTTTTTCCAGATGTCAAATAGCTGTACATCAAGAATGCTATGGAGCGCGAAATGTACGAGATTTCACGTCTTGGGTATGCAGAGCTTGTGAAACACCTCAAACAAAACGGGAGTGTTGCCTTTGTCCTATAAAAGGTACGATCATACTCTTCCCATTCTCAGTTTTTTCTTTTTCTTTACAAAGACGACTTCGACTCAACTACCAATTACAGTTTTGAAGGGTGTTTGGCTAGGCATAATTGTTGGCTTTTTAGGCCAAGAAAAACTAGGAATAACGGTCTCTCAATTCACTATGGTGAAAATTAATCGAAGCTAAATACCCTGTTAGACCAAATTTTTTATTCAATATGGTCTTTTATGTATTCCCAGGCCATTATTATTTTGTATTATTTTTATGTATGCCACTTCAGGTTAATTGATGTACTTTTTTCCAGTTAGCAATAAAATTTATCCATTTCCCGAAAAAAGGAAAAAAAAAAGGATCGATTGTTGAATGCTCTAGTGTGTTCAAACAGTTGAAGAGATAAACGTTCCACCCTTTCACTTGGACATTCGTAGTTGCTAACAAAGTATTAAATAGGTGACATAGTAGTTGAGTATAAATTTTGTTTCATGTCCAGGTAATTTGATTCGTTTTTAAAGTTAAAACTTGTTCATTATCAATAAATAGTATCTTTTATGATAAATTACTTTTACGATTTAATCTCTTTTTTCACATGTAATTCTGCGTATTTAGGGTGTATTCATGAATACTATTCGTTTTTTTTTTTCAGGGGGTGCTCTGAAGCCAACAGATGTGGATAATTTATGGGTACATATCACATGTGCATGGTTTAGACCTGAAGTATCTTTTAAAAGCGATGAGAAGATGGAGCCTGCTATTGGTATTCTTAATATTCCATCACAGTCATTTGCAAAGGTTAGTTGTAAATGAATTTAATAATGGTGCAATTTCTCATATGCTTTATTCAACTTTACAATTCTTACTTCCAAAATTTGCCAACAATATTTTGGCTAAAGTTTATAAAAATAGTTTCAAATATTTTTTTAAGGATCTGCTTGACATATTTCTGTGAATTTTACATTATACACACACACATACATATATAGATATGCATGCATACATACATGTACGTACAAACATACGTGTGTGTGTATCAGAACTATAAACTGCATTTAAACGCAGTAAGTGTTTTGTAACACTATGAAATCATAAATTCGATGTTAGAAGATTTCAATACGGAAAAAACTCTTTACAGGGTTCTGACAATTTATGATATACGTGAATATTTCGGAAGTAAAATTCTTTAATATGTAATTGTTTGGAAATCTCCAGGTCTGTGTGGTATGTAAGCAAATGCATGGATCCTGTACACAATGCCACAAGTGTTCTACTTATTATCATGCTATGTGTGCATCAAGGGCAGGATACCGTATGGAGGTCGGTAATTATTAGATTGAATAAACAAAAGAGGGACACTTACCTTTCTGTTTTATATTTCATGTCTAAATCACTCAAGCTATACCAATGATCGCTGATAATAGTGGTAAGACACATACTTTCTGTAGCCAGAGGTCTTAGCTTCGATCCCCGTACACATACATAACAATTAATGCTAACAAAAAGTTGCATAAGAAATAAAAATAACTCGTTACACATCACGACTATAAAAAATTATGTAAAATAATTGAAAAAGTAACATACAGAATATCCAAATTAAGTTTGCATATTTCTTATCTTGTTTTCTTTCATCTACTCACATTTGAATCAGGTAAAATAATTAAAACAGTAACATAAGAAATTAATTTATTTGTGAATTCCATGTAGTTAATAACTATTTTTAGTGACTATGGTATCAATCCAAATTGTCCAATTCATATTTAGTTGCAAATGTGGTGCTACTGAATATACTACGTACGTACTTGTACACGTAAGATCTAGGTTCGATAGCTCTTCTAAGACTGCTCATTTGCATCTCAAACTGATCCATTAGATTCATTCAATCAATGTTATTTGTGATCGTGTCATGACAATTAATTGCTATCACTGTTGCGTAGTATTAACTGCACAACACATAGCAATTAGTTAAAGCTTGTTATCTGTTTGTAGTATTGTACTACTATGATATATAGGCACATCAGTATAGTTCTCAATACTAATAATGGATAATTGTATCCATGCATTATACTTTAAACCTAAATTTGTTTTGATTATTCCTTCTAATTTTCAGTAATTTTACATCTCTTTGGAAACCCTATGAATGAATGATATTTCCCCTCCAGAATATATATTATTTTATTGGAAAATCTGTGATTTGATATTATTGTTTTGGACATATTACAGCTACACTGTGTAGAGAAAAACCGGAAACAAACGACAATGAAGATATCATACTGTGCAAATCATAGGTATACATGTTCTCTAAACTTGGCTTCTTTTATGTAGTCAAAATTTGTTATCTTCCCATACTACATCGATACTTATCTTTTATGACAGTTCAGTATTTTTCCATCTAAATCTCACAAGCACCGTTTAAATTTTGACCTTTACGGTTAAGGTATTAATGTTGAAATTTCTCTGGAGAAAGGGTGATTAAAGTTGTGTGCTGAATATAAATATGATTACTAAGTGTAGAATTCTAGTGTAAAAAGGTAAACAAGTAAAAATAGCAAACTCAAATAAAAATGATCAGCAGAAACAACATTTGTGATTAAATAATTTCTTGTCTCAATATTTGTGTAGGGAACCAAACCCAGATACAGTTCTAATTATACAAACTCCAAATGGTGTCATCTCTTCCAAAACTTTGCGGGAAAATAAAGAAAACAAGACTGGTTCAAGGTTAATACGAAAAGAATTACTCCAGGATTCAAATAAAGCTACTCCACTAAATACAAAATCTTCATCTGCAGCAAGGTGTATGGTTTATGTGAAGTCAGAAAATAAGGTACCATATGTGATATATGTATGCATGCATGTAACTCTGTGCGTGCGTGCGTGCTAATTTAAAACTATACGTTTTTGTTCAATTGGTTAGCAATAATCTTTCAACTGAATATTTCTGCTTCACAGAAGTTACACTTTTATGCTATATAATCATGAGAATGAATATGGCAGACTTGCAAACAATTGGTTTATCAGTACAAGTCACATGTTGTGTCCTCGTGAAATTTTTGTTATGCATTCCTATATCTGGCCTGCATATAGTTTATGCTAATTAGAATGAAGAAAGAATGCAGCCTCTTACCTACACTTATTTGGTGACTTGTTCATGGTTAGAATTATGATGAAAGTTCCATCTGCTTTTTATTTTTGTGAACAAAAATCTTTCTAATGGCATGTTGCCTTTTTAATCGTCATGTAGGCAGGAGGCTGTTTACTTTTATCGCTGTCTTAGTTGGTAAATAATCTGTTTAGCAGTCGATTTATTATTTACCGACGTTAATATCTTCTACTTGCACTCAGAGAAAGCGGGAAGAGGCTGTCCCGAACAGAATAAGGGGAGCTTGCCGACATTCATTACAGGAAATTGCAAGTTTGAACACACCAAAAGTAAGAACTTGTTCAAAAACAATATTTTGATAGCTGAGTTACACTTGGTCATCGACTAACTGCATTTAGGGGAATAAGTTCACAAATTACTATGTACTCTTTGATTCAGGAAGAAAACCTTGACAAAAGGCGTTCTAATTTAGTGCACAATTATAAGTTTATTGGCAGTACAATTATTTTTGATGCATATGGTATTATGTAGCAATGCACAAGTGTTAAAAGCTTAGGAAACAGGCTTACCGGCTTATAAGATGTTTACTTATAGATATTTTGATGAACAGGAAGAGAAGGACCCTAAATCATTTTCGACATTCAGGGAACGGCTATATTACTTACAGGTGCATGCTTGTTTATTTTACTTTTATTCTGGAATTAGTTCATTTTGCAAGCTAATCGGTTCCTACTCCACTGCAGTCGACAGAACAAAATAGAGTTTGTTTTGGTAGATCAGGTATACATGGATGGGGCCTTTTTGCTCGTAGAGATATTCAAGAAGGAGAGATGGTACTGTAAATATGAATAGTTTTCTCCTGTTGACATTTCAAAAAATTGTATTCATCTATAGTTATCTTATATGATAAACTTAACTATATTCTTCAATTTTCTTCCTTAGGTTATTGAATACCGTGGTGAGCAGGTGAGGCGCAGTGTAGCAGATCTAAGAGAGGCCCGATATAGATTAGAAGGAAAAGATTGCTATGTGAGTTTTCTTTGATACATGATATTTAAGGTGCACTACACTGGCCTAAGTGTTTCTGAGATATAGAACTCCAAAATTGAGCATTAGGTCTAAATACAGATATAACATCATTATTATAGCATATCTTATGTTTCTTATTTTATGTTGCAGTTGTTCAAAATTAGTGAAGAGGTGGTTGTAGATGCGACTGATAAAGGAAATATTGCACGTCTAATAAATCACTCGGTAAGACTTCTATTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTTGTACGTGATATTTATGATTACAATTCATTGTTTACTAACATGGTATTCTGCAGTGCACACCAAATTGTTACGCAAGAATAATGAGTGTTGGTGATGGCGATGATGAGAGCAGAATTGTTCTCATTGCAAAGGCAAATGTGCCTGCAGGCGATGAGTTGACGTACGTAATACTCACCTTCTTCTTTGTATGTATGTACATATGCATGTGTATTATGTATGTGTATGTATACACACACGTACGCACACATACACATACATATGTATTCTTATATACATTACCATGCAATGCTAAACTGTCTTGTTTTTTACAGATATGATTATTTATTCGATCCCGACGAAGCTGATGAATGCAAAGTTCTGTGCCTATGCAAATCTGAAAATTGCAGAAAATACATGAATTAAGATCCTGCTGATATTTTCATAAATTCTTTTGACACAGACAAGCTCTTCTAATT

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020262823.1	0.0e+00	histone-lysine N-methyltransferase ATX4-like
Swissprot	Q9SUE7.3	1.1e-246	Trithorax-homolog protein 4
trEMBL	A0A6I9QV21	2.1e-308	histone-lysine N-methyltransferase ATX4

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT4G27910.1	48.91	0.0	860	ATX4;SDG16	SET domain protein 16

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	bit score
AfisC7G02799	AT4G27910.1	959	411	22	1	899	1	940	48.91	860
AfisC7G02799	AT5G53430.1	970	429	21	1	899	1	956	47.01	823
AfisC7G02799	AT3G61740.2	833	416	13	86	899	77	894	45.98	764

Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g59864.t1
Allium fistulosum	AfisC7G02799
Allium sativum	Asa3G02590.1
Arabidopsis thaliana	AT4G27910.1; AT5G53430.1
Oryza sativa	LOC_Os01g11952.1; LOC_Os01g46700.1

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00855.14	PWWP	Domain	187	284	52.3	5.4e-14
PF00628.26	PHD	Domain	366	418	32.6	4.9e-08
PF13831.3	PHD_2	Family	569	603	43.5	1.5e-11
PF13832.3	zf-HC5HC2H_2	Domain	610	722	98.5	2.1e-28

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005515	F	protein binding
GO:0000785	C	chromatin
GO:0007165	P	signal transduction
GO:0005737	C	cytoplasm
GO:0005654	C	nucleoplasm
GO:0006357	P	regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0007275	P	multicellular organism development
GO:0008168	F	methyltransferase activity
GO:0009294	P	DNA mediated transformation
GO:0009506	C	plasmodesma
GO:0032452	F	histone demethylase activity
GO:0034968	P	histone lysine methylation
GO:0043967	P	histone H4 acetylation
GO:0044710	P	single-organism metabolic process
GO:0045595	P	regulation of cell differentiation
GO:0048522	P	positive regulation of cellular process
GO:0048523	P	negative regulation of cellular process
GO:0051128	P	regulation of cellular component organization
GO:0051239	P	regulation of multicellular organismal process

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network