result

Gene information

Detail information of AfisC7G03793

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC7G03793	chr7	733406141	733411998	-

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC7G03793
GTTTGAAGTATCATTAGCCAATCATTTCCACAAATCAAAGTCCAATGAATCATAGTTCTTCACAAGGCAGCTCGAGTTTGGATTCACAGTCACCTGCAGAGGTTGGAAATCAGTCGGTTAATGCGACTAATTATTTCTCAAATTATGGTTAGTCACTAATCTTATGGTTGATAAATGACAATTATATATGATAAATGATAATTATATATGATCAGTTAGAACAATGTAATTTATATTTACAGGTATTTTGTTATAGAACTAATTATGAGATGCTATATACTTGTACCATTTGATCCTGTTTAAATCTGTATAAAATGTTATATTTACAGGGTATAGTTGCCATTAGACTAATTTTAGCTTGGTGCTTTGAAGTATGATAAACTGCATTATTTTAAATGTTAGTTCACAACTATATTAATCATTTTTGCTACTTGCATTGATTTTATGCCTATATGATATAATTATCAACTTTAACTTAGAAATGATTGTATTGTATAGATTTAGTCTTACATTCATCCCCTCTTTTAGTAATTTAATGTAATAACTATGTACTACTAGTTACTAAAAACAATTCTTGTAGGTATTTTAACTTGTGTGTGTATGTGTGTGTGAGTGCACACGCGTGTAGACACACACAATTTGAAATTATACAAAAAATTGGAAACAAGTTCAAATCATAATTAGGATCATCTTTACAAAAGTTTGGCTTGTTAGAGTATTCCTAGAACAATGAGATTGATTTTTTATTTTAATGGTTAAAATATATGTTTAAACGATTATATTGGTTTATTATTTTGAATGGGTTAGCAAGATAGAGATTGTCTCATTTTTCGTGGACATGATCATCATAATATAGATTAAACATCTTTTAAATTTTGTAGCATTTGAAGTGTTAATATAGAACCATTTTATCTCTACACACAAGCAGTATATATGGAAGGGTTCTACGTCTCCTTCAACATAAATCCTCCTATTTAATTGACACTTCAAAAAGTTTTAAAATGAGCCATTATCATTAACTTATTTATGCAAAATTTAAAGACAATTCAAATTGTTAGCTTATTCAAAATTATGACTCATATGAGCTATCAAAATATTTATTTAACTGTCAATCTAAAATATAGTTTTGAATAAATTAAAAATTTTGTAAAAATGTGAACTTTAGCAAATATGATCTCTATAGTAATAAGATCACATACATAAAAGGTGGGCTCATTTTAATATTTCTAGCACTTGGATTGATATCTCAAATCAACTGTCCACTAATTTTTTTGAAATAGTCTAGTTTATTGTAAAGGCGGGCCTCATAATATAGATTGAATATCTACAAAGTTTCATAATAATTGTGTTGGTCTTAAAAGGTGCAATAAAGAGAGGAGTTACATCTCATTCCTATATTCATGTGTGTGTATTTAGGGGGAAGGGTCCACATTCCACCAACTATGAACCCACTTAAAATCTCTCATATAAAATTTCAAAATTGTTCAAAATTTTGTGGATATTATCTTATTACAATCAAGATCATCCTCTTGAATTTTTGTACTATTTTGAAACTTCTAACCTATTCAAAATTGCAAATCAACACGAGTCATAACATAATGTATTTTAACCGTTGATTTTGAATGCACTTGTGAACGAGTTGAAAATTTCAAACTGTTCCAAATTTTTGAGAATATGATCCCATTAGGAAATGAGTCATACTTACAAAGGGTTGTTTCATTTTGAAAACTTTGAGCACAAAAGGATGAAGAGGATTTTGAGGGATAAATCAAGGATGTAGATCATTACCCATATATATACACAAATGAGTGTCCACACGCGCACGCATGTGTGAGACAAAGTACTATAATTACCAGAGAGTTTTTTCAAAATAATAATAATAATAAATAAATAAATAAAACACGCGCACATGCGCGAACATTCATGTTATTGAAGTGGTCTCATTTTTACTATAGATGCTGTTCACGGTATAGAAACATCTTCATAGTTTGATTAAATTCAAATCAGTTAGCTCTAAAAAGTGTAGGATGTAGATGAAATGTAGCGAAAGTGAATCATAAGCGATCTCTCCTGATATGTATATTTTATTTTTTTATAACAAAAGTGATATTTAATTTAAGCAAAACACTCATTCTGATATGTACATATACGTACATAACCTTAGAAGGATTGTCACATGGTTGAGCACCAAGTTTAAGTGTAAGCGTTCAGTTCAAACGTTGATTTCGGTGTGTATACTTCGTAATATATTCAGATGTATGTTAGGGCAAACATATGTCCTTTAGATATTACGAGTGAAACTTGATACCTCGACTCTTTAATGAGAAAAAGGAAACACATATACATGTTTTCTCAAAATTACATATACACATACATATATTACTGATAAATATATACATCATATATTACTTACTAACAGAGATTGCTACATTTGATGATTGATTTATTGTCGGTCATTACTACAGCAGGGTCTCAGTTCAACTCCACATACCCTAGAGGTTTAATACAGCAGGGAGAGCCACATATGAATATGTACAAGGATTTTCATGAATTTTCATGTACTCCTCTACCAAATTGTACATCTAATTATATGCCTTCACAGTCCAGCAGTTGCCTTCCTGTGCAAATGGGAGGCTTTCCTACAAATACCTTTGTCTCTCCAGCAGGTAAACTTTAACTTGTTTTCTAGCGTTTCCAATTTGGAATTTGTATATGCATTTGATTTCACAATTAGTTTTGTTCCCCATATAATGTATATTTGATATATGCATGTATATCTAAGAAGTAATTATACAGAACTACCTTATAGAATTAGTATTGTTCCCTTTATATTGTGAACATCAACTGATATTTGTGCTGTATGTGCATTTGGTGTATCCCATATCCAAAAGTTATGAACTCAGGGCCAGATCAACTATTAGGGTATAGGAGAGGAAAATCACTTTATATAATTTAAAACATTCTTTCTTTATTTCAAATTTACGTGTGCTCATTTAAAATTGTTGATCATGAATTCTACCAGGAAATGCCAAATCTTGGCAATATTTGTAAAACTCTAACTGACATAATTAACCCATTTTTCGTATGATTTTTATGTACAGAGTTGTATAATAACTCTCAAACACCGCTAGGAAATTTCTTCCAAAGTGAGCATTCAAGCTCTGAAGGTTTGAATATTCAAAAGGTGAAAATTGAGGGGAAAAAACTTTCTGAATAATGATCACTTACTTTTTTTTGTTAACAGACTTAATTACTTGTGTGTAGAGTTTGATATACTCAAATCCAATTCTTTCAAGAGAGAACGGAACATCTGGAATGGTTCAGGTTCCAAGGCAACTACAGATTCGTCCATTGCAAGTGTTGAATGATGTATGTAATAATCTCTTTAACAATATTTATACATTTTATTTTAACATTATAATGATCATATGTTATACTAATTAGTTATCATAAATATTTCACACCTTGGACTTGTGGCGATATATTTACAAAATTGGACCAAAATAGTACTCTTTTCAATTTTTTACATACAAGAAGGATCATTCTTTCGTTTTTCTAAACATTCTTTCCATAAAAAATTGCCTTAGAAAATGTTAATTATGTACAAAACAATATTTTAGAACAGAATTTCTGAACTTTTCATAACTAGTCCTGCACTAATAAGAGCGAAAATTTAATGAAGACTTAATGAACTCAATTGTTGATATGCACTGATTGTTTCTTTTTTTCTTCGTCAACTTAATCTTCTTTAAAAAATATATATTCAGTAATATATTGTTTTTCATTTACTTACTGCTTTCTTTCATGATTAAACTACTTTGTTAGTAATTATTTTTGTGCTTTGATACATGAAAGCCAGTACTTCTATAAAAAGAAGTTCAGGAGCTCGCCATACAAATAGATAAGAACATTTAAATCGTTTGACTTCAAGTACAATCGCATGCAGATTTAGTCAACAAATCATTGCAGCACTAATAATATCTGTTACTACCAAGATATTTCAAAATATTGCATGTTAGTTATTGATGGATATATGAGGGTACAAAAATTATTCACTTAGATGTCATAACACAAAATATAATACAACATGTGCTATAGGTTTATGACATAAGAAATTTTCATATATTTGAGGCCATCTCTATGCTATAACAAATGACCATGTTGTTCTTATTATAATGTTCGAATAATTCAGTTCCAACTAATACCTTCTATACAATTATTTTTGTTGACCTACCAAGAATTTTCAACCAAATGATAATATTATGATATCTGTATCAAGATACACGAATTATGTTTGTTAGTATATTTTAATTTGCAGGACCATAGAGATACAAATCTTAAATTGATAATCAGAAAGGAATTATCAAATAGTGATGTTACTTCTGTTGGTAGAATTGTATTGCCTAAGGTAAACCATACCTCTTGCAAAAAGTGAATAAATTAATTTTAGACTTTGTGGTACACAAATTCTTATTGAACTTGCTTTGGTTTGACTTGATTTTAGAGGGATTCAGAGGCTCATCTTCCTCAATTAACTGAAAAAGAAGGAATCATATTGAACATGGATGATCATGAACTTCCACATACTTGGCAATTCAAGTATAGGTACATCGGAGTGTTTTTTACCTTTCCTTTTTCCTTTTCTCCTTTTAGAAAAAAAAACTACATTTCTTTTAGTAAATGTGGAAAATTAAGTGAGATCCTATCACTTAACTGGATTACAGATTCTAAACAAGCACTTATATTCAGGTTTTGGCCTAACAACAAAAGCAGAATGTATGTAATGGAGAACGCAGGCAAGCATACTTATCCCTAGGTTCATAGTTATGTGCAAAGTGTAAAAATATTCCTAACCTATAAGTTCGTATATTAACTCTGGCTCAGGTGATTTTATAAAAGCTCATGATTTGAAGGCTGGGGACTACTTCATTATTTACAAGAGTTTGGTGTCCCATAATTATGTAAGAGACTGGAAAATATGAGACTAGCAGTGTGATTGCATGCTATATCATTTACTTTTACTTCACAGAACATGGAATCAAAACTGTAACCCATGCCTGCCAAAATACTAAATTGGCCATATCAGGCTCATTTAGTCAAATTTAATTATTATTATTTAAAAAAGAAAATTTTAATGGCTTAAGAACTGCTTTGATGCTTCAGTTAAAGCATCAAATCACATGCATCAACGCTACCAAACTGCCATTTGTTCTTTTGTATATTGAGATTTGCAAATAACCTGAGCAGAATAGTTTTACCATAAAGCCCGTAATTTTTGGGAATAAGATTGTAAATCCAGACATGTGGCACTAATAAGGAGTTAATGCAGGAAGCATTCTGCTCTAATAGGGCAAGATTTTTCTTTTTCCTGTTTTCATTAACAGTATAATTCATATGGACTGAATGCAGTTAGTTATATTTTTAACACGCAACTCCACTTCTAATTTCTAAACTATTTTTTGGGGTTATCAGGTTGTTAGCGGAGAAAAAGTGCAGCGATCAATCCCTACAATCCCAAGATGGAATTCCTAAAAAGTCATCGAACACCATTATGAACTTCTTACATTAAATGGTCATTTAGCCAAACATACATATATGCATTTCGGACTTTTCCTACATACCAGAGTCTAGTCCAACCAAAGTTCTGAACCATTGGATCGGAACAGTCGGTACATTTTAGCTTGTTAACTGATCTAATGTTGCTTAAATGGTTTGATGCTTTGGGTCATTTGATCTTTGTTTGAATGATTCTAACTATGTGGTTTAAATTTTAAACCAGAACATGTGATCATATTCCATGTATTTCTGCATACATTATAGTTGTTTAAACAATACATATGCTTGGTGCATCCTATGTA

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020275342.1	5.9e-45	B3 domain-containing protein IDEF1-like
Swissprot	Q7XKC5.2	1.2e-34	Protein IDEF1 homolog
trEMBL	A0A5P1EE52	4.2e-45	TF-B3 domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT3G26790.1	53.77	9e-32	134	FUS3	AP2/B3-like transcriptional factor family protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC7G03793	AT3G26790.1	106	49	0	171	276	88	193	53.77	9e-32	134
AfisC7G03793	AT3G24650.1	147	72	3	136	278	538	675	42.18	1e-30	130
AfisC7G03793	AT1G28300.1	162	85	2	112	262	97	258	40.74	8e-28	120

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF02362.18	B3	Family	177	261	46.6	2.2e-12

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005515	F	protein binding
GO:0001076	F	transcription factor activity, RNA polymerase II transcription factor binding
GO:0003700	F	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0005739	C	mitochondrion
GO:0005829	C	cytosol
GO:0005634	C	nucleus
GO:0009657	P	plastid organization
GO:0009733	P	response to auxin
GO:0009737	P	response to abscisic acid
GO:0009744	P	response to sucrose
GO:0009793	P	embryo development ending in seed dormancy
GO:0010030	P	positive regulation of seed germination
GO:0044212	F	transcription regulatory region DNA binding
GO:0045893	P	positive regulation of transcription, DNA-templated
GO:0045892	P	negative regulation of transcription, DNA-templated
GO:0031930	P	mitochondria-nucleus signaling pathway
GO:0048573	P	photoperiodism, flowering
GO:2000034	P	regulation of seed maturation

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network