result

Gene information

Detail information of AfisC7G03966

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC7G03966	chr7	763030946	763042954	-

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC7G03966
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	RWR73793.1	2.5e-35	transcription factor bHLH48-like protein
Swissprot	Q8VZ02.1	1.2e-26	bHLH transcription factor bHLH048
trEMBL	A0A443N5L8	1.8e-35	Transcription factor bHLH48-like protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT2G42300.1	58.60	3e-36	148		basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC7G03966	AT2G42300.1	157	51	4	41	183	90	246	58.60	3e-36	148
AfisC7G03966	AT3G57800.2	172	42	7	42	183	96	265	56.98	8e-36	146
AfisC7G03966	AT3G57800.1	218	44	7	42	183	96	312	44.50	1e-28	123

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00010.23	HLH	Domain	132	159	24.3	2e-05

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0003700	F	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0005634	C	nucleus
GO:0006355	P	regulation of transcription, DNA-templated
GO:0046983	F	protein dimerization activity
GO:0009637	P	response to blue light
GO:0009739	P	response to gibberellin
GO:0009911	P	positive regulation of flower development
GO:0044212	F	transcription regulatory region DNA binding
GO:0040008	P	regulation of growth
GO:0043565	F	sequence-specific DNA binding
GO:0048446	P	petal morphogenesis
GO:1902448	P	positive regulation of shade avoidance
GO:2000488	P	positive regulation of brassinosteroid biosynthetic process

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network