result

Gene information

Detail information of AfisC7G03967

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC7G03967	chr7	763457334	763462367	+

Sequences

CDS

>AfisC7G03967
GTCAAGTTCAACGGCGCTTTTCTCCCGTTTTCCGTCAACTATGACGGCGCCCAACGTCGTGTACAAGGAAACCATGAGAATAATATTTTTGGTACAGTGACAGCCAGTCGCAATCTTTGCCTGTTCTCTTTTCTCTCATGTAACCTTTTGAGAACAAAATTAGTTAAAAATCTGAAGATGTCTGAAGAGCCACTGCATGTAGCGCAGAAGAGTCGTAGAGACAAGCTGAGGCATCAGTTTGTTTCAGATAATGAAAACCCTAATCAAGAATTTGCCTTCAATTCTGAAATTCTTGATTACAATACTTCTAACGCTCCTCAAAGTTCCTCATCTTATGATTGGATAATGAATTGCAGTGGTGCTAGTCTTCCTTTGTTTCCGCCTCATATTTATCCAGAAAATCAACAAAATATGTCTTACGAAAATACGCTTCAAGCAATGATTGCTCCTTCTTGCTCGAACTCTTTAGGCGGAGCTAGTACCGATCATGGTGGTTACTCTATTGATGCCAAAGTTGGTAATTTAAGTAGAACCCAAGGCTTGTCTTTGTCACTATCGTCAAAACCGAATATTGATCATGTTGGAGCATCAAATTGGCCGAATCCATCGAAATTATTGATGGATTCTAGAAATTGTGTAGGGCCTCTTGGCCCTTTTACAGGTTATGCTACTATTCTTAAAAGTTCTAAGTTTTTGAAGCCTGCACAACAGCTTTTGGATGATTTTTGTAACGCGGTCATTGGATCTAATAATTTAATGATTGAGTGTAATTCGGAGGCGGCTGCCTCATCGATCTTTGGTGAAGAAAGAGATGGAAGTGGTACAAGGAGTTGTATAGTCGGTGGTCAAGGAGCTGATATTCAACAGATTAAAGTGAAGTTATTGTATATGCAAGATGAGGTATGCAGAAGATACAAGCAATACCACCAGCAAATGCAAATGGTGGTGTCTTCCTTCGAGTCTGTGCCAGGTCTAAGTACAGCAACTCCTTACACCTCTCTAGCTCTGAAAGCAGTGTCGAGACAGTTTAGACACATCAAACATGCAATCTCCAATCAGCTACAGAACATGAGTAAAATGCTAGGTGAAGAATATTTCATGTCAACAAGTCCGACGTCAAGCTCTAGAGGCGAAAATACTCCTAGGTTAAAACATGTAGATCATCAAAGTTTGAGGAGACAGAAAAGAAATGAGATCAATACAAGTATAGGATACTTGGAAAATAATCAGCCTGTCTGGAGGCCTCAAAGAGGATTGCCTGAGCGTGCAGTTTCTGTTCTTAGAGCTTGGTTGTTTGAACATTTTTTGCACCCGTAA

Protein

Gene

>AfisC7G03967
GTCAAGTTCAACGGCGCTTTTCTCCCGTTTTCCGTCAACTATGACGGCGCCCAACGTCGTGTACAAGGAAACCATGAGAATAATATTTTTGGTACAGTGACAGCCAGTCGCAATCTTTGCCTGTTCTCTTTTCTCTCATGTAACCTTTTGAGGTAACTTTTTCTTTTATTTTAATTTTTTCCAAAGTATTTTATTCTCTTTATCTTCGTTTTGTTTGTGGCTCCTGTTCTTTACTCCCTTCGTATCATGATTCTATTATACACAGTACATGTGATCTGAAATTATAACCCTAAAAAGAACACACACTTTTCACATCAGTTCTCTACATGTTTGCATGAAAAGAGTGTATTGTATATATTATATGTATGTATGTAAATTTGGATGAATATGATTCTACAGTAGTAGTAACACTGCAAACCCTATTGTCAATTTACTGTACATATTCAGTTAAATCATATATAAAAAGGTTGTGTTTTGTAGTGGGATTTAGCCATGACATTCTTTTCATGATTTTTCCTCATCATCTTTGCCTCTTTGGTGCTTGTTTCTGATTCCCTATCTTATCTCCATTTGTTTGCACTATACATCTACCTTGACTTCCTTTAATTTTCTTCTCCTTTTAAAAATTACTTAATTCACAACTTTTCTTTTTTCTTCAGAACAAAATTAGTTAAAAATCTGAAGATGTCTGAAGAGCCACTGCATGTAGCGCAGAAGAGTCGTAGAGACAAGCTGAGGCATCAGTTTGTTTCAGATAATGAAAACCCTAATCAAGAATTTGCCTTCAATTCTGAAATTCTTGATTACAATACTTCTAACGCTCCTCAAAGTTCCTCATCTTATGATTGGATAATGAATTGCAGTGGTGCTAGTCTTCCTTTGTTTCCGCCTCATATTTATCCAGAAAATCAACAAAATATGTCTTACGAAAATACGCTTCAAGCAATGATTGCTCCTTCTTGCTCGAACTCTTTAGGCGGAGCTAGTACCGATCATGGTGGTTACTCTATTGATGCCAAAGTTGGTAATTTAAGTAGAACCCAAGGCTTGTCTTTGTCACTATCGTCAAAACCGAATATTGATCATGTTGGAGCATCAAATTGGCCGAATCCATCGAAATTATTGATGGATTCTAGAAATTGTGTAGGGCCTCTTGGCCCTTTTACAGGTTATGCTACTATTCTTAAAAGTTCTAAGTTTTTGAAGCCTGCACAACAGCTTTTGGATGATTTTTGTAACGCGGTCATTGGATCTAATAATTTAATGATTGAGTGTAATTCGGAGGCGGCTGCCTCATCGATCTTTGGTGAAGAAAGAGATGGAAGTGGTACAAGGAGTTGTATAGTCGGTGGTCAAGGAGCTGATATTCAACAGATTAAAGTGAAGTTATTGTATATGCAAGATGAGGTTTGTTATATGATTATAAACTTATTCTCAATTAATGATAATTATAATAACCCTTAACCATATGAAATAATTATTAATAGTTAGTAACTTATTTGCCTTGTGATGTTATAATAGATTGAGACTTGGTTGTGTGTATAAAATCGTTAATTGCTATCTATATCTTAGATTATTGGACATTGGGTGTGAATATATAAAGATCAAATGGTGATAATTATTATCGAAAATGTAAAATTGTGCTGAACATATAATCCAACTTTGATAGTCGTAGCTATAGTTCTAGTGATTATAATTACTAGTGGACTACCATCCGAGTTGCATTTAATATTACGTTTTAGACATTAATCTAACTATGCAAAGGTTCCTAATACTTTGTCTTGTGTTAACCTTGAACTGTTGAAATCTTTTAATTTTTACCAACATTACTATATCTCATTGATATATGCTACTGCTTGCTTTAATTGGATTTGAATGTACAATCCATAAGCCTGCCAATTAATATGAATCCGCCTAATTAATAAATGCATGCAGTGCCCGCGCGTGCACATACGTTTCGCAAGTTATGTTTGTCTAGAAATTAATCAAGGTATGTTTCGTGTATGGTTTTGTACACAGCAAAATTTGTTTTCCACTTTTAGGTTTTTTTGAAGTAGGTCTTAATATCTGATAATGGTTTATTAACATAAATCCATTTTAAAGTCATCTTTGCTAGCTTAGGTACTGTTTGTATAATAATCAATGAACAATAATCAATGCATGGCAAGGAGCCCTTATTTTATAGTTTTCTCCATATTTCCTTTTCTATCTTGTCAGCAAGTAAATTTTGTTTTGTTGAATTAATTCATTGGGTTTGATCATTGATGGCACTGGAGTAGTTTTTTATATTATAAGTTATTAGTTAGGGTTAGAGGTTCTAAAATATGTTTCTGACGAACACAGTTAAACGCATAACATGCAGTATTCAAATAAAACATGATCAATTGTGTTTGTATTTGCTTCTATTGCACATATCTACAAGTTTTACACTTTGGTGATTAAATCACGTCAAATCCTTTTTGTTTCTGTGTCTTATTGCATGGTTATATAACTTAAATTCAGTCAGCTGCTGACTGGTTTGTTTCAAACATTTTAGCTTATATGCAAACCTGAATTCTTCTTTAACCGCAATATAGTTCATGATTTCAGTGAATCTTCTTACCTTTTGTGGCTACATTCATTTATTATACAAATTTTGGATAACCATTTAAGATCAGGAATAGAAAAGTAGTTCCTGAAGAAAGCAATTTAATTTGTTGAAGGAAACATAACATGTGCATTTTAAGGGATGGTAACACAAGTCTTTCAGCATGTAGGCAACTAAATATATGTTTATGAACCAAATTAGGTATGTTATCATGTGGGGTTTAATTGCACACTTCGATTATTTAAATTTAATAAGTCGTCAACCACGTGAAGATGGAATCTGCATTTAATTCTACACACCTATTTGTCTTGCAACCATGGCATGGGCAACAACTCTCAACTGTTGGAACAATCCTAGTTGAATTTCACTACATGCATTAAAATATACTACATACGTACAGTGAATCCTGTTTATTTGTACATGTACATTTAACTTAATCTACAACTTAAGGTATGCAGAAGATACAAGCAATACCACCAGCAAATGCAAATGGTGGTGTCTTCCTTCGAGTCTGTGCCAGGTCTAAGTACAGCAACTCCTTACACCTCTCTAGCTCTGAAAGCAGTGTCGAGACAGTTTAGACACATCAAACATGCAATCTCCAATCAGCTACAGAACATGAGTAAAATGCTAGGTGAAGAATATTTCATGTCAACAAGTCCGACGTCAAGCTCTAGAGGCGAAAATACTCCTAGGTTAAAACATGTAGATCATCAAAGTTTGAGGAGACAGAAAAGAAATGAGATCAATACAAGTATAGGATACTTGGAAAATAATCAGCCTGTCTGGAGGCCTCAAAGAGGATTGCCTGAGCGTGCAGTTTCTGTTCTTAGAGCTTGGTTGTTTGAACATTTTTTGCACCCGTAAGTTATATAAGCTATTTATTTTCAAAAGGAATATATATAGTAATATTTGTTCAGTGATTTCGAACCTAAGATCTTTGTACACAGTTAAATTGTCTTACCATTTTGCTGGTGGTCGGTGACAATCCATGAGTAATTCAGCTAGCCAGTCGATAAATTAGATAGTTTCATTTTTTTTTTCACTTTTTTTTTCTTTTGATGTTCGTTGTCCAGGTATCCGAACGACAGCGATAAGCATATGTTGGCATCTCAAACTGGTTTGACTAGGAATCAGGTGAATGTCTTTTCTTTTATTGTCCCCCATAATTTTCCTGCTACGTTTTTGCCCTTGAATCTTACTGAATGAGACAATGTTAATATAGGTAACAGTTTTTTATTTTCACGTAACATTTTTCACTACCAATGTTTAGTGCATATTTTGAAGGTGCATTGCATGTATGAGTATTTGATAAGATATGTATATAATCAATCAATGTATTAATATGTAATCTAATGTTGATGCATAAAACTTACTGCTTTCTTCAGTTGTCCATTTTGTTTGTCAAAATGCAAATATGTCTAACAGTTTTTTTTTTTTGACTCAACATATATCATTATTAGCACGCTACTGTTGCTTTATATTTAGAAAGATCATTGCAAGTATGTGTACAAATTAATATTTCCTTCAGGTAAATATACCATAGATGAGAACTGTTGAATATCATTTATCTAAACAATCAAGGAATCAATATATACTCTTAATATTGGTGCATAAATCTTGCTCCCTTCAACAAATGCGCATTTTTTATGTTTTTTAAAACCTTCCTGGATATTTCTGGCTATGCTACATGAAAATATAATATATGGAAACAGTGATCCCTCATGCACATTTCATTTTATTTCAACCGAAAAACAACAGGTTTCAAACTGGTTCATCAATGCAAGAGTAAGACTGTGGAAACCAATGGTAGAAGAGATTCATATGCTAGAGACAAAAGGAGTATCGGGAATGGACCTAAACAATGCATCAAAGAGGAACACTGGAAAGTCGATCATAACTGATGGTGATCCTGAGCCTGAGTCCCAGTCTAACAATAACAAGACAGTTATCGACTACTCAAGAGCAAATAATAATGAACTGGGGTCAAATGTAAACACAATGGACCAGCAATGGCACCAAGAGAAGCGGTTGAGATTGGAAGACAGAGAGGAAAGGTTGCTGAGCTTTGCATATCATGGTAGCATGGACATGTCCCTAACTTTAGGACTGGGGCAAAATGATGATCCTCAACACCAGCATCAGCAAATGGTGCATTTTGGAGGCCAGATGCTTCATGATTTTGTGGGATGATTTATTTTATGATCAATAGTTGTTGAAAGTGTCATTATTGTTATGTGAAATTGCCTAGGTGGGCTAGGTTTTGTTTGCAATGAGGCTCATTTGATGGCATAAACAGTGGATGTGTTATATGTAGACGAATTTAGAATGAAAGGTGAAGTCATGTAGAATGCGTATGTGTTCGTTTTGTAAAGGAAGATTCAGTAGCATGTTATTGTTTCGGCAGTGATTTTTTTGTAATTATTTGGTTTTCTTTTATGGCTGCG

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020250871.1	1.6e-78	BEL1-like homeodomain protein 9
Swissprot	Q9LZM8.1	1.8e-42	Protein VAAMANA
trEMBL	A0A1R3L583	1.2e-78	Homeobox domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT2G27990.1	37.77	1e-42	171	BLH8;PNF	BEL1-like homeodomain 8

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC7G03967	AT2G27990.1	278	139	6	162	438	206	450	37.77	1e-42	171
AfisC7G03967	AT5G02030.1	392	216	9	63	438	6	374	34.95	2e-41	166
AfisC7G03967	AT2G35940.3	239	90	7	226	438	190	411	44.35	1e-40	164

Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g281842.t1
Allium fistulosum	AfisC7G03967
Allium sativum	Asa0G00959.1; Asa0G04566.1; Asa0G04568.1; Asa3G01814.1
Arabidopsis thaliana
Oryza sativa

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF07526.8	POX	Domain	225	351	131.4	3e-38

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005634	C	nucleus
GO:0005737	C	cytoplasm
GO:0006355	P	regulation of transcription, DNA-templated
GO:0046983	F	protein dimerization activity
GO:0009639	P	response to red or far red light
GO:0009908	P	flower development
GO:0010076	P	maintenance of floral meristem identity
GO:0010077	P	maintenance of inflorescence meristem identity
GO:0010223	P	secondary shoot formation
GO:0010228	P	vegetative to reproductive phase transition of meristem
GO:0010229	P	inflorescence development
GO:0043565	F	sequence-specific DNA binding
GO:0044763	P	single-organism cellular process
GO:0048510	P	regulation of timing of transition from vegetative to reproductive phase
GO:0048523	P	negative regulation of cellular process
GO:0080006	P	internode patterning

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network