result

Gene information

Detail information of AfisC7G05178

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC7G05178	chr7	945273087	945276840	+

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC7G05178
CTTCAGCTTCATTCTTCTACTTCTTAATACTCAAATCTTAACAAAAAATAATGGATGTAGTCACTCCTCAAGAACACCTGTGTTATGTTCGTTGCGCTTATTGTAACACCGTGCTTGCGGTATTTGTTACTTTGTCAGATCCATGAAGAAGAAAAGAAAACTTTATGTTCTTTATTTAGGACCAGATATAATATATGTAGTATTTATTTGATCAATTTGAGAATAACAAATATGTAGGTAGGAGTACCATGTAGGAGAATGATGGATACAGTAACGGTGAAATGTGGACACTGCAATTCTCTTTCTTACTTAAATCCAAGGCCACTTCTTCAATCACTTAGTTGTTCTGACCATCACATCAATTTTCAGGTTATTTCTTCTTGTTTTTTATTATTTTAATTTGCTGCCTTTCTTTGATATTTATTTGTGCAATTTAATTGAGCTGTATAAATTTTAGGGTTTGAATCATTTGTTCTGGTTAAAGCTGTTTTTATTCAGTGGATGATGGGTTAAACGTTTACAAGATATAATAATGTTTTTTATTCTTAGTGTTATTGAAATTTTTACTAAATGTACAAAAAATGCTATAGCCTAAAAATAAAATGTGGTAACTTAGCTATTCAAACTTGGATTTTGTTTTTTTTTTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTTCTTCTTTTTTTAGTGACTATGATTTGCTTGTAAAATACCAGAATCAAAACCTGTTTTCACATTTAACTAGCTTTCAGATCTAAAGTTTGTATTGTACTTTTTAAAATATATATCAGGGAAGTAGTAGAGTTCATATGCTTTTTTTTTTTTCGTTCTTGTGTATGAATAGTACTATATAGTGACTTTTATGTACTAAATCTGCACTTTTATTGTTTTCATGGAATATATAATTAGACACTAAAGAGGACACTGAATGTATTTATCTTCATGTATGTTTTGAAGAAGTTTGATTAACCGAGCTACAGCTAGCCCCATTTTAGTTGGTGTATAAACTATATTTTGTTTATGATTTATGATTTCTCGTAAGGTTAGTCGGGCCGATCTTACTCACTATATTTTAGAACTTTATTCCGATGCAGTTTAGTTAAATACAAAAATCTAATATATAAACACATTGTATTACTATGATTAATTGCACACATTTTGAATTCATATATAATCTAAGGATACCTTCCTGTTTTCAATTTGATTGTAAAATCTTTGTGCTAATCCACATAAGACATCTTGGATTACTGAGCTTTGTTAAGTAAATCAACTGATATTTCTTTTTAATTTGTTGGTCTGTTAATTTGATAAACCCTTTCTAATGGTATGTATATTTGTCTAGCACTTAAGTCGCTTATCTAGTTATCAAGACAATTTTTTATTTTTTATTAAAATATAAATAAATAAGTAAAATCATTTCCATATTCTTCTGTATTTAACAAGAATTTAGTTTGTATGCTATATAGGGTCAGTGCAATGAGTTTAGGAAGGGGCAGCAGTTCTTACCGTCTTCATCAACATCATCTGAAGACATTACTAGCCCTAAACTGCCTTTTGTCGTTAAGCGTAATTATTCATTTCCTAATCAGAATTAATATGTTGACTTATTATTAGTTTTTTATACCTTATTATATATATATATATATATATATATATGTTTATCTTGTACAGCCCCAGAGAAGAAGCATCGACTTCCTTCAGCATATAACCGATTTATGAGGTAATTTGGATATATATATAACACATAGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAACATTTAATTAAAACAAGAAGTAAAATTGACCTTAATTTGATAATGTATGCACACTGTTAAAATATACATATCAATGAATTATATGAAACTAATTACTCTTAAATGTGAGTGACTGCCCGGTTAAAGTATTTGGTTGTATAGACCATAGTTTCAAGAAATGAACCAAGAGTTGAACCGTGTTGATGCAAGGTCAACGGTTCTAATGGTTCAACCGGTCAGAGTATGAGAATCGCGTTGATCATCGTTATTTTCTATTTTTCAAATTTAAATGTAAAATTATTTCAATTAATATTAAAATTTAACCAATTATAATTAATATATTGAACTTTAAAACAATTTTCTTGAACATTTCATAATAAATATTGATTGAAATAATTCTATAACAATACTTTTAGCACAAAATTGTGAATTTTCTTATTTTTTGAAATGAAAGAGTTTCGGTTCAACAATAATTCGTAAAATGTACGCTAATAATGTATAATGTCGTCCAAAATTGATAAGATAATCTAATAATTTAGTGGTGGTTAAGGTTATGAAATTATTTGTTAATTTGATTGTGTGAAAAAAATGAGGAGTGAAGTTATACTTTTCCTCAAATTTGAAGAACCGTATGGTTCAAAGAGGTTGGTCCAGAGGTTTTTTTTTCAAGGTTTTTAGGTTAGACCGTGTCATACACGCGCAAAATTATTTTATTTTCAGAACCATAGTGCTCCAAGGTTGAAGGTTAATCGTGGTCGAACCGAGATTGGATTGGGTCTTTAAAACACTAGTATATACAAAGATCTTGGATTTCACATTCCAATGCATCTTCTATAGTCAAGTTCAGGAGAGAGAAAATCACCACAAATGTATGGTGATTTATTCTGAAATTTAGTCCAAAAATGAGTTGCATAATAGAAACAATGTATTCGTGGTCAAATTATCTGTTAATAATTGGTAGATTGTAAGTAGACATACTCAAAACATAGAACACATTGACAGTCTTATATTAAGGCAAATTAATTAATAACGAAATTTTTGTCTACTAACATAATGGTGAACAATAAAATTGGCTTGTAATTTGACTGGATTCAAGAATACTGATTTCTATATTATTTGGCCTTTGGAAAAATATAACTCATACCACTTAATTAAATATAAATGAGATATATACGGCCAAGTTGTAAAACACTAACTAGGTAGGACATGTATGCTTTTAATTCTAATATTAGATAAATACAACGCTGCATACATTTCTTCACAGGAATCTACAACTACATATATTTGCAAGATCGCCTAGGAAATGAAAAGAATTGTTTACTTCATATTGTGCCTTTATTAATTTGAATGTGGCATTATGAAAGTAGCTGGTGAATTATGTAATCTGCACAGTATTCTATTTCATATATGTAGCAATTATTTTTGTGTTCTGATAATTTCAAATGGCTTTATACAGGGAGGAGATCCAACGAATAAAAACCGCGAATCCTGAAATGCCTCACCGTGAAGCCTTTAGCACTGCAGCTAAAAATGTAAGCCTTTGTGTTATGATATTATCATATATATATTTCATCTTAGCTTTATATGATTAAATGATTAAATTTCTTAGAAATAAGAATCAAGTTATTAATGTCTGGAAACAAATTGTGATCAAAATCAGTGGGCGAAATGCGAACCACGAGGTGTGCTAGCAGCTTCTGCAAGTTCAAATATTACGCATGTTGATAAAGATCTTGGAACATCTAAATCTATTGCTAATACCCTTGATCAAGTAAGTTCTAAAACTGGTTATTTTTTAAATCATATGCATTGAATTCTTTTTTAATAAAATATACTTTTTATTAATGTTAATTTTCAGGAAAAGACTAGCAATGGATTTTTGATGAGTAGCATATTCAAGCAAATGGATCATAGAATGTAGTATCCTCACTTTAAATTTTAATTATTGATATTGTATGAGTGCTTTTTCTCTGAAGAACTATCAGGTTGTAATATTTATTAGTTGC

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020276732.1	1.6e-73	protein DROOPING LEAF-like
Swissprot	Q76EJ0.1	9.0e-58	Protein CRABS CLAW homolog
trEMBL	D2Z0F1	1.4e-68	Uncharacterized protein AaDL

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT1G69180.1	59.88	6e-43	170	CRC	Plant-specific transcription factor YABBY family protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC7G05178	AT1G69180.1	162	60	4	4	162	14	173	59.88	6e-43	170
AfisC7G05178	AT2G26580.2	147	63	4	4	144	5	144	48.30	1e-31	132
AfisC7G05178	AT2G26580.1	147	63	4	4	144	5	144	48.30	1e-31	132

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF04690.10	YABBY	Family	6	146	175.6	1e-51

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005515	F	protein binding
GO:0003677	F	DNA binding
GO:0003700	F	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0046872	F	metal ion binding
GO:0005634	C	nucleus
GO:0006355	P	regulation of transcription, DNA-templated
GO:0009909	P	regulation of flower development
GO:0009933	P	meristem structural organization
GO:0009944	P	polarity specification of adaxial/abaxial axis
GO:0010022	P	meristem determinacy
GO:0010093	P	specification of floral organ identity
GO:0010154	P	fruit development
GO:0010158	P	abaxial cell fate specification
GO:0010450	P	inflorescence meristem growth
GO:0048440	P	carpel development
GO:0048833	P	specification of floral organ number
GO:1902183	P	regulation of shoot apical meristem development
GO:2000024	P	regulation of leaf development
GO:0090706

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network