result

Gene information

Detail information of AfisC7G05783

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC7G05783	chr7	1042998006	1043004837	-

Sequences

CDS

>AfisC7G05783
ATGACATTGAGAAGACGACAAAAGACTTTTCTACATGTTTTCATGCTATTTGTGATTAATAACACACAAGGAAATTTTTTTGATGTCGAAGGTGGTGGGAGCGGCAATGCATTCGGTGGAGGAGGTGAAGAGCGAGTGGAGAGGATTGAGACGACCCATCATTCTGATCAAGATCTTTCACTTGACATCACATATCATACGAATATGGAGTCTATGTTAGAGCCTGCATTGAAATTAGGTTTAGATTTGAAATCAACAGATGCATCTCAAGAGCAAGAAGTAATAACCAATCAAAATTTTCTCAATCAAAATCGCCATACTCAGATCCATGGACCATGCAAGAAGAATTCAAGGTTGGAAGGAAAAAGAAGTGCTCGAGCTCCGAGAATGAGGTGGACTACTGCGCTTCATTCTCGCTTTGTGCATGCTGTCAACCTTCTTGGTGGGCATGAAAGGGCGACGCCGAAATCTGTGTTGGAGCTGATGAATGTAAAAGAGCTAACATTGGCTCATGTTAAAAGTCATTTGCAGATGTATAGAACAGTAAAAAGCACCGACAAAGGCATAGCAGGACAAAGAAACGATGATATGAATATGAAGGTGCAGAAGACATTAGTACAAATCGATGAAGAGCAAGTTGCGTGTTCTGAGAAAGACGAGACAGTAGTAGATAATAACAATAATATTTATAACAATATGGATCCTACTTATAGTGCAGTTAGTGCACTAATTCCACCCGCTCTTCCATTCTCAGAATTACCAAGATATCCTTGCTTACAGGTCCAAAACAACAAGATGAATCCATCTCTGCAACAAAAAGGACCATTTGAATTCAAGGTGCTGGAAGATTCAGATAGAGAATACATAATAAATTCGCTATCTGGAGATCAACGAGAAGATATAACAAGGATCAATAGTTTATCACCAACTCAGCAAACCGAATCAAACTCTATTACTGGTACCGATTTACCTAACTTGGATATTTCACTAGGAAGACAAAGCTGGCAAATGGAATGTGTTGACTCCTCAAACGAACTGACTCTTCTAAAATGCTTGTGA

Protein

Gene

>AfisC7G05783
ATGACATTGAGAAGACGACAAAAGACTTTTCTACATGTTTTCATGCTATTTGTGATTAATAACACACAAGGTTTGAAGTTTCCAAAAAAAAATGATCATCCAATTTGAGGGGAATACCTACCACACTAGCAATTGTGCTTAATATTTCTCTGTCCCACAGTCTAAGGTTTAATTCAGGCAGTTTAATCCAAATAGGCATAGGAGAGAGTAAATCTTTGTAAAGATTTATTTTACCGCTCCATTTTTTCATAATAATAAGTTTTCCATTAATAAAATATGGACCCCCATTTATGGCATTATCACAATCAGAAGCATTGGAAAATCTGATTAAAAAGAATCCATTATTATGAGTGAAAATGTCGAAATTACCTATGGGATTACAAGATTTAGCGATAACTGCCTTGAAATGATGATATGCGGGTCTGTTGCCAAATACGTAGGCAAAAACTGAGAAACTCCATTTACTTTCTGCCCTTTTGATGGCCTCCGCGCTCACCACCACTATTTTCTTCTCATTAATGGAGAGAGGAGCAGCATACTTGAGGCCAAATTTAGTATTTGAACCTCCTTTCTTGATTATTTCTGCCCATGAAGAAGGTTTGTTCAGGTTAGTGCTGGATTGAGATACTAAATTCTCATTATGTTGAATGATTCTTGAATTGCTTCTTGAATTTCAGAAATGAATATCTGAGTTTACAACTTGCTGGTTGGTTCTTGCAACAATTTTTGTTGAGATTCTATCATTTACAGTATTTCTTGAATTGAATGTTCTCTGATTTGCATTTCTGAAAGTCTGTTTGGATTGATTCATAATGCCTTGTTTCAGGTTCAACTGATAAGAACCGATTCCTGCACGTTGCATTTGAGAAGTAGATTCTTTATTCAACATTTTTGATCTTCTATTCTGAACAACTTGAAAACCTTCTTCATCAATATCAGGAAATTTTTTTGATGTCGAAGGTGGTGGGAGCGGCAATGCATTCGGTGGAGGAGGTGAAGAGCGAGTGGAGAGGATTGAGACGACCCATCATTCTGATCAAGGTTGTAGATATGATTATTTAATAGATTTGTAAAAACAGACATGACATTTAGAATGCATTGATGAGATGTAAGGAAGAGAGGATGTTACTGTAGAGGTAACCCCCCTTATTTAGCTCCCTTTAGCACCCCTATTCGTTACCGCAAGTTTTTATTTAATTATTATTATAAACCGATTTGAACATGGATATCAACGTCTGAGCTTCAAGTAATTGTTCTTTGTCTGTATGAATAAAGAATTCAACAAAGTATATACAAATGCGTACAACCTTATTAACTCATCAGCCTAGTCGACTGGTCCATCTCTGGATACCAAAATGACCTGCATTATTAATTGTCTGTAGAATTTGGTCTTTGTCTATTGACATCATCTGTACCTCTCTAACATATAACATGCATTCCAATTTTTTAATAGATATTCCAAGTCTCTATCCCTATCAAAATTAAAAAGTCTCTTTCTCCGTGATTCAATTTAATAGCTGCACCACCCTCCAACTCCCAAAAAATTTCATAAAAAAGGATAAAAATTCTTTCATTCTCTCTGTCAAACATTATACCTCTGATTTCTCTATATGCACCACATATATCATTTTCACACTCTCTTTCCCCCACTTGTACATGTCCACCTCTCTGCTATTCTCTTACTCTATTTTCCACTAGCTCTTCTTTTTCACAATAATTGATGATGCATATACCATTTGATGTGGGTTTGGAGTCAATGTAAAGCAAACTATGTATTTTCATAAACCCTTGGTTAGAGCCTTGTGCATGACCTTATTGTCATACTTAATCATAACCTTTTTTTTATTAACGATCTAAAATATTGAAGTTTTATGATACACTTCTTTGACAGTTTAAGGATTGTCTGGTTTACTTTGTATTAACAAATATGACTGTTTGATGTGGAAATATGATGATAGAATCGAAACATGAGATACATTAATGAATATCCTAAATATCAACAGACCAAAAATACCAAAAATGTATTAAATAAATATTTGTAATCATCATAAATAAAATGAATATTATATAAAAAGGATAATATATTATAGCAATGTTATAACCTTAATGTGTGTCTCTAGGACACATGTTAACTTTTTTTGTTGTACATATATCATAACGACAATTAATTAACAATATGTCTAGGGACCTCATACTATCAATTTTTTTAATATGGGACTGACTGCATAAATAATTAATACTACTACCCTATAGCTACCCAAGCCTTCACATTCATTGTAAATCTTATATCACTCATGACCTAATATATTTCTTTTTAACCTGTTCACTAGATCTTTCACTTGACATCACATATCATACGAATATGGAGTCTATGTTAGAGCCTGCATTGAAATTAGGTTTAGATTTGAAATCAACAGATGCATCTCAAGAGCAAGAAGTAATAACCAATCAAAATTTTCTCAATCAAAATCGCCATACTCAGATCCATGGACCATGCAAGAAGAATTCAAGGTTGGAAGGAAAAAGAAGTGCTCGAGCTCCGAGAATGAGGTGGACTACTGCGCTTCATTCTCGCTTTGTGCATGCTGTCAACCTTCTTGGTGGGCATGAAAGTATGAGTTCAACCCTAGAAAAATAAAAATAAAATGATTAAGGTTGTATATATACACTTGGTTAAACAATTTATTTGATATTTTTGTTTATTTTAGGGGCGACGCCGAAATCTGTGTTGGAGCTGATGAATGTAAAAGAGCTAACATTGGCTCATGTTAAAAGTCATTTGCAGGTACAAAAAGCGAAAAGAAAAAAATCATTTTAGAAAATATATTCAAGAAATGAAATGAACACAAGTAACTGTGTTCATTCAGCTTTCATTTTCTTCTGTTTCCTGCTTTTGCAGTTAGAGACTTTGTCCTTGTAGTAAAATTGGTTTAGGGTTAGGGTTTTTGGGAAGAGAGTTTTGAATACAAGTACTAAGGACAAAATGGAATCTAGTGTTAATGCTATTTCATACACATCTTACATTATTTCTCCTTCATTTAACTCTTCTTGGCATAATAATTTGAATTTTTATTCCTGTATTTGTTGCAGATGTATAGAACAGTAAAAAGCACCGACAAAGGCATAGCAGGTAATAGTTTTAAAATTTTATTTCTCTTTTCCTAATTTTAGTAAAAAAAAAAATGTTTTATATTCCATTTAGCAAATTTGGTTTAATATCTTCTTAATAGTTGTTTTGGGTTTAGGACAAAGAAACGATGATATGAATATGAAGGTGCAGAAGACATTAGTACAAATCGATGAAGAGCAAGTTGCGTGTTCTGAGAAAGACGAGACAGTAGTAGATAATAACAATAATATTTATAACAATATGGATCCTACTTATAGTGCAGTTAGTGCACTAATTCCACCCGCTCTTCCATTCTCAGAATTACCAAGGTATGTTTCCAAAAATAAATTCTAAATTACACACATGATATAATCAGTGTTTTTAATATGTTATAGTCCTCTTTCACAGGCAACAATTTATTTAATCATAATATACGATATTCCTGTTGGTTTGCTTCATTAATTCTCTCAAATATCTATGCAAAGGGAGTATGTTTCTTCTTCTTCTTTAAATTACTTTGATACATTTCGAAGAATTGTTCTGTTTATTGTATTAGATTAATTTAACCAGCTAGAAAAATATTATAAACATATATAAATCTTAACTGAGTTGAGCCACATATTCGCACTTGGATTTCGGACAAATCCAAACTAAGTGTGTATTTCTAATTGTAATGTTCTGTCTCCATATTTTTTAACCATTAACGAAATCATAGGCAAAGATTTGATTAAATACACTGATTCACAAATGAAAAATTAAAGTTAAAATATGCTATCAATACATTATAGTTCGGTCTTCTTTTTAAAAAATTGGAGATGATTTGAGGCTTTGAGCATCAATATTAGAATATTTCATCATATTTTTTTTTTTTTTTTTACGGTCAAAACCATCTAAAGCTTCATTTAAATTTGGTCCTCTAAAATCATTATGAAACAATGATATTGCGCACCTAAACCAAACAGAAAATACTTTTTTTTAAAGAAAAACAATGTATAATTAAGAGGAAAAAAAACGTCTTTCTCTATTTCATCATATTATAAAGCTTTGGCTTATATATAAAAGCTTAAGAACTAAACTACAAAAATTTAAATTTGATTAGTAGAGATTTATCAATGCAGGAAGGGATTAATGGGTTTTGAATAACATAAAAAAAACGTGCTCAATACAGTTTTGCCCGATGGGCGTGCATCATTGGATGTACCATTTTTGTGAAGAACCAAGAAAGATATTTGTTTTCTGCATCTTATGTTGTACGATATATAAGTCGCAGTATTTTCCTTGGTAAAGGTTCCCCATAAAAAGTCCTTAGGTTCTGATGATACAATAACTTTCGTGGCATAAAAGTATGCATAAACTTTCTGTGACAAGAAAAGTATGTATAAACTTTCTGTGACAAGAAAAGTATGTATAAACTTCAAGTCCATTATCTCGGTTTCAATAATTTAGAGTTAGTAGCCTCTGGTTATAAGATCAATTCCAAAAAAATAAACATTTGTAATATATAACCAACCTTGAGATTTTGTTGTAGGTGTTTTAATATATCAGTTATGCTCATTCCTGTGGTGGTTTAACTTTTTGTGTTCTAGGTTTCTGTTATATCATTTTGAAATTCAGTTATAAATTATAGTGTATATACATTGGGAGAAGAAAAAATGTGCACATGTCTCATTAGAATATATAATAATAGTTATGTGGAAGAATTTGTATCTTTAACATAAATGAAAAGCTATGCAATGTTAATGCTACCAATAAATTGCATATTATATCATCAGAAAAGGTTATAGTTAATTAGCAAGTACTTCTAGCATTTAGTAGAAGTTTAATATGTATATGCCAACACTGATATATACATTTTGAAAGCAAACCATTTTGACTTTAGTGATAGTATTGA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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_010941887.1	1.3e-41	probable transcription factor KAN4
Swissprot	Q9FJV5.1	1.2e-28	Protein KANADI 4
trEMBL	A0A6I9SLN0	9.1e-42	probable transcription factor KAN4

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT1G32240.1	65.05	2e-32	137	KAN2	Homeodomain-like superfamily protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC7G05783	AT1G32240.1	103	34	1	95	197	183	283	65.05	2e-32	137
AfisC7G05783	AT5G42630.1	107	19	2	122	228	100	187	64.49	4e-31	132
AfisC7G05783	AT5G42630.2	107	19	2	122	228	100	187	64.49	5e-31	132

Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g439813.t1; g439814.t1
Allium fistulosum	AfisC7G05783
Allium sativum
Arabidopsis thaliana
Oryza sativa

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00249.28	Myb_DNA-binding	Domain	129	180	31.5	1.3e-07

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005515	F	protein binding
GO:0000719	P	photoreactive repair
GO:0003700	F	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0003904	F	deoxyribodipyrimidine photo-lyase activity
GO:0005634	C	nucleus
GO:0006355	P	regulation of transcription, DNA-templated
GO:0007623	P	circadian rhythm
GO:0009536	C	plastid
GO:0009555	P	pollen development
GO:0009650	P	UV protection
GO:0009944	P	polarity specification of adaxial/abaxial axis
GO:0009956	P	radial pattern formation
GO:0010051	P	xylem and phloem pattern formation
GO:0010158	P	abaxial cell fate specification
GO:0010229	P	inflorescence development
GO:0044212	F	transcription regulatory region DNA binding
GO:0016036	P	cellular response to phosphate starvation
GO:0048481	P	plant ovule development
GO:0055063	P	sulfate ion homeostasis
GO:0071486	P	cellular response to high light intensity
GO:1905392

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network