result

Gene information

Detail information of AfisC7G05874

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC7G05874	chr7	1055677797	1055695081	-

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC7G05874
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	ONK64912.1	3.3e-20	uncharacterized protein A4U43_C07F31400
Swissprot	Q1PF16.1	5.0e-13	bHLH transcription factor bHLH019
trEMBL	A0A5P1EGC5	2.4e-20	BHLH domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT2G22760.1	45.74	3e-15	77.4		basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC7G05874	AT2G22760.1	94	42	2	60	148	76	165	45.74	3e-15	77.4
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Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g430704.t1
Allium fistulosum	AfisC7G05874
Allium sativum	Asa3G00445.1
Arabidopsis thaliana
Oryza sativa

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00010.23	HLH	Domain	103	148	40.0	2.6e-10

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0003700	F	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
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GO:0005634	C	nucleus
GO:0005737	C	cytoplasm
GO:0007029	P	endoplasmic reticulum organization
GO:0046983	F	protein dimerization activity
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GO:0009753	P	response to jasmonic acid
GO:0010444	P	guard mother cell differentiation
GO:0010629	P	negative regulation of gene expression
GO:0044212	F	transcription regulatory region DNA binding
GO:0050826	P	response to freezing
GO:0045893	P	positive regulation of transcription, DNA-templated
GO:0043425	F	bHLH transcription factor binding
GO:0043565	F	sequence-specific DNA binding

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network