result

Gene information

Detail information of AfisC7G05885

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC7G05885	chr7	1057676122	1057688803	+

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC7G05885
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020276312.1	4.0e-44	transcription factor bHLH18-like
Swissprot	Q9T072.2	7.9e-29	bHLH transcription factor bHLH025
trEMBL	A0A7M3UQK8	8.1e-47	BHLH transcription factor

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT4G37850.1	41.54	3e-34	142		basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC7G05885	AT4G37850.1	195	96	3	101	295	151	327	41.54	3e-34	142
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AfisC7G05885	AT2G22750.2	189	96	2	101	289	125	298	41.27	5e-30	128

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00010.23	HLH	Domain	102	148	39.9	2.7e-10

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0003677	F	DNA binding
GO:0003700	F	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0005634	C	nucleus
GO:0007029	P	endoplasmic reticulum organization
GO:0046983	F	protein dimerization activity
GO:0009813	P	flavonoid biosynthetic process
GO:0009867	P	jasmonic acid mediated signaling pathway
GO:0009957	P	epidermal cell fate specification
GO:0010026	P	trichome differentiation
GO:0010444	P	guard mother cell differentiation
GO:0050826	P	response to freezing
GO:0045893	P	positive regulation of transcription, DNA-templated

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network