result

Gene information

Detail information of AfisC8G00316

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC8G00316	chr8	63682431	63687147	-

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC8G00316
ATGGTAGAGGTTCGAGGTATTTCCCAAATATTTATGAATAAAAACCGAAGAGCATTGGGTCCTATTTATAGGAATTGAAATGCACCAGACCGTAGGATTGAGTTCGGCGAAAGATGGATAAATCTAGAACATTTAATAGCATAAAACCCTAATCGCCGCTACGACCAAGCGGTCGACCCCCTATACTCAACCGGTCGATTGCTGGGGGTCGATCGGTTGGGTTTAATAAGTTGAACGCTCCTCTTAAATGGGGTGCGTTGATTTGTTTCTGTTGCACGATTAATTTTATGCCCTAATTAACTTTTTAATGTTAACTGTTAAATAAACATTTACTTAACCCCTAAGTAATATACAGTTAATTTTTGAAATTCAAACCCTAGATTTAAATACTCATTTGAATTTGAACTCAAACTAACTCAACTTAAGTTTGAAAACTTCAAACGCTCATAACTTCTTCGTTTGAGCTCCATTTTCAGCATATTATATATGGAAACAGATCAGAATTTTGCCTCGAACGCAACAGAATAACTTTCGTAGTCAAATTCTAACTTTTATAAGATTTCCATTTTCAACACTACCTTGTTTAATTCAATTCACTCAATTTACTTATTGTTGATTTTACGGGGTGTTGCAGAAGATTTATAATCTTCAGTATATTATATTAAGTTATATCGACTTATGGAATAATGTATTTTTTATGAAATACCCTCGTTATTTAAGTGTCTAACAAATCAGAAATCATGCCATACGTACATTTACGTATGTATTTATTCCTTAAGTTTATTTGGAGTTTATAATGTTCCACCTTTAATTTAAACATTCGTAGTATATAAGTTTTGCCATTATCTAACTTTTATATCTCATACTACTTATATAATAGTCTTACGTATAATATTATATTAATTAATTCTTATTCGATTAATTCTAATCAATTAACATTTTAATCAATTTTATATCATCATAATATAACAATTATATTAAATATTTATTATATACTATAAACTTTATAGCATAACACATATATCATATATATGTATATATTATCTAATTAATTAACCTTTTAATTCAATTAATTAATTTCTTTAACTAATTAACCTTTAATTAATTTATTTAATTAAACAATTTTAATTAAATTATATTGATTTCAAAAAATCATATAATATGCATACTACTTTTGATATCTTAAACATTTGAAAATACCATAACTTATATCAAAAATATATAATACATGTATATTTTTTTCATTAATTAACTTATTTAATTAAGTTATTATTTTTATTAATCTTATTAATAAATTTAATATTTGAAAATTAATTTATATTATTTTTCAAATATTTTGAAAAAATTAATCATATTATAACCTTTAATAATATGTGTATATCTTATTTTAAACTTAACTTTTAAATTTAAAATCTTATATTTATAGTTCTCAAATGATTTCGTAAGTTAGCCTAAGGCCAAATTCAAATTGGACCTTTTCTATTAGAGACAGCCTTTGGGCTTACATATCTTTTCGAGGCAGGCCGGTAGCCAAGTTGGGCAGAGTACTAGATTACCGAAACCCAATCCTAGACGCTGCTTTCTAAACATTCTACAAACTGGGCTGTGAGCTTAATTAGTTAACCCTAACATGACTAGTTTAGACTGCATAGGCTATTGGATTCTGGTACCATTGTTGGAAACGGGTCAGCCCGCAGCGGAAGAAATCGGTGAATTTCAAAAACAATTATCATTTTGAATCTTTATTGTACCTATGAAGTCTAATTCATTTAGAAAATTTCTATTTTTTTTAAAATAAAATCATTATTTTATTTAAATTTATAAAATATTTAAATTTTATGTATTAATATTATATTGTATATATACGTATATCATATACACACATGTGTGTATATATATGTATATATATATATATATATATATCTTTATGTGTATGTAACATAGCAAACATGCAAGGTGTAACATGCCGTGTATAAGTGTCGATTGTGAAGTTAAAGCGCTTAGGGGTTCCATAGCGGTGGAGGTGCAAAAAGTTACAATGGGTATAAAGTAAGAATATTGAGGAAAATGGTGGAGGTGCAAAAAGCTTCAATATATATAAAACTAACTTTTTAAGTTAATTTATTCCCATTCTCATATCATTTGTGTAGGAAAAAGCAATATTGTTTGTCCTTTTTTTTGAAATTCTGTACTTGAATGGTAATACATTTTAATTCTACAAGTCTTAGGTAGTATACAATATATATCAATATATGTCCAGCGGTTCAAATCATGTTATGCAAGTTTAGAACCTGTGACCTTCCACACCAAAGTCGGAGTGTCTAACCACTGGGATAATGGTGCGGTTCAAATATTGTTTGATCTTATATAACCAAATCGAAGAATATCAAGATTTATGCAGCCTAATTTGGTGATTAAAATAGATTTCTAACTTTTATCAAGCATTCACTACACCATAACAGCCATTTCGTAACACTTATTTTTTTCAATTGCTAACACTTATCTGCGTTGTAGATTAATCACAACAATAAGCGTTGCTAAGTAAGAAATGTGTGACCGAAAATACATAATTACATTTTTTTATTGTCCACGCATATATGCGTTGCCAAATTTGGTAAAATTGAAACTAAATGAATGTTTTTGGGGCAAAAAAGTAATAAACATTCTTTTTCTTCCACAACCCTAATCCAAACGTCTAACATTCATTCCCCAGCTTCAGCCGCAAGAATTTTCCCCAACTTTGGAAATTAGGGTTTCTAATTCGAAGCTTCCGATTGATAATCAGATGAGATAAATTCACATGTGTCCCTTGTCACTTTGATTGCTTGATTGTTGCCTCTCGGTAGCTTCGACGTCGAGTGAGATTGATCTAGAATTCGGTATATATTCTTCGATTTATGCTTTTGATTTTATGCTTTTAATTCAACTTGAGTTTATGCCAATGATGAATTAGGTTTATTTATAGGGTTTGATTTTCGATATATTAGTTTGCTTGAATTTTTCAATTGCTTTCTTTTTACGTTCGATTTATGATCAAATAATTTTTCAGTGGTTGACTCGTTATTTATTTTGATATAAGTGCGAATGTATAGACTTATATATCTAGACCCATGGTTGCATTTTTGGCCTTGACTTTGACTTCTTCTTTGATATTTTTGATGCTTTGTTTCCTTGCATTGTACATGTGATCTGCTCCACTAAGACCATGCTAAGGTGCAACTTCAATATGTATAATATACTAGGGTTTTTAAGATTTTATTGCAAAAGGCCTTGATTTTCTGTTACAATTCAGTGTTAAAATTCATATATATTCATGAAATAAGCTTAAGTCTGTGCAGATCTGACAGATAAACAAAGTTTGTGTGTAACTAATTTTTTTTGAGAAAAATGTTATTTAAGTTGCACTGACCTTTTCTCTCCTTTATGTGTATATACATTGTGAAATGAACAATAATCTTTTATTTAATTGTGTATTGTAATTATCATAGGTGGACTGGACTCCGGAGCTTCATCGGAGATTTGTTCAGGCAGTGGAGCAACTTGGGGTAGACAAAGCAGTACCATCCAGGATTTTAGAGCTCATGGGAATTGATTGTCTCACAAGACATAATATTGCAAGCCATTTACAGGTACACCTAATTTTATCTATATGTAGTTTTGGATAAACTTCTTCTTCTTCTTCATTATTTTTTGGGTTTGTTTTATTTTTCTGATTTTGGATACCATATAGAGATAAGCTTATCTGTAATATATTTAAAAGTATTCTCGTACATATGGTATACTAATTAGTTCACTGATAATAAATATTGTTGTATATCTAGCAACAATTTCTAAAAGTAAACTAATTTAGGTAAAAGCTGAGTGTAATTACATAAATTTTCCTGGATATATTACAGAATTTATATAATCTATTAACAAGGTCTTCTAAAACATGTAATTTAATCACGGTTATACATATCACATGCCAGATGCTTTTCTAAACCTGCACTTAATTTGATATTCAATCTTTTTACACACATGTACTCCAACTTTTAATGTAAAAGCAATTGAGTTTTCCTGAGAAGAACAATCGAAAAAAAAACTATTATATGAGTACAGAAAATATATGGAAACTTCATGTTCAGTATACTAAAAAACTATATATATATGAAATTCGTTAACTTCTTGAGGATAAGTACAAAGAAATATGACATCTACCAGTATAAGCATGCATTGACTGAAATTTGAAACTTGGAAGCATGTTACACTCTCATTTACATATTATATACGTAAGAACTCATAATTGTTGTTGAAGTACTAACAAAGTTTTAAAAAAAAATTGAAAAACGAAACACAGAAATATCGGTCGCACAGAAAGCATTTGCTAGCAAGAGAAGCAGAAGCAGCAAGCTGGAGTCACAGACGTCAGTTGTACGTGAGCAGCACTAACAATGGAGGAGGAGGAAAGACGATGAACATGAAACCTAGTTGGGCCCCACAACCACAGCCCATGGTTGGATTTCCTCCAACAATGAATCATCCTCAACATCAGAACTTCAGACCTTTGCACGTCTGGGGCCATCAACAGGCGGTGGAGCATCCTCAGCTGGTTCCGGTCTGGCCCAGACCTCCATGGGGCACACCTCGACCAGTGCATGGACCTGTTGTGCCTGCGGACCCTACTTATTGGCATCATCATCCACATTATAATCAAAGGGTACAGTTTACATGCTTTTGA

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	TYH29572.1	1.8e-44	hypothetical protein ES288_A01G023500v1
Swissprot	Q9FFH0.1	3.1e-38	Golden2-like protein 2
trEMBL	A0A5D2HH98	1.3e-44	HTH myb-type domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT2G20570.1	56.89	2e-40	161	ATGLK1;GLK1;GPRI1	GBF's pro-rich region-interacting factor 1

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC8G00316	AT2G20570.2	167	58	6	2	160	172	332	56.89	2e-40	161
AfisC8G00316	AT2G20570.1	167	58	6	2	160	156	316	56.89	2e-40	161
AfisC8G00316	AT5G44190.1	177	56	4	2	167	150	308	51.98	2e-38	154

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00249.28	Myb_DNA-binding	Domain	3	51	34.3	1.8e-08

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0000160	P	phosphorelay signal transduction system
GO:0005515	F	protein binding
GO:0003700	F	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0005634	C	nucleus
GO:0009409	P	response to cold
GO:0009658	P	chloroplast organization
GO:0009736	P	cytokinin-activated signaling pathway
GO:0009910	P	negative regulation of flower development
GO:0010380	P	regulation of chlorophyll biosynthetic process
GO:0010638	P	positive regulation of organelle organization
GO:0045893	P	positive regulation of transcription, DNA-templated
GO:0043565	F	sequence-specific DNA binding
GO:1900056	P	negative regulation of leaf senescence

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network