result

Gene information

Detail information of AfisC8G00649

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC8G00649	chr8	121807819	121812544	-

Sequences

CDS

>AfisC8G00649
ATGTGGTGCTGTGGAGATAAGGAAGAAGATAATTTTGGTACTCAAGCTACTCAAAACACAGCGCCTCCTAGTCGCCCTAATGGTCCGGATAGAGAAGCAAGAGGAAGCAATGTCCCGAAAACTGGAGCCCCTAAAAAGGAGTTATCTATAGACATTCCAGCATATTCATTATCCGATCTTAATCGAATAACTAAAACTTTCAGTCAAGATTCATTTGTTGGTGAAGGGTCATATGGTCGTGTATTTAAAGGAACTCTACCTACTGGTGAACTTGCTGCAATAAAAAAACTTGATCCAAATGCCTCTCCCGAACCTGACTCTGATTTTCAAACCCAGTTATCTGTTGTTTCTAGACTCAAGAACGAGTACTTTGTCCAACTGATGGGATATTGTTTGGAGGATAATAATAGAATTTTGGTATACGAGTTTGCTATGAAAGGCTCTTTGCACGACATTCTGCATGGAAGAAAAGGGGTGGAAGGTGCCAAGCCCGGCCCTGTATTAAGTTGGAACCAGCGTGCTAAAATAGCTTATGGTGCAGCAAGAGGACTCGAGTTTCTTCATGAAAAAGTTCAGCCTTCTATAGTTCATAGGGATGTGAGATCAAGCAATGTACTTGTTTTCGATGATTTCAATGCAAAAATAGCGGATTTTAATTTGACCAATCAATCACCTGATACAGCTGCTCGCTTGCACTCAACAAGAGTTTTGGGAACTTTTGGTTATCATGCTCCCGAGTATGCAATGACTGGTCAATTGACACAGAAGAGTGACGTATATAGCTTTGGAGTTGTTCTATTAGAACTCTTAACAGGTCGAAAACCTGTAGACCATACCATGCCAAAAGGACAACAAAGTCTTGTTACCTGGGCTACACCAAGGTTAAGCGAAGACAAAGTTAAACAGTGTGTTGACCCCAAACTGAATGATGAATATCCTCCAAAGGCAGTTGCTAAGATGGCAGCAGTTGCAGCTCTTTGTGTTCAGTACGAAGCCGACTTTAGACCTAACATGACTATCGTCGTCAAAGCCCTTCAACCGCTTCTCCAAAAAGCTCAGGAAAATAGTGGCTGA

Protein

Gene

>AfisC8G00649
TTCTTAAATAGGCCTGATCAAATTTATTCTCAAAAATTTAGGGTTTTTTTATTCTTCCAGAAATTGATCGCATCGATTGTAACTCCGTTTGGATTTGGGTAAGTTATTTGTTTCAATTTCATGCATTGCCATCTAAATAATTTCATTTTGGTTGCACTATGGCTATGTATTCAGATTGACATTGCGAAAATTTATACCCAGAGGGCCAGATTAAAATTAATCAATAAATTCTGGTATCTTATGAATATGTTCAACGATTTCTTATCTCAAAGTTTGCCATTCTATATTTTGATCGTCTTAGTAAATAGGAATTTGATTGTCGGAATTTGGACAATGGTACGACTTCTGATATTTGGTCATTTGATCGAAAATTTTGTAGCTCGTTCACATCAAACAAGGTTTATGATTTTATCCTTTGATTGATAAGTTAAAAATAATCATCCAAATATGTGTTCCAGTTACCCAGATATAAACCATAGCAAGTTCAACCTATCAGAACAATGCATTATACTAAAAAATAAATGCAAGTTAAAGATTCTACAGAAGTTTTTATAAATATTGAGTGGAATCAGACCGATTTTGCTTCATTCCTCCTGTCATTATAGTAAAAACAAATCTAACTCATACTTAATAAACTAAATCTTAATCAATGTGTTATTAGATAACTGTTATTGTATTGAGTCATTTTTTCTATTTTCCTCTAGGTTCATCTACTTATCTCTTGAGCGAATTAGTAAGCCTATAGCTAGTATACGAAGGACTTCCATAAAAGCCTTCACCGAAGGATTTTGAGATAAGGAATTTAAAAATGTGGTGCTGTGGAGATAAGGAAGAAGATAATTTTGGTACTCAAGCTACTCAAAACACAGCGCCTCCTAGTCGCCCTAATGGTAATATTTTTACAGAGTATAATATTTCAGTATACACCGTGACTTCTTGTTCAATTGTTATCTTTCATTTTCTTATGTATACATGTATCTTATTCTTGATTATTATGTTCAAAGCTTCAATTTTCCAATTTGTCTTATTATACTTGAGTGTAACAAGATTAACCGACCTTTTCATTATTTTAATGTTCTAAACAAGCATCATATCTAATATGTATGAAGCTGTTTTATGTTAATTGCATCTTTTGTAATTTCTAATTCTAATCAAAGCTTGCGCATGTTCATTGATTGTGCATAAGTGATTGAACACTAATATGTATAATTGTAGAAGAGCTCCAAGTCTTTTCTTTCATAGCATTGTAAAACTGTGTTTCTATTCTAAATAGGTCCGGATAGAGAAGCAAGAGGAAGCAATGTCCCGAAAACTGGAGCCCCTAAAAAGGAGTTATCTATAGACATTCCAGCATATTCATTATCCGATCTTAATCGAATAACTAAAACTTTCAGTCAAGATTCATTTGTTGGTGAAGGGTCATATGGTCGTGTATTTAAAGGAACTCTACCTACTGGTGAACTTGCTGCAATAAAAAAACTTGATCCAAATGCCTCTCCCGAACCTGACTCTGATTTTCAAACCCAGGTATAATTATTTCCTGATTGAGAACTTATCTTCTTGAAAATAAATTTCTGCTTACTCTGAATCATATTTTTGCATTTGTAGTTATCTGTTGTTTCTAGACTCAAGAACGAGTACTTTGTCCAACTGATGGGATATTGTTTGGAGGATAATAATAGAATTTTGGTATACGAGTTTGCTATGAAAGGCTCTTTGCACGACATTCTGCATGGTATATTCATTATACTTCATTTAACCTTTTATTTTCCATTAGCATGTACGTATTTGAACATTAGCTTATACTAGATTCCATAGGTTTATTCATCCCCCATTTATTTATAATTCAGTATCAACCCACTTACATGAGTTTGGTAAACACAATTGTGAGAAATGTGGAATTCTGCCCTATATCACGGTTATATCCACTTTCAAAGATCATAAAAAGTTTTTTAAGTACTCTTAGTAAATCAAACAAATTTGGAATTTCAAAGTTTCAAATATATTTAACACCAAAAAGAATTTGAGTTAGTAAGCATGACTTATCTTTGTTATAGTCAAACTACCCAAGAACAACAACTGACTTCCAATTTGGGTTAGAATTTATATATTCATAGTTATATGTGGTATAACCCAAATTGCATAAGCCTCTATATTTTGAGATATCATGCTCAAAATACAAACTAGAACATACTTGCCGTGAATATTAGGAAGAGTTTTATTTGGATTTTTCATAAAACGCCCTTTTTAAGTTTAAAAATACACAGTTGTCCATCCTAAAAACCTATTATAAAAAACACCATTGTTTTTTTGTTTCAACCAAACTGCATATTTGCAGTTTTGCCAAAAAATTCAGAAAAATAAAATAAAATATTTTTGTCTATGAAAACCAAAATTAAGTGCAGATTTGATTTTCGTAAAAAAAAAAAAAGATTTACCGAATATAATTCTGAAAGTGTAATTTAAAATATGTTTTTGAGAAGGTTTTTCATATATGAAACTTGAAAATAAGGGGTGGCTCCAAATTTCCACATTTCAACTTCAAGGCTAATAAAATACAACTTTTTTATTCGCATTGCTCTCGTCAGTGTCATGTAATGTACATTGTTAAAGTTATATTTTTTATTTTAGTTTAGCTATGTCTTAAATAGGAAGAAAAGGGGTGGAAGGTGCCAAGCCCGGCCCTGTATTAAGTTGGAACCAGCGTGCTAAAATAGCTTATGGTGCAGCAAGAGGACTCGAGTTTCTTCATGAAAAAGTTCAGCCTTCTATAGTTCATAGGGATGTGAGATCAAGCAATGTACTTGTTTTCGATGATTTCAATGCAAAAATAGCGGATTTTAATTTGACCAATCAATCACCTGATACAGCTGCTCGCTTGCACTCAACAAGAGTTTTGGGAACTTTTGGTTATCATGCTCCCGAGTAAGCTCTTGTGGTTATCGATTATTTTATACATTTCGATTTTTAATTGTGAACAAAAATCGTGTGGAAATCTAATAGGATTAGCATGAGTGTATCATAACATGTGCGGTTAAAACAGTTAGCGGTTCTATAGTGGTGGAGTCGTAAAATGTTATATCGGGGATAAAGCAGGATATAGCGGAAAATTGTGGAGGTGCAAAAAACTTTATTAGATGTAAAACCAAATATTTAAAGTTAATTTATTCTCAGTCTCACTTCATTTGTGTATAAAACATAAGTTTTTTTAATTTTATATAACAAAACCAAAAAATATCATGATTAATACAGACTAAATTTGGTGAGTATAATAGATTTATGCCTTGAAATTAGGTCTTTACCCTTACTATGTTAATTTGGTTTGGAAGAGAACAAGTCAAATCAACCTTTGTATATTAATGTTGCTAAAGCGAGTGCTAAAAAACCTTAATTTAGTGAATGTAGCGGCAAATAGCAGGGCTTAAGGCGGATCTGCTATTTAATAGCGCTAAAATTAAATAGCGTAGCGGTTGAAGAGCGTTATACGCTATAACGAGGATTTTACGGGGATTTAGCGGGGCTTTAACTGCATAGATCATAACCGGTTTTTATTTGAATTTTATATGAGGCAACTTTTTTGGTTTAAGAAGCAAAAATTTATATGATCAATTTTCATATGAAAAACTAAATGACTTTTATTTTATTTTCCTTATCTGTATGAAAATATTTTAGCTAAAATAACAAATATTTTTCCTTCAGAATAAATAATATTAAATAAAAGTGAAATCAAATATTCTGCCTTCACTATAAAGACTGTTAATATCTTAGAATTGCATCCACAAAATTCCAACTGTATATTATTTGCCAAGAAACTCCTAGCACATTCTTAAACATCGCACTGAAGTAGTCATTGTAAAGAAATGTTATATACTTGCCTAATGCAATGCATGCTATATTCTAATTTTTAACCATTGCAAATACATAGGTATGCAATGACTGGTCAATTGACACAGAAGAGTGACGTATATAGCTTTGGAGTTGTTCTATTAGAACTCTTAACAGGTCGAAAACCTGTAGACCATACCATGCCAAAAGGACAACAAAGTCTTGTTACCTGGGTAATTATGTCTTGTTCTTAACATTACATATTTTCTCCGTTAAACACCAGCACACATAATATGAATTACATAACATACTTTATCACACCATATATACTGACAAAAGTTGCATTTGATTAAAATAGGCTACACCAAGGTTAAGCGAAGACAAAGTTAAACAGTGTGTTGACCCCAAACTGAATGATGAATATCCTCCAAAGGCAGTTGCTAAGGTCTGTTTTTCTTTCCAAGTTTTTAGTTATACGCATATAAAGTATAATCTTCTGAATTGTGATAGTTGGGGATAACCTTCATAGTTCCAGGTTCAGTAATTGAGATATTGTGCATGCAGCTGCATTTTATGCAATATCTTATAGGTATATTTTTCTTTTGACTTATCAGATGGCAGCAGTTGCAGCTCTTTGTGTTCAGTACGAAGCCGACTTTAGACCTAACATGACTATCGTCGTCAAAGCCCTTCAACCGCTTCTCCAAAAAGCTCAGGAAAATAGTGGCTGATTAAGTTCAGTTTTAGCAATTTGATTTGTTGATGTACTAAACAAATTAGGAGGTTAATGATCATATCAATTATTTTCAGATGTATGCTTCTATTATTGCTCCATTACATTCTTGGTAATAGTATTTTCCGATGTTATGCTGCATGGTTATATAAGGTTGGCTGATAAAAT

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020273948.1	2.2e-166	probable protein kinase At2g41970
Swissprot	P93749.1	3.0e-152	Probable protein kinase At2g41970
trEMBL	A0A5P1EHE4	1.6e-166	Protein kinase domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT2G41970.1	74.65	3e-151	531		Protein kinase superfamily protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC8G00649	AT2G41970.1	355	83	2	1	349	1	354	74.65	3e-151	531
AfisC8G00649	AT3G59350.2	353	112	2	2	352	4	356	67.71	1e-132	469
AfisC8G00649	AT3G59350.3	353	112	2	2	352	46	398	67.71	2e-132	469

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF07714.14	Pkinase_Tyr	Domain	71	345	151.1	3.1e-44

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0002221	P	pattern recognition receptor signaling pathway
GO:0004675	F	transmembrane receptor protein serine/threonine kinase activity
GO:0004715	F	non-membrane spanning protein tyrosine kinase activity
GO:0005524	F	ATP binding
GO:0005634	C	nucleus
GO:0005737	C	cytoplasm
GO:0006979	P	response to oxidative stress
GO:0007166	P	cell surface receptor signaling pathway
GO:0009506	C	plasmodesma
GO:0009626	P	plant-type hypersensitive response
GO:0009816	P	defense response to bacterium, incompatible interaction
GO:0009860	P	pollen tube growth
GO:0010068	P	protoderm histogenesis
GO:0019901	F	protein kinase binding
GO:0042335	P	cuticle development
GO:0046777	P	protein autophosphorylation
GO:0048367	P	shoot system development
GO:0048768	P	root hair cell tip growth
GO:1900459	P	positive regulation of brassinosteroid mediated signaling pathway
GO:1905393

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K13436	PTI1; pto-interacting protein 1	EC:2.7.11.1	Plant-pathogen interaction	ko04626

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network