result

Gene information

Detail information of AfisC8G00963

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC8G00963	chr8	193779206	193794244	+

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC8G00963
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TATTTGTTTGTTTGTAGGTTATGTGGTGATGCTGGTTAG

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	OVA02215.1	1.6e-17	B3 DNA binding domain
Swissprot	Q2HIV9.1	6.9e-13	bHLH transcription factor bHLH035
trEMBL	A0A200PVL5	1.2e-17	B3 DNA binding domain

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT5G57150.2	43.24	1e-16	83.6		basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC8G00963	AT5G57150.2	111	49	3	107	216	18	115	43.24	1e-16	83.6
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AfisC8G00963	AT5G57150.4	111	49	3	107	216	18	115	43.24	2e-16	83.2

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF02362.18	B3	Family	14	95	36.0	4.3e-09
PF00010.23	HLH	Domain	163	202	30.1	3.2e-07

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0003700	F	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0005634	C	nucleus
GO:0005737	C	cytoplasm
GO:0046983	F	protein dimerization activity
GO:0010444	P	guard mother cell differentiation
GO:0010629	P	negative regulation of gene expression
GO:0044212	F	transcription regulatory region DNA binding
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GO:0045893	P	positive regulation of transcription, DNA-templated
GO:0034756	P	regulation of iron ion transport
GO:0048657	P	anther wall tapetum cell differentiation
GO:0071281	P	cellular response to iron ion
GO:0071369	P	cellular response to ethylene stimulus
GO:0071732	P	cellular response to nitric oxide

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network