result

Gene information

Detail information of AfisC8G01338

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC8G01338	chr8	272822510	272828633	+

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC8G01338
ATGGGTTCTTGCACTTCAAGATTGGAGGTGGATAACAAGGGAAATGCACGTTCAGGTACTATCAACTAAAAAATTCTTAATTCCATGTCCGTCCTTGTTTATGTTTTTTGATGCTTAAAAGTTTTCTATTTTGGTTTTCATTCTTTCTCTTCATTCAAGAAACTCATTTGTATTTTCGGTTCTTGAAATATACTTTATGATTTGAACATAATCCATTATCTTGGTGAAACCTTTTCAAGTTCTTTTTAGTAGTTTTTATCAAAATCTTGTTATATTATTGACAACATGTTTAAGTCATTGCTGAGTTGAAATCATATGTGGAAAAACTATCCAGGCTCCTTTTATGCATTTAGTTTATTCAAAAAAGAATTAAAAATCAATTTCTCTGCTTTTGGTTCATGATATTTGATCAAGAAATTCAAATGCTTGCTTGTCTTTCTCTTTATAAAACGAAATTCTTTACTTCTATTTGGACTCAGTAGACAGTGGTCCATGAACATTTTCTGTTGCTGACTTTTGTTTGGATTTAGCAGGCAGTGCTTCATGGAAATATTCTTATGATGAATTGGCTGCTGCCAGCAATAATTTCAGTGATGATTGTTTATTGGGAAGAGGAGGATATGGTTCTGTTTATGTAGGAAAACTGAAGCGCACAGGCCAGGTATTTAAAGCTATGTATCGTGTCTGGTAACATTCAAGTGTATATTTGCTATCAAAGATATCAACATATAAAATAATACAGTTTTCGAAACATTTATCATGTCGATAGATTGTGGCTATAAAGAAGCTTCATAATGATGATGGTCATCAACGTTCTGAATCATTTCATACTGAAGCAGTGATGTTAATCGAGCTCCGTCATCCCAACCTTGTTAGTTTGATTGGACTTTGTGATGATGGTGAAGAAAGGCTTTTGGTACTAGAGTACATGTCTCTTGGGTCACTGGATGACCATCTCTTCAGTGAGTACCACACTTGTATTCATAATTGTGCATTCAAATTGGTGACAATTACAATATGGCTTAAGGATATTACTCTAATACACACTTCACGATATTATGCAATATGTGTAGCATGAAGCATAGATAATACAATTCCTTGATCATGGGAGAATAATACAATTCCTTAATCATGGGAGAAGTCTATATAAAAGATATGGATTCAATTCAAAATTCGTGAAACTTTATTTTAAGTTATACCATCATTATTTTTTGTGCGAGTGAGTGAAAATCAAAAGAGGAAGAAGGTAGTGTTCTTAACTCAAAAGATTGGACATACTACTTCTGATGTACTCAAGTACTGTGATGATTCTTCTATATTGGTGTAGAATTTGTTTAATTCTATCAATGGTAACATGTTCTTTGATTTCCATAGGATGTAATTCAAGAATGGTACCTCTAGATTGGAATGCACGGATGAAAATAGCATTATGTGTTGCCCAAGGATTGGAGTATTTGCATCTTAAGCACGATCCACCAGTTATACATAGAGACCTGAAATGCTCAAATATATTACTTGGGGAGGGTTACCATGCAAAATTATCAGATTTTGGCCTGGCTAAAGAAGGACCGGCTGTTGATAAACCTCATGCTAAAACAGCTGTTGTAGGAACTGATGGATATATTGCCCCTGAATATGCTAGTACACATAGATTGACTGCTAAATCTGACATATATGGTTTCGGGGTAGTGCTTTTGGAAATTATTACTGGAAGGAGGGCGGTTGATGATTCCAGTCAGGCAAAAATGAAAGAGCTTGTTGTTTGGGTATGTGCTTTCTTTCTATCATACTTTTCCTTAAGTGTTGGAAAAACAAATACGAATAAATATCTTCATAATACTTTTATTTCTTGAAAGCATTCATAGGTGTGAATGTAATACTACTAGCAATAGTTTGCCTACTGTGCGAAAATTTTAAGAATGTAAACCTCTTGTATTATTTAATCAGTTTGCAAAAACATAGGAAACCAGAAAGAAACCGAGTGCTTGTCATAAACTATAATCAAACAGAACTTATGTTCTGAATTGCCATAGGCAGTAGTGACCCAAGTATTCCTATAGATGGAGTAGCTACCATAACTGGATCCTAGTATTCATGGCAAAATTTTGTGAATTCAAATGGTTGTGGTACCTGATTTTAAACAAATGGCCATATCTGACCTCAGTAACCATTATAGGGTTGCATTGTATGTAATACATGTCAGATTGCAGAATTTATTTCCTTGCACTGTACACAGTACAAACATCTGAGCCTGACTGTAATATACTCCTATGATTTTCATTGGAAATATGATAAAAAAGTGGATGCTCATAGTCAAGTCAGTTTGTGCTTTCTATGCCTTGAATCATTTTTGTTAAATTATCTTGATTTATATAATTAAAGCGACACATTATATGCAAATAAATAAGATAAATTATTAAGCATTTAAAGTCATGTCTTTATACAATTTATGATGACTTTTGTTTTGCCTTGCATTGTTTACAGTGCAAATTACCAGATTTTTTTTTTAAAATTTATTTAGTAAATGACATATTTTATTCAGAAAATGATGTAAACTATGTATGTATATATGCATGTATATATATCCAAATTTGTGCAATTTTAGTAGTTTTTTCGCCTTGCTTTGTATACATACAATGCAAACCATGTTAAGATTTAGAATTTGTTCATTTTTATTAAAATTTATTCATTAAATTATAAAAGTGTTTTCATACGTGTGGTATAAACCATATAGATTTAAAAAAAAAATAAGAGCATTACTTTATTCAAGCAAAGCACTCATTTTTATGTTTTGGAGGATTGAACTCAAGGCCTGAAACTTAGTATAGAGCTACTCACTACTTGCCACTTGAGCTAGTAGTTCTTGACTAGAAAATAGGAATTTAAATATAAATAGAGATTGGATTTACAATATTAAAAGCACAAGACAATTTTTTTTATTGGAAATCAAAAGAATGAATTTTTTTCGCTCAGTTACATTTATTAGTAGGGCAATGCTAAGGTCTTATTGAATGAAGATTGTGACTGTAATTTCGTCTATTTCTATGAATCAGTTGATTATTGTACGGGTCTAGCTATGTGGTTCAATTTTGTGATTGAGGGAGTCTTGCATTAGTATTGTTTTGTAGTTTTTGTTATGTCATTATTATGTATTCAATTTTGATGTTAATGTAAAGTTGAAGTTGTACAACTCTGCAACACTGCTTGTTCTGCGGAAAAAAGAAAAGTAATCCTATTTATTAAAATGGAGCAAAGTTTCTAGCAATAAAAGTATATATTCAAGTGAAATATGAATACTTTAAATATAAGGTTCGTATCTAAATCCAGTTTTTATTTATGTTTTAGTGGAAAATAAGGAGACACCCTTATTCCAAATCTCATCTTTCATAAACCCATCACAGGAAGTTATAAAAAGTCTTGAAATCTTACGATTTAAATCCCGTTTCAGATCGGATCTCTTCTTTTATGATTCGATTTATATTCCGATTCAAACTTAGTTTGACTCAATCATACTGATATGTTCAATATACTTATTTGGATCCATGGTTTCACTTCTAATATTTTCTAAATAAAATAAAAGTGCAACAAGAAAGAAAATTGAGTTTTAGGTTTAAATTTAGAAGTTCGAATGTCAAAATCAATTTAAAAATGAGTACAAAACTTAAAAATATGAAATTTTGAATCTACGGTTTACGATTTAAATCTCATTTAAATTTAAAGTTTGAACTTTACGATTTACGATTTGAATCCCTTTTGAAAACCTTGGAAATCATTCAATTTTATGCTTTTTTTTAAAGCTTCTAGTGTGTTCTTCTATTTGGTGTGATTTCTTCAATTCTATTTTAACATTATTTAACATCCATTTATTTTGTAGTTTTTTTTGGCTAAATTATGCTATTGTTTTGCAAATATTTGCAAAATTGAGTTTATTTATGCAAATATTTGCTGAATAAACGTAGTTTTGTGAATATTTTATAGAAACATTTTTATTGTTTCAGAATCACTTTGCAGGTATTTTCAGAAAAGTTTTGCAAGTATTTACAAAATATTGTTATTCATTTTTCATTCATTGTGCAAAATGTTAGCAAAATATTTATGAAATATTGCTGTTTGTTTGACAAATATTGCAAAATATGCATTATTTTTGCAAATGTTTGCAAATTATGTAAATATTTGCAAAAGCATGAAGGTGGAGCCTTAGCGCAACGGGTAGATCACCCGCGTGGTGATCTACCCGTCCGGGTTAGAGTCCAGAAACAGCCTCTTCGCAATGCGAGGGAAAGGTTGCAAATAATATCAACCTCCACAGAGCCCGATCTCGTGCGGGAGCCTCGTGCAATGGGTTCCACTTTTTTATTTGCAAAAGCATCTTTATCGTTTCAGAATACTATGCTAATATTTGTAGAAACATTCTGCGAATTTTTGTAGAAGACTGTTGTTCAGTTTCATTCACTTTGTAAATATTTGCAAAAATAATTCATATTTTGCAAAATGTTACAAAATGAATAACAATTTATTACAAAATTCTTGCAAAATATTACCGGTCCATTTTCATTCATTTGCAAATATCTGCATTCTTTTTGCAATATTTGCAAAATGAATGATAAATTTGTAGTATTTATATTTTTACGTCTTATGTTGATTTCGAACTATAATTTTTTGTCTTTGATGATTTTTTCATATTTGTTAGATTTAATTCTTAATTATACTAAAATCGAACAAGAAATCGAGGGAAAAATGACATCGGTACCATAATTTAAGGGTCTGAGGTTAATTTGGGTTCAATATTTTCGTAAATAGGGGATTGTTTTTTATAGTTTTATTGGAAATGCATTTTGATGGTTTTTGATACTTAATAAGAGGTTTAACATACTTACCCTGAAATTTAAACTGTGATTTATGATTTAAATAGATGTCATGGAAAATTATTGTTCCAACTTTTAACCCTTTGAAAACAACTACCTGTACATGCTTAACACATAGATGACTATGCTATATTTGCTCGACCTTTTCAGGTTCGCATACACATGCACACTCATTTTCTCGTGCAAACACGTACACACATATACATACACACATATATACGTACATACATAAATACACACATATATATGCATGCATGCATATATGTGTGTGTGTATGTAGTGTAGTAAGTGAGAATTGAATCCTCGGCCTCGCTATTGAAAGCTGACATTCTCAACCAACCGCATTACCAGTGAGAGACACTTGCAAAACATGTAACATGCACTTATGTTGTTGTTCACCCCCCCATATCAAACACTGAATAGAGCCCAAAGTAAAATTAAAATAATTATTATGCAAACTCACTTAATACTAAGTCTTTTCCTCTAAATTCTCACGTTATCTTTCAAACACTAAACCCTAGAACATAATTACTCTTATCAACTCATAAATCAGTAGAAAAATATAATCTTTTTTTGCAAAACATGGATTAGAAGAAAAATGACAATGGAAAGAAGTTATCTCATTTAAAATCGATTAAACATATTTATTTTTGTTGTATAAATTAATGTAAATGACATTTTGGGACTGTGTTAAAAGTTTACAAATTTAAATCACAAAAACCTGCGCTTCAACCTAGGGTTGGGTAATTGAAATTCATGTTCAAGTGGCATACTAATATCGCTCCCCGAGCATAACTAATGACTGTTGATTGGACATGTCTTACCGTAGGGACATGATTTTGGTTTTCTTTGATTTCCGCATTACAGGAAGATAAGTAGATAACAGTGAGTAGAAGATGAAGAGAGTAGTAAAAGAGTCATTAGTATTGGATGGGCGTTTATTTATTTTAAATTTGGGTATTGAATAAGGGTATTTTTTAATGAAATGGGTAATATTAAAGATATAATATGGGTGAGTAGCAACACTCTTATATTTTTTGTATAATGATTTTATATTGCAGGCACTACCATACATAGAGCATGAGAATTCAGTCACCGATATAGCAGATCCTTCGCTTCGAGGCAAATACCCAAGAGATGAATTTGCTAAAGCTGCAGTTTTAGCTGCAAGGTGTGTCCAGCTAAATCCAGATAGAAGGCCTCAAATTGACGAAATTGTTTATGGACTTACTAACCTTTCAGAACCATCGACACTGTAA

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_021624237.1	2.8e-88	LOW QUALITY PROTEIN: probable serine/threonine-protein kinase PBL7
Swissprot	Q1PDV6.1	3.3e-86	Receptor-like cytoplasmic kinase PBL27
trEMBL	A0A5P1FK15	2.6e-88	Protein kinase domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT5G18610.1	54.39	3e-87	318		Protein kinase superfamily protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC8G01338	AT5G18610.2	296	134	1	21	316	67	361	54.39	3e-87	318
AfisC8G01338	AT5G18610.1	296	134	1	21	316	67	361	54.39	3e-87	318
AfisC8G01338	AT5G02800.1	292	132	1	25	316	61	351	54.45	1e-85	313

Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g175758.t1
Allium fistulosum	AfisC8G01338
Allium sativum	Asa1G03731.1
Arabidopsis thaliana
Oryza sativa

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00069.22	Pkinase	Domain	41	309	173.0	7.1e-51

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005515	F	protein binding
GO:0002221	P	pattern recognition receptor signaling pathway
GO:0004674	F	protein serine/threonine kinase activity
GO:0046658	C	anchored component of plasma membrane
GO:0005634	C	nucleus
GO:0009816	P	defense response to bacterium, incompatible interaction
GO:0009941	C	chloroplast envelope
GO:0010183	P	pollen tube guidance
GO:0035420	P	MAPK cascade involved in innate immune response
GO:0046777	P	protein autophosphorylation
GO:0071323	P	cellular response to chitin
GO:0090404	C	pollen tube tip
GO:1900150	P	regulation of defense response to fungus
GO:1900426	P	positive regulation of defense response to bacterium
GO:1900459	P	positive regulation of brassinosteroid mediated signaling pathway

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network