result

Gene information

Detail information of AfisC8G01498

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC8G01498	chr8	310145886	310155440	-

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC8G01498
ATGGCTAAAAAAGGAAAGTCTATTGGCATGCGTGAATATAAAGAGATGGGTAAATTGATGGTAGAATCTGACATATATGCATTTGGTTTACAACTTTTGGAGATTATTACTGCTAAAAAGGCGACTGGTAATGCTAGCAGTAGTTCAAACTATGAGGAATGCGGATTACGGATCTTAAGGCTAGGAATAACACTAGAGGGGGGGTGAATAGTGTTTATAAGAAATTACTAAATCTTTTTGAGTTTATGTTAATTTGAACACAAATGTATGTAATATTCAGACACATATATAATCACAGATGCAGAAATAAAGTAAATGCAGTAAAGGAAAGAACACACCGGATTTTATACTGGTTCGGAGTTACCCTACATCCAGTCCTGCACAACTAAGTACAGATTTCCTTTCAAAAGCAATTCAACAATTACAACCCTCGGTTTCAAGTCTATGAGGTACACCCTCCAGAATCACAATCCTCTGGGTAGAGATAATTGATTTCTCGGGTAACAAGTTCACCCAATTAATTTCCAAGGCTACCATCACACCTTTTCTCGCTTGATTGATTTCCAAGGCTACAATCACACCTTTTCTCGCTAGATAGATTACAAAGAAGCCTATAACTCCGAATAGCACTGGGATCTTGTTGAGATAGTGATAGAGAATCAAACCAGAGATAATCTAGTTAGATTCAATGTTGATTTCGGCGGAGTGATGATAGGATTTTGAATAAGAAAATGTGGAAGAAGAAGAGAAGTGAAAAACCAGAAAATCTGATATCAAATTCGTTAAAACTAACCCCTATTTATAGAAGAACAACAACCATGTCCATTCGTGAAAGGTTATGGCGAATAGACACTTCTTTGAAATTCAAATTTTTGAATCTAACTGTCACTATGTCGACATGGGGTACTAGGGCATGTCGACATCCCAAAGCATTTTTTGATGATTTGATTTTCTTTGAAAATAACTTTTATCTTATATTACACTTTATAAATATACTTGACTATAGATAAAATACATAGATAAATATAGAGAATAATATATATAAAATTTTACTATAATTTTATATTTAAATCTAAGTATAAATATATTATAATTAAAAGATAGTTTAAAACAAACGAAGTTTAAAAACAAGAATTTAAGGCTAAAACATCTTTTTGAAAATCATTTGAAAAGATAATTTTTAAGGCTAAAACATTTTGAAAAGCAGTTTTGAAAATCATTCTGAAGTAGTTTTGAAAATCATTTTGAAGTAGTTTTGCAAGCTTCTTCATGTAGAATATCTCATCATATCAGGACTCGAGAACTTGTACAAAACCAGAATGTTCGTGGGTTTGTAAGCCACTTGTCGTAGGTTTGTAAGCTACTTGTCGTGGGTTTGTAAGCCATTAAAAAGGTAGAAATGGGTTCCATCCCAAAAGAAAAATGGAGTGAAGATTTCAGTACTATTATGAAGTTTTAACATAATTCTAGACTCAATACTTACCTTGAAATCTTGAACTCTTGATACTCATGAGTCTTCAATCTTGATATCTTGAATCTCTATACTGTACAGTCTTCATTCTTTGTACCTGCATGGTTAAATCCTGCATATACATATATATCTAAACTATAATGTTAGTATTTATATTTTATAATCTTATTCTAAGGTTGTTGTCATCAAAACCATCATCTCAAGGACTAACAATCTCCCCCTTTTTGATGATGACAACCTTTGTTTATAAAATATTACTTCTATCCTAATAACTCCCCCTAAATCTAATAACTCCCCCTTAATCTATGCCTAACTCTCCTATTTTATATTTCTCCCCCTTTGTCATCAACAAAAAAAAACTAACTCTAAACTATATAACTCTTAGTCTAATATCCTATATGATGATAGTGTTATCATCAATACTTACTTGTAAACCCAAAACTTAGTCCTAAACTACTAACATTCCTAACCAAGTACCTATATAATATATATAGGAATCATATATAAGAACACACAATATTTATTTATATATATATATGTTTATATTTACATTTTCGTAAAACGTGACAAATATACACATAACGATGAAAAAACGAAAAAGAGGTAACTACTGAGTATCTTTGACAATTGGAGATCTATGGATCGAACAATTTGGATAATGGAAACAAAAATTTCCACGTTGTTCAACCAAGTTTCCGTCCTTGTCAAAACATACTTCGCCAAATGCAAATGACTTTGTTTTACTATTTGATTTATTTTGATTTAATTTTTAATTATACTTTGTTATTTATATTTTATATTTCAGTTAATGAACAAATATCTAATTCTCTTCTTAATTTAGTAAATGTAGATTCATTTAAGGGTTTTGTTAAGATATTAGCAATTTGATTTTCAGAATTGATATAGTCGAGAGTAATTACTTCTCTACTTATATTATCTCTGAGAAAATGGTGTCTGATATCAATATGTTTAGTTCGAGCATGTTGAGTAGTATTTTTGGATAAATTTATTGCACTAGTATCATCACAATAAATTGGTGATTTTGAGATATTTAAACCAAAATCTTTTAAAGTTTGTTGCATATATATTACTTGAGAACAAGCCAAAGTAGCAGAAATATACTCTACTTCAGTTGTTGATAGAGAAACTGTGTTTTGCTTTTTACTAAACCAGGAAATCAGAGAATGCCCTAAAAAGTAACAAGTTCCACTTGTACTTTTTCGGTCTGATTTACAACCAGCATAATCAGCATCACACTAGGATATTAAGTCAAACGAATCATTTTTAGGATAAAATAAGCCATAATCAAAGGTGTGTTTAACATATCTTATAATACGTTTTACAGCTTTTAAGTGAGTTTCTTTAGGTTGGGATTGATACCTTGCACAGAGACAGACACTATGCATGATATCAGGTCTACTCGCACTGATATAGAGTAGTGATCCAATCATTCCTCTATATAATTTTTGATCTACATCTTTCGAGAGATCTTCTTTACTAAGGTACTCATTGGTTGCCATGGGAGTGGGTTTTCCACTTGCAGTAGTCAAACCAAATTTACTAACTAGGTCTTTAGCATATTTTTATTGACTAATAAAGATACTATTATCTAATTGTTTTATTTGTAATCCTAAAAAGAAGTTTAATTCACCCATATGACTCATCTCAAACTCTTTTGTCATTATTTCAGAAAATTCTTTATTCATTTCAAAATTAGTTGATCCAAAAATGATGTCATCTACGTAGACTTGTACTAGTTGAATATCATTTTTATTTCTTTTAATAAAAAGAGTATTATCTACTTTACCTATTTCAAAATTTGATTGTAACAAGTAAGATCTTAGTCTATCATACCAGGCTTTAGGAGCTTGCTTTAGACCATATAGAGCTTTCTTAAGTTTGTAAACATGATTTGGAAATTTATCATTTTCAAAAAGTGGTGGTTTTTTAACAAATACTTCTTCTTTTACAAAACCATTTAAAAATGCACTTTTAACATCCATTTGAAATAATTTGAAATTATTATGATTTGCGAAAGCAAGTAGAATCCTAATAACTTCTAGTCTTGCTACAGGGGCAAAGGTTTCATCAAAATCTATTCCTTCTTCTTGACAATAACCTTGAGCGACTAACCGGGCTTTATTTCTAATAACCTATACTTGTTCATTCATTTTATTTTTATAAACCCATTTAGTTCCAATTATTGTTTTATTTTCAGGTCTAGGAAGAAGTTCCCAAACATCATTTCTAGTGAATTGATTTAATTCTTCTTGCATAGCCAAAATCCATGAATCATCAGTTGATGCTTCTTCTCGATTTTTGGGTTCAATGGTTGATATAAAAGCTACATTACTCATTTGACTTAGTTGGTTTCTAGTTTTAACAACAGATTGCATATCTCCAAGTATATTTTCTATAGGGTGATCTTTTAAAAGTTTAATCTTTTATTAGGATGATTTAATTCATTATTAGTTTCAGTTGACTCTTGGTTTTGAGTGATTAAATACACTTCATCATTTATTTCTTCAAAATTTTTGAAATTTTCATCAAATGAAACATGCATTGTTTCTTCAATGGTATTAGTTCTTAAATTAAATACTCTGTATGCTTTACTTCTATTAGAGTATCCGATAAAGATACCTTTGTCGGATTTAGGATCAAATTTATCTAAGTTATCTTTTGTATTTAAAATAAAACATTTACTTCCAAAAATTCTAAAATAAGATACCTTAGGTTTCTTTGAGTAAATAAGTTCATAAGATGTCTTATCAGTTAAATGTCTAATTAAAATTCTATTTAAAATATAACAGGCGGTAGCAACTGCTTCTGCCCAAAAGTACTTTGGTAAATTACTATCAGAAAGCATAGTTCTCGCACACTCTTGAATCGTCCTATTTTTACGTTCTACTACTCCGTTTTGTTGTGGAGTTCTTGGAAATGAAAAATTGTGAATTATTTCTTTTTTATTGCAGAATTCTTCAAACTTTTCATTTTCAAATTCACCACCGTGATCAATACGAATGGTTATAATTTTTTGAGAAAGTTGATTTTGAACCCTTTTTGAAAAATTCTTAAAATATTCAAAAGTATCACTTTTATGTTTAAAAAAATATTGTCCATGTAAATCTAGAATAATCATCTACAATTACAAAAACATATTTACCATTATTTATTGATAGAATTTGAGATGGACCAAATAGATCAATATGAAGGAATTCAAGAGGTTTTGAAGTAGAAATTATATTTTTTAATTTAAAAGAGCTTTTTCTAAGTTTTCCTAGTTGACATGCATCACATAGACTATCTACTTTAAAATTCATTTTAGGGAGGCCTCTTACTAGATCATGTTTTGATAGTCTAGATAAGAGTTTGAAATTTAAATGCCCAAATCTCTTATGCCAAATCCAAGGGTCACTTGCATTTGCCAAAAGACACAAGTTATCATTTGAAATTTTCATACTAAGAATATAAATATTCTTTTTCCTAATTCCCTCAAATATTATAGTTGAATTATTATCTTCAATGTGAC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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_028071376.1	6.3e-09	probable serine/threonine-protein kinase PBL25
Swissprot	Q9SFT7.1	6.7e-08	PBS1-like protein 26
trEMBL	A0A7J7FSC2	4.5e-09	Protein kinase domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT1G20650.1	33.33	9e-12	66.2	ASG5	Protein kinase superfamily protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC8G01498	AT4G13190.1	103	51	2	12	98	245	347	34.95	9e-12	66.2
AfisC8G01498	AT1G20650.1	129	65	3	12	124	251	374	33.33	9e-12	66.2
AfisC8G01498	AT1G76370.1	126	74	2	12	121	248	373	28.57	5e-11	63.9

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF07714.14	Pkinase_Tyr	Domain	16	94	28.9	5.8e-07

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0006952	P	defense response
GO:0004674	F	protein serine/threonine kinase activity
GO:0005488	F	binding
GO:0005634	C	nucleus
GO:0006468	P	protein phosphorylation
GO:0009653	P	anatomical structure morphogenesis
GO:0009507	C	chloroplast
GO:0051707	P	response to other organism
GO:0009742	P	brassinosteroid mediated signaling pathway
GO:0010183	P	pollen tube guidance
GO:0044446	C	intracellular organelle part
GO:0048437	P	floral organ development
GO:0048507	P	meristem development
GO:0048584	P	positive regulation of response to stimulus
GO:0090404	C	pollen tube tip

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network