result

Gene information

Detail information of AfisC8G01939

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC8G01939	chr8	388069680	388079745	+

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC8G01939
CATCTATGCTATGAACAGATGAAAATCAAAATCTAGTCAAAATTTGGATTGATAGGAATGCGTTAAAACTGGGTAACTGCTTGCGGGAAATCCGAGAGTAGTTCTGTTTCCTTTTATTCATTGCTCCGGCACACTTGCCACGTTGGGGAAAAAAAGACAATAGCGTTGGGATACTCTTCCATGTCTCTATCATCTATGATGCTATTTCAACTGAGGAACGGGGCAATGCGATGATAATCCAAAACCATCATTGTTTCTTCTTCCCCTGATAATCACGGCACTTTTCTAAGAATTAAATTATTCCTTTTTCACAAATCTGACGACTGCGCTTGCGTTAGCGCTTCAGAGATTTTATCACCTTTCCATAGGTAATTTCATTACCTTTTCTTTTCACTGGATCCGTAGTATAAAATGGATAGTTTTTTTTTCTTGTTCTTTTGTTTTCTATTTATCCGATGAATTATTGATATTACCTCAAATCACGATTTATTGCCGTAGATCTGCATCTGTAAGATTAATTCAGTGGGTTTTGATTATTGTTTTCACCTTTACTCTAGTTTTTTATGTAGTTGTGATCTGCATACCTTTGTAACATTTAACTGGGTTTAATGATAAATTTAAGGTAAAATAGGTTCATAAATTATTTTGAAAATGGATATAAAATAAGTCATCATAACTTAGTGGTTTGGGAAAAAACCTGCATATACCGTAAAACACATCAATTATGCTGTTTCAAAAAGATGCTTATTGTTCAAGTATTTGGAACGTCATTAACCATTGATTATCGGCACATATAATGTTTTTGATTGAATATATGGTTAGCTCAGGTGTTTTTTTGGCATGACTTTCACATTTAATGACTCATGATAATGAATATCTACATTTTCATAACTGTCTACTGGATGCCATATGATGTTGCAAGGTGTGGAGGCGGTTATTAATTGTAGAAACGTTTTGCCAAACAAGATGTTTGATTGCATCCCGGTTTCTGAAGCTCGTTGTATTTCTGTCTTTTGTTGAAAAAGTATAATATTTTATGTGTTCATTTCACTTTTATTAGGCTTGGTTATATTGGGTCCAATACGTTAATTGTTTGTCTATTTGTCAGTTCAAATTTTTGTCCAGGCCTAATTTGGGCTATAAGGACGTTCTTGGCACCTAAAATTTTGCTTCAACCGTAACATCATAGATAAATAGCGACTAATATGGTAAATAAATATTGATCTATGTTTAACAAAAGACCTAAACGTGTTTACGTGACCAAATACACATGCTAAGTAATTTTAGTATACACAAATTTCAAGTAACACATCCCGTTAGATTATTTCTATATAGGTTTACATTTATTGTAGCTAATAGGTTTTTCGAGTTTTCATTTGTAACATGATTCTGAGATATGTAAACTATGGTTTGTGTAATGGGGCACGTTTTGAATTTATTTTGAAGGAAGCATAAACCATGTTGAATTAATTTTAACCACAAATGGAATTTTAATATCATAACTTGCAGTTGATAATACAAGGATATATTTTATATATTAAATAATAATAACATCTTTGTTTACAAACTTCCTTGCGATGCCTGACATGTATTAGTCTCTATAGTATTATATGCTATGAGGTCACATGTATTTAAGGCCGACCCTAGGGGTAGGTTGGCTAGACAATCGAATCGGGCAACTTCCTAGGCTGGGCAACCACCATCGAAGAAAGTGATGGCAATTGACGAACGTTAGGGATAAGATAATATTATTGTTACAAGAAATTTTTACAATTTGTTTGTTGTTGTAGTTGGTTGTGTGATATGATTCTTATCTTGAGATCAAAGGCTAAATTGATATCTTTTAATTTATATGCACAAAACCTTCTTTTATCATTATGTTTAAGTAAAATTTACTACATATTGTTATCATTATCTTTAAATTTTTAGTTTATACAACACATACTTGTTAAGATGGTAATATTCTTATGTTTATATTTTATTTTGTTATGGATTCACGTCTTCTTATATATATATAAAATACAGGGGCAAAAAAAGATCTCGCCTAGGGCAATCCAAACCTCAGGACCGGCCCTGCATGTATTATACTTATGGTTATATATATATATATATATATATATATATATAATTACTGGATGACATTAAAAAAAACTATCAAACGCGAGACATGACGTTATTACTTATTACACTGTTAGGTGACGACGCCCAACAAAGCCCAGATGAAAACTTTTGTAACAACATAGGTTATGTATGTATAATAATATAAAATTGCAAGAGACATCAAAGACAAATTAAAAAACAATTATTTGTTTATGTGTCAATAGAGTTAAATTAAAAAGGGAACATATTACTTTTGTGAGCAATAAAAGAAGACTACATAAATGAAATAGATGAAACAATAGATGTGCAATGAAGTATGAATCTTAAACAACTGTACATCTTAAAACGATGATCTTGGCCGATAATTGCAAATAAACACCTGTAGATATCTAATTCCCAATGGAGTTAACTATTGAAATAATAAGAAAATATACATATGTTCGTGTTAAACGAATAAATAAAGGAATAGCAAATAAGCTATTCCACACAACTCCATTGATCCACTTAAAATATGGGAAGAACTCAACTTTCTGTATGTCTTGACAAAATTAATATGGATATATTTCAATTATTGTGCCAACTATTATGTGATTCAATGTGTGGACCAGAAGCACATTAGTTATTGCTTGTTTAAATATAGTATCTAATAATTCTCTGAAATTGAGGATTATACCAGTTTGATATCTTAACAACTGTAGTTGCACCATTCTTGAATAATACTTAATCAAATGGATCGATGAATTTAACCATTGGTAGACGGGAAATACATGCTAATACTCAAAGTATTTCACATATAATCATGTACACGAATGCGCACTGCCTGCCGAAACAAAATCAACAAATAATAATGCTTTATTTTAATATCCGAATCTATTTTGCATGAACCACCTTATTTTTATATTTTGTATTTGGTCAATATTTCTGTTTCAGTTGATATATGTATGTATGTAAGTATGTCTTATTTGAGATTGTTGATGTTACGATCTTAGTTTATACGGATGATTTGCATCTTTTTTGTTAGTTCAGATATTGTTTGTAATTTTTGATAGTTGCATTCTTGTACATTTTTGCGAATTTTTGAGTTGGCTTTTGGAGTATTGTATATTTGTGCAATGATTTAAACATGTAATTTCTTTGACTAAACTGATCCATCCTTTTCAGATTATAATGAATTACTAAAATGATTACATTGGTGCATGCATGCAAAAATTCTTAAATAAAGAATATGTTAAATAAAAATAATAAAAATCTTAGTTTGCACTAGCAATTGATTGAATAATGATACATAGTGAATATCTATGAAATAATAGATTTACCATTATCATACCAATTATACTTGTGTACCGGCTTAACTCAAAACTTGTAACTGACTGACCGGTAATGATATCGTAAAGAGAAATTTACCATTACCACAACATTTCATTCAATCATTCTAACAAAAACATAGGTGGATGGTCTCCTCACTAGTTTTTAGCTCTGTTTTTCTCTTATTTCATCTATCATATTATTATATTTTCATATACGCCCTTTCATGTAATATATTTGAGTAGACACGATATTGCATTTAGTTATCTCTATTATTGTTTATTCTCTAGAAGTTTATGTGCAATCATTGTTATCATTATCTCATATTGACAAAGATCATTTTTTCTCTCGATAAATTTGTGCACTTTAGGCTTTGTAAATTCCAAATTGTAAGTAGGCATCTTACACATAAAATTCTAATTCTAAAATCATTCATTTCTTAATACTGGGAATAATGACCAATATTGTCATTTTATTCTTGATATATATAGTAGTATCGTATATTGTACTTAAACTTCTATGTGCTACTTTGATGATGTTGTAAATTTCAAGGTGTAGCTAGGCATAGAGTCTTACAAATAGTTTTATATTCTTTAATTTTCATTTCCACTTATGTGCCTATTTGGTTTTGTATATTTTGATTGTAAGTAGGCATCTTATACATAGTTTTATGATGCTAAAATCATTCTCCTTCCAATACGCATGGTATTCTTGCTATTTTCAATATTAATTTCTTCTAATATTTGTCTTAAAATTGTGTGCAGTTACATTTTGTCATGATTCCTTTCATAGGTTCAAACTGTATGTTACTTACGTTTGGCGGCGGTGGCGACGACGACAACGACGACGATGATTGCAAAGATGACGATGATGATGAGATTCAATGTTCAACCCGAATGACCAACCAAGTATCATTTATCTTCACATTTTCTTAAATAGTATATTGTTAATGTAATGTTTGTTTAGCATATAATGTTGTTTCTTGATAACACATGATTGAAATATGTAATATGACAACTAACTATAACATAATAACTAAAGTATTTTCTTTCTGTTTAAATAAATTCATGAAAATGCATTTTTTTTGGTACAACGTGAGTAATAAATGGGTTTTGTAAAGTGTCAATTAATTTGTTTTTTTTTAAATGTCATATTTGTATAATATCAGATTGTTGGAAAATGCATTTTGGTTCATGAAAATGTATTATTTCTGCCTTGCTATGTTATTTTAAGAGAAATGAATAACGAGATGATAGGTTTTTTTTCCTAGGTTAATGTGATTAAGCGTCAGTTGGTTTTTCAACTTTAAATATGAAATTAACTTGCATTCAAGTGTGTATATGTTTATGTAATCTTTGATTTCCGAATACTAGACATTTGATTTTACATTTTATTTATGAAAAACAACATTAACAACAAAGTGGATTATAAAAAAAGTTGAATTGCAAAGTTTATAACACTTTTTATTTTGCAAAAGAAGAAGAAAAAAAATACATTTTCCTTTCATCTATCTTTTTAGTACAATGAAAGCAACTGCATAATAATAATATAAGATAATGTGTAAAGGTAATATCCTTTAAAATAGCTTATACTAG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TTAATTTGAAAACTTGTTTCCTGATTGTACAGTTAAATTAGATTTATTATTTTGTATATTTAAATA

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_008813584.1	2.4e-06	uncharacterized protein LOC103724184
Swissprot	Q08759.1	1.0e-06	Transcriptional activator Myb
trEMBL	A0A6I9QGF3	1.7e-06	uncharacterized protein LOC105035310

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT4G18770.1	72.22	1e-09	58.5	AtMYB98;MYB98	myb domain protein 98

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC8G01939	AT4G18770.1	36	10	15	50	272	307	72.22	1e-09	58.5
AfisC8G01939	AT3G27785.1	36	13	15	50	244	279	63.89	2e-08	54.7
AfisC8G01939	AT5G10280.1	45	21	11	55	66	110	53.33	4e-08	53.5

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00249.28	Myb_DNA-binding	Domain	14	50	49.3	3.6e-13

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0000981	F	RNA polymerase II transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0001135	F	transcription factor activity, RNA polymerase II transcription factor recruiting
GO:0005634	C	nucleus
GO:0006357	P	regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0009611	P	response to wounding
GO:0009651	P	response to salt stress
GO:0009737	P	response to abscisic acid
GO:0009751	P	response to salicylic acid
GO:0009753	P	response to jasmonic acid
GO:0044212	F	transcription regulatory region DNA binding
GO:0030154	P	cell differentiation
GO:0043565	F	sequence-specific DNA binding

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network