result

Gene information

Detail information of AfisC8G02348

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC8G02348	chr8	470480299	470488682	+

Sequences

CDS

Protein

>AfisC8G02348
MEIWTQSHHLPSPSRKLNHRSPSPDMASDSKRQKHHRHHRHRHHRHRHRSKMDKKADDFEDAADKIKVEQNRVAEDGEIEEGEIVEEGEIVSDYDNENLVVPEKSQPYTDREAEALDHHLDSLTLESPTKDCELLNRKVNSVPRFRDADKADEKITVNMVKIDLSYSDHKERKQPINKDADGGNEDLTNRLSSVSPYPRDSTYPLSCNSNEDDNELSAYPSRGRDKNIDCNQRDRSRSHEIHAKRNHVTNVDRDKHKQRKYHDKEGNKSDHGRLDKKDRGVHSDRLDSERSASHIRHYERGSFNTDNDTEREKMRKHTEVREQSSSISGRQGHDIRKIERDTVRHRNCEKPTDASRDMYRERESSEETGRDIYRHDRRMGRNRDHDRENDKSVVRDTERDTDNNHVMRKVYQHPRHGDWEKYRDRMRSKEISYDTHDALNNEKPKDVGRDRYRERESRDEIGKDRYRDDRHRGHNRDRENDDRYNVRGTGNNREKQNDYQHLKHDDREKHNNRMKQKEIFYDTHDTLGRNRESLREEDEDNYQERIKQQLANQEEDEVGKIKEESRKRREAILKKYKQQPLQNKLAVSLVDEESMQKDTKNNSSDVKQDSPNSYTMDPSFTVEKSPMGGVASTLVAGGGVGGLGEGSPKSERSTDMFCDDIFGESPVGSRKRGRVDALQVEQSGLHDNWDDAEGYYSYRLGEVLDGRYEVIAAHGKGVFSTVVRAKDLKATIGQPDEVAIKIIRNNETMYKAGQEELKILGKLVATDPEDKRHCVRFLSTFKFRNHLCLVFESLHMNLREVLKKFGRNIGLKLTAVRTYAKQLFIALKHLRNCGVLHCDIKPDNMLVNEGKNILKLCDFGNAMPTGKNEPTPYLVSRFYRAPEIILGLEYDHPMDMWSVGCCLYELYCGKVLFPGPSNNDMLRLHMELKGSFPRKILRKGLFTNTHFDQDFGFLATEEDPVTRKPTKRLLSNIKPKDIGTLISSSPGDDPKMIAHFKDLLEKMFVLDPEKRLTVFQALSHPFITVFMSYYVYEIMELQQRLHW

Gene

>AfisC8G02348
ATGGAAATTTGGACGCAATCTCATCATCTTCCTTCTCCGTCTCGAAAGCTCAACCACCGTTCTCCGTCGCCGGATATGGCGTCGGACTCTAAGCGCCAGAAGCATCACCGCCACCATCGCCACCGGCATCACCGACATAGACATCGCAGCAAAATGGACAAGAAAGCGGATGATTTTGAAGATGCTGCTGATAAAATTAAAGTTGAGCAGAATAGAGTAGCCGAGGATGGAGAGATTGAGGAGGGGGAGATAGTAGAAGAGGGGGAGATTGTTTCAGATTACGACAATGAAAATCTGGTATGTTTCATTGATTTTGGCATTGAATTTAATCGATTTATTTTAAAGTGTTAAGTCCAAATTTTATATTTCTGTTATCACGTAGATGTCAAAATTTTGGTTCACCAGGGCAGAAAATTATTGTTAAGGACAACCTTTCTCAACGTTTTAGCCTAGAGGACAGACCTTCAGTATTTTAGGTATCAGTTTTTAGTTATTGATAGCAGTTTTTAGGTATCAGTTTGTAGTTATCGGTATCAGTTGTTAGTATCAGTTTTTAGTTCGGTAGCAGTTCTGGAAGAATGTTTGTCCTTATGAATAATTTTGAAAGAATGTTTGTCCTTATGAATAATTTTTAGAAGAATGTTTGTCCTTGTAATTAAAATATTGAGATCGTGTCTTTGAGGTTAAAAATATATAAATTTTTGTCCTTTAAATTAATTCCCCTTATCAGGGTGCATTTGTTCAGTAGTTCACGAGTTGCTTAGCGCTTACTAAAAATGTAAAAGATGTAGAGCACGTGCGGTTTGATTTTTTTTTTTTTGCAACCACCAGGCATTGAGGTTGTTAGTGTTTATTACTTGATATAAACAACAAAGCACTCAGTAAGCACAAAACCAATCGTAAAACGAGCACTCAAAAATTACTCGTTTTCAAACAATGAAATCAGAAAGCAATTTGTATTTTATTTATTGAAGGTGGGATGTTAAATGTCATTTAGGGGGTTACACTGTCGCATGAAACTTCGATGTGTACTTGATAGCATTGTTTGCAAGCTTGCTGATCTCTTTCTTTCTTTCCTTTTTCCCCAATTAATACTTTCATTCAACAACCCTCAGTAGTTACTTTACCCTTGTAGTCACTAAACCATGTATACTCTTGGACCTTTTTTCCAAGATACTTGACATTAATGTACCTATTTTGCAACCTAGGCTATAACTTCTCGTTGATATTTTTAACCTTGCATTCATTGTTCTCTCTGTGTCCATCCTTTTGGCTGACTTGATTTAGTTTGACGAGAAGTTCAGCAAATGTACTACGTTTAGATTTCATGGGATTATTTTAATTGCGTCTTTTTTTTTACCTATAGTTTTCTCCACTTTTTTGTTCAGCGCCTACTTAATTATGCAAGAACAACTTTCTCTTGAGTTTTTCCTTCATAATTTCAATGCTAAATAATGAATATGGTCTATATATAATGTCTTGAATGGTAAGAATATTAATACATCCATGTACAGGTGGTTCCTGAAAAAAGTCAACCTTATACAGACAGAGAAGCTGAAGCACTTGACCATCACTTGGATTCTTTGACTTTAGAATCACCAACTAAGGATTGTGAGCTTCTTAACAGAAAGGTCAATTCTGTACCCAGATTCAGGGATGCAGATAAAGCTGATGAAAAAATCACAGTAAACATGGTTAAAATAGACTTGTCATATAGTGATCACAAGGAAAGAAAACAACCAATAAATAAAGATGCCGATGGTGGTAATGAAGATTTAACAAATCGATTAAGTTCGGTATCGCCATATCCAAGGGATAGCACATATCCATTGTCATGTAATTCAAACGAAGATGACAATGAATTGTCAGCCTATCCTTCCAGGGGAAGAGACAAAAACATTGACTGCAATCAAAGGGATCGGTCAAGGTCGCATGAGATTCATGCCAAGAGAAATCACGTAACCAACGTAGATAGAGATAAACACAAACAAAGGAAATATCATGATAAAGAAGGCAATAAGAGCGATCATGGAAGATTAGATAAAAAGGACAGAGGTGTTCACAGTGATAGACTGGACAGTGAGAGAAGTGCCAGTCACATCAGACATTATGAAAGAGGTTCATTCAATACTGATAATGATACAGAGAGAGAGAAGATGAGGAAACACACCGAGGTAAGGGAACAGAGCTCTAGCATTTCCGGTAGGCAGGGCCATGACATAAGAAAGATAGAACGGGATACTGTTAGACATAGAAATTGTGAGAAGCCAACGGATGCAAGCAGGGATATGTATAGAGAAAGGGAATCGAGTGAAGAGACAGGAAGGGACATATATAGGCATGATAGACGCATGGGTCGTAACAGAGATCATGATAGAGAAAATGACAAGAGTGTCGTGAGGGATACAGAGAGGGATACAGATAACAATCATGTCATGCGAAAGGTTTATCAACATCCTAGACACGGTGACTGGGAAAAATATAGAGATAGAATGCGATCAAAGGAGATATCTTATGACACACATGACGCTTTAAATAATGAGAAGCCAAAGGATGTAGGCAGGGATAGGTATAGAGAAAGGGAATCTAGGGATGAGATTGGAAAGGACAGATATAGGGATGATAGACATAGGGGTCATAATAGAGATCGAGAAAATGATGATAGGTATAATGTGAGGGGTACAGGTAACAATCGAGAGAAGCAAAATGATTATCAACACCTAAAACACGATGACCGGGAAAAACATAATAATAGAATGAAACAAAAGGAGATATTTTATGATACACATGACACTTTAGGAAGGAACCGAGAATCTTTGAGGTAATTTGAATCATCCTTTCTAAAGCTTGAATACAAATCAACAAAAACTTCAAATTCATATTTTATAGTTAGTTGTTATCTGTTTTTACTTTACTTTGTTAGGGAGGAGGATGAAGATAACTATCAAGAGAGAATCAAACAACAACTTGCCAACCAAGAAGAAGATGAAGTTGGGAAAATCAAGGAAGAGAGCAGAAAAAGGAGAGAGGCCATCTTAAAAAAATACAAGCAGCAACCTTTGCAGAATAAACTGGCTGTATCACTTGGTAACACATATTTATTGCCATCATTATATTATCTTGTCAGTTTTGTTTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTGTTTTGTTTTGTAGTTGATGCACATCCATGCATTACTCTTCTTAGCAGTGGACGAGGAATCAATGCAGAAAGACACCAAAAACAATTCTTCTGACGTGAAACAGGATTCTCCTAACAGCTATACCATGGACCCATCATTTACTGTGGAAAAATCACCTATGGGTGGCGTAGCCTCAACTCTCGTGGCAGGAGGTGGGGTTGGAGGACTTGGTGAAGGTTCTCCTAAGGTTTGTTACTAATATCTTTAAAATTAGCTTTAATGTAGAGCTTTATTCATAGCTGATGCAAGCTATATGCTAATGTTAATGATGTGTCAAATATCAATAGAAACTTGTTACTTTCACAGAGTGAGAGATCAACGGATATGTTTTGTGATGATATTTTTGGCGAGTCGCCTGTTGGCAGTCGGAAAAGGGTAAGCTTTTGAAAAGTTCACATTCTTATAAGTGCTGTGCTGTTTTTCCTTTTTATTTTGGAATATTCTTTGGCTTTTATGGTGGCACATCAACGTCAGATACAACCAGTGCCATACTTGTACTCGATATTGTTTCCGAGTAACATATACCATATTCGTAGATATTGGACAAATATCGAAATTTTAGCTATCTGCTGACAATCGATGGATGAAAAAAATAGATAGATTAATACAACTTAACATAGATCCGTTTCAGTGCGAATTCTTAAAAACATGCAAAAAAATAACTTAATATATGACAATAAATATAATGTTTCACAGCAATTTCGCATTTAAAACATAACAAAACAATACAGTCATCAATCATCCATTTTATTGCAGTACACATATTATCACCTTGATAAATACTGGATGGATATTTTTCAGATGCAGATACCATCATATCCATATTCTTATCATTTTTTGAATATTAGATATTTATTCATTTTTGGACTTGGACTGATTTTCGTGTAAGCTCTAATTTATGGAAAACTATATGTTTGTAATTTGTATAACATGGCATGAATGGCAAAGTATTGGGTTAAAATAGTTTATAAATGTATCATGTGATAGTATTGTAGTTCTCATAAGTGTATTTGTGAAGGGCATATGTGGTGCAGTGCAGCATTAGTACGGCATGGCAAATAATGCATGGCCGTCCGCTCCAAAAAAAGAGTGTTTTTTTATTTTGACTATTTTCCTTTTTCTAATTTTTTATGTTCATTTTTCATCCTTTTTCAGGACCAAAAGAGCAAAAATTAATATTTACTATACAATTCTGTGTTTTTATTGAATTTTTTCGATTTTTTCGATAGAAAGAGTGGTTGGTTACTTTATTCAAGCAGAGCATTCATTTGGATGTTTCGGGTGTTCGAACCCATGACCTCTAGAACTATGTTTAAGGCCATACCACTAACCAATTGAGCTAGTGGTCCTTGACTGTGTTTTAATTGATTTTCATTCTTTTATGATTGAAGTACATGAATCTGATGAAACATACATTGATTCTGAGAATCTAATTGAGAAATCTGATTCATATATTTAATTTTTGGAGTATTGTATGTTTATTATTTAGTTTTTTACTTCCGTACTTGAATCATATGTTTGTAATTTATATAACATTATATTTTAATGGTACTTCTGCGAAATAAACTAAATATCTTTGTTCGATATCTTTTCAGTAAATAAAATATAAATTATATTAGTCTTGTTTCATTTTTTCGTGTTGTATAATATATTTTCACATAACTGTACAGTATTTCAGAAATGTGTGCATTGTTCTCCACATTGTGTGCCTTGGCTCCACGAACGTTTTGTGCCATTTTTGCATCGTAAATAACACTGCTCATAAACAAATTTTACAGGGGATAGTGCGATTATTACACTTTTCTGCTTATTATGTGTTACCACATCTAGTTTCATTATTAAAACTTCAGTTGTGGTTAAGATAATTGGAGTTGCATGCGCTTCATATTAATGTAAATTACTTCCGATTCATAAAGCTTTGAAGGTTTGGGTGTAACATTAACTGCAATCTCCTACCACAATTTCTCTATATGTATACGTGTGTGTGAAATGATTTAAACAACATTCGCTAGTACTTGATTTCAATGGAGACAATGCTATATTTTGAAATATCTATGACTAGTGTGGTAATGTAAACGATAACCACTATATCTTTGTTAACTTTTTTTTGGGTTAAATCTCTAACCATGAAAGACAGATTTGGATAAGAGAACCTATTATGTATACACTAGTAGGGCAGAGTAGATCTTTGTCACTGAGAATTACTTGTCTACATAAATCAACTGTAAACCTCTTATGTTTATTTTTTTGGATTTGTGGTTCTCACTAAGGTGTAAGTCTTCAGGGTAGAGTCGATGCTTTACAAGTTGAACAGAGCGGCCTTCATGACAATTGGGACGATGCTGAAGGTTATTACAGTAAGTCTAGTGGATCAATGGTTGTTTATTTCTCTTTATTTTGTTTGGAAAAGTATATTGTGTAAAATTTCTGCATCTTTCGTTTTTGTTATTTTCTTCTTCTTCAGATGTCTCTTGTACCTGTCAGGTTATAGGCTTGGTGAAGTTCTTGATGGTCGTTATGAAGTTATTGCAGCACATGGGAAAGGAGTTTTTTCAACTGTTGTTCGTGCTAAGGACCTGAAGGCTACAATTGGTCAGCCTGATGAGGTTGCCATAAAAATTATTCGTAATAATGAAACCATGTGAGTGATATACTAACTGGGCCTGTTCTTTCTCGAATTTTGTGTGCATTTATTTATGGTTTACTTTTTTTACGATATAGGTACAAAGCTGGTCAGGAAGAATTAAAAATATTAGGCAAGCTGGTTGCTACTGATCCCGAGGATAAGCGGCATTGTGTTAGGTTTCTTTCTACTTTTAAGTTCAGGAATCATCTTTGTTTAGTTTTTGAATCTCTTCATATGAATCTTCGTGAGGTTCTAAAGAAATTTGGTCGTAATATTGGGCTTAAGCTGACTGCAGTGAGGACATATGCAAAACAGCTTTTCATTGCCCTGAAACATTTGAGAAATTGTGGTGTCTTACACTGTGATATAAAGCCAGATAATATGCTGGTAAGGAATTTTTTTTCCGATGCTGCTAAAATTATTCTTTGTATCTGATCATTGAGGAGACTTGTATTGCGTAAAACCTTCTAGGTGAACGAGGGAAAAAATATTCTGAAGCTATGTGATTTTGGCAATGCTATGCCTACTGGCAAGAATGAACCCACACCATACTTGGTTAGCCGTTTCTATCGAGCCCCAGAAATAAGTAAGCGTTATTTTGTTTTTTCTAAATTATGTATAGGTAATATAGCCCCAGTGCTTATCTATCTATATCATAAGTTAAATTCTTCTTTCGCAGTACTTGGATTAGAATATGACCATCCAATGGATATGTGGTCAGTTGGTTGTTGTTTGTATGAGCTTTACTGTGGAAAGGTTCTATTTCCTGGTCCATCTAATAACGATATGCTTCGACTTCATATGGAGCTGAAGGGTTCTTTTCCGAGGAAGATTCTTCGGAAGGTAATATTTCCTTGGCTATATTATATCATGTCATGTATTCTCATTTTGGTTAGAATATTTATTTATGTGTCTTATCTCCTGTTTTTAATCAATGTACATGGTATTATTTTTTATCCATACGCCTGTTCTTTGGTAATTTTGTCATGCATGAATTCTAATATTAAACTAGTTTTTTTTTTTTATTCATTTCAATATTTCATGTATCGCTTTAGGGGTTATTCACTAACACACATTTTGATCAAGATTTTGGTTTTCTGGCTACTGAGGAAGATCCTGTTACTAGAAAGGTAACCTTTTTTTTTTGCTTTTATACTATATAAGCAAGAAGGTCAGCCCATCGATATTTTCAGACTGATTAAAATCTCATTATTTATTTGTATGACAGCCTACTAAGAGATTGCTTTCGAATATTAAGCCGAAGGACATTGGAACACTAATATCAAGTTCTCCTGGAGATGACCCAAAAATGATAGCCCATTTCAAAGATCTCCTAGAAAAAATGTTTGTTTTGGACCCAGAAAAACGATTAACTGTTTTTCAAGCATTAAGTCATCCTTTTATCACGGGCAAGTGAATTAAGATGCTGTTTTCTGAACTACGATTGTTTTTGAGATTGATTCTACGTTGTAAACTATTGTTCCTCCCATCTAATTTTTCAGTGTTTATGTCTTACTATGTATATGAGATAATGGAACTACAACAGCGATTGCATTGGTGAAGCATTGAGGAGATGATCGATCTTCAGTCTTCCTACATGGCAGTTCTTGTCACTTGTATTCTGTTCTTGTAAGATAACTCGTTAAAGGCGTTTTTATATCGTGTAAAAAGAACATATTTGAGTGACTTTGGAAATTCATGAAACTAACACAGGGTTATATTTATTCCATTTCTACCCAACTTTTATTGGTGCTTTTCTGCAAATTTTATTCTCCCACACACACTTATACATGTGTATCGGGTCATAAGAAGTCCTTTTGAAGACGTCCTCATGTTTTCTTCTGTTGTGAAGTTTGTGATACACGATAGTTGTATATTTGATTATATGTGATTTTTATTTATTTATTTCAGTAACCTTATATAAATGCTAATCTAATTCATGCCATTATTAGTTCTTATTACCATAGCGTGTTTAGGCTTCAATTAGTCTAATGTTTTATTTCTTCAGGGTTCTACTGGGTCTCTGAGGCTACCAAATCCTTGTTTTAGGTGCCAGAATGCTGCCAAAAAGAAAGGTACCCTGGTTTGATTGATGGGATACTATTATTTTTGACATCTTTGATGTTGGCTTATCTCAAGTATATGGATAAGTATATATGATTTTCTACATTGATATTTAGTTAGACTTTATGCTGAAATAAGTAGAACTTTGAATATGAAGTGTATTTAACTAGCAACTCACTGTAGGGATTTTAATGGTAGTATCGAAAATTCGTTCTCATTTTTTAATATAATTTTTAATATTATTTGATACAACAACTTGATAATAAAGATAATAGAATTACCCTTTTAGACTTCCCCCCTGCCTTAGTTTTGAAGATTAGTTTGCACAATGAATATTTTTAATGGTTTAGTTTTTTTGCGTGTGCGTGTATGTATATATAGAGGCACCCCTGTAGCACTCTGTTTTCCACCACACAATCTCAATTAAACAAATTAAACAATATGACTAGTGGGAAGAGAGAGAAAACCATATTATTTAATTCGGGTTGTGTGTTGGAAAT

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	CBI27037.3	2.3e-208	unnamed protein product, partial
Swissprot	Q61136.3	7.7e-108	Pre-mRNA protein kinase
trEMBL	F6HFP0	1.7e-208	non-specific serine/threonine protein kinase

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT3G25840.1	65.86	0.0	674		Protein kinase superfamily protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC8G02348	AT3G25840.1	495	127	7	558	1024	453	933	65.86	0.0	674
AfisC8G02348	AT3G25840.2	606	193	12	448	1024	101	671	57.59	0.0	663
AfisC8G02348	AT1G13350.1	497	172	4	553	1024	263	759	60.36	5e-180	628

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00069.22	Pkinase	Domain	709	1023	156.9	5.5e-46

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0000166	F	nucleotide binding
GO:0005515	F	protein binding
GO:0000398	P	mRNA splicing, via spliceosome
GO:0006915	P	apoptotic process
GO:0004713	F	protein tyrosine kinase activity
GO:0046872	F	metal ion binding
GO:0005654	C	nucleoplasm
GO:0006468	P	protein phosphorylation
GO:0006974	P	cellular response to DNA damage stimulus
GO:0010604	P	positive regulation of macromolecule metabolic process
GO:0018193	P	peptidyl-amino acid modification
GO:0031325	P	positive regulation of cellular metabolic process
GO:0044822	F	poly(A) RNA binding
GO:0048519	P	negative regulation of biological process
GO:0048731	P	system development
GO:0071013	C	catalytic step 2 spliceosome
GO:0072331	P	signal transduction by p53 class mediator
GO:0080090	P	regulation of primary metabolic process

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K08827	PRPF4B; serine/threonine-protein kinase PRP4	EC:2.7.11.1	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network