result

Gene information

Detail information of AfisC8G02668

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC8G02668	chr8	521246642	521257027	-

Sequences

CDS

>AfisC8G02668
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Protein

Gene

>AfisC8G02668
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020263121.1	8.9e-247	LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC109839097
Swissprot	O00311.1	1.8e-26	Cell division cycle 7-related protein kinase
trEMBL	A0A5P1F6T8	4.2e-230	Protein kinase domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT4G16970.1	51.49	3e-151	533		Protein kinase superfamily protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC8G02668	AT4G16970.1	536	222	10	449	972	375	884	51.49	3e-151	533
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AfisC8G02668	AT3G01085.1	140	81	4	810	946	276	400	29.29	3e-10	65.1

Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g334457.t1
Allium fistulosum	AfisC8G02668
Allium sativum	Asa1G01502.1; Asa2G05164.1
Arabidopsis thaliana	AT4G16970.1
Oryza sativa	LOC_Os10g41390.1

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00069.22	Pkinase	Domain	479	622	78.3	5.5e-22
PF00069.22	Pkinase	Domain	809	946	65.5	4.3e-18

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0004707	F	MAP kinase activity
GO:0035556	P	intracellular signal transduction
GO:0005488	F	binding
GO:0006259	P	DNA metabolic process
GO:0006468	P	protein phosphorylation
GO:0009628	P	response to abiotic stimulus
GO:0022402	P	cell cycle process
GO:0031505	P	fungal-type cell wall organization
GO:0034599	P	cellular response to oxidative stress
GO:0036170	P	filamentous growth of a population of unicellular organisms in response to starvation
GO:0043229	C	intracellular organelle
GO:0044011	P	single-species biofilm formation on inanimate substrate
GO:0048522	P	positive regulation of cellular process
GO:0048584	P	positive regulation of response to stimulus
GO:0051128	P	regulation of cellular component organization

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K02214	CDC7; cell division control protein 7	EC:2.7.11.1	Cell cycle	ko04110
			Cell cycle - yeast	ko04111
			Meiosis - yeast	ko04113

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network