result

Gene information

Detail information of AfisC8G03216

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC8G03216	chr8	606014492	606022592	+

Sequences

CDS

>AfisC8G03216
ATGGAAGGAAGGAAAGATTTGAGGCGCCAGTTTTCAACTGGCTCCATAAAAAAATGTGTCAAGCGCACTTTTACCAGGCAATTGTCGCTTGACCCAAGACTTAGTAGAGCTATCCGTTTCTCATTTGGTCGGCAGTCATCTCTCGATCCAAATAGAAGAACATCCATGAAATCTGAGGCTAAGGACGAGCTTATGGTTCCCGAGAATTTGGATCATACTATGCAGTTGTTATTCATGGCGAGCCAAGGGGATGTTGATGGTGTGGAGGATTTATTGAAGGAGGGTGTTGATGTAAATAGTATTGATCTTGATGGGCGCACTGCTCTGCATATTGCTTCTTGTGAAGGGCATGTTGAGGTCGTGAAGTTGTTGCTTAGATGGAAGGCCAATATTGATGCTAGGGATAGATGGGGAAGTACGGCTGCTGTAGATGCCAAGTTCTATGGAAACAGCGAAGTCTACAATATATTAAGAGCTCGTGGAGCAACAACTCCAAAAATAAGGAAAACTCCAATGACTGTATTAAATCCCCGAGAAATTCCAGAGTATGAAATGAAACCAGGGGAGTTTCAATTTCGGCGGGGAGAGGAAATTAAACAGGCAACTTCTCTCTCACACACACATATACATATGGGTGCATATCAAGTTGCTAAGTGGAATGGATTGAAGGTGTCTGTTAAAATACTTGGCAAAGAGAGCTACTCAGACCCAGATAGTATAAATGCTTTCAAGCATGAACTAACTCTACTTGAAAAAGTTCGACATCCTAATGTGGTACAGTTTGTAGGAGCTGTTACCCAAAATATACCAATGATGATTGTTTCAGAGTACCATGCCAGAGGTGATCTAGGAAGCTACTTAAGAAAGAAAGGGAGATTGCACACACATAAAACTCTTAGATTTGCTCTTGATATTGCAAGGGGCATGAACTACCTTCATCAGTGCAAACCAGACCCAATCATTCATTGTGATTTAAAGCCTGAAGATATCTTGATAAATGATGGTGGGCAGTTGAAGGTAGCAGGATTTGGTTTGATCAAACTATCAAAGTTATCAGCCGATAAAGTGAAGTTGGCAGATCATGCGAGCCAAATTAGCAGTTTAAGTTCATACATAGCACCTGAAGTTTACAAGGATGAAATATTTGACACGAGCGTGGATGCATTCTCATTTGGTCTCATTCTCTATGAGATGGTTGAAGGAGGAGCACCATTTCATTTGAAGGGTCCAGAAGAAGCTACCAGAATGATATGCTTGGAACGTCTTAGACCTCCTTTAAAATACAAATCAAAAAACTACCCTATTGAACTCAAGGAGTTGATTGAAGAATGCTGGGATCCAGATCCAGTAGTTAGGCCAACATTTTCCGAGATAATTATCCGTCTGGACAAATTATATGCCAATTGTCCTAGCAAAGTGCGGTGGAAGGATAACTTTAAAATTCGTTGGAAATAA

Protein

Gene

>AfisC8G03216
CCCATCCCCAATTTCTCGACCTAAAATAACCATGGCGCGAAATCTTCTCATATCCGCACTCTATTCTTTCCTCCTCCTCCTTCAGTTTCTAATTTTCATTCACAAGTTTATTATATTATCTAAATATTTGAGTTCTCGATCGAAGTTGGGGATCATTCTTAACCCTAATTTCGTTCGAAGCCACTCACATTTAGTTCCGATCACATTGATTTCGAGATGCATTTAAACAGTAAGTATTTATATAAATCTAGCCTTAAACTTTATTAGTGTTTTTTCCCCCTTTCATATTTGCGAGACTTTGAATTTACTGACTCCGATAATGAAATATATTTTGTCAAACTTTGGGGGATAACTTGTTTTCGCTAAAAATTGGAAATAGATTTAACTACAAAATTTCATGTCTTGTCTTGATAATGATGTCTTATGAAATACTTGCAGGAAGAAATTTCCTGCACTTTTCCTTGCTAAACAATTAATCAATGACTCTACGACCCACCATTTCAATATTTACCATATATCAATTCAATATCTTGAAATTAAACATAATGAAGTCATATTCATATGTAAATAAGCGACTGATACGATATATTTATCTGTGCCAGCAAAAGTTATTCATGATTGATCCTATCTTAATTATAAAACATGGAAGGAAGGAAAGATTTGAGGCGCCAGTTTTCAACTGGCTCCATAAAAAAATGTGTCAAGCGCACTTTTACCAGGCAATTGTCGCTTGACCCAAGACTTAGTAGAGCTATCCGTTTCTCATTTGGTCGGCAGTCATCTCTCGATCCAAATAGAAGAACATCCATGAAATCTGAGGCTAAGGACGAGCTTATGGTTCCCGAGAATTTGGATCATACTATGCAGTTGTTATTCATGGCGAGCCAAGGGGATGTTGATGGTGTGGAGGATTTATTGAAGGAGGGTGTTGATGTAAATAGTATTGATCTTGATGGGCGCACTGCTCTGCATATTGCTTCTTGTGAAGGGCATGTTGAGGTCGTGAAGTTGTTGCTTAGATGGAAGGCCAATATTGATGCTAGGGATAGATGGGGAAGTACGGTATGAAATATTAAGTTGAATGCATTTAGATATATAAAATTGAGATGTTTTGATTTTGTGTGTGATCTGCTAAGCTAATGATTCTTTATGTATCATTGAACCATAGCAGTAGTTACAACATTTTTGTTGGCCTTTCCAGGCATCATATTATTAGTGAACTGAATGAGTCATTGGGGAAGGAAGAAGAGTGCCATTGTGATTTATGAATTATTGTTAAACTCTACAGTACTAGTAAAACAAGTCAGTGGTGTCGACATATCAGGATTATAGTTTTGCAAAGTGAATATTAGGCTCAGGTCTTTAATAAGTTTCAAAATACACAAAAACCACAATATAAAAAAGTATGTAAATTAGGTCTCTAGAATTAAGTTACTAAGTAATTGCATATAGTTATGCAATTATTCATTGAATAATTGCAGACATTTATGCAATTATATCCAAAAGTTGGATAAATTTATGCAATTTTTTCGATGAATAATTGCGAAAATTTCTGCAATTTTTTTGGATGAATAATTGCGGAATTTTCCGCAATTTTTCAGTGAATAATTGTTAAAATGTCTGTAATTTTTTGATATAATTGCATAAATGTCTGCAATTATTCATTGAATAATTGCATAAGTGTGTGCTATTATTCGGTAACTTAATTCTAGGCATCTAATTTACAAACTTTTTTTTTACTGGGGTTTTTGTGTATTTTGAAACTTATTAGGGACCTGTGTCAAACTGTCCCTTTTGCAAATGATGCAGTAACAATGTCTACGTACTTTGTTACTAATCTTTATGTTGCAAAAGTTGAGTGCTTTTCTTAACTTTTTAAATTTCTACCTCAAAAGTCCATCAAAAATACCTTTTGCTAGATAATGTACATCTCTAAACATATATGCTAAACCCAATAAATTTATGCTAAATTTGGTAGAAGTAAACATATTTGATTGCCAGTTAAACTCTAGAACATGATTTCAACTATTTTTGTCTTGTGCGGTGCTTGTAATATTGTGATCTTGACTCCCCTTTTCTAATTCTTGTTCCTCTATGAACTCTCACAATGCCACTACTTGCTAGGCTGCTGTAGATGCCAAGTTCTATGGAAACAGCGAAGTCTACAATATATTAAGAGCTCGTGGAGCAACAACTCCAGTATGTATTCAATTATTTTGTGACCATCTTTCACCTTCTATTTAGAAAAATATAGTTTATTCTTTTGATGGCTAACTTATTTTTAATTCCCATACATCTTTGTTCTTTCCATTGTAGAAAATAAGGAAAACTCCAATGACTGTATTAAATCCCCGAGAAATTCCAGAGTATGAAATGAAACCAGGGGAGTTTCAATTTCGGCGGGGAGAGGAAATTAAACAGGCAACTTCTCTCTCACACACACATATACATATGGTTACACACACATCATGGTTCATTTTGATAGTTCCGTTCTGTTCCGGTGAAAATCAGAACACAATCGGTCAAAATTCCTGTTTCGATCAAATTTCTGATTTGCCCGAAGTGCTAAAAACAGCTGAAAAAAAATGAAAAATAATAATAATACGATAAACATGTAAAACAACAATAAATTAAACAAGATAATAACAAAAAAGATGATCTAATAGTTTCACAAAAAAAACTACTATACTTTTGTAAATTCGACCCAATACAACAAAAATAACTTGGAAAAAAGGATAAAATTCAATAATTGAATCAGCTTTTTTTTGTGTATGGTACATTTGTAATTTTGTATTTCCATATATACAAATATGTACTATCTATCAATGCATTTCCATTAGAAAATATCGAAGCTGAAATGGAATCATAATTGAAAGGGGCATCTCACTAGAAGAACAAACTTTGCAGTCTAATTAGTTTCTAGGACACACATCCACAGAAATTAATTTCAAGGTCAAAGTCAGCAGAATAATTACTTTTAAGGACAAAGTCAGCAGTTCAATTACGACATAATTTCATAGGTTTTTAGGCTTTAAAAACTAATTATTTTGCATTTTGTCCTTAAAAGTAATTATTTCAGCTGTGTGTCCTAGAAACTAATTACACTTGCTAAAGAGGCCCTTGTGGCTAATTTCCACTAATTGAAATGTCTGAGGTTGATCGGATTTTCGAAAATCTTAAATTAATGAAACGGAACCTTAAATCAACGAAACGGAACATGAAATCTTAAACCTTAACACACACACAGGAGCATGGATCAGCACTCCTTTTTTAGTTTCCAAACTTAGCCTTAGTTTCATCCACAAATTTGTACTTAAATGTCCATTGTTTTTCTCTTTTAACCCATCATGCTATTAATTAAATATAAACTTGTGGTTAAAATAAGGAGGTTAAATGAGTGGACCTAAGTAAAAGGGCAATTGATCTGATCCTAGCTCTCTCTCCCTCCTTACTTCTCTATATATACATACATATACATATGTACACACACACTCTGCATCCCCTTTTTTGTGTCCAGCTCGTTTTTTAGTGTAAATGATTATTGGAATTTCATAATTTTCTACAGCTATGATTCACTTATCACCAACATCGGCTTTGCAAAAATTTATTTTATTACAACTTTTTCAACCCATCAAAATTTAATTATGCAATATTTTATATGTTAAAAATAGCTATTATAGTTTTTGATTCAAAAGCATTAATCTTTAATGGGCAAGATACATTAAAATAAATTAACATTTAGCAGATCGCACCTTTTTAAAAGTTTCTATAATCATAGATACAAAAAACGAGTTGGACATAAGTCGGATACAAAAATAGACGAGATGTAGATCCCTCCTCAACATACACCCACAGAGAGTCAGTAGTTCTGGTATTTTTGGAAAGATGCCACAAATATTTTATAGGTATCTTTAGCAGACTCAACTTTAACATGGGTGCTGCATCATTAAACTAATCTAGCAGTAATTCCATTCATCGAGCTATATTGTTATTTTACTTCTATGTTATAGGGTGCATATCAAGTTGCTAAGTGGAATGGATTGAAGGTGTCTGTTAAAATACTTGGCAAAGAGAGCTACTCAGACCCAGATAGTATGTAAGAAACGTTCTTCTCTTTTAATAAAGACAATACATATTCTTTTAGTTGCTTTTTTTTAATATGGTTCATCAATGCCAACAAGTGTCGATCTCGAGGATCGAACTCGTGACATTTAATCTCATAGTTTGAACTACCAACCAACCGAGTCAAACCCGTTGGCTCTTAGTTGCCATTTTGAAACGGTGATTCCTTTCAAAATTTATGTATAATATCCATCAACCTTAGTTGTTAGAGTAAATCATGTTAATTGACATGTCATTTTTATTGTGAACCTATTGTTTCTAAATGCTACAGTCAAAAGGTAAATAAATGTTTATGATTTACTAAAAGGCCTTCATGTCTCACGAGTATCTAGGGAACTTCTCAAACTTGCTCTACATTTAAAAAAAGCTTCGTCATCTCCTTTCAATCCCTAAAGCTGCCTCTGTTCGTGTTCACGTATTTCTTTCTATTTGTCTTTCCTTTTTATACTATATATTGTTAGTACCTTAGCATAGATAATCCCTGAAGAAAAAATACATATTTATTTTTGCTGAAACAACACTGTAAACTGTCAAGCATGAGCTAACTCTACTGTAAAAAATATAGATAATTACTTTAAATTGTACTTACTACGTTCCTTTGATTGTAGAAATGCTTTCAAGCATGAACTAACTCTACTTGAAAAAGTTCGACATCCTAATGTGGTACAGTTTGTAGGAGCTGTTACCCAAAATATACCAATGATGATTGTTTCAGAGTACCATGCCAGAGTAAGCCTTACATTTTCCCTTGTTATAATCTGAACTATGCATTTTATAACACTGTAGTCTGAGGCTATGAATAGTATGTTCACTTGGGTTTTCTAGGTATATTCCATCTTGATATTCATTTCAGTTTAATAATATATCATGCTTTTTGG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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020248100.1	2.5e-173	serine/threonine-protein kinase STY17-like
Swissprot	F4IS56.1	3.4e-135	Ankyrin protein kinase 1
trEMBL	A0A5P1E2P0	1.8e-173	Protein kinase domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT2G43850.1	67.08	0.0	669		Integrin-linked protein kinase family

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	bit score
AfisC8G03216	AT2G43850.1	483	145	3	4	484	9	479	67.08	669
AfisC8G03216	AT2G43850.2	483	146	3	4	484	9	479	66.87	667
AfisC8G03216	AT2G31800.1	481	152	3	4	484	9	476	65.70	661

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF12796.4	Ank_2	Repeat	77	162	42.5	6.5e-11
PF07714.14	Pkinase_Tyr	Domain	207	460	165.4	1.3e-48

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0000166	F	nucleotide binding
GO:0005515	F	protein binding
GO:0001666	P	response to hypoxia
GO:0002831	P	regulation of response to biotic stimulus
GO:0005829	C	cytosol
GO:0004709	F	MAP kinase kinase kinase activity
GO:0004712	F	protein serine/threonine/tyrosine kinase activity
GO:0005634	C	nucleus
GO:0005768	C	endosome
GO:0005789	C	endoplasmic reticulum membrane
GO:0007166	P	cell surface receptor signaling pathway
GO:0008219	P	cell death
GO:0009617	P	response to bacterium
GO:0009620	P	response to fungus
GO:0009651	P	response to salt stress
GO:0009658	P	chloroplast organization
GO:0009686	P	gibberellin biosynthetic process
GO:0009723	P	response to ethylene
GO:0009738	P	abscisic acid-activated signaling pathway
GO:0009744	P	response to sucrose
GO:0009750	P	response to fructose
GO:0009898	C	cytoplasmic side of plasma membrane
GO:0009968	P	negative regulation of signal transduction
GO:0010182	P	sugar mediated signaling pathway
GO:0031347	P	regulation of defense response
GO:0032101	P	regulation of response to external stimulus
GO:0034654	P	nucleobase-containing compound biosynthetic process
GO:0043168	F	anion binding
GO:0043506	P	regulation of JUN kinase activity
GO:0044431	C	Golgi apparatus part
GO:0045087	P	innate immune response
GO:0045860	P	positive regulation of protein kinase activity
GO:0046330	P	positive regulation of JNK cascade
GO:0046777	P	protein autophosphorylation
GO:0048510	P	regulation of timing of transition from vegetative to reproductive phase
GO:0071281	P	cellular response to iron ion
GO:0098542	P	defense response to other organism
GO:2000035	P	regulation of stem cell division
GO:2000069	P	regulation of post-embryonic root development

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K06272	ILK; integrin-linked kinase	EC:2.7.11.1	Focal adhesion	ko04510
			PPAR signaling pathway	ko03320
			Axon guidance	ko04360

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network