result

Gene information

Detail information of AfisC8G03723

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC8G03723	chr8	693296735	693301623	-

Sequences

CDS

>AfisC8G03723
ATGGGATGTTCAGCCCGAGATAAGATCCACCGCAAGTTGGGGGAAGGTGCTTTTGGCCAAGTTTTAGAATGTTGGGACAGAGAAAGTCAAGAGATGGTGGCAATTAAAGTTGTTCACGATTTACATAATTTCCGAGAGGCTGCCAAGATTGAAATTGATGTTCTTTACCAATTGAAGAAACATGCTGATGCCAACAGCTGTTTTGTGCAAATAAGGAACTGGTTTGACTACCATAATCATATCTGTATCGTTTTTGAGAAGCTTGGACCAAGTTTATATGATTTCCTTCGTAAAAATGGTTATCGTCCATTTCCAATTGACGTAGTCCGTGAGATTGGCAGACAACTGTTGAACTCTATATCATTCATGCATGATTCACATCTTATACACACTGATTTGAAACCTGAGAACATTCTTTTTGTGTCTTCCGACTATGTAAAGGTTGGCTCGAGCTCAACTAGAATACCCAAATCAAATAAGATCAAGGTCATTGATTTTGGCAGCACAGCCTGTAATAATAGTCATGATCATAGCTATGTTGTGTCAACTAGGCACTATCGAGCTCCTGAGGTTATTCTAGGGTCAGGATGGAGTTATCCTTGTGATATATGGAGTGTGGGTTGTATACTTGTGGAGCTTTGTTCTGGAGAGACATTATTCCAGACTCATAAGAACTTGGAGCACCTGGCTATGATGGAAAGGATTCTGGGTCCATTACCTGAACATGTTCTTAGGAGGGCTGTTGAGCGACGTGCTGATAAGTATTTAAGAAGAGGTCGATTGAATTGGCCAAAAGGTGCAGTATCTAGAGAGAGCATCAAAACTGTTTCAAATTTGTCTCGTCTTCAGAATCTGGTAATGCGACATGTAGACCACTCAGCTGGCGATCTTATTGACCTTTTAAGAGGGCTTTTGAAGTATGACCCTAAAGAGAGGTTAACTGCTCATGAAGCCTTATCCCACCCTTTCTTTTTGAGAAATAAATCAAGGTCCTAA

Protein

Gene

>AfisC8G03723
CGCGTTTCTGTTTCTTTGTTTGTAACGTTGTCTAATTAATAAGAAAAGCAATATTTCCGCAAACTAGGTCAATTTTCTCAGCCCCAAATCATCTTTTCCTTCCCATACTAATAATTGTTCGTTTCTAATTCAGACGCCTATCCTTGTTAATCGATTAATCATGGCGATGTATTTCTTGTCCGATTTTCCCCAAATTCCGATTGATCATCGCCCTAGGAAAAGACAAAGATGGGATGTTCAGCCCGAGGTAAATATTTATCGATTTGATCAATACTTATTGCTGCGGATTATTGATTTATGGTTATACTAATCGTGTGCATGATGATTATTATTCTAGTTATATATTATTATTACCCTTTCCCTTCTTTTGTTAATGTTTATTGGAATGAATTAATTAGAATCCAAAAAACGGAGGAAAAAAAGGAGGGAGAGAAAATAAGTGCAGTAAAAGTTATTTGAACGCAAACACACACACACACACACTAATACAAAATTATTTTGTAGCAACACAGGAACATTGAAAGTGTTTATATTTTATAACATATGAGTGTTGTTGAAATGGGGAGTGCTTCAATTGGATGATAAAGAGGATGAAAATAGCCAAGTAATATAATCAATGGATCTGTGTAGGTTCAAACAGGAGCGTTGAATGGGCTAGAAGCCGGGCTTGTTGATCTGAAAAGCTTCCTGTCATTGATGCCATCTTCAACCACATGCCCTTCTGACTTAGTTGTAGAAGGAATTGTTCAACCGTCTTCTGCTCCCCTTAGAGTGGGTGATAAAGATGGTCATTTCATATTTGCAGTCGGGGAGGATTTAACTTCTCGATGTAAATACATTAAATTTGTAGATGTCATGATATAAAAAACTGTATACTTTGATGTAATATTCACTGTTAACATGCTAAAGCTAAGTAGGCATTACCTGTTTTTCATTTTCTTTTTTCCCACTAATCATTTGTGTGTCTATATTTGCATATAACATACCCTTTTTAACTACTCTGTCAACAGCTTGTGTAAATTTGAATAGATATAACTTGATATAAATGCTCTGCAAAATGTTTGGTCCTTTTGGCTAGATACCATCACACTTAATTCATGTTTTATGGTAAACTAATTGACATGGTTATTTTGTTTTTTGTATTTCAAGTTTTGTAGTCTGACTCATCTACTCTGTTGTTTTTACAGATAAGATCCACCGCAAGTTGGGGGAAGGTTAGAAATCACGATGACATTCAAATCGAAACATGCATAAAGTTTTTGATCATTTATATGAAATAGCAACCATTTATTTTCATGCCAGGTGCTTTTGGCCAAGTTTTAGAATGTTGGGACAGAGAAAGTCAAGAGATGGTGGCAATTAAAGTTGTTCACGATTTACATAATTTCCGAGAGGCTGCCAAGATTGAAATTGATGTTCTTTACCAATTGAAGAAACATGCTGATGCCAACAGCTGGTTAGTTATTTCTTTAATTTTTCTAATATGTCATAGAAACAATAAGTCACGTTTGCTGGATTATATTTAAGATGCATTCTCTAAACTCCTCATTTTTGCAGTTTTGTGCAAATAAGGAACTGGTTTGACTACCATAATCATATCTGTATCGTAAGTTTATAATTATCTCATAGATACTTCCTAGTTCAGCCTAGCACCCAAAGGTGTTAAGACTTCCTATGGTTAATGTTGACAACAGGTTTTTGAGAAGCTTGGACCAAGTTTATATGATTTCCTTCGTAAAAATGGTTATCGTCCATTTCCAATTGACGTAGTCCGTGAGATTGGCAGACAACTGTTGAACTCTATATCATGTGTGTTGAGTTAACTTTCATGATCAATTTTATAATTATTTTCTGATATATGCTGCTTTTGTGCGTGGTATTTTATTCTTTAGGATTCTGCTTTCTTTGCATTGTACTTACTGCCTACAGCAATACGTGCATTTGTTAGTGCCTGGCTCTGCCAATTCTTCTTATCAACCAAGAAACAGTTAAAAACTGCCAAACCTCTAACTATAGGAAGCAATTTTTGCTGAAGCGCTCATACAGTAGAGAGAGCAAACATGGTCTTAGGTGTTTAGGTTATACGATCAGGGCTCGACCTTTCTCAAGCATTTGTAGAATCACTTGACCCTGCTAGCTACCATTAATGGGTACTTGGTAGTTATGTTGTGCTTGATTGCTATGATATTGAGCTATTAAATTTAAGAGATCTGTCATAGTTTCTACTTCTGGCCCAACAATTTTCACTAGGTAGCTGTTTGAAAAACTCACAGATTAGAAGTATTCTTAGCAGCCACTGCCTAATGTAGTGTTTGGAACTATTATGAGCATGCAACAACTACTTGGTTGCAATACTTTACGTACCTTGCAGCAGTTTCTAGTTTCTAGTTTCTAGCTCAAGTATTTGTCAAAAGTTACGCAGTAAAAGTGCTTATCATATATGATGCCATCATTTTGTTTGCTTTGTTAATGTAACTCTATGACCTCAACATTTATTGTTTCTTTTTTCTTAATCTTTCCACAGTCATGCATGATTCACATCTTATACACACTGATTTGAAACCTGAGAACATTCTTTTTGTGTCTTCCGACTATGTAAAGGTATTCTGGTGGAGTAAAACCATTTGTTCATTGCTGTTGCATTCATCTCTTCAAACTTTACTCATGATATGTATGTATTGGTAATTTTTATTCAAGGTTGGCTCGAGCTCAACTAGAATACCCAAATCAAATAAGATCAAGGTCATTGATTTTGGCAGCACAGCCTGTAATAATAGTCATGATCATAGCTATGTTGTGTCAACTAGGCACTATCGAGCTCCTGAGGTTATTCTAGGTAGGTAGTCCATTTAGTTATCATTCTTCCCATCCAAAGTAAACATGATCAGTATTGATATCAACAAATAAAATAAAGTATGATATGATATTTATCAGGGTCAGGATGGAGTTATCCTTGTGATATATGGAGTGTGGGTTGTATACTTGTGGAGCTTTGTTCTGTAAGCTGCTTCTTTCGATCTTGAGTGGAAATTGGAAAGTGTGTAATTTGGTTGATAAACTATTTCTTAAAATGCACTAGGGAGAGACATTATTCCAGACTCATAAGAACTTGGAGCACCTGGCTATGATGGAAAGGATTCTGGGTCCATTACCTGAACATGTTCTTAGGAGGGCTGTTGAGTAAGTTTGTTTTCTTTGTTCAGTCTTGAACATGGTAGTCCAACATTGGAATTTTAGCAAATGACTTTAACATTTGTCTTATGTTTATTCTCTTCTTCTTTATATTTTTTTAGGCGACGTGCTGATAAGTATTTAAGAAGAGGTCGATTGAATTGGCCAAAAGGTGCAGTATCTAGAGAGAGCATCAAAACTGTTTCAAATTTGTCTCGTCTTCAGGTACAGGCTAGTGTTTGCTTGTCATCATGTTATCAGTTAGAGTGCATTTCATATTTTTAGCCGATTTCGAACACTATCTAATATTATTGTTGCTTGAATCTATTAGCACCCCTAAATCTTCCTTTCACACCCCATTTTTTTATGAAAAATATCACACCCCATGTATTTCTCTCAACACATTATATCAAATTTATACTTTTACTTTCAATTTCTTTTCTTTTTCTTTCCGCTCTTTAATCTTCTTAAATTGTCAAATTCACGAAACCAAAAATCATGTCTGCTTCCGGACAATTTTCATTGTCAATCAAAGTAAAAAATTAATTAAGAAAGAAAAACATACTCTAAATTAGTTTTATTTAGAAATGTATATTTTCTCTTTCGTATAGAGGCTAGGAGTAATAATTTTGGTTTTTTTATACTGAATTTGGTTAGATGTATTTGGAACTTGCTGACCGAATTCTTCTATAATTTTTGTTAATCGAATGGAATTAGTGTGAAATTAAATATAAATATGTAGCTATCTTCAACCTTTCAATTTGAGATTAAAGAATGGAGGGGAGGAAGGAGGAAATGAAGAACATCTCGACTACTGTATTGCCACTTTTGACCTTGTCAACACCATGTTGTCAAAACTGTGCTGGCGACATTTCAAATGTTGTTAGTATATTTTTTTTACAGAGACTAGCAAACATGCGCTATTTTTGAAGTTGCTCATATTAAACAGATAAACACTATAGGCGACTTTTGAAAATGCGCTGTGTTAGTTTCTAAAACATTACCAGCGTCTTTTGAAATGTCACCGGTACAATTTTGCCAGCGCCACGCTGACATGGCCAAAAGCGACCTATATTTGTAAATTGTTTTAAAAGTGGCATATCTTATAAAATTCCCTGTTTGTATTGTTTCGCCCAAGCTTAAAAGAAGTTTTGATTTTGATTTTTTTTTTTACCTTATCTAAATACTGTACAAGAAAGAATACCACTGTCCTAATCATTTACGCTTCTTGTTTATTCTTAGAATCTGGTAATGCGACATGTAGACCACTCAGCTGGCGATCTTATTGACCTTTTAAGAGGGCTTTTGAAGTATGACCCTAAAGAGAGGTTAACTGCTCATGAAGCCTTATCCCACCCTTTCTTTTTGAGAAATAAATCAAGGTCCTAAACGTGAAATGCTTTTAAGTTCACATTTGTGAAACTGCTAATTTATGAAAGTTGTACATAGCTTTACACGATTTCAAGTGGAATTTTTTTTTGAAATGTACATCAGAATATAGCTTGCAGTTTGGCAATTTCACCATTCTGTTTGTGTTTATTTACCTTGCCATAAGTTAGTTCTTGATTACTTGCATGCGTACTGAATTAGACAATATATAGCCTACGCCAATGTATTATTGTTCACTGTTGTGTATATATATATGGTAAGTATCATGTTAAACTACAGCTGTTGCTGGTTTCTTCCAGTTATTAATAAAATGATATTCGATTCTTTTT

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020260293.1	7.5e-145	serine/threonine-protein kinase AFC2-like isoform X2
Swissprot	P51566.2	8.6e-130	Serine/threonine-protein kinase AFC1
trEMBL	A0A8B7CW94	1.9e-142	serine/threonine-protein kinase AFC2 isoform X1

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT3G53570.1	65.69	1e-131	466	AFC1;AME2;FC1	FUS3-complementing gene 1

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC8G03723	AT4G24740.1	335	101	4	4	328	95	427	66.27	1e-131	466
AfisC8G03723	AT3G53570.4	341	102	4	4	331	112	450	65.69	1e-131	466
AfisC8G03723	AT3G53570.2	341	102	4	4	331	112	450	65.69	1e-131	466

Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g201033.t1
Allium fistulosum	AfisC8G03723
Allium sativum
Arabidopsis thaliana
Oryza sativa

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00069.22	Pkinase	Domain	10	324	180.2	4.2e-53

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005515	F	protein binding
GO:0004325	F	ferrochelatase activity
GO:0004674	F	protein serine/threonine kinase activity
GO:0004712	F	protein serine/threonine/tyrosine kinase activity
GO:0004715	F	non-membrane spanning protein tyrosine kinase activity
GO:0005524	F	ATP binding
GO:0005654	C	nucleoplasm
GO:0006397	P	mRNA processing
GO:0006783	P	heme biosynthetic process
GO:0008283	P	cell proliferation
GO:0009535	C	chloroplast thylakoid membrane
GO:0010212	P	response to ionizing radiation
GO:0018108	P	peptidyl-tyrosine phosphorylation
GO:0031324	P	negative regulation of cellular metabolic process
GO:0031969	C	chloroplast membrane
GO:0043484	P	regulation of RNA splicing
GO:0044822	F	poly(A) RNA binding
GO:0045111	C	intermediate filament cytoskeleton
GO:0046777	P	protein autophosphorylation

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K08287	E2.7.12.1; dual-specificity kinase	EC:2.7.12.1	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network