result

Gene information

Detail information of AfisC8G04104

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC8G04104	chr8	748741589	748747914	-

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC8G04104
ATGGTGGCCAGGGGACAGCGTGATAGGGTTTGGAGTGCTGTTTGGTTGTGTTGGGTACTCGTGATGATTCTGGCGTCGATGGATCATCGGAGGCACTCGCGTTGGGGGAAACAATGCTGGGGTTCGAGACAAAGCTCGGATGTGGTTGGCAGGGGTTCTCGAGGTCAGGTTCGTCGGCGATTGGGAATTTTCCGTCGATGCTTTGGTTTCTGGTATGCTCGAATTTGTTCGATTTCGTTACACAGCGAGTTCGACGAAGCTGGGTGGTCGGGACGTTGGCAAGGGTCGTTGGCGACTTGTAGGTATCATCGGAGGTGATCGAAACGGAGGCAGTTGCGTGTGCATGTGCACGGGAGCAATGGTGTCTGGGTGTTGTTTTGAGTTTGGGGAAGAACTGTTTTCCTCGGGAACGAACTTGAAGTAGGCAAGGTTTGGCTCCAAGGAATATGGTAGCGGGTTTGCTCGTGTTTGAACTCGAGAAATTTGAGTTTGTCTCGGGTATTATTGATTTTAGCTCGGGAACGTTTTGTTTCTAGATTTTAATCCTGTTCAGATTTTTAAACAGTAAATGTTTCCAAATTTAAAGCAAAGCTAAATTTTAAACAAAGTTTTTAACCAGTTTTAAAGATGTATGAAATGTTGAATTTAGAGAATGATGTTAAACAAGTTTAAGTTTTAAAAGAATATATTTTCAAAGTTTTAAATTTTGTTTAAAAAAATAGTTTTGGTTTATATAAATATTACATTAAACAAATTTTTGTAATTTGTCCTTGAATGTTTTCAAGTAAAATGTAATCGATGAAATTGAAATGTTTTTAAATTGAAAGGTATTTAACTTTAATAAATTAAAAAGATGATGATTTTGTATAAACCAAATTTAAGCTTTTAAATTTAACTTTAATTTAAATGGTAGGTAAGAGTTTAATGTAGTAAATGGGTTATGTTAATTTAATCAAGTTTATTAATTAAAGTAATTAAGGTATAATTACTCAATTAACTAAGATGATTAATTTAGGATATTAAATTAAGATAAATTAATTTGTGAAATTAATTAAAGGTAGTTGATTACATAATTTAGGATTGATTAATCTAAGTAATCAAAGGATTAAGGAATAATTAAGTAATGGATGTAATTAGAGGTAAATTTACTTAATATTAGAAGGAGTATTAAGAGTAATTACTTAATGAAGTAATTAAATTAATTAATTACTCAATGTAATTAATTAAATTAATATGGTTAATTAAAGTTAATTAATTAGTTAATTAATTAAAGAGAATTACTTGATGAAAGCAATTAAAGGTAAATGACTTAAGGGAAGTAATTAAGGATGAATTACTTTGAGTAATTAATTAAGGTTAATAAATCATTGTTAATCACTTTATAAGAGTAATTAAGGGATTATTTAATGTGATGGGTGAAGGTTAATTAATTTTTATAAGAGTAAATTACTTATTTTAATTAAAGGATAATTAGTCAAGGATGATTAATTGAGATGGATAATTAAAGGATGATTAATTAATTGGGTTGTAATTAATTAATGTTAAGTAAAGGTAATCTAAGTGATTAAAGTTAGTAATTAATTAAATTAGAGAAAAATTAAATTGATTTTTAAAAAGTGATAAATCTCGTTTATGAATGATTGAATGATGTTAAATGCCTTGAATTGGTTGATATCTCTGATATGAAATGTTTTATGAGATGATATGTTTGGGTGGACAGTGATAATGTGGTTATATATCAATGATAAATTGCTGTGTAAAAAGTGACATCCTGTATTTAAAGTTGAATTGTAATTAATTGAATAACTTGGGTTAAGATGACATGAGATTCGAAGAGACCGGAGTCGGGTATCAGTAAATACCCGGAACCACTTCGATTTGTAATCTACAAAAATTTTATAAACCGTATATGTGGTATTAAACAGGCTGGAATGGAATGAATTGTGTAATATGGATATTTAACCTAAAACTATTGTGTGATAATGATTGACTATGAGAACTCGTAAGAGGGTACGAGTTACCTTGATATTCACATATGTTATAGCTTGGTATTTCATGTTATATGGATTTACTCACGCTGGTTTCCAGCCTGACCCGGGTGTTACTTTGATGTAATGCTCGGGTCAGACCGAGTATTACCGATTTTCAGGTAAGGACGTTCTGGAGTTCAGGAGGTGAGCTGGATGACAAGAACGTATAGAGTATTTCCGCTGTATTGTATTGTTGTATATCTGAGATATGATAACTGGGTATATTCAGTGTCTATATATATGTGTAACTCTGATGTATTAAATGCAATCGACAGATATAGTATTCTTTGTAAACTGTTATATTTGTTACTATATTTTATCCGCTGCGAATGTGAGGTGCTGATGTTTCTGATCTTTTCTTCTATCTCCTTCTTCTTTTTCATAACTATCTGGCATTTTCGGGATCGAAAATCCCGGGTTGTCACATTTAGTATTAGAGCTGAAAGGTTAAGCGAGAACCTTGGCTCTGGTGGGGGATACTCTTTAAGGATAGGGTCAATAGTACCCTAGAATGAGTTCAGTGTGTATATATATATATATGAGAGCGTACTTGTTATTTTCTTATATAAAGGTTTTAAATGATTTTATATAGGATTATATATTTTGATATATAAAGCAATATTTCCTTTAATAAATATTAAGGTAGTTGGTTGCTGAATAAAGATAAGTTTGAAATGGATCCAAACTGAAATTAAAATCCTGAATTTGTGGAAATGTTTCCAGAATAAAGATAATAATAAATTGGTTTCCAGATATGATAATCATGGTTGATATCATTAACGATTAATAAGATGTGTATTAATGAGTAAACAAAAATAAAATGTTTGGGAGGTAAAATAAGATGTGTATTAAGTCGATGCCGAATTTTAGGACCATCAAATCATCAATGCAGAAAACAATGTGATCCATAATAGCGCATCCATTGAAAAACAAATTCAACCACCTGGAATTATTGGTGGCAAAGTTGAATACAATTGGCATACATTGTACAGTTTCATAACGGGATCGACAGCATACAGTGTACCACATTGCCGGGTAGGTCCCACGCACGAATCTGGTAACTTCAGCCTTTGTTTTGACTGTCGGCTGCATTGATGGGGGCGACGAGTGGGACCCACATTGTCATGTGAGTGCCGGCTCAAGTGAAAAGAGAGTTAATGATATTGAGCATGTGATGTAGTGTAAAGGATCTGTTCCTTTTGTTGCAAGTGACAAAAGTTTTACTCTTCTTTTATGTTTTTATATCAAGGTACACATTTTTTTCCTCTCAAAAATCATAAATCTATTATTGTATCTATCTAAATTCATCAAAATAGCAGTTGGATTTGTAGTTCACTTCATATTTAAATAAAGTCGCTTGCGTCTGTGATGACAAGGGATTTGGTAATGAGAATGAACTATTGCATCTCTTTAGCCTTATAATTAATTAACTGCTTAAACGGAAACTATTCTTGCTAACAATTCTTCGTGTTTACATCTCTTGTGAGGAAGACATAACTCTGATTTCTTTACTTTTTGCTTCTATGTTAGACAGTAAAAATCAATGAAAATGGAACAGTCATGTTATTTCTAATCATCTTAATTAAATTATTTGTTTATTGGCAATTTACCCAATTTGTGCATATATTGATCTCTAAGGAACGTGTTTCTTTCTTAAAAAACCAATAATTCTGTTTGTTGATGTTAAAATTCACTTTAATATACAAATATTTGTTGTACCAGGTTCCGTAAAACCTGTATCGCACATGTATGTGAAATATAATTTTTAAAACTTTTTTAGTACATAATCAACTATAAGAGTTTGATAGGTTTTCTTTTCTAGTTAATACAAACCACAATATGTTAAATCTTCCCATGGACTGTAAATGTTTTTTCATGTCAACAAGTATCCAATAGGGCATTCATACAAATTGTTGTTCACTTAAATTCGGTAGATTTTTTGTTTGGAATATGGATATCCTTCCTGTAACCATATGACATTACAAGTTAAGCTCAATACATGCTGCACTATGAGTTTATGTCGATCATACTTAACAATAGCTGCACCTTTGTTTTTTTTCCTTATTCTGCACTAGAAGTATTAAATTTTATTTTTTGAGTCCATCCATGTAATTTTTTTTATTGTTTTGAATCATTCGATGGAGTTTAATGCATTAACATAACATTAGGCACATAAAAATGAAAGAACAATTTATATTACAAGTTGTATCATTTGTTTCAAAGCAACTTGAGCGTTTTTTCAATGAAAGTGCTTCCCCTTCCTACGAAGATGCTACCCTTGGTTCCTCATGTGTTCATCATTCACTAGTTCCTAATCTCTTTCATCTGCTTTTATATCTACTGTAGGAAAATTTATTAATTTTTAATTTTTCTGCTATATTAATTTAGGTGTGTATGACGTGAAGAAAATGCTTCTAATCCATGTTGGATATTAAGACGGCTTGCAACTAATCCTTAAATGTTGGTATACCAAAGTTAGCTAATTTGTTTAATTCAATTTTATGTGAATATTACTAGAATATGGTCCGCTACACTCAAGAATTCGAGTTGATGAGTGGCTTATATGACAATTTTTAAAATCTAGAGGTGCATTAGGCATTCCTACAAAAGGTAGATGTATATAGAGACATTGGTTTCTTCACATAAATCTCAGGTGTAGAAATCAATTTTATGTACAATGTTGTATGCTACATGCACAATGTGTATAAAGATACAAAGAACCGAGACAAACTCAGTATTCAATTTTAAAATTGTTATTATTTTAAACTTCCAAGTTTAGTACGAGGAATATAATTGATCATTGATCTCAAACTTCTGTTAGGATTAACCTAATAAAGCATCATAGAATTCAATTTTAAAATTGTTATTTATTCCTTTTTTTGTTAAATATGTCAGATAGGGTATGTCATACTAAAATAATATAATGAGTTAATTGATTAAACTACTTGTTTTGTACAAATGATCTATTCATAAAATTACATCAAAGACTATAGGATATATTTAAGAAAGAAACACGTATGATGATTGGGCAACATAATCTTTTTGAAAATAAGCTATACGATTAAGGACAAAGAAAAGTTTTTCATTAGTAACAAAATGACAAATATATGTGAGGTGTTTATATGTTATTTTAGCCTTATACAAAAATACTTAAACAGATGTGCTCCTTTATGATCATTAACTACACTAAAAGGATCATCTAAGAAATACGCATCAGAATCACTGTAAATTGCTCTTGCTGATTAAATCCTTTGTTTATATCCTCCATTAAAATAGACTAGGTTTTATAAAAATAGCAAATTTTGACTTCTTTATATGTATCATATTGCAGCAGTAAAACAACTAGATAGAAAATGGACTTGATGGAAACATCGAGTTTTTAGTAAAGGTATTGATGCTTAGCATCCTTCATCATCCGAACCTTGTAAAACTTGTAGGATATTGCACTGATGGAGATAGCGCTTATTGGTGCACGAATTCATGACTAATGGTTCCTTACAAAACCATTTGTTCGTTAATATATAGCATTTTCTTATGTTTTCCTTTTCTTCTTATTCCAGATAAACCATACATTATTCATAAATTTGCAGATCTTCAACCGAATCAAAGTCCATTAAATTGGTCAATGGGAATGAAAATAGCATACGGCGCTGCACAAGTACTCGAGTATCTACACGACAAGGCAAACCCACTAGTTATATATGGTGATCTAAAATCATCAACTATTTTATTAGATGAACAATTAATGCCAAAACAATCGGAATTCGGACTGGTAAAACTTGGCTCGGTTGGAGATTTTCTAGTTGCTTCCTCAAGAGTTATGGGCACTTTTAGCTACTATGCTCCCAAGGATGCAAGAACCAGAAATATCGGTTTGAAGTCTAATGTCTATAGCTTTGGTGTTGTCCTTTTAAATCTTATTGCCGGAAGAAGAGCAATTGATACTACCAAACCAACGAACGATCAAAATTCGGTTACTTGGATATGTAGTGCTACTGATTCTTTCTTTTTTATGTTGATATATGTATAAACTGAAGATTTTACTATTTTATATAGATGCAACCCATGTTTAAAGATTAGCAGAGATATAAAAAGCTGGTTGATCCAGTACTGGAAAACAACTACCCGTTAAAAGTGTTGAACCAAGCTGTTGCAATTGTGGCAATGTGTGTTCAAGAAGAACAACCAGTGCGCCAATCCATGCCAATTGTTGTTGTGACATTGAGTTTTTCAGCTGAAGCTTTTCCTTCATCTAAAGAGATGCCTTCATCCTCCGGTCAGATAACTGTCCCATAA

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020113706.1	1.2e-57	probable serine/threonine-protein kinase PBL25
Swissprot	Q9LRY1.1	1.6e-51	PBS1-like protein 25
trEMBL	A0A199W6E2	8.6e-58	Serine/threonine-protein kinase

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT3G07070.1	54.07	4e-54	208		Protein kinase superfamily protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC8G04104	AT3G07070.1	209	91	1	116	324	164	367	54.07	4e-54	208
AfisC8G04104	AT3G24790.1	197	83	1	116	312	132	323	55.33	4e-54	208
AfisC8G04104	AT3G02810.1	242	97	7	95	333	137	356	49.59	7e-54	207

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00069.22	Pkinase	Domain	127	245	54.4	1.1e-14

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0002221	P	pattern recognition receptor signaling pathway
GO:0004674	F	protein serine/threonine kinase activity
GO:0046658	C	anchored component of plasma membrane
GO:0009506	C	plasmodesma
GO:0009816	P	defense response to bacterium, incompatible interaction
GO:0009860	P	pollen tube growth
GO:0009941	C	chloroplast envelope
GO:0010183	P	pollen tube guidance
GO:0019901	F	protein kinase binding
GO:0035420	P	MAPK cascade involved in innate immune response
GO:0046777	P	protein autophosphorylation
GO:0048768	P	root hair cell tip growth
GO:0071323	P	cellular response to chitin
GO:0090404	C	pollen tube tip
GO:1900150	P	regulation of defense response to fungus
GO:1900426	P	positive regulation of defense response to bacterium
GO:1900459	P	positive regulation of brassinosteroid mediated signaling pathway

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network