result

Gene information

Detail information of AfisC8G05032

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC8G05032	chr8	921021073	921027633	+

Sequences

CDS

>AfisC8G05032
ATGTTCAACTCTCCTGGCCTCTCTCTAGCTTTGCAGACACATAAGAATGATGAACTGAGTCGTATAATGGGGAATTTAGATTCAGTGGTGAGAACAAATAACGAAGAAGTAGAAAACGAGATGAGTAAATCTGGAAGCGATAATTTAGATGCAGTTTCGGGTGATGATCTTGATCAGGAAAATCCTCGAAAAAGAAAGAAGCGTTACCACCGCCACACTCCTCAGCAGATTCAAGAGCTTGAAGCGCTTTTCAAAGAAAGCCCTCACCCGGATGAGAAACAAAGAAATGATCTAAGTAAACGCCTTAATTTGGATCCGAGACAAGTAAAATTTTGGTTTCAAAATCGTAGAACCCAAATGAAGACCCAAATTGAAAGACACGAGAATTCGCTGCTGAAGCAAGAAAATGAAAGGCTTAAGTATGAGAACATCACTATAAGAGATGCGATGAGAAACCCCACTTGCTCCAATTGCGGTGGGCCTGCTATTCTTGGTGAACTCTCGGTGGAAGAACAACAAATACGAATTGAGAATGCTCGATTGAGAGATGAGCTTGATCGAGTTCGCTCACTTGCCAGTAAATTTCTAGGGCAACCAGTTTCTGGACTGTCTCCTAATTCGGTACCTAACTCATCTTTAGAGCTTGCAGTTGGTTCTAATGGATTTGGTAGCATGGATTACTTTAATAGCTTGTCTAGTAGCTCTATGGGTTCTATCGTGACTCCATCATACAAACCAATGTCTAATTTGGGTGGAGTTGATAATAGTGGCTTAGATAAGTCAGTTTTGGTGGAACTTGCATTGAGTGCAATGGATGAACTTGTGAAAATGGCACAATTGCATGAGCCTCTTTGGATTCGGACCTTTGATAGCAGGAAGGAGACATTAAATTTTGAGGAGTATTTACAAACATTTCCTCGTTGTATTGGAGTTAAACCTGTGGAATTTGTTTCTGAGGCGACAAGGGAGACGGGGATGGTGATTCTTAATAGCTTCGCTCTTGTGGAAACTCTAATGGATGCTACACGTTGGGCGGATATGTTTCCGGGTATGATTGCAAAAGCTACGACCACAGACATCATATCAAGTGGTGTCGGTGGAAGCCGAAACGGTGCACTTCAATTGATGAAAGCGGAGCTCCAAGTTCTTTCACCGCTGGTTCCAACCCGGGATATTAATTTCCTCAGATTCTGCAAGCAGCTAGCAGAGGGAGCATGGGCTGTGGTAGATGTGTCAATCGATGCAATCAGGGAAAACCTTTCTGGAAATATAAAATGCAGGAGGCTGCCTTCTGGATGCGTTGTTCAAGATATGCCTAATGGGTATTCTCAGGTTACATGGATGGAACACACGGAGTACGATGAATCTCCAATACACCAACTGTACCGTTCTGTTATCCGTTCTGGGACAGCTCTTGGGGCCCACCGTTGGGTCTCTACCCTACAAAGGAGATGCGAATGCTTGGCCATTCTGATGTCGACTTCATTTCCTGCTGCTGACTCGACTGTAACGCCAGCTGGCAGGAGGAGTATGCTGAAGCTTTCTCAAAGAATGATGGATAACTTCTGTTCTGGAGTGTGCATGTCTTCATCTCGTAAGTGGAGTCAGCTTACTGTGGGAAGCATTGGAAAGGATGTAAGGGTTATGACTAGGCAGAACCTGGACGACCCTGGCGAACCACCTGGCGTTGTCATCAGTGCAGCCATGTCTGTGTGGTTGCCTGTGCAGGCAAGGCGGGTGTTTGAGTTTCTTCGGAATGCGGGACTTAGGAGTGAGTGGGATATACTATCCAATGGTGACCCTATGCAGGAGATGACTTGCATTGCTAAAGGGCAGGATGAGGGCAATGCTGTTTCCCTTCTTCGTGCCAATACAGTAAATGGGAATCAAGGAAACAACATGCTGATACTGCAAGAGACATGCACGGACTCATCAGGCTCGATGGTGGTGTACGCACCAGTCGACATCCCAGCCATGCACGTCGTGATGAACGGTGGAGATTCAGCATGCGTGGCGCTGCTCCCTTCAGGCTTCTCTATCCTACCAGATGGAGCTGAGCAGCAGGACGTAGGTGGCTCTCTCCTGACCGTCGGATTCCAGATCCTGGTCAACACCTTGCCAACTGCCAAACTGACCGTCGAGTCCGTAGAAACCGTCAGCAGTCTCATATCCTGCACAGTTCAGAAAATCAAGGTCGCTCTGCATGTCGAATGA

Protein

Gene

>AfisC8G05032
AATTTTGTTCGATGCAAATTACAAAAAGAAATAGATAGAAATTGAGCATGGAAAATTGAGTCATTATCTTCTTCTTCTTTCTTCTAGATTTTTTGTTTTTCTATGGCTTGTCCTTTTTTGTATGCAGAAAAAAAGGCTACATTTTGACCAATCTACTTAAAAAGTGATTTTTAAGTCAACACTTCACACCTTTCTCATTTTCGCCTTTTAAACAGATCCCTTTCCTCACTTTTTCTGCTACTCATTGCCTTTCTCGAGCGCTGCGTTCCAGTTTCTGTTTGCATGTGTTCCAAAATTATACTTGGGCTTGATTTTTAGGGTTAGGGTTTTGAGTTTATAGGAAGTGGAAAGGAAGACGGTTAGAGAACGAGGTGCTAGCTTTTTTGTGCTTGGCTTCCTTCCCTCTCTTTCTTCCCTGAGTAAATTAATTTATTTTCAGCAAAGTTTTCCTTTTTATTTTAGTCCGTAAACAATGTTCAACTCTCCTGGCCTCTCTCTAGCTTTGGTAAGCAATTTACGTTGTTCAATGTCTTTGTACACAGATCTTTTTTTTTTCATTTTCAGTTAGCTTCTTTCATCTTCTTCTTTTATTTTTTATTTTTATTTATTGGATTTAATGCGTTTTTAAATTTGCAGCAGACACATAAGAATGATGAACTGAGTCGTATAATGGGGAATTTAGATTCAGTGGTGAGAACAAATAACGAAGAAGTAGAAAACGAGATGAGTAAATCTGGAAGCGATAATTTAGATGCAGTTTCGGGTGATGATCTTGATCAGGAAAATCCTCGAAAAAGAAAGAAGCGTTACCACCGCCACACTCCTCAGCAGATTCAAGAGCTTGAAGCGTAATTCTTTTGTTTAGTTTTTTGATTGATATAATTTGGATTATATTAACTAGTTAGCAAAATGTTGATAAATGTTCATATCAGGCTTTTCAAAGAAAGCCCTCACCCGGATGAGAAACAAAGAAATGATCTAAGTAAACGCCTTAATTTGGATCCGAGACAAGTAAAATTTTGGTTTCAAAATCGTAGAACCCAAATGAAGGTTTGCATCTATCATAATAAAATTCTCACTATGATTTTATGTCACTTGTTTTGAACAATTATGATTGTATAAATCAGACCCAAATTGAAAGACACGAGAATTCGCTGCTGAAGCAAGAAAATGAAAGGCTTAAGTATGAGAACATCACTATAAGAGATGCGATGAGAAACCCCACTTGCTCCAATTGCGGTGGGCCTGCTATTCTTGGTGAACTCTCGGTGGAAGAACAACAAATACGAATTGAGAATGCTCGATTGAGAGATGAGCTTGATCGAGTTCGCTCACTTGCCAGTAAATTTCTAGGGCAACCAGTTTCTGGACTGTCTCCTAATTCGGTACCTAACTCATCTTTAGAGCTTGCAGTTGGTTCTAATGGATTTGGTAGCATGGATTACTTTAATAGCTTGTCTAGTAGCTCTATGGGTTCTATCGTGACTCCATCATACAAACCAATGTCTAATTTGGGTGGAGTTGATAATAGTGGCTTAGATAAGTCAGTTTTGGTGGAACTTGCATTGAGTGCAATGGATGAACTTGTGAAAATGGCACAATTGCATGAGCCTCTTTGGATTCGGACCTTTGATAGCAGGAAGGAGACATTAAATTTTGAGGAGTATTTACAAACATTTCCTCGTTGTATTGGAGTTAAACCTGTGGAATTTGTTTCTGAGGCGACAAGGGAGACGGGGATGGTGATTCTTAATAGCTTCGCTCTTGTGGAAACTCTAATGGATGCTGTAAGCTAACCTTTTACTTCATTGTATTACAGCTTACCTTTTTCCGTAATATTCGGCTTATCTTATCCTATTCTCAGAGATTGTATAGGAAAATAATAGTTTATATGTGATGTTACTTGCCACCTTTAATTAACTATTATTATGAAAGATAAGATCGTATGTCTAAATAGCCACCCTTCAACACGTTATGCACACTGAAAATTTTCTCTTCATAAATCATAGTGATAGTATATTGTTCTACTTTGTTATTTTTCTTTTACCATGTATTGTTTCGTATCAACTATTCACAGTACTTGATTTATGTTTCGAGAGAGACTAGACTTATTGCTAGTACGTATTACAATGAATTTTGTCTCTAGCAATAGAGAATTGATAAAGGGTTGGTAGGTAGTCATAAACTCTTGACCCTATCTTTTAAGCGAATGAAAATATTTTGCATGTTCGGTACCTGTTAAGCACACTGAAATTTGTATTGTTTTTCTCTTCATAAATCATAATAATAGTACATCGTTCTACTTTGTCATTTGCTTTTCCCATATATTGTTTCGTATCAACTTCCTACATTAGTCAGTTTATATTTTAAGAGAGACTAGAATTATTCAATACTGATATATAATAGTATATATTACAACGAATTTTGGCACTAATAGAGGATTGATAAAGGGTTGTTAGGTGGTCTTAAACTCTTGACCCCATCTCTTAAGTGAATGAAAATACTTTGCATGTTCATTCATCAATGATCAACGTGTAGAATTTTTCTTCTGTGTTTTTTCTACCCGTATATCTTTTTGTTCAAGATTCTTATTTTTGATGAAACTTGTATTTCACAAACTATTTATTCTTTTACATCTTTAATTGTTTATACAGACACGTTGGGCGGATATGTTTCCGGGTATGATTGCAAAAGCTACGACCACAGACATCATATCAAGTGGTGTCGGTGGAAGCCGAAACGGTGCACTTCAATTGGTCAGTGATTTTATCTGTAATAACAATAACTAAAATTTCCTCATTTCAACTATAATTTTAAATTTTTATTATTACTTTGTGTCGTCATCTACTAGAGTAAATTTTGGATGTAAGATAGAATTGTGAGGCCACTTTAATGTAATGGTACATATGTTTTTACGTTAATAACGATATTAAAAACACAACTTTTATTCAATTAGCGTGTGATTACACTAGTTTTCACATACCATGCAATATGGTACCACATATAATTAAATTAATATTTAGTTTTTGTTTTCCTTATGTTTCTTGGCTTTAATATAATTATTTGTTTAGATGAAAGCGGAGCTCCAAGTTCTTTCACCGCTGGTTCCAACCCGGGATATTAATTTCCTCAGATTCTGCAAGCAGCTAGCAGAGGGAGCATGGGCTGTGGTAGATGTGTCAATCGATGCAATCAGGGAAAACCTTTCTGGAAATATAAAATGCAGGAGGCTGCCTTCTGGATGCGTTGTTCAAGATATGCCTAATGGGTATTCTCAGGTACTAATATAACTAATATATGTTTAAGTTTGTGCATTATTTTTATATAGGTCATTGTGATTCATATTTATATATAGTTTAGAATAATCCTGTGTGTCGGTGATTAGTAACAACAAGAGGGTCAATACTGAAGACTTTTTGCTACGTAATCCTTCAGATCTAGAATCAATGATATGATGGTAGTCTTGACTTAGCATGCTATTTCTAGTTCAGGGACCATGCATCAATTAATATATAGTTTTAAGGCAGACAGTTTATTAACATTAGTTTTGGAGCTCAGTGTCATGTGCTGCTGTTTATAAGTCAATCCCAAACCTCCATGTATATAAAATTATAAATTTACTGTTTACCATGCTTATTTTTTTCTTCTTCTTGTTTTTGTTAAACTAATTTTAGATGCTTCTTCTACACCGTATAGGAATCATCACCACTAGGTCCTTTATTGTCTTCTTTCACATATCTAAATATATTTGTTTCCCCCAACTCCACATTGGAAGCCTGAATTCAAGGCTTGTTTTCCCCAAATCTTATTTCTTTACTCTTTCTATTCTATTCTTCTGTCTTTCATTAACATTAATTAGTATCATATCAGCCCTAATTAATTAATCAATAATTACTCCAGGTTACATGGATGGAACACACGGAGTACGATGAATCTCCAATACACCAACTGTACCGTTCTGTTATCCGTTCTGGGACAGCTCTTGGGGCCCACCGTTGGGTCTCTACCCTACAAAGGAGATGCGAATGCTTGGCCATTCTGATGTCGACTTCATTTCCTGCTGCTGACTCGACTGTAACGCCAGCTGGCAGGAGGAGTATGCTGAAGCTTTCTCAAAGAATGATGGATAACTTCTGTTCTGGAGTGTGCATGTCTTCATCTCGTAAGTGGAGTCAGCTTACTGTGGGAAGCATTGGAAAGGATGTAAGGGTTATGACTAGGCAGAACCTGGACGACCCTGGCGAACCACCTGGCGTTGTCATCAGTGCAGCCATGTCTGTGTGGTTGCCTGTGCAGGCAAGGCGGGTGTTTGAGTTTCTTCGGAATGCGGGACTTAGGAGTGAGTGGGATATACTATCCAATGGTGACCCTATGCAGGAGATGACTTGCATTGCTAAAGGGCAGGATGAGGGCAATGCTGTTTCCCTTCTTCGTGCCAATGTAAGCATTTTTATTTCTGTTCATTGAATTAATAGTGCATATTTTATCAATATCGTTAACGTATGCACACTATGACATGTTAACAATGATTGTCTTGAAGAAAACGCATGGAATTCAGGGAGGTGGGGGTATTTGTGTAATCGATCAATTTTAATACGTGCCTTCATATTTTACTCAGTAATGACAAATCGATAAGACATTAAATCTCTTCATTTATCAGCCTGAGGTAATGAAATTTTTTATGGCACCCTTTGAGGAGTTTAGTGATAAGTCTTACGAGTTTTGAACTTGACACTTTTATTCTATGAGCATTTCACCAGAAGGACAAACTTTGCAATCAAATTAGTTTATAGGACACACATTCAAAGAAATTACTTTCAAGGCCAAAGTCAGCAAAATAATTACTTTCAAGGACAAAGTCAGCAGTTCAATTACTTTCAAGGACATAATTTCATAGGTTTTTAGGCCCTAGAAACTAATTATTTTACGTTTTGTCTTTGAAAGTAATTATTTCAGTTGTGTGTCCTAGAAACTAATTCCACTTGCTAAAGAGGCCCTTGTGGCTAATTTCCACTTTATTTTATATATATTACATGAGTCTCCGGTCCGTTGCATTTATAACGAGGTCGCTGCTTTTAAAATTAGCACCTATATCCTATTAATTCTTGGTCAAATTGTATGGACAATATGTATATAACTGGCAATGAATAAAGGTCTTCTCCTACAGAATATTGAATGCTAGGACCTTGAAGTTATTTAGTGCAAAAACAAAATAATTTGGTATTTCTAGTAAAGCATTGAGCTGCTAGCACAGCATATGCCATGGGTCCTCATGTTTTTGGACTTAATGCATGCTACTGCACCTTAGCAGAAAATGTTGTACAATACAAAAGGTCCAACTTTTGCATTTCAAGCACTGATATCTACTATTACTATGAGTTGCATCTGATGTGCACACTGTTTTCTGATGTGGACAAATATACTCTTGTTCATTTAGCTGTTTTTATACCACACGACTTATATTTATTGGAAATTCTATTTGAACATAAATTGGTGACACAAAAAACGTTTAACACAAATAAGAAATTCAATGGTCAAATTTTGTGTTTTATTTTGTGTTTAAATAGTCGCTCCCTATGTTTATAATCAAGATATTTTTACATCGATAAATGAATAAAAATTGACACGATTTGAAACCTAGCAGACAGTAAATGGGAATCAAGGAAACAACATGCTGATACTGCAAGAGACATGCACGGACTCATCAGGCTCGATGGTGGTGTACGCACCAGTCGACATCCCAGCCATGCACGTCGTGATGAACGGTGGAGATTCAGCATGCGTGGCGCTGCTCCCTTCAGGCTTCTCTATCCTACCAGATGGAGCTGAGCAGCAGGACGTAGGTGGCTCTCTCCTGACCGTCGGATTCCAGATCCTGGTCAACACCTTGCCAACTGCCAAACTGACCGTCGAGTCCGTAGAAACCGTCAGCAGTCTCATATCCTGCACAGTTCAGAAAATCAAGGTCGCTCTGCATGTCGAATGAACGAAGATCAGTTTAAAAAAATTAATGTAGTAGGCAAATATTTACATTGGGTTGAGTCAAGAACGAACCCTGCAAATTGGGGATCAAACCCATTGCTAATTGATAAGCAATCACAACATCATCATCATCATCATTGTAGTGTTGCTTAACAAGGAGCAATGGTGGTGGTTCGGGTATTGACTCGAGTTTCTTTTCATTTCTTCTTTTTTTTTTTCTTTCCCTTAGCATTGCTGTTGTTGTATTCTCCGTACTTTTGGATGGTGTCGGTTAACATTTTACATTATGAATAATGTCGTTTTAATGTGTTTATCATGGGTTTGCGCTTCACTCTATGCATGTAAACCATTTTGTCAAGTAGTTATTCGGTGTTACTCAGGAAACGTGGGAAACGACTAAGTTGGTTCCAAATATCTGAAATACATTGAATGGCTAACAGTTTGTAACAGCTGGGGTTAGTGTACCGAAGCTATCTGTATGTTTTTAAGGCCATATAATGTTGTGGTTGGGACCCTTGAATACAGTTACAAAGTTTGTCCCACTCTTAGGACTTGGTCTGTATACTGTTTGAGTTTTAG

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020262629.1	2.5e-289	homeobox-leucine zipper protein ROC5-like
Swissprot	Q6EPF0.1	3.0e-247	Protein RICE OUTERMOST CELL-SPECIFIC 5
trEMBL	A0A5P1F9F4	1.8e-289	Homeobox-leucine zipper protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT3G61150.1	60.55	0.0	911	HD-GL2-1;HDG1	homeodomain GLABROUS 1

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	bit score
AfisC8G05032	AT3G61150.1	768	262	11	2	737	48	806	60.55	911
AfisC8G05032	AT4G00730.1	760	259	12	1	737	59	801	60.66	906
AfisC8G05032	AT4G04890.1	731	300	15	38	734	22	735	51.98	751

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00046.26	Homeobox	Domain	66	121	66.7	1e-18
PF01852.16	START	Domain	265	487	170.6	2.6e-50

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0044183	F	protein binding involved in protein folding
GO:0000976	F	transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0003700	F	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0006457	P	protein folding
GO:0005634	C	nucleus
GO:0005737	C	cytoplasm
GO:0006355	P	regulation of transcription, DNA-templated
GO:0008289	F	lipid binding
GO:0009828	P	plant-type cell wall loosening
GO:0009845	P	seed germination
GO:0009913	P	epidermal cell differentiation
GO:0010091	P	trichome branching
GO:0042335	P	cuticle development
GO:0043481	P	anthocyanin accumulation in tissues in response to UV light
GO:0048497	P	maintenance of floral organ identity
GO:0048765	P	root hair cell differentiation
GO:0048825	P	cotyledon development

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K09338	HD-ZIP; homeobox-leucine zipper protein	EC:-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network