result

Gene information

Detail information of AfisC8G05760

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC8G05760	chr8	1062106927	1062117746	+

Sequences

CDS

>AfisC8G05760
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Protein

Gene

>AfisC8G05760
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	KAF5735876.1	3.0e-53	putative Endoribonuclease/protein kinase IRE1-like
Swissprot	Q7XIT1.1	2.3e-50	Endoribonuclease
trEMBL	A0A7J7CPQ7	2.1e-53	Putative Endoribonuclease/protein kinase IRE1-like

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT2G17520.1	38.49	3e-47	185	ATIRE1-2;AtIRE1A;IRE1-2;IRE1A	Endoribonuclease/protein kinase IRE1-like

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC8G05760	AT2G17520.1	291	157	6	55	326	403	690	38.49	3e-47	185
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AfisC8G05760	AT5G24360.3	268	144	7	72	326	451	716	40.67	1e-41	167

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00069.22	Pkinase	Domain	78	326	112.9	1.5e-32

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0000166	F	nucleotide binding
GO:0005515	F	protein binding
GO:0016021	C	integral component of membrane
GO:0000394	P	RNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation
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GO:0006397	P	mRNA processing
GO:0006987	P	activation of signaling protein activity involved in unfolded protein response
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GO:0007275	P	multicellular organism development
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GO:0018105	P	peptidyl-serine phosphorylation
GO:0019221	P	cytokine-mediated signaling pathway
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GO:0043167	F	ion binding
GO:0043234	C	protein complex
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GO:0071356	P	cellular response to tumor necrosis factor
GO:0080134	P	regulation of response to stress
GO:0090501	P	RNA phosphodiester bond hydrolysis
GO:1902531	P	regulation of intracellular signal transduction

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network