result

Gene information

Detail information of AfisC8G05974

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC8G05974	chr8	1099355483	1099366022	-

Sequences

CDS

>AfisC8G05974
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Protein

Gene

>AfisC8G05974
ATTTGACAAACATTTTGAAATTTCGTCAAAGGAAGGTAATTTCAATGGCAACCTCGTTTCAGTACTCCAATCTCTAGTCTTTAATCTTCCTACGTTACTTTTTTCATGGGCAATTGTTGCCCGATCGGAAAAAGATCCGTGTCGGAGGGTAACGATAACCCGGAGCCTGCAACAACCTCAACATCGGATCCGAAACCTCCTTCTCCGACTTCTCAATCCGCACCCGCTAATGGGGAACCCGCTGCTCCTCCTCCCAAGTCCCCTGCGAAACAGCCTGCTATTGGGCCTGTACTTGGCCGGCCTATGGAAGAAGTCAAATCTTCTTATTCCATTGGTATTGTTCTATATGCATTTTGCTTTCCCATTTTCAAAATTGAGCAGTACTATTCACACAATCGTATACACCGAACGGTACCCGACTTCAGTCGGTATTTTGAGGTTTGGTATTATCTTCATGTATCCGGCACTTGGCTGCCGTTTGAATTGGAGAAATGCAAAGAAAATGGTTAAAGTGGCAACGCAAACTATGTATGTTCCTCACATAAGTCGACAACTTTTTGCCACTGCAATGAAAATCATACACAGACGATTTTGAAATCTGAGTAATTTTTATTGTTGCACTGCTCTCTGAAAATTGTTGGGTGCTTATCACATCATGTCATATGTCAACTCATACAAGAGTATTTGCGTGAAATATGATATCACTTAGCAAATTTGTACATATTATGACATAGGAAAATATTATTATGTCCTGGTTCGTCTTAGAGCATGTCCAGAGTGGAATATTCAATGTCCTAGTTTTGAAAATGTCGGATATAATATGCTCTCTATTAGAGTGACCCCCATCAGCTGAGGGAGAGATCATACATGTTTTTATTCGGCTTTAGAAAAACTGGGTAAAATCGATCAATGTGCATGTAGCTTTGTGAAATAGATGTTACTATGATATGACATAGCAGCTATGCATGTTATGATGTAGGAAATTATATTTATTATGACGTAAAAAATAAAATAAAATATTATAATGTCTTGGTCGGTCTTAGGGTCTGGATGCAATTTTTTACCACTTCAAGATGTCTGGCACGTCGAATGCAAGTAGGTGCAGTTGACACGTTAGACTTCTTAATGGTAATCGCCCTGCTCGCTCAGAGGAGGTATATATGTGCCTCGGCGCTTACGTCGGTCTAATTTGGATGCATCTGTAGATATTTAATGAACTTTTTTCTATTAAAAATTATGTTAGAATCGAGATAAATAATGATATTTCTTTTGTGTTTTTTCAGAAAAATTTAAATATCTATAGTTTGTAAAGGCACGAATTATTTATCAATTGCAAAAATTATTTTTAATTTTTTTTTTCATTTTTTTAAAAGATACAGATTATTTCATAGTATTTTGTATATCGATGTAGCTCAATAATGAACTAGTCCAAAATCAGGTTTAATTTTCAACGTCTTCAACTCCAAGCAAAATCCCCATATTTTTCTTAGCCTTCATGTTTGAGACCAGTAGTGAACATATCTGACGCTTTATCTTTTGATTTAGTATGTTTTGTCTGTAGTAGTCAACCTTACTTTATACCTTTCTACTTCATCTTTTGCAGTTTTCAGTTTGTTAACCCACTTTGCTCTAATAACTTTGTGTTTTTTGATAGGTTAGCCATCTCACATGTGTCATCATTTATTTGATTTACTGACCCGCGTTTCTCTATCTTTTGTGTTTTACTAGTATGTAACCCGTGCCTTGCACACGGTAATATTTGTTATACGTCTAGTATACCAAAACAGAGACTAATCAATAATAAACTCGTCTCATAAGTTTACAAATCAGATTTCCACTACTTTGAAATTCTGTATTAGCTATTTTTAACAATAAATATGTTGTAATTAATTACAACAAACTAACAACTATAGTAATAAAAACTATAACGATAAATCAAACGTTATACTATTTAAAGAAATAGTACAACGTAGAAACGAAAATGATATATATATATAAATATATAAATCAACTAGAAATCTAACCGGTTGAAGAAGGAAATTTCGTCTGAGGCTTGTCGTAACAATTTCCTTAAGATTTTATTCAAAGTCTCCCAAGATACAACAGACGTAAGCTGCTCGAGATCGTGATGTGTATGATCTTCTGTGTGATAGGATTGATTACGATTTTAAGAAATGTAGATAAAGAAGAGATAATTCGGTTTTAAAATTGAGTGAGGAAAGTGATCAGGTTTCCTCCTTATTTTTAGCCGAATTTCCAATGGCTACACCCGTTCAGAAAAGTAGCATTCCTTCATTTGCAACGTCAAAAAGTGTTACTGTTCGCAACAGGCACTTCCTTTCATTTGCAACGCCAAAAACTGTTGCTGTTTGCAATAGCCGCCTCCGTTCGGTTGCAACGGTTCAGAACTGTTGCTGTTTGCAACAGCCGTCCGTTCGTTTGCAACGGTTCAGAACTGTTGCTGTTCGTTTGAACGGTCATCTGAAATCGTGTCTCTTCATCAGTTTGCAACGGTCACAACCGTTGGAAAATCCGTATCTATTTAAACACACTTCTGTTTTAAAATCAGTCTATTTTTTAGGTAGCAAAAATATATGACACAACCCAATCTTATTGGACCCGCACCTGACCCGGCCCGGTTCGGTCGGACGGCGGCGCGCGAATGTTAGTCCATGACCATATAGGTCCTACCTCTCGCACAAAATTACTTGATCCTAAAGGCCAATATAGGATTGAAAGTACACTATATAAACAAGAAAATAGACTTATTTTTGACGATGTGGGATATATCTCATTCACTATTTTTGAAAATTCTAACAATATTTAACAATATAATATTTATATGTGGTATCATAGCTCAGTTGGTCAGTAATTGTAGAATATACTCTTGAATTTGTTATGTGGTATCAAATTAGTGGAGAATTAAGAAGGGTTGTAAGTAATTGAGAAAATTTAAAATGTAAGGGTTTGAAGTTAGTAGAATTCTATAGTGTAATGTATGGAAAATAATTTAGGTAAATAATTATAAAATAAATAGTTGATGTATATATTTTATTTTATGTGATTTATATATATTTGTATGTAAATGAAAAAAAATGAATTTACCCATTTGTTGATGTGCCTATGCTATACACATTGAAATGATATCTTTTAGGACTTATTTGATGTATCAATGAACATTAGTTGAGTGAGTTTATCAATTAGTTTAAAGTTTGGATTATGAAAATAGTTTAAATGCATGGACTTTAATGTAAAATATTGGAAAAGAATTGAGAAAAGATTCATAAACGACTGGTTATTTTTAAAAAGCAGGTGTTTGAATGTAAAATAGTAGGAGAAGTTTCGTAGATAATTGTCAAGTGATAAATAATAGGATTTTGAAAATAAAATATCTCGACTTGGAGAGAATTAAGGAGAATGGAGAAAACTCCTTGGAATTAATAAAAAAGCTTTAAATTCTTATGTTTTACTATTATCTAATAAATTGCTTCTTCAAACCTGCTTGTCCACAATTTGATGCTTACTAAAGTAACATCATCAGAAATTAGTTTTACCTCATGTAATGCTTAGAAGGATTTCATATGTGACATCTTTTAATTTGAACTTACTTAACCTGGAGATTTTTGCCCATAAATGGTTGATTTGGTGGACCGTATTGGACTGTTCTTGCCCATCAATGTCTTCTTCTTTTCAATCAAGAGAAGAGTAAAATTAGTTTCTTTGTATTTACTCCTCAAATGCATTCTTCATCAAATTCTTTTTTACTAACAACTATGTTTTTATTGATAGGATTATATTCTTTTTATTTTGAGTCTTAACCATTGAAAACCTTTTTCTTCTTCTTTCACTTTTATGATGTAATTTGAAGTGTCCTTGGTAGCGAACATATGTTTTGAAAATACTTTGGAATGCACTTGAAGCAATCCCATATGATGACCAAGGATCATGATTTCAAGATCTTATTATTTGTCCATCGATACAAGATTTATTCAAACATTGAGTCCAAAGATCATAAACAATTTCAACTAAACTAGCATCATCTAAGCCTTGGTAGATGAAATTGAGAGTCTTTCATCCTTTTCCTTGAAGTCTTTTTTTGTATATAGAAATGATAAGATACATGCCTTGACCGGTCACAATTATGGCAATTTGTAGCCATACATACATACACACACACAAACACACACACACACACACACACACAAACAAATGTATATCAAATAAAGGCACAATCGATTTTTGTTTCTGTAGGAGGACTTTTTTACCATTTTATAAAGATTGCAAAGTAAAATATACGGTGAACAAGGTAATAATGAGCCAAACGAAATAAAATAAGGTAAAATACCTTGGATGAATAATACCAGAAACCAAAGAGGTATAAAAAGATATAATGAGCCAAACAAAATAAAATATAGACAAACTAATGGCATTTTGTCTGACAAGAAAATAATAGAGAAATGAAAGAAAAATTCATCGAACAGTTTTCATACCAACTATAATATAAAGAGCGGAATTTTGATTTCTTTTTATCAAGTAAGATTACCATAGAGGAAATGAAATATAAAGGGTTGACTGTAGTTACTAAAAATGATATTCAAATAAAAGAATGTGAGAGAAAGTAAAAATGGCACCTACAAATAAGAAAATTAAAGAAGGTAGATTTATATGGTATGGACACATATAATAAATAAAACAACACCTATAAGGAGAGAAAATAACATATACATAGAAAGAAAAACTTAAATTAACTTGGAAGAAATAGTATAAATGATGGAAATTTATGAAAAAGAGAGATCTCGTGGGGCGTGGCCAACCCCAACCATTTAAGAAAAAGACAAGTAAGACAATAACGATGATTTATTTATAGCATAGCTAAGCATTACATCTTTACTAGCCAAAGGTAGTGCCCAAACCAAAAAAAAAAAAAAAAATAGAAAAAAATAAAAAAAAGAAGAAAAGAAAAAGAAGAAGCATAACTCATAGGCATAGGTGCACGTCAA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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020254698.1	1.7e-207	calcium-dependent protein kinase 14
Swissprot	Q9FMP5.1	6.0e-202	Calcium-dependent protein kinase 17
trEMBL	A0A5P1FLD2	1.2e-207	Calcium-dependent protein kinase 34

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT5G12180.1	80.61	0.0	885	CPK17	calcium-dependent protein kinase 17

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	bit score
AfisC8G05974	AT5G12180.1	526	101	1	1	526	1	525	80.61	885
AfisC8G05974	AT5G19360.1	526	100	2	1	526	1	520	79.85	868
AfisC8G05974	AT4G23650.1	465	133	0	60	524	64	528	71.40	711

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00069.22	Pkinase	Domain	74	332	256.0	3.3e-76
PF13499.3	EF-hand_7	Domain	380	440	47.8	1.3e-12
PF13499.3	EF-hand_7	Domain	449	512	45.0	9.4e-12

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0005509	F	calcium ion binding
GO:0005773	C	vacuole
GO:0005829	C	cytosol
GO:0004683	F	calmodulin-dependent protein kinase activity
GO:0004713	F	protein tyrosine kinase activity
GO:0005778	C	peroxisomal membrane
GO:0035556	P	intracellular signal transduction
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GO:0005524	F	ATP binding
GO:0005634	C	nucleus
GO:0009506	C	plasmodesma
GO:0009507	C	chloroplast
GO:0009651	P	response to salt stress
GO:0009738	P	abscisic acid-activated signaling pathway
GO:0009931	F	calcium-dependent protein serine/threonine kinase activity
GO:0010119	P	regulation of stomatal movement
GO:0010359	P	regulation of anion channel activity
GO:0018105	P	peptidyl-serine phosphorylation
GO:0019903	F	protein phosphatase binding
GO:0046777	P	protein autophosphorylation
GO:0080092	P	regulation of pollen tube growth

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K13412	CPK; calcium-dependent protein kinase	EC:2.7.11.1	Plant-pathogen interaction	ko04626

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network