result

Gene information

Detail information of Asa1G01024

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
Asa1G01024	chr1	270828790	270832248	-

Sequences

CDS

>Asa1G01024.1
ATGGCTCTTTACCCACTTTTGATCATTCTATATTTTCTTCCATTTTCTTTTCAAGCAAATTTCACTTTTGATTCACAATTTAGCTTTCTATCAATCATGAAACGGTCTCTAACAAGCCCATTCATGTCTAGATGGGATTTCTCATCAGTTGGTAATAATTCTTATTGTACTTTCTCAGGCATCACATGCGATGATTTAGGACATGTTTTAGCGATTGACATTTCTTCCTGGTCTCTAACCGGGAGTATGCCACCAAATATTTGTTCTTCAATTCCAATGCTTCACACTCTAAGGCTAGGCAATAATAACTTAGGTGGCGGGTTTCCTCTTAATCTTATTAACTGTTCATTTCTCGAAGAACTTAACTTGAGTCATAATAATTTTGAAGGTCATGTACCTGATCTTTCAGTTCTTCGCTCTCTTCGTGTGCTTGATCTTTCAAACAATTTCTTCTCTGGGAGTTTTCCTATGTCTATCATTAATCTTACAAACCTCGAGTTCATTAACTTCAATATGAATCCAGGCTTTGAAGTCTGGCGACTGCCTCAATCAATTACCAGACTGACAAAATTACAAGTTTTAATTTTATCTACGAGCTCCATGAGAGGAGAAATTCCAGAATGGATAGGGAACATGACATCACTTACCGACCTTGAAGTTTGCGGAAACTTCTTGTCTGGTCAGATTCCTGCTTCTATTGGTAAGCTAGAAAACCTACGTTTTTTAGAAATTTACTACAACCTTTTAGTCGGTGAAATTCCTGAAGAGATTGGAAACTTAACTAAGTTGGTAGAATTTGATTGCTCCGTTAATCAGTTAACTGGTAGAATATCTGAGAAAATTTGTGCCTTGCCTAATCTCAAAGTGTTACAATTCTATAGCAACGGTATTACTGGTAGCATTCCTCCTGTCCTTGGAAACTCCACAACTTTAACAATATTATCAATATATCGAAATTTTCTTTCTGGCCCAGTTCCTGAAACTCTTGGAAAATTCTCTGATCTTGTTGTTTTGGAACTTGCTGAGAATCAGTTCACCGGTGAATTGCCTCCGCATGTTTGTACAAAAGGTAAGCTTTTGTATATACTTGTATTGGGCAATAGATTTTCTGGCAAAATACCTGAAGCTTATGCAACCTGCCACACACTTATTCGTTTCAGAGTAAATAACAATCAATTAAGTGGTCCAATCCCAAGTTCACTTTTTGGGCTACCTCATGCTTCAATCATTGATTTAGGGTACAATCAGTTCGAAGGGGAGATCACAAACGACATTGGAAATGCAAAGAATTTAACAGCTCTATTTTTGCAGAACAATAGGCTCTCTGGAACTTTGCCCAACAGATTATCTCAAGTTAATAGCTTGGTGAAAATTGATATAAGCTACAACTTTTTAACTGGTCCCATTCCTTTTGATATTGGCAGTTTGACTAATCTCAATCAGTTATCCCTGCAAGGAAATAGATTAAGTTCCTCTATTCCTCAATCTCTGTCTTCTTTAAGGTATCTTAATGTTCTAAACCTATCTAATAACCTTTTGATTGGCGAAATTCCTGAAAGCCTTTGTAGTTTATTGCCAAATTCACTAGACTTTTCTAATAACCAACTTTCGGGACCAGTTCCTCTCCCAATAATTAGAGAAGGATTATTAGACAGTGTTTCAGGCAACTTAAATTTATGCCTACCAGTTCGTATAAATCTAAGCAATCCAGTTATACAAATATGCCCTCAACCTAATGTGAAAAGAAGATTCAACCATATCTGGGTCTTTGCAGTTTCAACACTGGTAGCAATATTAGTGATCCTCTTACTAGCTAAGCATTATTGTGGTCGAAAAATAGAAGCGACAGAGCAAGATAGGTTATCCTATTCTTCTTCTTTTGATGTCACTAGTTTTCACAAGTTGATCATCGATCAGCATGAAATAGTTGAATCTTTGATAGATAAAAATATAGTTGGACATGGAGGATCTGGAACCGTGTACAAAATTGAGCTAAGCAATGGTGAATTAGTTGCTGTAAAAAAATTATGGAGTCAGAGAACAACTAAGGATCAGTCAACAATGTCATTATATATGAGCAGAGAATTAAGGTCTGAGGTGGAAACATTAGGAAGCATTCGACATAAAAACATAGTGAAGTTATATTGCTGTTTCTCAAGTTCCGATAGCAACCTTCTTGTGTATGAGTACATGCCTAATGGAAATTTATGGGATGCCCTCCATAAAGGTGTCGGGTGGAGTTTTTTAGATTGGCCGACAAGGCATAGAATTGCAGTAGGAATAGCTCAAGGAATAGCATATTTGCATCATGATCTATTGTTTCCTATTGTTCATAGAGATATCAAGACTTCTAATATTCTTCTTGATGCTGAGTTTGAGCCAAAAGTAGCTGATTTTGGCATTGCCAAAGTGCTGCAAGCTGGAGGAGATGTGGAGTCTTCTACTACAGTTATTGCTGGAACCTATGGTTATTTAGCCCCTGAGTATGCTTACTCCGCAAAAGCTAGCACAAAATGTGATGTATACAGCTTTGGAGTAGTATTAATGGAACTGATCACGGGCAAGAAGCCAAATGAACCTGAATTTGGAGAAAACAAAGACATTACTAATTGGGTTTCAACAAAGACGGCATCTGAAGAATGTGCATCTGAAATTCTAGACAAGAGATTACAATGGAGTTCATTTAAAAAAGAAATGATACAGGCACTAAAAATTGCTCTTAGGTGCACTTCTACCTTGGCTGCAAATCGTCCCTGTATGAATGAAGTTGTTCAGATGCTAATTGAAGGAGGTCCTACGAATTTTGGAGGGTCTTCATTTAAGCTTAAGGAATCATCACTTTCTGTTAAAGCTAGCTAA

Protein

Gene

>Asa1G01024.1
ATGGCTCTTTACCCACTTTTGATCATTCTatattttcttccattttcttttcaagcaaatttcacttttgatTCACAATTTAGCTTTCTATCAATCATGAAACGGTCTCTAACAAGCCCATTCATGTCTAGATGGGATTTCTCATCAGTTGGTAATAATTCTTATTGTACTTTCTCAGGCATCACATGCGATGATTTAGGACATGTTTTAGCGATTGACATTTCTTCCTGGTCTCTAACCGGGAGTATGCCACCAAATATTTGTTCTTCAATTCCAATGCTTCACACTCTAAGGCTAGGCAATAATAACTTAGGTGGCGGGTTTCCTCTTAATCTTATTAACTGTTCATTTCTCGAAGAACTTAACTTGAGTCATAATAATTTTGAAGGTCATGTACCTGATCTTTCAGTTCTTCGCTCTCTTCGTGTGCTTGATCTTTCAAACAATTTCTTCTCTGGGAGTTTTCCTATGTCTATCATTAATCTTACAAACCTCGAGTTCATTAACTTCAATATGAATCCAGGCTTTGAAGTCTGGCGACTGCCTCAATCAATTACCAGACTGACAAAATTACAAGTTTTAATTTTATCTACGAGCTCCATGAGAGGAGAAATTCCAGAATGGATAGGGAACATGACATCACTTACCGACCTTGAAGTTTGCGGAAACTTCTTGTCTGGTCAGATTCCTGCTTCTATTGGTAAGCTAGAAAACCTACGTTTTTTAGAAATTTACTACAACCTTTTAGTCGGTGAAATTCCTGAAGAGATTGGAAACTTAACTAAGTTGGTAGAATTTGATTGCTCCGTTAATCAGTTAACTGGTAGAATATCTGAGAAAATTTGTGCCTTGCCTAATCTCAAAGTGTTACAATTCTATAGCAACGGTATTACTGGTAGCATTCCTCCTGTCCTTGGAAACTCCACAACTTTAACAATATTATCAATATATCGAAATTTTCTTTCTGGCCCAGTTCCTGAAACTCTTGGAAAATTCTCTGATCTTGTTGTTTTGGAACTTGCTGAGAATCAGTTCACCGGTGAATTGCCTCCGCATGTTTGTACAAAAGGTAAGCTTTTGTATATACTTGTATTGGGCAATAGATTTTCTGGCAAAATACCTGAAGCTTATGCAACCTGCCACACACTTATTCGTTTCAGAGTAAATAACAATCAATTAAGTGGTCCAATCCCAAGTTCACTTTTTGGGCTACCTCATGCTTCAATCATTGATTTAGGGTACAATCAGTTCGAAGGGGAGATCACAAACGACATTGGAAATGCAAAGAATTTAACAGCTCTATTTTTGCAGAACAATAGGCTCTCTGGAACTTTGCCCAACAGATTATCTCAAGTTAATAGCTTGGTGAAAATTGATATAAGCTACAACTTTTTAACTGGTCCCATTCCTTTTGATATTGGCAGTTTGACTAATCTCAATCAGTTATCCCTGCAAGGAAATAGATTAAGTTCCTCTATTCCTCAATCTCTGTCTTCTTTAAGGTATCTTAATGTTCTAAACCTATCTAATAACCTTTTGATTGGCGAAATTCCTGAAAGCCTTTGTAGTTTATTGCCAAATTCACTAGACTTTTCTAATAACCAACTTTCGGGACCAGTTCCTCTCCCAATAATTAGAGAAGGATTATTAGACAGTGTTTCAGGCAACTTAAATTTATGCCTACCAGTTCGTATAAATCTAAGCAATCCAGTTATACAAATATGCCCTCAACCTAATGTGAAAAGAAGATTCAACCATATCTGGGTCTTTGCAGTTTCAACACTGGTAGCAATATTAGTGATCCTCTTACTAGCTAAGCATTATTGTGGTCGAAAAATAGAAGCGACAGAGCAAGATAGGTTATCCTATTCTTCTTCTTTTGATGTCACTAGTTTTCACAAGTTGATCATCGATCAGCATGAAATAGTTGAATCTTTGAtagataaaaatatagttggacatGGAGGATCTGGAACCGTGTACAAAATTGAGCTAAGCAATGGTGAATTAGTTGCTGTAAAAAAATTATGGAGTCAGAGAACAACTAAGGATCAGTCAACAATGTCATTATATATGAGCAGAGAATTAAGGTCTGAGGTGGAAACATTAGGAAGCATTCGACATAAAAACATAGTGAAGTTATATTGCTGTTTCTCAAGTTCCGATAGCAACCTTCTTGTGTATGAGTACATGCCTAATGGAAATTTATGGGATGCCCTCCATAAAGGTGTCGGGTGGAGTTTTTTAGATTGGCCGACAAGGCATAGAATTGCAGTAGGAATAGCTCAAGGAATAGCATATTTGCATCATGATCTATTGTTTCCTATTGTTCATAGAGATATCAAGACTTCTAATATTCTTCTTGATGCTGAGTTTGAGCCAAAAGTAGCTGATTTTGGCATTGCCAAAGTGCTGCAAGCTGGAGGAGATGTGGAGTCTTCTACTACAGTTATTGCTGGAACCTATGGTTATTTAGCCCCTGGTAATTTTCAATTATTACAGTTCCTTTTACtaacatcattttttttattttacttgtgTTAATTACTGTGTTTGAACATGTTTAAGTTTGTGGTTACATCCCTTCTTCCCCGGTGAAAACacactttttttgttgttgttgctgccagTACTCAACAAGTGGAAATATAAACACTGCATTCAACCAACTATTGCTGATCGTAATGAGTAAATTGCAGTAGGGGTAAACTGGGGTAATTTTATGTTGAGTTAGTTACAAAAGCAAGCTTCCTTAGAGGAAGTCCTAAAGAAATAAGCTTAGGCCGAAACATGTTATACCCtcgtgcgcgcgcgcgcgcacacacacacgtgcacacacatgcatatacattCACGTGTACTTTTTTTCAATTTGTGTATTCCATGAATATGCATGTAGAGTcccaaatttacttttcaaaacgtGCACTTGTATTTACCTTTCCAAACCCAAAATGATGCGTATATTTTTAGTAAGTTTCGATCAAGGTCTGTTTCTGTATAAATAGAAATGTTTCTTGTCTATTTACCATGCGATAGATTTTTCATAACTTTGCTATTTCATGGTCATTGTTTACTGCAGAGTATGCTTACTCCGCAAAAGCTAGCACAAAATGTGATGTATACAGCTTTGGAGTAGTATTAATGGAACTGATCACGGGCAAGAAGCCAAATGAACCTGAATTTGGAGAAAACAAAGACATTACTAATTGGGTTTCAACAAAGACGGCATCTGAAGAATGTGCATCTGAAATTCTAGACAAGAGATTACAATGGAGTTCATTTAAAAAAGAAATGATACAGGCACTAAAAATTGCTCTTAGGTGCACTTCTACCTTGGCTGCAAATCGTCCCTGTATGAATGAAGTTGTTCAGATGCTAATTGAAGGAGGTCCTACGAATTTTGGAGGGTCTTCATTTAAGCTTAAGGAATCATCACTTTCTGTTAAAGCTAGCTAA

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_018683649.1	3.5e-195	PREDICTED: receptor-like protein kinase HSL1
Swissprot	Q9FGL5.1	1.1e-134	Protein XYLEM INTERMIXED WITH PHLOEM 1
trEMBL	A0A804JN68	6.6e-196	Protein kinase domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT5G49660.1	56.26	0.0	1028	XIP1	Leucine-rich repeat transmembrane protein kinase family protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	bit score
Asa1G01024	AT5G49660.1	935	394	9	24	948	29	958	56.26	1028
Asa1G01024	AT1G09970.1	924	489	12	56	950	61	973	42.75	677
Asa1G01024	AT1G09970.2	925	489	13	56	950	61	974	42.70	672

Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g510329.t1
Allium fistulosum	AfisC8G04717
Allium sativum	Asa1G01024.1
Arabidopsis thaliana	AT5G49660.1
Oryza sativa	LOC_Os12g43660.1

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00560.30	LRR_1	Repeat	140	158	10.1	0.91
PF00069.22	Pkinase	Domain	649	925	162.5	1.1e-47

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005515	F	protein binding
GO:0004672	F	protein kinase activity
GO:0004713	F	protein tyrosine kinase activity
GO:0005524	F	ATP binding
GO:0006468	P	protein phosphorylation

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K00924	E2.7.1.-; kinase	EC:2.7.1.-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network