result

Gene information

Detail information of Asa1G01705

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
Asa1G01705	chr1	456874936	456880050	-

Sequences

CDS

Protein

Gene

>Asa1G01705.1
ATGGAAGTGTTTAAGATTCTCTATCTTATATCAGCCCTCTCATGTTTAAATTCAGTTGTTTGGAGCAAAACAAATCCAAGTGATTTTGCCATCATACAAGAATTCATTAAAGGATTGGAAAACCCAGAAGTTCTTAAATGGCCATATAATAGTAGCAACGATCCATGCGGTGAAAGTGATCGGTGGCCTTTAATCTTTTGCAGTGGTGATCGTATTAGCCAAATTCAAACCAAAGGTCTATTTTTGCGTGGCACTCTTCCTAAAGATTTCAATAAGCTTACTGAGCTTTCTAACATTGGACTACAGAACAATTACCTCTCAGGTAGTCTGCCATCTTTTTCAGGTTTATCAAAGCTTGAGTATGCTTATTTGGGTAACAATATGTTTGATACAATACCCTCCGATTTCTTTAGCGGGCTTACAAGTTTACGTGCAATAGCTTTACAAAATAATACATTATTGAATGCCACCAATGGTTGGATGTTACCTTCAGATTTGAAGAATTCAGCCCAACTAGTCAATTTGACTCTATACATGTGCAATCTTGTTGGCCCTTTGCCTGATTTTATCGGAAGTTTTGACTCTTTGATGACACTTGATGTATCATATAATAAACTTTCCGGACCAGTCCCAAAAAGTTTTTCAGGATCTCCCCTTCAAATATTGAATCTTAACAATCAGAATGGCCCTGGGATAAGTGGCTCGATCGACTTTGTTGGTTCCATGACTCAATTAACTCAACTATGGCTTCATGGGAATTCGTTTACTGGTCCTATACCTAGTGCTATTGGCTCTTGCGCTTTCTTGACAAAAGTTTCGCTTAACAATAATAGGCTTGTTGGACTCATACCAAGCAATTTGACTTCATTACCCAAGCTTGAATCATTAATTTTGGATAATAACTTGCTAATGGGTCCAATACCAAATACGAAAATTTCAAAGTTCTCATTTGCAAACAATCGATTTTGCCAATCAGTTCCTGGTATGCCTTGCTCACCTCAAGTTTCTGCTTTACTCTATTTTCTTCAAAGCATCAATTACCCAGAGTTTCTTGTGAATTCTTGGACTACAAATGACCCTTGTCACTGGCGTGGTATATCTTGCATAAGTAACAATGTTACCCGTATTCTTCTTTCAAATTTGAGATTGAATGGTACCATTAGCCCTTCACTTGGACAATTACATTCCTTAACCGAGATACAACTTGGTGATAACAATTTAGTTGGTACAATTCCTAATGAGCTATCAACATTGCCCTCGTTGCAACTCTTGAACGTGTCTAATGATGATCTAGGACCACCTCTGCCAAAGTTTAGAACTAATGTAAAACTTTTGTACGATAGAAATCCAAAACTTGACCCAAATGCTCCTCCAAAATCACCAACTGCTGGAGACAGCAATGCACCAAGCAAGTCCAAAGTCGTTAAGATAATCGTTCCAATACTGATATGTCTCATATTACTTGTTTTGGCTATTATTCTATACGTATGTTATCGCAAAAGGAAAAATAAGGGAACCTATCCATCATTAGGTTCGGTTGTCGTTCAAGACGAAGATAGGCTCAAAATTGTCGTGGCAAACAATAGCAATAACAGTGTTGCATCAAGCGATCTACCACCTAGTTATTCTAAAGGTCCAACTGAAAAACATTTGATCGAAACTCGTAATATTGTAATATCGGTACAAATTTTAAGAGAAGTGACACATAATTTCTCTAAAGAGCAAGAACTTGGGCGTGGGGGGTTTGGAGTAGTTTATAAAGGAGAGTTACATGATGGAACAATGATAGCAGTCAAAAGAATGGAGTCTGGTGTGCTTAGCTCTAAAGGGTTTGACGAGTTCCAAGCGGAAATTATGGTTTTGTCCAAGGTCAGGCATCGTAATTTGGTTTCATTGTTAGGGTTTTCTGTAGAAGGCAATGAGAAGCTTTTGGTTTACGAGTACATGCCAAAAGGTGCTTTGAGTAGACATTTGTTCCATTGGAAACAGTTCGGTTTGGATCCTTTATCGTGGAAGAGAAGATTGATTATATCATTGGATGTCGCTCGAGCTATGGAATATCTACATAGCTTGGCCAATCAATCTTTCATTCATAGGGATTTGAAATCGGCTAATATACTTCTTGATGATAATTATAGAGCTAAAGTGGCGGATTTTGGACTCGTTAAACTTGCACCTGATGGGAAGTTCTCCGTTGCTACCAGACTTGCTGGGACTTTTGGTTATCTTGCTCCTGAATATGCTGGTATGCTGTATTTCCGTGATAGCTTTACCTTATGCTATATATCTGTATTTTTCTACCCTTCTTTTCCATTTGTCGTTTAAATACTACACATGTTTCTGTCATGTTACCTTTGCGGAATATACAAGTCTCACGAATAAGGTGTAAATATTTATAACTAAGAGCAGTCTCATTAATATGGATCTATGGCACCAAATGGATGTCATCACGCAGATTGCAATCATACCCATGCATTTCTTAGCCGGTGCTTAAATTTTTGGATAAGAAGGTAGTTTAATTTTAACTATGTTGGACAGTGAtgtttataatataagaaaaacaCTCTCGGTAAGTTTTAAAATGCAAAGCCATTCCATTTCAAAAAATAAGTTAGAGCACAAAATAAAAAACTTATTTATTAGTTTCACTGTATTTATGAAAAAACTCTGCAATTGTTTGCAGACTGCAAACATTCAAAGTTTCTGCATTGTAAATATTTGTGATTTTTCCAAAAAGGTTGAAATAGTCTGCTTTGATCCCATAAATATGGGATTACTGTACAAATTTAATTTAAggcaaagaatttttttttttcttttttccaccGAAATTGAAAATATGAGTGCAATTTAGAGTGTTTCTAGGAAGGGTTTTCATGTATTAATTTTGAAACTAAAGGCCGGACCCAAATTTCCACTATAGTACATATACTATGCAGTGGCGGTGTGTTAGCTCTTGGACCTGCCCTAAAGCCTTTTGTTGAAAGAACCTGACGTCTCATATTTTTGTACTTcactagtttgaaaatttaaagggTAAATTTGGTTATAGACCCCAAAAAAAGCATCTTTCAGCTTTGGGTCCAGCCAAAACTTATTACAGAAATAGGCATATTTTTCACTATGTCAGGATTTCGAATTGCACAATTTAAAATTGTGCAAGTACAGAAGTCTCAATTACACATGTACATTTTGAAAttgcacaagtgtaatttattgaaaaagaatattgTGCTTGTAAAATCTCGGCAgtgtattttttttggaaaaaaaataaattgTGCTTGCCAAATTCAAATTGCGCAAGTATAAATGATGTGATAGGAAACACGAGGTATGTTTTTGTAAAATATTTAGGACGAAGCCCTAAGTttaaatagttttttattttttgcgGGTGTATGAGGCTATGAGCAAAATTATGTAGGGAATGCCAACCTTACCGTAGCTTTACATACGGCTTTATGCTTATAGCAACTGGAAAGGAGGCAACTGCTCCACATCCCTAGAATATCAAAGCGAATTGTACGACACGTTAAGTGTTATAACAAATACATGATTACCAGTTTGTCAATGGTGGGTCCACTAAAGCCTTGAGGCGTTGTTTCATAAATGGGAAGAAActtaggtggtgtttggtttattttttgttttgtattttgagttttcaacattagctACAAAAAATGGATATAGTAAATGGACGAAAGAGGGTATGAAGGAGATGACGGAGAGGTTGGAGGGACGACGGAAGGGTGAATTGTGTCTCGTCCATCCATTATTTCCCAAAACATGGAAAATAagaaaaattgtttttcattttatatgttaaattcgttttctaaaacgGTAATTTTTCACGGTTTATATACGTCGTTTGCAATTTTGTTACGGTGAAAACGGAAAAGTAGAAAGGGTGAACCGAATGCACTCTTAAATAATGACAGTGGTCGGGTGTGTGTTCgcatgtgtgtctatatatatatatatatatatatatatatgtgaattgattcCCATCtactttttgaatttttgaaaataccCTAGATCCATTGAGTTAATGTTACAACCTGTTTGCGTTCTCCATTACCATCCTTTTCTCGACCACCCATTAATTGAATTTCGCTATAACTTTATAATCTACATCACCAACAAAATTGTTTGAAGTGTGTGACAATCAAAATCTTTGCATACATCCGTGACCCGTCCTTTAATTTTATCGACTAAAAAAGAAATATCTCTGGCTATTACATATACATACGTGCTGTACTAGTATAACAGTAGTAGCTCAATGAAGCAAATGGTACTTCAGTGGAAATAACGTCTCATTTTTAATAGAAGCACAAACTtagttaatttcatttatttatcactCTTTATACTATGGGcgatatgattattatttttcaacAACTAGGAGCACTTTATACACCAGGGGCGATCCAAATCGTTAGGCAATACTAGTTTatggtatatttttattgttttttaaatgAAATAGGGATAAATCAAGAGCGAAGGTTATGCTTTCACTTTGATCATAGATTTTCATACACCAAAACAGCTTAAAAACATAAATCGTTATTATGAAACGGAGCATAGATGTTTTAACATACTGAAATGCTCATTTGATAATCTGTACTGAATACTCCCAGAATGCAGcctgtgagattttttttttttttatttttttattttttttttattttaagtaccATTGGAATATGCAATTTACtttgtaattcaatttgaaatttgaactttatgACCAACGCTTAAAGTTCCTTCTGAAAACCTTGTCTAGAGGcatcattttttctattttaaaagctatgtatgtattcatatttattggCCACTTTCTCTTTTCCATCGGAACCAGTGACTGGAAAGGTAACAACAAAAGTGGATGTCTTCAGTTTTGGAGTAGTTCTAATGGAACTGTTAACTGGCATGACCGCACTGGACGAGACCCGATCCGAAGAAACCAGGCACCTCGCCTCATGGTTCTACACGGTAAAGTCCAACAAAGACAAACTCAGAAACTACATTGACAACTCACTTGACATATCAGAGGAAACCACATTCGAAGAGATGTGCATTGTCGCCTGA

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020260416.1	2.0e-247	receptor-like kinase TMK3
Swissprot	Q9FYK0.1	1.1e-138	Transmembrane kinase 2
trEMBL	A0A5P1F0T4	1.4e-247	Protein kinase domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT2G01820.1	46.94	0.0	685		Leucine-rich repeat protein kinase family protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	bit score
Asa1G01705	AT2G01820.1	818	389	15	28	815	29	831	46.94	685
Asa1G01705	AT1G66150.1	822	394	16	28	815	28	833	45.99	667
Asa1G01705	AT1G24650.1	815	400	18	13	815	9	791	45.52	646

Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g231446.t1; g281542.t1
Allium fistulosum	AfisC8G03536
Allium sativum	Asa1G01705.1
Arabidopsis thaliana
Oryza sativa

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF08263.9	LRRNT_2	Family	27	68	11.8	0.21
PF13855.3	LRR_8	Repeat	95	153	28.4	9e-07
PF08263.9	LRRNT_2	Family	333	368	28.2	1.6e-06
PF07714.14	Pkinase_Tyr	Domain	573	787	151.6	2.1e-44

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0004672	F	protein kinase activity
GO:0004713	F	protein tyrosine kinase activity
GO:0005524	F	ATP binding
GO:0006468	P	protein phosphorylation

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K00924	E2.7.1.-; kinase	EC:2.7.1.-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network