result

Gene information

Detail information of Asa2G06950

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
Asa2G06950	chr2	1889255620	1889260013	-

Sequences

CDS

>Asa2G06950.1
ATGTATGAAGCACTTAATAATCCTGCTCAATTAATGGGGTGGAATTTTGTTGATGGTGACCCCTGCGGTGGTCCTCGGATTTGGGAGGGAGTTGCTTGCTCAAATCAGTCTGTGATCTCTATGGATTTGAGCTACAATAATATAGGTGGTGAAATACCTCATGATTTGCCACCTAATGCTACCTACATGTATGTGTTTTCCTACATTTTAATGCTTTGTTTTGGCTACAGCCTTGCTTACCCATTGCCGTCTGTTAAGGCTCTCATTTACTTGAACGTAAGTCACAATGGACTTTCTGGTCCTATAGGCGATGTGTTTGCTGATATGCCAAACTTAGATAAACTGGATTTGTCATTTAACCACTTAACTGGTGATCTACCTAGTTCTTTTGCTGCTCTAACGAACCTTCATGCTCTATTTCTCCAGAACAACCATTTCAGTGGTTATGTCCCTAAACATTTCAAGTTCATTCCAACCTTGAGAATTGAAGGTAATCAGTTTGAGCCTGGATTTGATGTTCCATCTCCAGTTGTGAATGGAAACACAGGATCTCCAAAAGATGCAAAATCCCGAAGTATTCCTGAATCAAAACTAAAACCTCTAAAAAACTCCAATTATCGTGAAACGCATTCACACCTTGGAGCAACTGCGGGGATCATTTGTGGTGTTCTACTACTGGCTCTGTTGGTTTCTATTGTTTTGGTACTGCTTTACAGACCACGCATAGCAAACACGAAGAAGTCAAAGATACCAAGAGAATCCTTTTTTGATCTTCCGGTCACTACGCCCAAAGTGTCTGCAATCAGTAAGGAACAAATCAACTCGCTTTCTCCTCCTATTCCATTGATCGTAACTCCACCTACTATGGAAGGAAGAATATCTAGAAGGAAAAGTTGTTCGCGGAGAAGTATAAACTTGGAACATGCAAAGGTTTTTTCTCCTCCTGACCTTCTTAAGGCCACACACAATTATAGCCCTGATAGTATTATTGGCAAGGGTCCAAATGGCTATGTCTACATATCTCACTTTCCTGATGGTCAGATGTTTGCACTCAAGAAGTTTAAAATGGTTGCAAGTGACGTTGCCAAGGATGAATTTCTAAAATGCGTTCATAACATGATGCGGCTGAGGCATCCAAATATTAACGTCGTCATAGGCTATTCTGTTGATCGAGAAGAGCATGTTCTTGTTTACGAGTATGCAAAAAATTGGTCGCTTAGTGATGCTCTCCATTCCTCTTCTGATGAACTTTGCAAAATTCTTTCCTGGAAAGTCAGGCTTAGGATTGCTCTTGGTGTAGGTTATGCTTTAGAATATATGCACTGTATTTGTTCTCCTCGCTTGGCACATGGAAATTTGAAGGCAACCAACGTTTTGCTTGATCACGAACTAGTGCCTCGGCTCACTGACTGTGGATTCTACTCACTAAAGCATCTGATTAAATCAGATACAAAGGTTCCAGACTTTGATGTAGACTCTAGCGGACATGCTGCACCTGAATTTGACAATCCAGCAGCTGATATGGCTAAGTGTGACGTGTATAGCTTTGGAATTTTATTACTGGAGCTATTAACTGGAAGAAAACCATTTGACAGATCAAAGAACAAAGAGGAGCGATTATTAGTAAGATGGGCATATCCCCACCTCCACGACATAGAATCTTTAGAAGCGATGGTTGATCCAGAAATCAAAGGAACTATATCTTCAAAAGCCCTCTCTCAATACGCCGATATCATCTTATCATGCATTCAGGTTGAGGCAGGATTCAGACCGATAATAAGTGCTGTAACTGGAAATTTGCTAGATGTAGTGCAGAAGCTGTCTAGGCCTCATCAACATAGCAATAGGAAGCAAAGAAGATCATCAGTCGATGACTTTGTTTCTGAACTAAACGCAACGTCTGAGATTTCATTCAAGTCAACCCTACCCTACTTTGACACCCCAAACGCTCCTGTATACGATTAA

Protein

Gene

>Asa2G06950.1
ATGTATGAAGCACTTAATAATCCTGCTCAATTAATGGGGTGGAATTTTGTTGATGGTGACCCCTGCGGTGGTCCTCGGATTTGGGAGGGAGTTGCTTGCTCAAATCAGTCTGTGATCTCTATGTGAGTCGTTTATATTCGTGTATTTGCATACATTTCTTGGAACTATTTTGAGAAAATCTGCAGATCATACCCTAAATATCTGTCACATTATGTCCCTATTGTATCAGTGTACTTTGCCTGATTATAGTATTTGTTTATTCAAGTGAAGTACATCCATGAAAATTATACACTGAAAAAGTACTCATACAGAAATTTGTTCAGCTTTTTCAAGAGAAATTTGCCTTAACGGAACTCTTGCAAGAACAAATAGTTGTTCATTAAGCACGTTTAGCGATTCAAAAAATTTGCCATTTTATTTTGAGGATCAACATCCATCTTTTGAGTCATGAATGTTGACAAGTGGATGTTTCTAATTTTGCCGATAAATTCAACAAAATATCTTTcttataaattcaagtgaaatattTAGGCCTTGAAGCAAAATAAGCTTATATGAACTTGTACAACGGTATCAGCatgtatgaattacataatttgATGTAGGTAATGAACCATGATTGTATGATGTAGCTTAtaagttataaaattaaaatagttCCAAATTGCACTAGTGTCATCTGGTTACATAATTATTGCAAGATTTTGTTTGTATGACAGCTACATCAATGGATCGGGATTGAGCGGAAGGCTGAGTCCACAAATATCCAATCTTCTTTCATTGCGCGAGCTGTAAGAATTTATATGATCAAACTGTTTATTGCTATAACTATGATTTTAAACGCTGATGCAAATGCAAACTGTATATGCAGGGATTTGAGCTACAATAATATAGGTGGTGAAATACCTCATGATTTGCCACCTAATGCTACCTACATGTATGTGTTTTCCTACATTTTAATGCTTTGGtaccatttttgttttgtttttctttctttttcatccAACTGAAAAATCTTTCTGTATTATTTACTTTAAGAAATTTGGCTGTCAATAGTTTTGGCTACAGCCTTGCTTACCCATTGCCGTCTGTTAAGGCTCTCATTTACTTGTGAGTTCTCATAGCAAAACTTTTATTTCTCTTAAGAATACAACAGTTGAATAAATGATTTTTCTTGGTAAATTGTCTCTGCAGGAACGTAAGTCACAATGGACTTTCTGGTCCTATAGGCGATGTGTTTGCTGATATGCCAAACTTAGATAAACTGTAAGATAACTATATTTTTTGTTGATATTGTATCAGTTCTATTGCTAAATGATATTAGTCAGTTCAGTAATGATCTGATATGTGGATACACATTTCAGGGATTTGTCATTTAACCACTTAACTGGTGATCTACCTAGTTCTTTTGCTGCTCTAACGAACCTTCATGCTCTGTAAGTTCCAAACTAACAAATATGCATCCACAATATCATATTTTATCTCATGCTCGTTTTAGTTACTGTGATAAAATTTCAGTTATTTGCAGAACAATGATTTAACAGGCTCAATTGGTTTTTTAGCAAATCTTCCACTCAGAAGCCTGTGTGTTTCTCCTCtactgatttttttttcctttttctcattaatcaaTTCACATTACTTGCTATCGTGGGGTGTTCTAAtgcattgttttcatatattttatgctATGTTTGTATGCAGATTTCTCCAGAACAACCATTTCAGTGGTTATGTCCCTAAACATTTCAAGTTCATTCCAACCTTGAGGTGCATTTTCAGAAACCTAACctactcttttattattattattataaaataatgatgCAATTAACCTACTATCTTTTGGTAGTTGACATTAATAATTCATGTTTCCATATCAGAATTGAAGGTAATCAGTTTGAGCCTGGATTTGATGTTCCATCTCCAGTTGTGAATGGAAACACAGGATCTCCAAAAGATGCAAAATCCCGAAGTATTCCTGAATCAAAACTAAAACCTCTAAAAAACTCCAATTATCGTGAAACGCATTCACACCTTGGAGCAACTGCGGGGATCATTTGTGGTGTTCTACTACTGGCTCTGTTGGTTTCTATTGTTTTGGTACTGCTTTACAGACCACGCATAGCAAACACGAAGAAGTCAAAGATACCAAGAGAATCCTTTTTTGATCTTCCGGTCACTACGCCCAAAGGTTAGGTGAAATCTCTGGTCATACATTATTTTCCTTTCACCATTGTTATGTCACACTTGGCATGTCAGGTATACTGTAATAGTAGTAGATGCTACTAAAATATCAAGTTAGTGTAAAATTGCCTTGTCCGGTGTACAGTACTGGCAATTGATGCTAAATGCAAGGACCATGAACAACTTGTTTTGCAGTGTCTGCAATCAGTAAGGAACAAATCAACTCGCTTTCTCCTCCTATTCCATTGATCGTAACTCCACCTACTATGGAAGGAAGAATATCTAGAAGGAAAAGTTGTTCGCGGAGAAGTATAAACTTGGAACATGCAAAGGTTTTTTCTCCTCCTGACCTTCTTAAGGCCACACACAATTATAGCCCTGATAGTATTATTGGCAAGGGTCCAAATGGCTATGTCTACATATCTCACTTTCCTGATGGTCAGGTAAACAGAAAAAATAGTATATTATTACAGAAAAGCCGCATTACAAGGTACAATACACGTGGCTGATATGCTATTTTTGTGAATTATGAAGATGTTTGCACTCAAGAAGTTTAAAATGGTTGCAAGTGACGTTGCCAAGGATGAATTTCTAAAATGCGTTCATAACATGATGCGGCTGAGGCATCCAAATATTAACGTCGTCATAGGCTATTCTGTTGATCGAGAAGAGCATGTTCTTGTTTACGAGTATGCAAAAAATTGGTCGCTTAGTGATGCTCTCCATTCCTCTTCTGATGAACTTTGCAAAATTCTTTCCTGGAAAGTCAGGCTTAGGATTGCTCTTGGTGTAGGTTATGCTTTAGAGTATGTTTTCTTTCCCACCattatgtatttaatatatatgttgATATTGTTATTTTTTGAAAAGACAAGCAAATGCTATGCTTGGTGTTTTTTTTAGATATATGCACTGTATTTGTTCTCCTCGCTTGGCACATGGAAATTTGAAGGCAACCAACGTTTTGCTTGATCACGAACTAGTGCCTCGGCTCACTGACTGTGGATTCTACTCACTAAAGCATCTGATTAAATCAGATACAAAGGTACATGCTATCACTTCGGATAATGTGTATAGTACTTACACATATAGCTCAATCCAAGTAATGTACTTATTGTACCTACTGCAACTTCAATCTAGGTTCCAGACTTTGATGTAGACTCTAGCGGACATGCTGCACCTGAATTTGACAATCCAGCAGCTGATATGGCTAAGTGTGACGTGTATAGCTTTGGAATTTTATTACTGGAGCTATTAACTGGAAGAAAACCATTTGACAGGTCTGTACTTTACATGcttttttatatatacagtttttcttctttaatttacatggaatgatgTTGGTCATGAATAGAGAGGTAATTTATTACTAGGTTCCAACATATGTAGCTATAACAGTAAGAGTAAAACAGGAGTTAATTATAAAACCTGGTTGGTTTGAAAATGTACTCCTAGAATAGACTTGCTCATAGCTTTGGGTGTATAGTCCTTGCACACTATAGCGTGCAAATACGGTTTCAAACTTGTTTCTGCACATTTTAAATTTTGCAAACATGGAAACTGATCTTTTTCGCAGTAAGTTTAGGAGAAAGCTTAGTCTTGCTGTTGTTATTTCTTTCTCTGTTAATACACGTATCTGTATTTATATGTGTGTGCACGTGCAAATCTACATTTAAGGGAGTCTGTATACCTCTTCTGTGCGCTACATATTATTTCTCAATTTGTGTATTTTTTTGAATGTATTAGATCAAAGAACAAAGAGGAGCGATTATTAGTAAGATGGGCATATCCCCACCTCCACGACATAGAATCTTTAGAAGCGATGGTTGATCCAGAAATCAAAGGAACTATATCTTCAAAAGCCCTCTCTCAATACGCCGATATCATCTTATCATGCATTCAGGTACATAATATGAAATTAATCAACTTAGCAAACAATTACAAAATAAGAAATTCTATTCTGAATTTTTGACTAATGATTGTTGCAACAGGTTGAGGCAGGATTCAGACCGATAATAAGTGCTGTAACTGGAAATTTGCTAGATGTAGTGCAGAAGCTGTCTAGGCCTCATCAACATAGCAATAGGAAGCAAAGAAGATCATCAGTCGATGACTTTGTTTCTGAACTAAACGCAACGTCTGAGATTTCATTCAAGTCAACCCTACCCTACTTTGACACCCCAAACGCTCCTGTATACGATTAA

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020265270.1	1.9e-123	protein STRUBBELIG-RECEPTOR FAMILY 2-like isoform X3
Swissprot	Q9FG24.1	4.1e-91	Leucine-rich repeat receptor kinase-like protein SRF2
trEMBL	A0A8N4F060	2.0e-119	protein STRUBBELIG-RECEPTOR FAMILY 8 isoform X1

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT5G06820.1	37.34	1e-110	397	SRF2	STRUBBELIG-receptor family 2

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
Asa2G06950	AT5G06820.1	699	336	17	1	625	38	708	37.34	1e-110	397
Asa2G06950	AT4G22130.1	681	345	17	1	624	40	686	35.98	1e-104	377
Asa2G06950	AT1G78980.1	667	355	14	1	608	35	680	34.78	1e-92	337

Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g156776.t1
Allium fistulosum	AfisC3G08439
Allium sativum	Asa2G06950.1
Arabidopsis thaliana
Oryza sativa

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF13855.3	LRR_8	Repeat	88	146	37.1	1.8e-09
PF00069.22	Pkinase	Domain	325	591	95.5	3e-27

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0004672	F	protein kinase activity
GO:0004713	F	protein tyrosine kinase activity
GO:0005524	F	ATP binding
GO:0006468	P	protein phosphorylation

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K04730	IRAK1; interleukin-1 receptor-associated kinase 1	EC:2.7.11.1	MAPK signaling pathway	ko04010
			NF-kappa B signaling pathway	ko04064
			Toll-like receptor signaling pathway	ko04620
			Toll and Imd signaling pathway	ko04624
			Neurotrophin signaling pathway	ko04722

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network