result

Gene information

Detail information of Asa4G02248

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
Asa4G02248	chr4	597099085	597103179	-

Sequences

CDS

>Asa4G02248.1
ATGGCGGCAGGACAGAACGGGTCATATCGCGAATCCGGTTTAGAAGCTTCTAGAAGAATCAGGTATGATGATAGTAGATCTAGAGAATCTAGGGTTAGGGTTAGTTCAAGAGAGAGGAACCAAATTAATGAAAAAAATTATAACCGGGATCAAATGCGTTCAAAATCGAACGATCGTGAGCCTGGTGAGGTTTCCAGTGGGGAGGAAGACTATAAGGCTTCCAAACGAGAAGAGAAAAGGCTTAAATTTTCTCCTATAGTTTGGGATAGAGACGATAAGAAGCAGTCTCCGAGTGTAACTAGTTTGCCAAATGGTAGTAACGGGCTCCCACCGCCTCCACCACTTCCTAAGGATTTTGTACCTGAAACGTCAGAAACTGGACAATTTTCAGCTAATGTCAGTATGAGTCATGAACATGAGGGGGAGGATGAAGAAGCTGGATTTTCTAGGCATATATCATCTTCTAGATGGGCTGATAATGACGATGACGATGAATCTAACACAAGTTTACCTAAAAAGAGGAAAATTACGCCTTTAGCAGAGAAGAAGATTAGTCCTGAAACTGAAGTGGCGGTTGTAAGGGAAGAGTCCAGGCATATCTCATCTTCAAGATGGGCTGATAAGGTTGACTACCATGAATCTGATGCAAGTGTAATTAAAAAGAAGAAAATAACACCTTTAGCTGATAAGAAAATTAGTCCGGAAATAAGGGAGATGGTCTTAAGAGAAGGGTCACAGAGTAATAATTCTAAGTCAACAGGATCGGGCAGGGATGACAAGGACAGTGATCGAGAAAATGAGGTTGACAAAGATGGTTATATGGACATAGATGGGAATGATGATTACCAGAGCGATCATGATTCTGATTCAGAAGATGAAGATGGAAAAAAGGGTATACTGCCTGCTACTCCACCCCAAAGGAGTATAAATATGTTGCAAGGCTGTAGAAGTGTTGATGATTTTGAGAGGCTGAATAAAATCGATGAAGGTACTTATGGTGTTGTCTACAGAGCTAAGGATAAGAAGACCGGGGAAGTAGTGGCATTAAAAAAGGTGAAAATGGAAAAGGAGAGAGAGGGGTTTCCGTTAACTTCACTGAGAGAGATCAATATTTTGTTATCATTTCATCATCCTTCGATTGTAGACGTTAAGGAGGTGGTTGTTGGTAGTAGTTTGGATAGTATATTTATGGTAATGGAATATATGGAGCATGATCTTAAAGCTCTTATGGAAACTATGAAACAACCATTTAGTCAAAGTGAGGTCAAATGCTTAATGTTGCAGTTATTGTCAGGTGTAAAGTATCTTCATGATAATTGGGTTCTTCACAGGGATTTGAAGACATCTAATCTTCTGCTAAATAATCAAGGTGACTTGAAAATTTGTGATTTTGGTTTATCTCGTCAGTATGGTAGCCCACTAAAGCCATATACTCATCTTGTGGTAACTTTGTGGTACAGATCGCCGGAACTTCTACTAGGAGCAAAAGAGTACTCAACCGCTATTGATATGTGGTCTTTAGGATGTGTGATGGCTGAACTTTTAGCTAAAGAACCATTATTTAGTGGCAAGTCTGAGTTTGACCAGCTCGATAAGATATTCAGAACTCTTGGTACCCCGAACGAGAAAATATGGCCTGGGTTCTCAAAGTTGCCTGGAGTTAAAGTTAACTTCGTCAAGCAACCGTATAATAGGTTGAGGGAGAAATTTCCACCAACTTCCTTTTCTGGACGCCCAACTTTGTCGGAAGCTGGATTTGATTTACTGAACAAACTTCTTACCTATGACCCTGAGAAGCGGATAACAGCTGAAGCTGCACTTAATCATCCTTGGTTTCGCGAAGTTCCTTTGCCCAAATCGAAGGATTTTATGCCTACTTTTCCTGCTCAACATGCACAAGACAGGCGTCTGCGAAGAATAATGAAGAGCCCAGATCCTCTAGAAGAGCAGCGAAGAAAAGAATTGCAGTTAGGTGATAAACTGGGATCTGGTGGGTTGTTTGGCTAA

Protein

Gene

>Asa4G02248.1
ATGGCGGCAGGACAGAACGGGTCATATCGCGAATCCGGTTTAGAAGCTTCTAGAAGAATCAGGTATGATGATAGTAGATCTAGAGAATCTAGGGTTAGGGTTAGTTCAAGAGAGAGGAAccaaattaatgaaaaaaattataacCGGGATCAAATGCGTTCAAAATCGAACGATCGTGAGCCTGGTGAGGTTTCCAGTGGGGAGGAAGACTATAAGGCTTCCAAACGAGAAGAGAAAAGGCTTAAATTTTCTCCTATAGTTTGGGATAGAGACGATAAGAAGCAGTCTCCGAGTGTAACTAGTTTGCCAAATGGTAGTAACGGGCTCCCACCGCCTCCACCACTTCCTAAGGATTTTGTACCTGAAACGTCAGAAACTGGACAATTTTCAGCTAATGTCAGTATGAGTCATGAACATGAGGGGGAGGATGAAGAAGCTGGATTTTCTAGGCATATATCATCTTCTAGATGGGCTGATAATGACGATGACGATGAATCTAACACAAGTTTACCTAAAAAGAGGAAAATTACGCCTTTAGCAGAGAAGAAGATTAGTCCTGAAACTGAAGTGGCGGTTGTAAGGGAAGAGTCCAGGCATATCTCATCTTCAAGATGGGCTGATAAGGTTGACTACCATGAATCTGATGCAagtgtaattaaaaagaagaaaataacacCTTTAGCTGATAAGAAAATTAGTCCGGAAATAAGGGAGATGGTCTTAAGAGAAGGGTCACAGAGTAATAATTCTAAGTCAACAGGATCGGGCAGGGATGACAAGGACAGTGATCGAGAAAATGAGGTTGACAAAGATGGTTATATGGACATAGATGGGAATGATGATTACCAGAGCGATCATGATTCTGATTcagaagatgaagatggaaaaaAGGGTATACTGCCTGCTACTCCACCCCAAAGGAGTATAAATATGTTGCAAGGCTGTAGAAGTGTTGATGATTTTGAGAGGCTGAATAAAATCGATGAAGGTACTTATGGTGTTGTCTACAGAGCTAAGGATAAGAAGACCGGGGAAGTAGTGGCATTAAAAAAGgtgaaaatggaaaaggagagagAGGGGTTTCCGTTAACTTCACTGAGAGAGATCAATATTTTGTTATCATTTCATCATCCTTCGATTGTAGACGTTAAGGAGGTGGTTGTTGGTAGTAGTTTGGATAGTATATTTATGGTAATGGAATATATGGAGCATGATCTTAAAGCTCTTATGGAAACTATGAAACAACCATTTAGTCAAAGTGAGGTCAAATGCTTAATGTTGCAGTTATTGTCAGGTGTAAAGTATCTTCATGATAATTGGGTTCTTCACAGGTACTTGGGCCTCTGAAGTTTACTCTAAGTACCAATTGCTTGTTTGTTCAGGCTTATATCCCTTGTTTACCCAATTACTTAGGCTGGTGCGTTCATTTGATAAAGGAGTTTCTTCAGTTTGCATTAACATTTTAATACTTATCTCATGAGCCTTTTCCATTTggtagttctctgcttcttaactagcctTTAATATACGAGCCTTCCCCCAGTATTAATTTTGTTTCTTTCAGTTATTATCCTTTCTTTACACAATTACTTAGGATGGGGTGTTGGTACATTTGATTGAGTTGTGTATCCTATATGCATTAACACATTTCCTAATACTTCTTTCATCATCGTGCTCTCCTTTTCACCGCTCTTTGGAGAAGATCATTTAGATATATAgggttaattttgattatttacactttttttttaaaaggtaaactagttcatgtgtaattttctttcttccttAGTTGTGAAAAAGACTTCGGAATAGATGAGTAATGCATTGAGGGGtgtcataaaataaagtaaataatacatGCTTTTAATATAGTGTGTGAATTGAATAGTTTCATTTTTACAGGGATTTGAAGACATCTAATCTTCTGCTAAATAATCAAGGTGACTTGAAAatttgtgattttggtttatcTCGTCAGTATGGTAGCCCACTAAAGCCATATACTCATCTTGTGGTAACTTTGTGGTACAGGTACGTCCTTTTTCCTTTCCTCCCCTCCCTCGTTcacacacacatacgcacacacACCCAACCATATTTTTTATTCAATTGTTAAAACTCATCATGGTTTTGTGTTGGCAGATCGCCGGAACTTCTACTAGGAGCAAAAGAGTACTCAACCGCTATTGATATGTGGTCTTTAGGATGTGTGATGGCTGAACTTTTAGCTAAAGAACCATTATTTAGTGGCAAGTCTGAGTTTGACCAGCTCGATAAGGTAGACATCACaattttacaaatatttgttaaattcaGTTTCTAGATGCGTATTGGCTTACAGCAACCTCACTTAAATGCAGATATTCAGAACTCTTGGTACCCCGAACGAGAAAATATGGCCTGGGTTCTCAAAGTTGCCTGGAGTTAAAGTTAACTTCGTCAAGCAACCGTAAGTTATCTGTATCTATGATGTGATGTTTTTAATGATATAGAATGCATTCTTATGAACCAACACTTTTTCCCAGGCGTACAGCTATGAGTGATCTTGCTCAAGCTTCCTGGCTTTACTTGGTGGCACTTTTCAATTAGGTGATGAATTGCTCAAAGTTTTAGCAACTGAGACTTTTCATGTTGTATTCAGGTATAATAGGTTGAGGGAGAAATTTCCACCAACTTCCTTTTCTGGACGCCCAACTTTGTCGGAAGCTGGATTTGATTTACTGAACAAACTTCTTACCTATGACCCTGAGAAGGTAAGATGTACTTTTATTTCATATAtcattttgttctttctttttcattttttcttcATTTAGCTGAGTACGATTCTGATATTCATTTTTATACGCATTTCATGTAAATATTTGCAGCGGATAACAGCTGAAGCTGCACTTAATCATCCTTGGTTTCGCGAAGTTCCTTTGCCCAAATCGAAGGATTTTATGCCTACTTTTCCTGCTCAACATGCACAAGACAGGTTTCGTTtattttttgttgtcattttaattgatttttagatGTGGTAGCTTGCCTTATTCCAAAAGTGCGCCATATAAGTACATACCTAACCACATCTAGTTTATTTAGTTGGTGTGGCCAGTAccataattttctttatttattagcAGTTTCACACGTAGAACAGTGGATGCATTTTCTGTGTGTTTTGACCATAGAGGGATGTCTCAGTACGCTTTGATACAAGGTTGTAAAAATAGCTAGGTGTATGCTAGATGGTTAGTATGGAATAAAGATTAATCGTTTAGACGGGGAAAGTCGATGACTAATCAGAGTTAGGAATTTTTGATAACTCGTGTATCTTGGATAAATTTTTAAGGGCCGTTTGACCTATTTAGTGTTTTGATAACATTAATCACAAAATATAAGAAGAGTGGAGGGACGATGGGGGGAATGAAAGGAAGACGAAGGGGATGGAGAATGGACGGAAGGATGAATTATTTCTCGTTTTTTCCATTATTTCCCAAAatacaaaaaaatttgttttgtatgTTAGCTTCTATTTTTAAGATGGTTGTTTTTATAATATACATGCGTCGTTCCCACTTTTATATGGGtgaaaatccaaaattaaaatgAGTAAATTGATCGCCTCCTTGGTGTTTTGTTTAGCGAGAACTGatgtaaattggaattttgggATTTTAAATGTGCTTAAGGGGGGAGCCAAGTATGCGAGGTCGCCTAAAACTAGCACATTGATGCTCATATGTATCATTGAACCTTAAATAAAGCTTAACTAGTTTTAAATACACGTTTTGATGTTTACATGGGGGTTACAAACCTTGTCAAGGCGGACGTAGGTAAATCACCAGGTGTTAAGCTTCGCATAGCGCCTAAGCATGAGGCTTAGGAGAATTTTTACAAAAGTGGTTCGAGTAATCTTGTGATTTTTGCAGTCAATCATATACTTAATTTTTGTGATGCAACACATTGACTATTCTCAACCTGCTTCTCTTTTGCATGCTTAGGCGTCTGCGAAGAATAATGAAGAGCCCAGATCCTCTAGAAGAGCAGCGAAGAAAAGAATTGCAGTTAGGTGATAAACTGGGATCTGGTGGGTTGTTTGGCTAA

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020261534.1	1.4e-227	cyclin-dependent kinase G-2 isoform X1
Swissprot	A2XUW1.1	3.1e-187	Cyclin-dependent kinase G-2
trEMBL	A0A5P1F2W5	9.6e-226	cyclin-dependent kinase

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT1G67580.1	60.95	0.0	719		Protein kinase superfamily protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
Asa4G02248	AT1G67580.2	671	186	14	54	668	102	752	60.95	0.0	719
Asa4G02248	AT1G67580.1	671	186	14	54	668	102	752	60.95	0.0	719
Asa4G02248	AT5G63370.4	641	298	15	1	628	1	609	46.49	7e-145	511

Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g400580.t1
Allium fistulosum	AfisC4G02860
Allium sativum	Asa4G02248.1
Arabidopsis thaliana	AT1G67580.1; AT1G67580.2
Oryza sativa	LOC_Os02g39010.1; LOC_Os02g39010.2; LOC_Os02g39010.3; LOC_Os04g41100.1; LOC_Os04g41100.2; LOC_Os04g41100.3; LOC_Os04g41100.4; LOC_Os04g41100.5; LOC_Os04g41100.6

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00069.22	Pkinase	Domain	321	612	252.2	4.6e-75

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0004672	F	protein kinase activity
GO:0004713	F	protein tyrosine kinase activity
GO:0005524	F	ATP binding
GO:0006468	P	protein phosphorylation

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K08818	CDC2L; cell division cycle 2-like	EC:2.7.11.22	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network