result

Gene information

Detail information of Asa4G02608

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
Asa4G02608	chr4	696698675	696701160	-

Sequences

CDS

>Asa4G02608.1
ATGTCTGGAACAGTGCCAGTTGATATTGGTAACATGAATTTTACAATTTTTCAGATATATAGGAATAACTTTTCGGGGAAAATACCAAATGAATTTGGGAATATGCAATATCTTAAACATTTCTCTATTTACCAGAATAATTTTCATGGTGAATTTCCTTCATCTTTTGGCCTTTTGTCTCCACTTACAGGTTTTGACATAGCAGAGAATAATTTTTCTGGGCTGTTTCCAAAGTTTTTATGTAAAAGCAAAAAATTACAGTACTTGCTTGCTTTGAATAATAATTTCTCAGGTGAATTTCCTTATTCGTATTCTGGCTGTAAATCATTGTCAAGATTCAGGATAAGCAACAATTATTTTACTGGAAAATTTCCTACTGGCTTATGGGGACTACCTTCAGCAGTTATTATTGATATAGCAGATAATTCTTTTGTTGGAGAGATTACTGCAGACATTAGTATATCAAGCAGTCTGACTCAGTTATATGTGCAGAATAACAGATTGTCTGGGAAATTACCTGAAGAAATTGGAAAGCTTACTCAGTTGAGGACTTTTTCCGCATTTAACAATTTGTTCTCGGGACAAATTATATCGCAATTCGGTGATTTAATGCTGCTATCATCCTTGCATTTGGAAATCAATAATTTTACTGGGATGATTCCAGTAGAAATTTTTGGATGCAGTAGTTTGGTAGATTTGAATCTTGCATATAATTCATTATATGGTGAAATTCCTTTCAATTTATCCAGGCTCACTTCACTCAATTCACTTAATTTATCAAATAACCTGTTTGTTGGCTCAGTGCCTGAAGTCATACAAGTGCTAAAACTAAGTTCTTTGGATGTCTCTAATAATAAATTATCTGGAAAAATTCCTGGCCAACTTTTGATGGTAGCAGGGGAAGATTCATTTTTGGGAAATTTACAGTTATGCATTGATCAACAATATCAAAATCGATATGGTTCAAATATCAGTATATGCACATCAAGTACTTCACAAAGGGATATATTTCGAAGATACAAGAGTTTTATAATAACAGCGCTCACGAGTGAACTTCATGCAAATGATATATGCAAGTTGAAAGAAGAAAACTTGATTGGAATTGGTGGCACTGGAAAAGTTTACAGGTTAGATTTGAATAAAAATAGGGGCACGTTTGCAGTAAAAAAGATACGTGGAAGTAAATTCAGAAAAGCAGCTGCATCAGAGATTAGCATAATGGGGACAATCAGGCATAGAAATATTCTCAAATTTTATGCTTGCTTGACAAGAGATGAATGTATTTATCTGGTATTCGAACATATGCAGAATGGATGTTTGTATCAGGTTCTAAATAGAGAACTAAAGAGTGAAAAAACTGAACTAGACTGGAATAGAAGATATAATATTGCAGTAAGTATAGCAGAAGGTATCATGTATCTTCATCATGATTGTTCCCCTTCTATTATTCATAGAGATATAAAGTCTACAAATATTTTATTAAACGAGTATTATGAAGCGAAAATTGCTGATTTTGGAATTGCGAAAATGGTAGAGGATTCGAGTAGTAGTATGGTTGTCGGTACTCATGGTTACATGGCTCCTGAACTTGCATATTCTCCTAAGGTGGCGGAAAAGACAGATGTATACAGTTTCGGTGTCGTCCTTCTAGAACTTCTGACTGGCCGTATCGCAACTGAATGCCAGTTTCGTGAAGGAAGTAATATGATAAGCTGGATTACTGGCCATATTGAAGCCCAAAATTTTAAGGACATATTTGATCCCAAAATTTCGGTATCTTCGATAAACGATATGGTCAAAGTACTGAAAATTGCCACTCTTTGCATATCTCAGTTGCCATTACTTCGCCCTACTATGAGAGAAGTAGTTAACATGCTTACTGATGCCAATCCGTGTTCACTCAATAACAGGCAGAAGAAATTTTGTTAA

Protein

Gene

>Asa4G02608.1
ATGTCTGGAACAGTGCCAGTTGATATTGGTAACATGAATTTTACAATTTTTCAGATATATAGGAATAACTTTTCGGGGAAAATACCAAATGAATTTGGGAATATGCAATATCTTAAACATTTCTCTATTTACCAGAATAATTTTCATGGTGAATTTCCTTCATCTTTTGGCCTTTTGTCTCCACTTACAGGTTTTGACATAGCAGAGAATAATTTTTCTGGGCTGTTTCCAAAGTTTTTATGTAAAAGCAAAAAATTACAGTACTTGCTTGCTTTGAATAATAATTTCTCAGGTGAATTTCCTTATTCGTATTCTGGCTGTAAATCATTGTCAAGATTCAGGATAAGCAACAATTATTTTACTGGAAAATTTCCTACTGGCTTATGGGGACTACCTTCAGCAGTTATTATTGATATAGCAGATAATTCTTTTGTTGGAGAGATTACTGCAGACATTAGTATATCAAGCAGTCTGACTCAGTTATATGTGCAGAATAACAGATTGTCTGGGAAATTACCTGAAGAAATTGGAAAGCTTACTCAGTTGAGGACTTTTTCCGCATTTAACAATTTGTTCTCGGGACAAATTATATCGCAATTCGGTGATTTAATGCTGCTATCATCCTTGCATTTGGAAATCAATAATTTTACTGGGATGATTCCAGTAGAAATTTTTGGATGCAGTAGTTTGGTAGATTTGAATCTTGCATATAATTCATTATATGGTGAAATTCCTTTCAATTTATCCAGGCTCACTTCACTCAATTCACTTAATTTATCAAATAACCTGTTTGTTGGCTCAGTGCCTGAAGTCATACAAGTGCTAAAACTAAGTTCTTTGGATGTCTCTAATAATAAATTATCTGGAAAAATTCCTGGCCAACTTTTGATGGTAGCAGGGGAAGATTCATTTTTGGGAAATTTACAGTTATGCATTGATCAACAATATCAAAATCGATATGGTTCAAATATCAGTATATGCACATCAAGTACTTCACAAAGGGATATATTTCGAAGATACAAGAGTTTTATAATAACAGCGCTCACggtaatattgattattttagCGGCTTTTAGTTTTGTGAGTTATAAGAGATTTAAGGTGAAAGAAATTCACAAAAAAGTCGTCAATGAAGATAAATTTGAAGTTTTTATTCAGAGTGAACTTCATGCAAATGATATATGCAAGTTGAAAGAAGAAAACTTGATTGGAATTGGTGGCACTGGAAAAGTTTACAggttagatttgaataaaaatagggGCACGTTTGCAGTAAAAAAGATACGTGGAAGTAAATTCAGAAAAGCAGCTGCATCAGAGATTAGCATAATGGGGACAATCAGGCATAGAAATATTCTCAAATTTTATGCTTGCTTGACAAGAGATGAATGTATTTATCTGGTATTCGAACATATGCAGAATGGATGTTTGTATCAGGTTCTAAATAGAGAACTAAAGAGTGAAAAAACTGAACTAGACTGGAATAGAAGATATAATATTGCAGTAAGTATAGCAGAAGGTATCATGTATCTTCATCATGATTGTTCCCCTTCTATTATTCATAGAGATATAAAGtctacaaatattttattaaacgaGTATTATGAAGCGAAAATTGCTGATTTTGGAATTGCGAAAATGGTAGAGGATTCGAGTAGTAGTATGGTTGTCGGTACTCATGGTTACATGGCTCCTGGTGAGTATGCACTAAGATTTAACTTTATTTAGTTGACAAATTGATAGGCCTTTATTAACATTGTTAAActtctcaattttaattttaaaacttgagGACCGTTATGGTTTTGATCCCGATACAGAtttcatatgtttttttttcttcaggaGTTCTTACCTAACAAGAATTTATTTGTCATTGGATTTTTACAACAATATATATGGCTAGTTGAACATTACAAAAATAAGTTGTGTTATGTTTATTTCTATATGTTATGTGCTATAATATAGAAATCAATTACATTATTGCACACATGAAATTAATGATGTTCCTCCCATTCGTAGGAATTATCTTGCACTTGGGTCACTTTTTGTGTTATAACATAAGAACATTATCCTGTAGACAATATCTTAGATAATTAATTTCTGTAGCCTCACTCTGTTTTTCGCTTTTTATGAATTCAGAACTTGCATATTCTCCTAAGGTGGCGGAAAAGACAGATGTATACAGTTTCGGTGTCGTCCTTCTAGAACTTCTGACTGGCCGTATCGCAACTGAATGCCAGTTTCGTGAAGGAAGTAATATGATAAGCTGGATTACTGGCCATATTGAAGCCCAAAATTTTAAGGACATATTTGATCCCAAAATTTCGGTATCTTCGATAAACGATATGGTCAAAGTACTGAAAATTGCCACTCTTTGCATATCTCAGTTGCCATTACTTCGCCCTACTATGAGAGAAGTAGTTAACATGCTTACTGATGCCAATCCGTGTTCACTCAATAACAGGCAGAAGAAATTTTGTTAA

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_029118408.1	1.8e-102	receptor protein-tyrosine kinase CEPR2
Swissprot	Q9C7T7.1	1.5e-77	Protein C-TERMINALLY ENCODED PEPTIDE RECEPTOR 2
trEMBL	A0A8B8J6P3	9.9e-103	receptor protein-tyrosine kinase CEPR2-like

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT1G72180.1	46.25	5e-172	601		Leucine-rich receptor-like protein kinase family protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
Asa4G02608	AT1G72180.1	694	316	9	1	638	278	970	46.25	5e-172	601
Asa4G02608	AT1G72180.1	294	192	4	1	291	110	402	33.33	2e-33	141
Asa4G02608	AT1G72180.1	228	116	4	93	295	83	286	27.63	3e-13	73.9

Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g435445.t1
Allium fistulosum	AfisC4G03346
Allium sativum	Asa4G02608.1
Arabidopsis thaliana
Oryza sativa	LOC_Os01g65650.1

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00069.22	Pkinase	Domain	362	624	166.2	8.4e-49

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0004672	F	protein kinase activity
GO:0004713	F	protein tyrosine kinase activity
GO:0005524	F	ATP binding
GO:0006468	P	protein phosphorylation

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K00924	E2.7.1.-; kinase	EC:2.7.1.-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network