result

Gene information

Detail information of Asa4G03097

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
Asa4G03097	chr4	829794484	829797567	+

Sequences

CDS

>Asa4G03097.1
ATGAAATACAGAGGAGTTACGATAAATTACACTCTTTTCATTCTCCTCATCGAATTTCATCACATACTCTCTCAAATCCCCACCTGCAGCCCAAATGATCTCAGTTCCTTGCACGGATTCATGAACTCCCTCAACTCCACGATCCCAAGTTGGGATTTCAATGCTACAAATTGCTGTGCTTGGAGAGGAATAGATTGCAACAATCAAGGAAGGGTAATTGGATTGGATCTTTTCTACATGAACTTAAAAGGACCTATCTCCAACTCCTTAACTAATTTGGATGAACTGAAAAGATTGAATCTTTCGCTCAATTCGTTCAATGGAATCGTTCCTAAGCAACTATTCAGACTTCACGGAATAGAGCTACTCGATTTAAGCTTAAATGAATTATCCGGGGATATCCCGTTGAATTTGGAGCTTCCTGCAATCCAAATTTTCAATATTTCATTCAACCGCTTCAATTCTACACATCCGATACTTCAAGGTTCCAAAAAGCTAAGTTCTTTCGATATAAGCTACAACAGTTTTAATGGCAGTATCAATACTAGCATTTGCAACGACTGGGATTCAATAAAAGTTCTTCGTTTTTCAGGTAATCAGTTTTCGGGTAAATTTCCTATCGGGTTTGGAAACTGCACTTCACTTACTGAGCTATCTGTTGATTCAAACTTAATCTCAGGCAGTTTGCCTGAAGATTTGTTCAAGTTGTTTTCATTAACGAAATTGAACGTTCAAGGTAATGATATATCAGACTCTTTGAATACCGCTATCACTAATCTTTCCAATCTCACTCACTTCGATATCTCATCAAACAGAATTTTCGGAAATATTCCTAATATATTCAACAAATTACCAAAATTAGAGTGCTTTTCTGCATATTCTAATAGCTTGAATGGTCCATTGCCTTCATCATTATCTAACCTATCATCTCTTAAATTTCTAAGTTTAAGAAACAATTCATTATCAGGCACGATAACTCTAGATTTCCCTGCCTTGCCTGGACTTACTTCTCTTGATCTTGGTTCGAATTTGTTCACTGGATCGATTCCTTCTCAGTTATCTCAATGTTTAGAACTGAAAACGGTGAATTTGGCAAACAATGTTCTTACTGGACAAATACCCGAAACTTTCAAGAACTTGAATTCATTATCTTATCTCTCGCTTTCGAAAAATAATCTGTCGAATGTATCTTCTGCACTAGATATTTTACAACAGTGTTCTAATCTCACTAGCTTAGTCCTCACAAGAAATTTTTTCAATGAAGAGATACCCACAAGTTCCACATTAAAGTTTTCGAACTTGGAAGTTTTTGTAATACCTAACTGTGGGCTATTGGGTTCGGTTCCGAATTGGTTGAATGATTGCCCAAAACTGAAAGTTCTGGATTTATCTTGGAATAGGCTGCAAGGGCAGATTCCAATATGGATAGGCAAGCTAGACCATTTGTTTTACCTTGACTTATCGAACAATTCGCTATCGGGTACAGTACCTGAAAGTTTATCGGGTATGAAGGCAATGATATCTTCAGACAGTTCATCGCAAATGATATCTCAAGACTTTCCTTTCTTCATCAGAAGGAACGAGTCTGGTAAAGGGTTGCAGTACAAGCAGATAAGTAGCTTTCCGCCTTCTATCATTCTTTGCAATAACTTACTTACCGGCTCTATTTTTCCTGGGTTTGGTAACCTTAAAAAGCTACATGTGTTGGATTTGAGCGATAACAAGCTATCGGGTACCATACCCTATGAATTATCGAACATGTCGAGCCTAGAAACATTGAATTTGTCTCATAATAATCTTTCTGGACCCATTCCTGTGTCCTTAACCGAACTCACCTTCTTATCAAGTTTCGATGTCTCCTACAATAATTTGCAAGGAAAGGTTCCTCCAGGAGGACAATTCTCGACCTTTTCAAATTCGTCCTTTGACGGGAACCCTAATCTTTGTAGGGCAAGGTGTAAGGAGGATCAAGTAGGTTTGATGACAAAACATAGGAAGAACAAAATTGTAATAGTGGGTATGGCTCTGGGTATCGGGCTTGGCACAACCCTTCTCCTCGCTATAGCATACTTGTTTGTGTCTAAAACTAATTCAAGAAAAATCACCTCGAAAGAAGAAGTCGATTCAAATGGGCCTTTGGAGCCTGCGGGTTCGAGAGTGGTCCTCCTATTTCAAAATCCTGACAAGCAGGAAATTACATTCTCGGACATAATGAAAGCCACGGACAACTTCTCTGAGTTGAACATAGTCGGGTGTGGTGGGTTCGGGTTGGTCTACAAAGCGACCCTGCCCGGTGGCAAAAAAGTTGCTATAAAGCGCCTTTCTGGTGACTATGGTCAAATGGAGCGGGAGTTTCATGCTGAGGTCGAGTCCTTGTCTCGGGCACAGCACAAAAACCTTGTGCTTCTCCAAGGCTATTGTAAATTTGGTAACGATCGTCTCCTAATCTACTCGTACATGGAAAATGGAAGCTTAGACTATTGGTTGCATGAGAAGCTCGATGAAGGGTCTATACTAGATTGGAGGACCAGGCTTAAAATAGCCCAAGGATCTGTTAAGGGCTTAGCATATCTGCATCAATCTTGCGAACCTCATATACTACACCGTGATATCAAGTCAAGTAACATTCTTCTTGATGAGAACTTTGAGGCGCATTTAGCGGATTTCGGGTTGGCTAGACTTGTACTGCCCTACGATACTCATGTGACTACGGATTTGGTGGGGACTCTAGGGTATATACCCCCGGAGTATGGGCAGAGTTCTATAGCGACTTTTAAGGGAGATGTGTACAGTTTTGGGGTAGTTCTTTTGGAGCTGTTGACTGGTAAAAGGCCCGTGGATATGTCGAAGCCAAAGAGGTGTAGGGATTTGATATCGTGGGTGTTGCAAATGAAGGAAGAAAAAAGAGAAAATGAGGTTTTTGATCCTTATATTTACGACAAAGATATTTCTGGACAGATGAGTAAAATGCTTGATATTGCTTGTTTGTGTTTGAACAGTTCTCCTAAGTTGAGGCCTTTGACACATCAGTTAGTTACATGGCTTGATGATATTAGCAGCGTTGATGTTCACATAGTTAAGTGA

Protein

>Asa4G03097.1
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Gene

>Asa4G03097.1
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020260165.1	1.5e-212	phytosulfokine receptor 1-like
Swissprot	Q8LPB4.1	6.5e-160	Phytosulfokine LRR receptor kinase 1
trEMBL	A0A5P1F382	1.1e-212	Protein kinase domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT2G02220.1	53.59	0.0	1026	ATPSKR1;PSKR1	phytosulfokin receptor 1

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	bit score
Asa4G03097	AT2G02220.1	1030	439	9	3	1018	4	1008	53.59	1026
Asa4G03097	AT5G53890.1	1033	497	13	12	1018	2	1028	48.79	908
Asa4G03097	AT1G72300.1	1050	554	14	12	1020	31	1079	43.24	795

Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g274927.t1
Allium fistulosum	AfisC4G03900
Allium sativum	Asa4G03097.1
Arabidopsis thaliana	AT2G02220.1
Oryza sativa	LOC_Os02g41890.1; LOC_Os04g57630.1

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF08263.9	LRRNT_2	Family	31	67	21.6	0.00017
PF13516.3	LRR_6	Repeat	238	251	10.2	0.61
PF00560.30	LRR_1	Repeat	262	284	10.5	0.7
PF13855.3	LRR_8	Repeat	333	393	32.7	4.2e-08
PF13855.3	LRR_8	Repeat	456	505	30.5	2e-07
PF13855.3	LRR_8	Repeat	545	600	32.1	6.5e-08
PF00069.22	Pkinase	Domain	745	1012	149.5	1e-43

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005515	F	protein binding
GO:0004672	F	protein kinase activity
GO:0004713	F	protein tyrosine kinase activity
GO:0005524	F	ATP binding
GO:0006468	P	protein phosphorylation

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K13415	BRI1; protein brassinosteroid insensitive 1	EC:2.7.10.1 2.7.11.1	Plant hormone signal transduction	ko04075

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network