result

Gene information

Detail information of Asa5G00272

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
Asa5G00272	chr5	70518536	70521647	+

Sequences

CDS

>Asa5G00272.1
ATGGCTGTTCCATCTTCCTTTTCATTTCTCATACTCGTTTTCAGATATGTGCTCTTGTTTTCTTTTATCTGTTCACCTCCTATTTCGTGCTGCGACTCTAATGATCTTCAAGCTCTTCAATCTTTTGCCTCTAATCTTGAAAGTGGCTCCATTATTTCCACTTGGAATACTAATGGTTCATGTTGCCATTGGACTGGAGTTTATTGCAACGATTTCAATAGAGTTATAAAGCTTCAAGTATCAAACTTCAATTTAGTTGGAAAAGTTTCACGATCCTTAAGCAATTTGACTCATCTCACTTCGTTAGACCTTTCTCATAATTTTTTCACTGGTAGCATTCCGGTTGAATTCTCAAACTTCGTTCATCTTCAAATGCTAAATCTTAGTTATAATGGATTTTCAGGTTCAGTCACAATCTTTAAATCCATGCCAGCGTTGAAAAGTTTTGATTTTTCATCAAATTTCTTTAGTGGTTCACTTCCTGATTTGGGCAGTGGCTTCCCGGTGTTGTCATTTTTCAATGCAAGCAATAATTCCATGAGTGGCTATATTGGTTCTAACATGTGCATTGGTTCCAAGTATCTGAAGGTGATAGATGTTTCCTTTAATTCATTTTCTGGCTTTATCAATGGTGATGTTTTTGCTAATTGTAGTGGTTCTCTCGAAGAACTGAATTTCGGGTTCAACTCATTATCAGGTAATATACCTGAGCAACTCTTTGATTTAACTTCTTTGGTGAGGTTATCACTTGCATTCAACTCTTTTTCAGGTGAGTTGGGTGAAAATTTGAGTAGATTTTTGAAGATTAAATCTTTGATTTTGTCCGGAAATAGATTCAGAGGTCCTATTCCTAATGTATTTGGTAATTTAACAATGCTAGAGCAGTTGATAGCACCTTCGAATTCGTTCTCTGGTTTGGTTCCTAATACTCTGTCTATGTGTGCAATGCTAAAAGATCTTGATTTGAGAAACAATTCCCTTTCGGGTGAATTAAATCTCAATTTCTCAAATTTGCCTTTGCTTAGATCTCTTGATCTTGCAAGTAACTATTTGAAAGGTCCTCTTCCTTCAAGTCTTTCTACTTGCCATGAATTGAAAACTTTGAGCCTAGCTAAAAATGCATTTTATGGGGAAATACCTATTGAGTTTGGAAACCTAGAATCACTTTCATTCCTCTCACTGTCAAACAATAGCTTCCATAACATTTCTAGAGCATTATCAGTGCTTCAACAATGTAAAAATCTCAGTACATTGATCCTCACAAAAAACTTCCATGGGGAACAGGTCCCCAAATTCACAATTGAGTTCTCAAATCTTGAAATACTTGCATTTGGAAATTGTGCTCTTTACGGTGAAATTCCTACTTGGTTAAAAAGTTGCAAGAAGCTACAAGTATTGGACTTGTCCTGGAATCGATTCCATGGTACAATTCCTACATGGATTGGGCAATTCGAAGATTTAATATACTTAGACATGTCCAACAATTCGCTTAGCGGTGAAATTCCAAGAAGTTTAACCCTACTGAAAAGCCTCAGTGTTGCACAAGGTTCTTCAAATGGTAGTTCAATTGTTATGCCTCTCTATGTCAAGCGAAACCAAAGTGTTCTTGGTCTTCAATACAATCAAGTATCAAGTTTCCCTCCCTCTTTATACTTGAACGATAATAATCTGAATGGATCTATATGGCCTGAATTTGGAAACTTAAAAGCTCTTCATGTCTTGGACTTAAGCCACAACAGAATTTCTGGAACTATTCCTGAGACTATTTCAAAAATGGAAAATTTAGAGGTTTTAGATCTTTCAGGCAACGAACTCAATGGTTCAATTCCTCTATCTTTAACCAAGCTCACTTTTTTATCCAGATTCAGTGTAGCCCACAATCACTTGGAAGGAGAAATTCCGACTGGTGGTCAATTCTTTACTTTCTCGAATTCATGTTTTGAAGGTAACTCCGGATTGTGTCGCTTTCCTAACAGGTGCAATAAAACATATCCAGCTGCTACAACATTTTCTTCACAAAGTGGTAGAGTTGGGAAGAGAAATATCATAGGTATAACCATTAGTATATGTGTTGGCATTGCTGTACTCTTGGTGGTTCTCTTAGTTAATTTATCGAGAAAAGACATGATCGAACCTACACAGGTAGTGGACATTGATGAAGAAACAGCTAACTGCCATTCTGCCGCCACTTCCAAGCTTGTAATCTTTTTTCAAAATCCGGAATCTAAAATAGAAATAACCATCAATGACCTATTGAAGTCTACAAACAACTTCGATCAATCAAATATAATTGGGTGTGGAGGATTTGGCCTAGTGTACAAAGCATGCTTACCCGATGGCACCAAAGCAGCCATCAAAAAGCTGTCTGGAGACTGTGGTCAAATGGAAAGAGAGTTTCAAGCAGAAGTAGAAGCATTATCAAGAGCGCAGCACAAAAATTTAGTCTCTTTAAAAGGTTATTGTCGCCATGGCAATGATAGACTTCTCATCTACTCCTACATGGAAAACGGAAGCCTAGACTATTGGCTGCATGAAAAGTCCGATAGTGGTTCATGCTTGTTATGGAATTCCAGGCTCAAAATAGCTCAAGGATCAGCTAGAGGTCTAGCTTACTTGCACAAGATTTGGTTGGGACATTTAGGGTATATACCTCCGGAGTATAGTCAGACCTTAAGTGCAACTACTAGAGGCGATGTGTACAGCTTTGGGGTCGTTCTTTTGGAGCTGTTGACAGGTAGGAGACCCGTGGATGTCTGTAAAGGAAGAGGGTGTAGGAATTTAGTGACATGGGTAGTTCAAATGAAGTCGGAAGGTAAAGAGGAGCTGGTTTTCGATGAGGGAATCGTGAGTAAAACTAACGGGAAGCAACTCATGGCTGTACTTGAGACTGCTTGTAGATGTGTTGCTTTAGATCCGAGACATAGGCCTACCATTGATCAAGTTGTTATGTGGCTTGATGTTGTTGGCGCTGATGGATGA

Protein

>Asa5G00272.1
MAVPSSFSFLILVFRYVLLFSFICSPPISCCDSNDLQALQSFASNLESGSIISTWNTNGSCCHWTGVYCNDFNRVIKLQVSNFNLVGKVSRSLSNLTHLTSLDLSHNFFTGSIPVEFSNFVHLQMLNLSYNGFSGSVTIFKSMPALKSFDFSSNFFSGSLPDLGSGFPVLSFFNASNNSMSGYIGSNMCIGSKYLKVIDVSFNSFSGFINGDVFANCSGSLEELNFGFNSLSGNIPEQLFDLTSLVRLSLAFNSFSGELGENLSRFLKIKSLILSGNRFRGPIPNVFGNLTMLEQLIAPSNSFSGLVPNTLSMCAMLKDLDLRNNSLSGELNLNFSNLPLLRSLDLASNYLKGPLPSSLSTCHELKTLSLAKNAFYGEIPIEFGNLESLSFLSLSNNSFHNISRALSVLQQCKNLSTLILTKNFHGEQVPKFTIEFSNLEILAFGNCALYGEIPTWLKSCKKLQVLDLSWNRFHGTIPTWIGQFEDLIYLDMSNNSLSGEIPRSLTLLKSLSVAQGSSNGSSIVMPLYVKRNQSVLGLQYNQVSSFPPSLYLNDNNLNGSIWPEFGNLKALHVLDLSHNRISGTIPETISKMENLEVLDLSGNELNGSIPLSLTKLTFLSRFSVAHNHLEGEIPTGGQFFTFSNSCFEGNSGLCRFPNRCNKTYPAATTFSSQSGRVGKRNIIGITISICVGIAVLLVVLLVNLSRKDMIEPTQVVDIDEETANCHSAATSKLVIFFQNPESKIEITINDLLKSTNNFDQSNIIGCGGFGLVYKACLPDGTKAAIKKLSGDCGQMEREFQAEVEALSRAQHKNLVSLKGYCRHGNDRLLIYSYMENGSLDYWLHEKSDSGSCLLWNSRLKIAQGSARGLAYLHKIWLGHLGYIPPEYSQTLSATTRGDVYSFGVVLLELLTGRRPVDVCKGRGCRNLVTWVVQMKSEGKEELVFDEGIVSKTNGKQLMAVLETACRCVALDPRHRPTIDQVVMWLDVVGADG*

Gene

>Asa5G00272.1
ATGGCTGTTCCATCTTCCTTTTCATTTCTCATACTCGTTTTCAGATATGTGCTCTTGTTTTCTTTTATCTGTTCACCTCCTATTTCGTGCTGCGACTCTAATGATCTTCAAGCTCTTCAATCTTTTGCCTCTAATCTTGAAAGTGGCTCCATTATTTCCACTTGGAATACTAATGGTTCATGTTGCCATTGGACTGGAGTTTATTGCAACGATTTCAATAGAGTTATAAAGCTTCAAGTATCAAACTTCAATTTAGTTGGAAAAGTTTCACGATCCTTAAGCAATTTGACTCATCTCACTTCGTTAGACCTTTCTCATAATTTTTTCACTGGTAGCATTCCGGTTGAATTCTCAAACTTCGTTCATCTTCAAATGCTAAATCTTAGTTATAATGGATTTTCAGGTTCAGTCACAATCTTTAAATCCATGCCAGCgttgaaaagttttgatttttcatcAAATTTCTTTAGTGGTTCACTTCCTGATTTGGGCAGTGGCTTCCCGGTGTTGTCATTTTTCAATGCAAGCAATAATTCCATGAGTGGCTATATTGGTTCTAACATGTGCATTGGTTCCAAGTATCTGAAGGTGATAGATGTTTCCTTTAATTCATTTTCTGGCTTTATCAATGGTGATGTTTTTGCTAATTGTAGTGGTTCTCTCGAAGAACTGAATTTCGGGTTCAACTCATTATCAGGTAATATACCTGAGCAACTCTTTGATTTAACTTCTTTGGTGAGGTTATCACTTGCATTCAACTCTTTTTCAGGTGAGTTGGGTGAAAATTTGAgtagatttttgaagattaaatctttgattttgtCCGGAAATAGATTCAGAGGTCCTATTCCTAATGTATTTGGTAATTTAACAATGCTAGAGCAGTTGATAGCACCTTCGAATTCGTTCTCTGGTTTGGTTCCTAATACTCTGTCTATGTGTGCAATGCTAAAAGATCTTGATTTGAGAAACAATTCCCTTTCGGGTGAATTAAATCTCAATTTCTCAAATTTGCCTTTGCTTAGATCTCTTGATCTTGCAAGTAACTATTTGAAAGGTCCTCTTCCTTCAAGTCTTTCTACTTGCCATGAATTGAAAACTTTGAGCCTAGCTAAAAATGCATTTTATGGGGAAATACCTATTGAGTTTGGAAACCTAGAATCACTTTCATTCCTCTCACTGTCAAACAATAGCTTCCATAACATTTCTAGAGCATTATCAGTGCTTCAACAATGTAAAAATCTCAGTACATTGATCCTCACAAAAAACTTCCATGGGGAACAGGTCCCCAAATTCACAATTGAGTTCTCAAATCTTGAAATACTTGCATTTGGAAATTGTGCTCTTTACGGTGAAATTCCTACTTGGTTAAAAAGTTGCAAGAAGCTACAAGTATTGGACTTGTCCTGGAATCGATTCCATGGTACAATTCCTACATGGATTGGGCAATTCGAAGATTTAATATACTTAGACATGTCCAACAATTCGCTTAGCGGTGAAATTCCAAGAAGTTTAACCCTACTGAAAAGCCTCAGTGTTGCACAAGGTTCTTCAAATGGTAGTTCAATTGTTATGCCTCTCTATGTCAAGCGAAACCAAAGTGTTCTTGGTCTTCAATACAATCAAGTATCAAGTTTCCCTCCCTCTTTATACTTGAACGATAATAATCTGAATGGATCTATATGGCCTGAATTTGGAAACTTAAAAGCTCTTCATGTCTTGGACTTAAGCCACAACAGAATTTCTGGAACTATTCCTGAGACTATttcaaaaatggaaaatttagaggTTTTAGATCTTTCAGGCAACGAACTCAATGGTTCAATTCCTCTATCTTTAACCAAGCTCACTTTTTTATCCAGATTCAGTGTAGCCCACAATCACTTGGAAGGAGAAATTCCGACTGGTGGTCAATTCTTTACTTTCTCGAATTCATGTTTTGAAGGTAACTCCGGATTGTGTCGCTTTCCTAACAGGTGCAATAAAACATATCCAGCTGCTACAACATTTTCTTCACAAAGTGGTAGAGTTGGGAAGAGAAATATCATAGGTATAACCATTAGTATATGTGTTGGCATTGCTGTACTCTTGGTGGTTCTCTTAGTTAATTTATCGAGAAAAGACATGATCGAACCTACACAGGTAGTGGACATTGATGAAGAAACAGCTAACTGCCATTCTGCCGCCACTTCCAAGCTTGTAATCTTTTTTCAAAATCCGGAATCTAAAATAGAAATAACCATCAATGACCTATTGAAGTCTACAAACAACTTCGATCAATCAAATATAATTGGGTGTGGAGGATTTGGCCTAGTGTACAAAGCATGCTTACCCGATGGCACCAAAGCAGCCATCAAAAAGCTGTCTGGAGACTGTGGTCAAATGGAAAGAGAGTTTCAAGCAGAAGTAGAAGCATTATCAAGAGCGCAGCACAAAAATTTAGTCTCTTTAAAAGGTTATTGTCGCCATGGCAATGATAGACTTCTCATCTACTCCTACATGGAAAACGGAAGCCTAGACTATTGGCTGCATGAAAAGTCCGATAGTGGTTCATGCTTGTTATGGAATTCCAGGCTCAAAATAGCTCAAGGATCAGCTAGAGGTCTAGCTTACTTGCACAAGGTTTGTGAACCTAACATCATACATAGAGACGTCAAATCTAGCAACATTTTACTTGATGAAAGGTTCGAAGCACACTTAGCGGATTTTGGGCTTTCTAGACTGATCAGGCCATATGATACACATGTAACTACAGATTTGGTTGGGACATTTAGGGTATATACCTCCGGAGTATAGTCAGACCTTAAGTGCAACTACTAGAGGCGATGTGTACAGCTTTGGGGTCGTTCTTTTGGAGCTGTTGACAGGTAGGAGACCCGTGGATGTCTGTAAAGGAAGAGGGTGTAGGAATTTAGTGACATGGGTAGTTCAAATGAAGTCGGAAGGTAAAGAGGAGCTGGTTTTCGATGAGGGAATCGTGAGTAAAACTAACGGGAAGCAACTCATGGCTGTACTTGAGACTGCTTGTAGATGTGTTGCTTTAGATCCGAGACATAGGCCTACCATTGATCAAGTTGTTATGTGGCTTGATGTTGTTGGCGCTGATGGATGA

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020256736.1	1.7e-192	phytosulfokine receptor 2
Swissprot	Q9FN37.1	1.9e-119	Phytosulfokine LRR receptor kinase 2
trEMBL	A0A5P1FA03	1.5e-190	Protein kinase domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT5G53890.1	52.19	0.0	967	AtPSKR2;PSKR2	phytosylfokine-alpha receptor 2

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	bit score
Asa5G00272	AT5G53890.1	1029	426	12	17	986	5	1026	52.19	967
Asa5G00272	AT2G02220.1	1037	448	16	10	988	8	1008	47.73	843
Asa5G00272	AT1G72300.1	1066	549	17	4	991	20	1080	40.71	711

Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g345952.t1
Allium fistulosum	AfisC2G00528
Allium sativum	Asa5G00272.1; Asa5G00273.1
Arabidopsis thaliana	AT5G53890.1
Oryza sativa	LOC_Os07g01710.1

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF08263.9	LRRNT_2	Family	33	70	35.4	8.4e-09
PF13855.3	LRR_8	Repeat	77	132	28.6	8.1e-07
PF00560.30	LRR_1	Repeat	462	480	10.4	0.75
PF00560.30	LRR_1	Repeat	487	505	10.2	0.86
PF13855.3	LRR_8	Repeat	549	605	36.8	2.1e-09
PF07714.14	Pkinase_Tyr	Domain	761	875	62.1	4.4e-17
PF07714.14	Pkinase_Tyr	Domain	881	983	29.3	4.6e-07

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005515	F	protein binding
GO:0004672	F	protein kinase activity
GO:0004713	F	protein tyrosine kinase activity
GO:0005524	F	ATP binding
GO:0006468	P	protein phosphorylation

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K13415	BRI1; protein brassinosteroid insensitive 1	EC:2.7.10.1 2.7.11.1	Plant hormone signal transduction	ko04075

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network