result

Gene information

Detail information of Asa5G00596

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
Asa5G00596	chr5	136300688	136306864	+

Sequences

CDS

>Asa5G00596.1
ATGGGTAGTAGTGATGCGGATAAGCCAACAAAGGCAAATACTATACCTCCAGTTGCTGCAGCAGCAGCTGTAGGGACACAACCGGAACAGGCACAAGCCAGCAGTTCCAGTGTTGCTACTTCAGCCGTTTATCCCGATTGGTCAGGATTTCAGGCATATCCACCAATACCACCTCATGGATTTTTTCAACCTGGTTCTCAAACTCATCCTTACATGTGGGGACCTCAGCCCCTTATGTCTCCATACGGAACCCCACCATCTCCGTATGTTATGTATCCTCATGGTGTATATGCCCACCCATCTATGCAGCTGGCTTCTCACCCTTTCAGTCCTTATGCTGTTCCTCCTCCAAATGGCAATGTTGATGCTTCTGGAGCTTTGGCTACTGGCATGGAAGTGGATGGAAAGTCATCTGATGGTAAGGAGAAAAGTCCAATTAAGAGATCAAAAGGAAGTTTGGGTAGCTTAAATATGATTACAGGAAAGGGCAATAATGACATGGGTAAAACGTCTGGAGCCTCGGCCAATGGAATGTCACAAAGCGGCGAAAGTGGGAGAAGTGGAAGTGAAGGTTCAAGCGATGGGAGTGATGACAATTCTCATAATGAATCTAATTTGAAAAGCCAAGGAGAAAAAGAGTCTTGTGGTGTGGACACACATCAAAATGGTGTTGATGCACATAAGAACCAAAATGGAGGGCCAACCCATCCTTCCTCGCAAGGATTGTTAAGTCATCCCATGCCAATTATGCCTATGCCAGCTACTGGTATTCCTGCTGGAGTAGCAGGTCCAACCACAGCCCTAAACATTGGAATGGAATATTGGGGTGCTCCAAATTCAACAGTTGGTTCTGTTCGTGGAAAGGTGCCTGCTAATTCTGTAGCTGCAACTCGTGAGAATGTTCCATCCGAGCTTTGGCCACAGGATGAAAGGGAACTGAAAAGGCAGAGGCGAAAGCAGTCTAATAGAGAATCTGCACGTAGATCAAGATTACGGAAGCAGGCTGAGTGTGAAGAGCTAGCTCAGCGTGTTGAGGTGTTGAAAGAAGAAAATGTCGCTCTCAGAACTGAAGTTGATCGAATAAGGAAGGAATATGAACAGCTTGTTGCCCAGAATACATCTCTTAAGGAGAGACTTGGAGGAGTACCTCTAGGCACCGATGATACCGGGCACGGACGAGATGGGACAGACCAACCCATGGATTCTAATGCAGGACCCCAAAATGGTCTTTGA

Protein

Gene

>Asa5G00596.1
ATGGGTAGTAGTGATGCGGATAAGCCAACAAAGGCAAATACTATACCTCCAGTTGCTGCAGCAGCAGCTGTAGGGACACAACCGGTACTTTATATTTTAGACACATGTTATTGAGTTTtaatttttttgggaaattttattatgttttgatTGAAATTGGACGTTTCAATTGTCTAGGAACAGGCACAAGCCAGCAGTTCCAGTGTTGCTACTTCAGCCGTTTATCCCGATTGGTCAGGATTTCAGGTAAATTCGGATAGTTTCAAGTGAATCTGATGGACGTctgttgatttatttgataaacataGTTAACATGCAATTTGATTGTCTGATTCACATATTGTTTTATATGAATAATATCAAGTGCATCGAACATGCTATTTAATGATTATGGTGCATTTGAACAAAAAGGAAGACTATTTTTTGTTTCCAAACCACTGATATATGAATTACATGTCTAAACAATGTGCAACGAAGTTAAATGAAGCGTAAACCtcttaaataaacaaacaagaaaccgtagtgtttatttatttttatcaagattCTTTTTCTTTATACATTTGGGCTGAACTTTGGGCCCATTTTGTTAGCTTATACAATGTAATTTCAATCATTTCATGAAGTTGACAGTCAGAATAATAATGAATATAACTGAGAAAATGTGTTATAGAATGACATTTCTTAATGAGTTTGGTTCCTAAAGGCGAGTAAGAATGATACATAGTTAACACATATGAACTGGAAATGTGTATAGCTGTTATTAGATTATCATTTATGCAGTTCTTATGTAATTATTTGCTTTATGAGAATAGGCATATCCACCAATACCACCTCATGGATTTTTTCAACCTGGTTCTCAAACTCATCCTTACATGTGGGGACCTCAGGTACTTTATTTTTACTCTAATGGCGCTCATAATGTTtaacttctgattttttttttaaatatgttttccgCAAAAAATAAGTAAATGACAGTGTCATATTCAACCTTAAAGTGCAGCAAATTGCTATTTACTGCACTATGTTATATACCAACGGCTTAACTTAAATTGTAGCAGCTTATTTTTAACTGCATTATGTTTTCTACCAACggctaaaacaatatttattgatGAACCTTGGTTAGTTGATTAAAAAAAGGTTGACGGTCTTCGTATGAGTCCGAATTCAATGTCTTTCCAATGATGAAAATCTCATTTTGGCGGTCTTTTGCTTTCCAGGCAATCTTCCAGCGTAGTAAAACAAAAGAAATAGCACGTCATCAGCTCGTTATTGTTGAAACCAGATGATGGATGCATATATTAGCAAATGAGTTGTTAATGTATGTCCTAGGGGGCATGCTAAGAATGATTATTATTTGCTAAacgaaagaaaaatatattttaaatactcGTTTCATTCTTACACCATAACAAATAGATGGAATTAAGAGGGGTTATTTTTGTAATATAACAACCTTTAGCGTTTTCGTATTAAATTACAAAACATTTCATTTGTTATGATCTCCGTTATTATTAGCCGAAAAATTCCCATAATTGTTTTTTCTTAATATTTGGAAGTCAAGGAAACTGAAAGTTTCGAGATTTTTCATTCCTAATTTCGAAATATGGTAAGGAAATGAATCACAATTGGCTAAGTCAACTCATCTTGTGGTTTAATACCTTCTTCTGTGGTGCCTTCCTTAAAATTAAGGGTACATAATCTTAAGTAGTGCAAATGTTTATGCATAAAATTTGTCCATGTATGTTTTGAGAATTAAAATAGCTGGTATATTAGTGGCGCAACAGCATGTGCTAAGTCGTctagatgtttatttcatttatatatgtcCATATCTATAACAATGCAGTtgcactgttttttttttaatattattttatttcatttttctcagcCCCTTATGTCTCCATACGGAACCCCACCATCTCCGTATGTTATGTATCCTCATGGTGTATATGCCCACCCATCTATGCAGCTGGTATGTTTCTACATATATTAAGCATGTCCCTTTCACCGTTTTTACAGAGGTAGGTAATGTCAGATTAATCATGCGCTTGACAATGACCTTTGCCTTGAAATTAGGTCAAACTCTTTCTAAAGTTTCCAGTAATAACGAGCTCTTTTGCATGTGCATTGCACGTGCATACATAATTATCATTGAAAAAAGAGAcgataattaaatttcaattttatatttagttttgatAAACATAAATTGAAAGATAAACGTAAATGTAAAGAATATAAGTGTTTTGCTGGAACTGGAATTTAGACCCATAACCTCTTTTATATCATATATGTTAGTTTcaactaaaaatgttaatttttgtcatTATCGGGAATCTGTGGTATGAACCTATAaccacacacatacacacatttttgggggggggggggggggggggagggagggcgGGGGCTATTTAGACCCAAAATCATACACAAATTGAGAGACACGGGATCTTGGCCATTGGATCATTTTATCTTATATGGGAAGGTGGAATTCATGGGGCATTCCAATGATTGagatgtgtacacacacacatacacggaGCACTCCGTGACAACCCTGTTTTCCAGCACCTCCATCGTATCGTGGACAACACCATTCTAGATTTAACAAAGTTATGTAGATGTCCAATCCACATATAgcatcatatatataaattttgggCTTATTTTGGTATTTGTAGTATGATATGTTTGATGCTTAAATTCAAcgattcaaatgaatattgaaGGACAAATAGTTGGTTAAGATTTTAAAGTagcatattatgttttatttttaaatttaacggGTCAAAAAAAATGTTTGAACTATGACTAACtgggttaagattttgaaaatgctacAAATATCGAAATAAGTCCAAATTTTACATATATGATCCTctatatgtggattgaatatccATGCACGTGTGTGTGCATGTGCGTGTGCATGCATTGCAGTTGGACCAAAAATTAAGTTGATGATTTATCACATCAAAACAGTTTGTGTTGTCCATTTGTACACTATGAATGACTTTTTCTCTACATGCTATACGTAACATGTTTTGATTGAGTTAAACAGTTTACATTGTCACTTTGTGCACCACTATAAATGACTTTTTCTCTGAATGCTATACGTAATACGTTTTGATTGAGTTAATCTTGGACATGATTCTATTTATGCTATGAACTTTggtaatcatatttttttaatgtgGAAACTTAGCAGGCTTCTCACCCTTTCAGTCCTTATGCTGTTCCTCCTCCAAATGGCAATGTTGATGCTTCTGTAAGTACATTCAAATCCATTTTTTAAGTAAAGATTATGTATGTACCGAACAATATCCGGTTTATAAACTTTGGGAGGCCCAACCACTTCAGAGTCAGAGCTGCTTTCAGTACTCACACATgatttagaataataattaaaaagccAGAAGTTGTACAAGgatgtaaattcatgtcatatTATGTTTGGTACTTGATGTTTTCTAGGGAGCTTTGGCTACTGGCATGGAAGTGGATGGAAAGTCATCTGATGGTAAGGAGAAAAGTCCAATTAAGAGATCAAAAGGAAGTTTGGGTAGCTTAAATATGATTACAGGAAAGGGCAATAATGACATGGGTAAAACGTCTGGAGCCTCGGCCAATGGAATGTCACAAAGGTCATATATCTTGTATAAACATGTATCAAatagattcattttgaatttaatttttattttagtaatccATCTTCAGCGGCGAAAGTGGGAGAAGTGGAAGTGAAGGTTCAAGCGATGGGAGTGATGACAATTCTCATAATGTAAGCCTTAAAAATTGGAATGTAATTTGTCGGAAATGTTTTTATTTcaagtgaattattaaaataaatgaaataaggtTATATGACATCTAATTTTTGAGTAGTTCCACATTATAGAACTATAGAAAAGAATCAAGTATTTAGACTTGATTCTAAATACTAGATTCTTAGATGCTTAGTTGGGCTCTTTGGACATCCATTGATGCGCTTTTGTGAGGGGGGAGACTATGCTTGACCACTTCATGCGTGCATAggcctgtaaacggatgcaaacggacgcggatagtgctgtatccgtatccgaaaataaaaatccgtatccgaatccgtatccgtatccggtggatacctactaaataatatccgtatccgtatccgtatccgcgaatattttcggatatccgaaaatatccgtatccggcttagcaaatacggatatttccggatatccgaaaatatccgaatccgaacttaaaaatatgtaagttacaatatgatgcatatttcattggtatatccgtatccgtatccgctaagcatttcggatatcggatatctatatccgcttttcggatatcggatatttttcgtattttcggatgcggatacggacggatttcggatatccattgacagccctatgcGTGCATGCCGATCGACTCGTCCCGGGCTAGGTTGgacagttgtgtgtgtgtgtgtctatatatatatatatatatatatatatatataatatatgcgagcgttcaatggcagcgcaaaaatatatatctgtgtgtgtattgTGTATGTATCGTCTCTAAGTTTGCTATGAATTATTTATTCAACTTTTACATGtttgtatttgaaatattattttattccaggAATCTAATTTGAAAAGCCAAGGAGAAAAAGAGTCTTGTGGTggtacgtttttttttttttggaagaaaataaatttaaacaaacaacaAGACATCACAAAATTCTCACTGTGCATATATTTATAGTGGACACACATCAAAATGGTGTTGATGCACATAAGAACCAAAATGGAGGGCCAACCCATCCTTCCTCGCAAGGATTGTTAAGTCATCCCATGCCAATTATGCCTATGCCAGCTACTGGTATTCCTGCTGGAGTAGCAGGTCCAACCACAGCCCTAAACATTGGAATGGAATATTGGGGTGCTCCAAATTCAACAGTTGGTTCTGTTCGTGGAAAGGTGCCTGCTAATTCTGTAGCTGCAACTCGTGAGAATGTTCCATCCGAGCTTTGGCCACAGGTAAAACCTTATCTGAAGTGATATACATCTGTCAGTGATATGATGGTAACATGCATGCTCAACTCATGTAACATGCACATAGAGAAGATACTTTTAATCTCATCAGATCAGTTTGCAAATTTTTTAGATAAGATACTTGTATTTGTTGAAAAActgaaaaggtaatattttgaaattaggaTGAAAGGGAACTGAAAAGGCAGAGGCGAAAGCAGTCTAATAGAGAATCTGCACGTAGATCAAGATTACGGAAGCAGGTAAACATATTGTATTAGACCTGTGAAGTATCCGTTCCTGTTAAATTGAAATATGGGCACTATTGTGTTCTTTCAGGCTGAGTGTGAAGAGCTAGCTCAGCGTGTTGAGGTGTTGAAAGAAGAAAATGTCGCTCTCAGAACTGAAGTTGATCGAATAAGGAAGGAATATGAACAGCTTGTTGCCCAGAATACATCTCTTAAGGTATGAATTCAGATAAAGTTCAATTGCTtagctttattatttcaaatagtACCTTGGAAGAATAACAtgtaataaaaaagataatttctattaacatattttgtgaatataaaataaatcccACTGTATCATACATAATTCTTAGATCAAGGTTGTTGATTTGATTTAATCTCTTGTACGTTTTCATCATCAGCTCAGCAATTGCATCCTGAGGGAGCTTACATATGTTGCAAATAGTTAGAATTATGAAAGGGTTTTGTGAGTGCTATCATTCCAAATATGGAAATATATCCTTGTTGATAAACTGATATTGCACTACAAATAAATCCAACCTATGGTTTGAATTCCATTACTGATAGTTTATACTTGTTTGTTGCAAACAAATTAGCGTATTTTTTATACATGACTTCCATACATCGAGGGGAATTTCTAGGTGAGAGcattcctgtttttttttttttaataaataaatgtagaGGGATCTTGCTTTTACTTGGCATCTATGTGTCGTAAATTCATAAGATTAAGCTGCACTTTGCAGGAGAGACTTGGAGGAGTACCTCTAGGCACCGATGATACCGGGCACGGACGAGATGGGACAGACCAACCCATGGATTCTAATGCAGGACCCCAAAATGGTCTTTGA

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_019705679.1	2.0e-54	bZIP transcription factor 16 isoform X3
Swissprot	A0A3B6KF13.1	2.3e-39	bZIP transcription factor 1-A
trEMBL	A0A8N4IBC8	1.4e-54	bZIP transcription factor 68 isoform X1

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT2G35530.1	54.82	3e-93	339	AtbZIP16;bZIP16	basic region/leucine zipper transcription factor 16

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
Asa5G00596	AT2G35530.1	363	138	10	32	383	29	376	54.82	3e-93	339
Asa5G00596	AT1G32150.1	390	151	12	1	383	1	366	53.33	1e-88	323
Asa5G00596	AT4G36730.2	400	141	20	1	387	1	294	35.00	5e-32	135

Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g415092.t1
Allium fistulosum	AfisC2G00387
Allium sativum	Asa5G00596.1
Arabidopsis thaliana
Oryza sativa	LOC_Os12g13170.2; LOC_Os12g13170.3

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF07777.8	MFMR	Family	1	102	82.1	2.7e-23
PF16596.2	MFMR_assoc	Disordered	142	281	145.7	9.8e-43
PF00170.18	bZIP_1	Family	310	372	74.6	4.4e-21

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0003677	F	DNA binding
GO:0003700	F	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0005634	C	nucleus
GO:0006351	P	transcription, DNA-templated
GO:0006355	P	regulation of transcription, DNA-templated
GO:0043565	F	sequence-specific DNA binding

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K09060	GBF; plant G-box-binding factor	EC:-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network