result

Gene information

Detail information of Asa5G01242

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
Asa5G01242	chr5	293276679	293279927	-

Sequences

CDS

>Asa5G01242.1
ATGCTCCGCCCATTCACGAGGGTATTCCTCGCCGGTTCTCTAGCTTTCCTCTTCCCAGTTCTCTTCGCCTGCGCTCAAAACCCTAGTGTTCAACTGTCCGCCCTTGTTGGGTTCAGAAACTCGGTCTCGGATCCTCACAACCTTCTGTCCAGCTGGTCTAGCTCGAACGTATGTGCTTGGTTTGGTGTTGCGTGCGATTCAGAATATAGAGTTGTTGCCATTAACATAACTGGTGACGGGAAGCAGAAGTTTAGTGGTAAGCTTAACCCTGAGCTTGGTAACTTGGCGGAGCTCAGTGTACTCTCGATTCGGTTCCAGTCGCTTCACGGCGAGATTCCCGACGAGATCTGGAAGTTACCAAAGCTTGAAGTGCTTAATTTGGAGGGCAATACTCTGTCCGGTCAGCTACCTTTTAAGTTTAAAGAAAGACTGAGAATTTTAAATTTGGGGTCGAACTTGTTTACTGGTGAAATTCCGCGGTCCATTTCTAACTGCGTGGAGCTAGTAAACTTGGATCTTTCTAACAATAAGTTCAACGGTACAATTCCGGATGTTTTTGGTAACTTATTGAGGCTGGAAATTTTGGATCTTTCTTTTAATCAGTTCACCGGTTCAATTCCTGCTAAAATTGGAAATGCATGTGAGAATTTGATGATACTTGACCTTTCACGGAATTTTTTGTTTGGTAGCATTCCGCGGAATTTGGGAAACTGTAGCAGGATTGAATCTATGGTTTTGTTTTCAAATTTGTTGGATGATGTTATTCCAATTGAGCTTGGAAAACTAGCAAAAATGAGAATTTTGGATGTTTCAAGAAATAGTTTGAGTGGAATTATACCGTCTGAGCTTGGAAACTGCTTAGAACTGTCTGAGCTGATTCTTTCAAATCCATACAATCCTGTACCACCTTTGAATGATCCCGACTATAATGAGATTGATGATTGCAACTACTTTCAGGGAGGTCTTTCAGAGAACATCACTAGTTTGCCAAAGCTTAGGGTTTTATGGGCGCCAAGAGCTACACTGGAAGGAGAGATTTCTAACAACTGGGGAAGTTGTGAGAGGTTGGAAATGGTTAATCTAGGTGGCAATTTGTTTACAGGTGGGATTCCTATTGCTTTTGAAAAATGTGAGAATTTGAAGTTTCTTAATTTGAGCTCTAACAAACTGACCGGCTGGATTAGTGAAGATTTACATGCTCCCTGCATAAGCGTATTTGATGTCAGTCATAACCATCTTTCTGGAACACTTCCAAATTTTACTTATCAAAATTGCTCATCGGTTGAATTTTCTGTTGCTGACTTGCCTTTTGATTATTACTCGTACTTCCGGTATTATACCCTTGTTGGGGCCTATTTGCCTTATTTTGATTCAGGAGGTGATCATGTGATTTATCATAACTTTGGCTGGAATAATTTCACGGGTAATATGCTTTCATTGCCAGTTTCAACTGAAATTGTGAGCAAGGATACTATATATGCCTTTCTTGCTGATGGCAATCAACTTGTCGGTCCATTGTCAGAATCCTTGTTTGGAAAATGTAAACAGTTACATGGGCTTGTCATTAGTTTTAGTAACAACTTGATTTCTGGTGTCATACCAGATAAAATTGGTAACTCATGCAATTCATTGCTAGTATTTAATATTGCTGGTAATGGAGTAACAGGTATGGTTCCAATTAGTTTTGGAGACTCTAGGAACCTTATTGGGCTTGATTTGAGTAGAAATAAAATTCAAGGGGAGCTTCCCACGAGCATTGCCAACTTAACGGGTTTGAATTATCTCTCATTAGGCAGCAATAATCTTACTGGCCACATTCCACCTGCTTTAGAACAGTTGCATTCTCTTAAAATATTGGATCTTTCTTCAAATTCTTTCTCTGGTGAAATACCAAGTGGTTTAGTGAATCTTGGGAATCTCACTTCTTTGTTTTTAGATAACAACAAACTTTCTGGAAAAATACCTTCTGGTTTTGCCAAGATTTCATCTCTATCCATGTTCAATGTGTCATATAATAATTTGTCAGGGCCGGTTCCGCTGAATTCGAGTATGTTGAGATGCGATAGTGTTGTAGGGAATCCACTTCTCGAGCCTTGTACTGGATTTTCTCTTTCAATTCCGCCATCCGATCAAGAAGGATCCACTGGAACCGCACAACCATATATCGATGCACCTCCCTTAACCCCATCTAACAGTGGTAGCGGGTTCAGTTCTATTGAGATCGCATCTATTGCATCGGCATCAGCCATTGTAGCAGTTTTGTTAGCATTGATTGTCCTATATGTATATACAAAAAAATGTACCCCTAATGCTTCAATTCGATCTTCTGGAAGAAAAGAAGTAACTATATTTACACACATTGGTGTCCCAATAACGTACGAAAGTGTTGTAAGAGCCACTGGTAGTTTCAACGCAAGCAATTGTATTGGAAGTGGTGGTTTTGGAGCGACATACAAAGCCGAAATACATCCAGGAGTTCTCGTAGCTATAAAGAGGCTCTCAGTAGGCAGATTTCAAGGTGTTCAACAATTTCATGCTGAGATTAAAACTTTAGGAAGGTGGCGCCATCCAAATCTAGTGACCCTAATTGGATACCATGTTAGTGAGGCAGAAATGTTTCTGATATATAATTATTTGCCAGGAGGTAATTTGGAAAGGTTTATACAAGAAAGGTCTAAGCGAGCAGTGGATTGGAGAATGCTTCATAAGATTGCTTTAGATGTAGCACGTGCACTAGCTTACTTGCATGATCACTGTGTCCCTCGAATACTTCATAGAGATGTCAAACCAAGCAATATTTTGTTAGACAAAGATTTTAACGCGTATCTTTCTGACTTCGGTTTGGCCAGGATTTTAGGGAATTCTGAGACTCATGCCTCTACGGGCGTGGCTGGTACATTTGGATATGTAGCTCCAGAGTATGCAATGACATGTCGTGTGTCTGATAAGTCTGATGTTTATAGTTACGGTGTAGTGCTTTTGGAGTTGATTTCTGATAAGAAGGCACTGGATCCATCCTTTTCTCCATATGGCAATGGTTTCAATATTGTAGCCTGGGCATGCATGCTTTTACGCCAGGGTAGAGCACGAGAGTTCTTCACTGAGGGATTATGGGATGTGGCCCCTCATGATGATTTGGTGGAGACATTGCATTTAGCGGTCATGTGTACTGTTGACTCTTTAACTATTCGGCCTACAATGAAGCAAGTTGTTCAAAGGTTAAAGCAGCTACATCCACCTAATTGCTAG

Protein

>Asa5G01242.1
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Gene

>Asa5G01242.1
ATGCTCCGCCCATTCACGAGGGTATTCCTCGCCGGTTCtctagctttcctcttcccagttCTCTTCGCCTGCGCTCAAAACCCTAGTGTTCAACTGTCCGCCCTTGTTGGGTTCAGAAACTCGGTCTCGGATCCTCACAACCTTCTGTCCAGCTGGTCTAGCTCGAACGTATGTGCTTGGTTTGGTGTTGCGTGCGATTCAGAATATAGAGTTGTTGCCATTAACATAACTGGTGACGGGAAGCAGAAGTTTAGTGGTAAGCTTAACCCTGAGCTTGGTAACTTGGCGGAGCTCAGTGTACTCTCGATTCGGTTCCAGTCGCTTCACGGCGAGATTCCCGACGAGATCTGGAAGTTACCAAAGCTTGAAGTGCTTAATTTGGAGGGCAATACTCTGTCCGGTCAGCTACCTTTTAAGTTTAAAGAAAGACTGAGAATTTTAAATTTGGGGTCGAACTTGTTTACTGGTGAAATTCCGCGGTCCATTTCTAACTGCGTGGAGCTAGTAAACTTGGATCTTTCTAACAATAAGTTCAACGGTACAATTCCGGATGTTTTTGGTAACTTATTGAGGCTGGAAATTTTGGATCTTTCTTTTAATCAGTTCACCGGTTCAATTCCTGCTAAAATTGGAAATGCATGTGAGAATTTGATGATACTTGACCTTTCACGGAATTTTTTGTTTGGTAGCATTCCGCGGAATTTGGGAAACTGTAGCAGGATTGAAtctatggttttgttttcaaatttgttggATGATGTTATTCCAATTGAGCTTGGAAAACTagcaaaaatgagaattttggatGTTTCAAGAAATAGTTTGAGTGGAATTATACCGTCTGAGCTTGGAAACTGCTTAGAACTGTCTGAGCTGATTCTTTCAAATCCATACAATCCTGTACCACCTTTGAATGATCCCGACTATAATGAGATTGATGATTGCAACTACTTTCAGGGAGGTCTTTCAGAGAACATCACTAGTTTGCCAAAGCTTAGGGTTTTATGGGCGCCAAGAGCTACACTGGAAGGAGAGATTTCTAACAACTGGGGAAGTTGTGAGAGGTTGGAAATGGTTAATCTAGGTGGCAATTTGTTTACAGGTGGGATTCCTATTGCTTTTGAAAAATGTGAGAATTTGAAGTTTCTTAATTTGAGCTCTAACAAACTGACCGGCTGGATTAGTGAAGATTTACATGCTCCCTGCATAAGCGTATTTGATGTCAGTCATAACCATCTTTCTGGAACACTTCCAAATTTTACTTATCAAAATTGCTCATCGGTTGAATTTTCTGTTGCTGACTTGCCTTTTGATTATTACTCGTACTTCCGGTATTATACCCTTGTTGGGGCCTATTTGCCTTATTTTGATTCAGGAGGTGATCATGTGATTTATCATAACTTTGGCTGGAATAATTTCACGGGTAATATGCTTTCATTGCCAGTTTCAACTGAAATTGTGAGCAAGGATACTATATATGCCTTTCTTGCTGATGGCAATCAACTTGTCGGTCCATtgtcagaatccttgtttggaaaATGTAAACAGTTACATGGGCTTGTCATTAGTTTTAGTAACAACTTGATTTCTGGTGTCATACCAGATAAAATTGGTAACTCATGCAATTCATTGCTAGTATTTAATATTGCTGGTAATGGAGTAACAGGTATGGTTCCAATTAGTTTTGGAGACTCTAGGAACCTTATTGGGcttgatttgagtagaaataaaATTCAAGGGGAGCTTCCCACGAGCATTGCCAACTTAACGGGTTTGAATTATCTCTCATTAGGCAGCAATAATCTTACTGGCCACATTCCACCTGCTTTAGAACAGTTGCATTCTCTTAAAATATTGGATCTTTCTTCAAATTCTTTCTCTGGTGAAATACCAAGTGGTTTAGTGAATCTTGGGAATCTCACTTCTTTGTTTTTAGATAACAACAAACTTTCTGGAAAAATACCTTCTGGTTTTGCCAAGATTTCATCTCTATCCATGTTCAATGTGTCATATAATAATTTGTCAGGGCCGGTTCCGCTGAATTCGAGTATGTTGAGATGCGATAGTGTTGTAGGGAATCCACTTCTCGAGCCTTGTACTGGATTTTCTCTTTCAATTCCGCCATCCGATCAAGAAGGATCCACTGGAACCGCACAACCATATATCGATGCACCTCCCTTAACCCCATCTAACAGTGGTAGCGGGTTCAGTTCTATTGAGATCGCATCTATTGCATCGGCATCAGCCATTGTAGCAGTTTTGTTAGCATTGATTGTcctatatgtatatacaaaaaaatGTACCCCTAATGCTTCAATTCGATCTTCTGGAAGAAAAGAAGTAACTATATTTACACACATTGGTGTCCCAATAACGTACGAAAGTGTTGTAAGAGCCACTGGTAGTTTCAACGCAAGCAATTGTATTGGAAGTGGTGGTTTTGGAGCGACATACAAAGCCGAAATACATCCAGGAGTTCTCGTAGCTATAAAGAGGCTCTCAGTAGGCAGATTTCAAGGTGTTCAACAATTTCATGCTGAGATTAAAACTTTAGGAAGGTGGCGCCATCCAAATCTAGTGACCCTAATTGGATACCATGTTAGTGAGGCAGAAATGTTTCTGATATATAATTATTTGCCAGGAGGTAATTTGGAAAGGTTTATACAAGAAAGGTCTAAGCGAGCAGTGGATTGGAGAATGCTTCATAAGATTGCTTTAGATGTAGCACGTGCACTAGCTTACTTGCATGATCACTGTGTCCCTCGAATACTTCATAGAGATGTCAAACCAAGCAATATTTTGTTAGACAAAGATTTTAACGCGTATCTTTCTGACTTCGGTTTGGCCAGGATTTTAGGGAATTCTGAGACTCATGCCTCTACGGGCGTGGCTGGTACATTTGGATATGTAGCTCCAGAGTATGCAATGACATGTCGTGTGTCTGATAAGTCTGATGTTTATAGTTACGGTGTAGTGCTTTTGGAGTTGATTTCTGATAAGAAGGCACTGGATCCATCCTTTTCTCCATATGGCAATGGTTTCAATATTGTAGCCTGGGCATGCATGCTTTTACGCCAGGGTAGAGCACGAGAGTTCTTCACTGAGGGATTATGGGATGTGGCCCCTCATGATGATTTGGTGGAGACATTGCATTTAGCGGTCATGTGTACTGTTGACTCTTTAACTATTCGGCCTACAATGAAGCAAGTTGTTCAAAGGTTAAAGCAGCTACATCCACCTAATTGCTAG

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	ONK76275.1	1.1e-258	uncharacterized protein A4U43_C03F25910, partial
Swissprot	Q9S7I6.1	3.3e-186	Receptor-like protein kinase 2
trEMBL	A0A5P1FCZ6	8.2e-259	Protein kinase domain-containing protein (Fragment)

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT3G02130.1	55.34	0.0	1131	CLI1;RPK2;TOAD2	receptor-like protein kinase 2

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
Asa5G01242	AT3G02130.1	1115	422	14	33	1082	48	1151	55.34	0.0	1131
Asa5G01242	AT1G69270.1	496	180	3	584	1079	89	537	54.23	1e-143	508
Asa5G01242	AT1G69270.1	124	54	2	33	134	34	157	38.71	3e-15	81.6

Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g525308.t1
Allium fistulosum	AfisC1G06707; AfisC2G01402; AfisS817G00001
Allium sativum	Asa5G01242.1; Asa7G02822.1
Arabidopsis thaliana	AT1G69270.1; AT3G02130.1
Oryza sativa	LOC_Os03g54900.1; LOC_Os03g54900.2; LOC_Os07g41140.1

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF08263.9	LRRNT_2	Family	31	66	39.2	5.5e-10
PF13855.3	LRR_8	Repeat	143	202	27.3	2e-06
PF00560.30	LRR_1	Repeat	216	238	12.5	0.15
PF00560.30	LRR_1	Repeat	266	286	9.8	1.2
PF13855.3	LRR_8	Repeat	566	625	32.7	4.1e-08
PF00069.22	Pkinase	Domain	806	1003	146.1	1.1e-42

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005515	F	protein binding
GO:0004672	F	protein kinase activity
GO:0004713	F	protein tyrosine kinase activity
GO:0005524	F	ATP binding
GO:0006468	P	protein phosphorylation

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K04733	IRAK4; interleukin-1 receptor-associated kinase 4	EC:2.7.11.1	MAPK signaling pathway	ko04010
			NF-kappa B signaling pathway	ko04064
			Toll-like receptor signaling pathway	ko04620
			Toll and Imd signaling pathway	ko04624
			NOD-like receptor signaling pathway	ko04621
			Neurotrophin signaling pathway	ko04722

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network