result

Gene information

Detail information of Asa5G05481

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
Asa5G05481	chr5	1482201028	1482204742	-

Sequences

CDS

>Asa5G05481.1
ATGCTAGGCTTGCTAGCTATCAAGAGCCAAATATTTAACGACCCTAACAAGATTCTTAACTCGTGGAATGGAACCAATACCGATTTTTGCAAGTGGTATGGAGTTTTATGTGGAAAAAAACATCCAAAAAAAGTTGTATCACTTGATTTAAGGTCTCAGGGTTTATCTGGCTATTTATCTCCATTTATAGGTAATCTTACATTTCTTAGAACTTTAATTCTAAAAAACAACAGCTTTTCTGGTGATATTCCACCCGAAATTGGACGCTTGAGACGACTTCGTCTCCTTAATTTAAAAGACAACCTGTTCCATGGAAGGATACCATCTAACTTGTCATTTTGTTCAGACATCAACCGAGTTGTACTCGAAAATAATTTACTGTCTGGGAAAATTCCTTATGAGCTCAAGTATTTATCTAAACTTGAAGTTCTGAATCTGCACACAAATAATTTAACTGGTATCATCCAACCTTGGTTAGGAAACCTTTCTTTTCTTACTTGGCTTGCATTAGGAAGAAACAATTTGGGTGGGGGAATCCCTAACGAAATCGGGAACCTCAAAGCACTTAAGTATTTTCAAGTGGGGTTAAGCATGCTTAGTGGTATTATTCCTCCATCCTTTTTTAATCTCTCAAATTTGGAAGAAATCAGTATGAGTTTCAATGAGTTGCAAGGAATGCTTCCATCATCTATGGGTGACACACTTCCTAATCTTAGAATTTTATATTCTGCAACAAACAAATTTGAAGGACATATTCCATCTTCACTTTTCAATGCCTCTAAACTTGAAAGGGTTCAGATTTCTGAGAATAATTTCAGTGGTCTTGTGCCTTCATCTATGGGGAAACTCGAAAACTTTGAACTTCTCGATCTTTCTATGAATTCTATACATGCAAATAATGTTGAAGAATGGAAGTTCGTTGATGAGTTGACAAATTGTACACATTTATTTGCCCTGTCCTTGCATAAAAATTTGTTTAGGGGCTCGATACCAAACTCACTTGTTAATCTCTCCACTCAACTTGAATATTTGAGTGTAGGATCGAATTCAATATCAGGCAGTGTACCTTTAGAAATCGGAAACTTGGTGAATTTAAATGTACTTAACATGAACGAGAATCTTCTTTATGGAAATATACCTGAGAGTATAGGAAAAATTAAGACATTAGAACATTTGAACTTGGATAATAATCAGTTAAGAGGGAATATTCCAGTAGCACTTTCCAACCTCACACTATTGTATAAACTTCGACTAAATGATAATCGACTGGATGGCAGTATATCTCCAAGACTTGGAGATATAAAGAAGTTAAATGTGGTCGATTTCTCTAGCAACAAACTCATCGGCAGCATACCTAAAGAGCTTTTAAGCTCCCTATATGAATGTCATCTTCTCAATTTTTCATATAATTCTTTAACAGGATCTATTCCTTTAGAAGTTGGTAGCCTGAAAAACGTTTTAATATTGTCCTTCTCTTCAAATAAATTATCTGGCAAAATTCCAAGAACGCTGTCTAATTGTTTATCACTGCAACACCTTTCTCTAGATGGGAATTCTTTTGAAGGGGAAATTCCATCATCTCTTAGTAACATAAAGGGTCTTCTTGAACTTGATCTTTCGAACAATAGTTTGTCTGGGATCATACCTAAAGAGCTTGAGCAAATTCATGATTTGGTCTATTTGAATTTGTCGTCTAATCATCTTCATGGAAAAGTGCCTAGTAAAGGCGTCTTTGCAAACATAAGTTCACACTCACTGCTTGGAAATGTTGGTCTTTGTGGTGGTTCTCCCAAACTTCGGTTACCAGTGTGTACCGTGAATGAATCTAGAAGTGAGAAGAAGTTTATTATTTTTATGGTAGTGATACCAATAATTGTTTTTGTTTTTGCCTTGTCTGTAGTTCTGTTGGTCTTTTTATTTGTTCGTAAGTCAAGGAAACAAAAACTGCCAAATTCTTCATTCGATGAAGGATATCCGAAAGTATCATATGCACAACTAGCTCGAGGAACTAATAGATTTTCTTCCACTAGTATCATCGGTTGTGGCAGACATGGCACCATTTATAAAGGTTCCATAGAACATGTGGAAGGAATTGTTGCTGTCAAAGTTTTTAACCTTGAAGTAGTAGGAGCTTCTAGAAGCTTCATGGCCGAATGCAAAGCTCTAAGAAACATCAGACACCGTAACATTGTTAAGATTTTAGTTTCGTGCTCAAGCATTGATCTTGATCGTAATGAATTTAAAGCGCTGGTGTTCAGGTACATGCCTAATGGGAGTTTAGAGGAATGGCTGCATCCAGAGTATGAAAGGCGGCTGAGTTTCGATCAGAGAGTAGATATAGCTATTGACATTGCTGAAGCGTTGGATTATCTTCATAATGATTGTCAGCCTTTGGTTATTCATTGTGATGTAAAGCCGAGTAACATTCTTTTAGATGATGACATGTTAGCTCGACTTGCTGATTTTGGGTTAGCTAGTGCTCTTGGTGGAGATGGGTTGCTTGATCCAGATCAATCGGATGCAATGATAGGAACTATTGGGTACATTGCTCCAGAGTTTGGATTGAGGAGGGCAAATTCCACAGCTGGGGATGTTTACAGCTACGGAATTCTACTTCTAGAGCTGTTTACAGGAAGAAGACCTGTAAATGATTTGTTTGTAGATGGATTTACTCTTCATGATTTTTCTACTAGGGAATTTCCATCAGGAATATCAAATATTGTCGATCCTTCATTGCTCAATTGTGTGCAAGAACCCGAAAGTAGGATAAGTGAAGAATGCCTGGTATCCATAATTGGAGTTGGCATTTCATGCTCAAATCATTTGCCTGAAAATCGAATGGAGATGCGAGACGCCGTCAGTGAGTTGCATAAAATTAAAAGTACTTATAACAAGAAATTTGACTCTATGCATCGTTGCAACGGTTAA

Protein

Gene

>Asa5G05481.1
ATGCTAGGCTTGCTAGCTATCAAGAGCCAAATATTTAACGACCCTAACAAGATTCTTAACTCGTGGAATGGAACCAATACCGATTTTTGCAAGTGGTATGGAGTTTTATGTGGAAAAAAACATCCAAAAAAAGTTGTATCACTTGATTTAAGGTCTCAGGGTTTATCTGGCTATTTATCTCCATTTATAGGTAATCTTACATTTCTTAGAACTTTAATTCTAAAAAACAACAGCTTTTCTGGTGATATTCCACCCGAAATTGGACGCTTGAGACGACTTCGTCTCCTTAATTTAAAAGACAACCTGTTCCATGGAAGGATACCATCTAACTTGTCATTTTGTTCAGACATCAACCGAGTTGTACTCGAAAATAATTTACTGTCTGGGAAAATTCCTTATGAGCTCAAGTATTTATCTAAACTTGAAGTTCTGAATCTGCACACAAATAATTTAACTGGTATCATCCAACCTTGGTTAGGAAACCTTTCTTTTCTTACTTGGCTTGCATTAGGAAGAAACAATTTGGGTGGGGGAATCCCTAACGAAATCGGGAACCTCAAAGCACTTAAGTATTTTCAAGTGGGGTTAAGCATGCTTAGTGGTATTATTCCTCCATCCTTTTTTAATCTCTCAAATTTGGAAGAAATCAGTATGAGTTTCAATGAGTTGCAAGGAATGCTTCCATCATCTATGGGTGACACACTTCCTAATCTTAGAATTTTATATTCTGCAACAAACAAATTTGAAGGACATATTCCATCTTCACTTTTCAATGCCTCTAAACTTGAAAGGGTTCAGATTTCTGAGAATAATTTCAGTGGTCTTGTGCCTTCATCTATGGGGAAACTCGAAAACTTTGAACTTCTCGATCTTTCTATGAATTCTATACATGCAAATAATGTTGAAGAATGGAAGTTCGTTGATGAGTTGACAAATTGTACACATTTATTTGCCCTGTCCTtgcataaaaatttgtttaggggCTCGATACCAAACTCACTTGTTAATCTCTCCACTCAACTTGAATATTTGAGTGTAGGATCGAATTCAATATCAGGCAGTGTACCTTTAGAAATCGGAAActtggtgaatttaaatgtacttAACATGAACGAGAATCTTCTTTATGGAAATATACCTGAGAGTATAGGAAAAATTAAGACATTAGAACATTTGAACTTGGATAATAATCAGTTAAGAGGGAATATTCCAGTAGCACTTTCCAACCTCACACTATTGTATAAACTTCGACTAAATGATAATCGACTGGATGGCAGTATATCTCCAAGACTTGGAGATATAAAGAAGTTAAATGTGGTCGATTTCTCTAGCAACAAACTCATCGGCAGCATACCTAAAGAGCTTTTAAGCTCCCTATATGAATGTCATCTTCTCAATTTTTCATATAATTCTTTAACAGGATCTATTCCTTTAGAAGTTGGTAGCCTGAAAAACGTTTTAATATTGTCcttctcttcaaataaattatctGGCAAAATTCCAAGAACGCTGTCTAATTGTTTATCACTGCAACACCTTTCTCTAGATGGGAATTCTTTTGAAGGGGAAATTCCATCATCTCTTAGTAACATAAAGGGTCTTCTTGAACTTGATCTTTCGAACAATAGTTTGTCTGGGATCATACCTAAAGAGCTTGAGCAAATTCATGATTTGGTCTATTTGAATTTGTCGTCTAATCATCTTCATGGAAAAGTGCCTAGTAAAGGCGTCTTTGCAAACATAAGTTCACACTCACTGCTTGGAAATGTTGGTCTTTGTGGTGGTTCTCCCAAACTTCGGTTACCAGTGTGTACCGTGAATGAATCTAGAAGTGAGAAGAAGTTTATTATTTTTATGGTAGTGATACcaataattgtttttgtttttgccTTGTCTGTAGTTCTGTTGGTCTTTTTATTTGTTCGTAAGTCAAGGAAACAAAAACTGCCAAATTCTTCATTCGATGAAGGATATCCGAAAGTATCATATGCACAACTAGCTCGAGGAACTAATAGATTTTCTTCCACTAGTATCATCGGTTGTGGCAGACATGGCACCATTTATAAAGGTTCCATAGAACATGTGGAAGGAATTGTTGCTGTCAAAGTTTTTAACCTTGAAGTAGTAGGAGCTTCTAGAAGCTTCATGGCCGAATGCAAAGCTCTAAGAAACATCAGACACCGTAACATTGTTAAGATTTTAGTTTCGTGCTCAAGCATTGATCTTGATCGTAATGAATTTAAAGCGCTGGTGTTCAGGTACATGCCTAATGGGAGTTTAGAGGAATGGCTGCATCCAGAGTATGAAAGGCGGCTGAGTTTCGATCAGAGAGTAGATATAGCTATTGACATTGCTGAAGCGTTGGATTATCTTCATAATGATTGTCAGCCTTTGGTTATTCATTGTGATGTAAAGCCGAGTAACATTCTTTTAGATGATGACATGTTAGCTCGACTTGCTGATTTTGGGTTAGCTAGTGCTCTTGGTGGAGATGGGTTGCTTGATCCAGATCAATCGGATGCAATGATAGGAACTATTGGGTACATTGCTCCAGGTAaccctttgtttatttgtttttattttttccagTAAGCCGCTTTTGGCTCATGAACTTTTAGATAATGTGATTTTCACTTGAGGATGATATTGAaatgacgtttaatttgaatagaaatactaTTAAAGGCATGTTCAGAGGCTGCGCTTTTTTAAATATAGAGGATTttaatgatttttcttttcttttcaacatggtCATCTGTTCGAAACCTTTTTAGTCTCTTTTCTGAAAATAATGCCAATGACGGCAACATTTGCACTTCAGGGTTATTTTTTGTAATAATTTAAAGTTTTGCActttttaagaataatttatttggaaATGTTGGCACTTGGCAATGATATAGAATCACCATTGCCGAAGTTATCTTCACTACCGGCAATCGATTCTCAAACAAGTTGGACGCCTTGTGGTACTTCATTGCCGATCAAACCTTGGGATACATGGCTAAAAATATCACCAATTATTTTCTATAAAACGAAGTCATTTTGGttagtaaataaacaaaaatttaaagcTGGTTCCTCGAAACATTTTCCATCTTGCACATTGATAATTTCCTATTCCATTTTGGTGAATGACATTTGCTAAAATGAAGAACTACTATTCATGTGCTCTTCAATTTGCCAGATTGAAAAAATGATTGGGAAATCAACTTTAAATGACTCCATTTTACCAAAATGATGTCTTCAGCTCCAATTCTATTATAACGCTGCAAACTGCTATCATATTTTTGTTACTTAGAATCAAATACTATTAATCAAAAATATGTATCTTCAAGAGTTTGGATTGAGGAGGGCAAATTCCACAGCTGGGGATGTTTACAGCTACGGAATTCTACTTCTAGAGCTGTTTACAGGAAGAAGACCTGTAAATGATTTGTTTGTAGATGGATTTACTCTTCATGATTTTTCTACTAGGGAATTTCCATCAGGAATATCAAATATTGTCGATCCTTCATTGCTCAATTGTGTGCAAGAACCCGAAAGTAGGATAAGTGAAGAATGCCTGGTATCCATAATTGGAGTTGGCATTTCATGCTCAAATCATTTGCCTGAAAATCGAATGGAGATGCGAGACGCCGTCAGTGAGTTGCATAAAATTAAAAGTACTTATAACAAGAAATTTGACTCTATGCATCGTTGCAACGGTTAA

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_010910544.1	1.4e-101	receptor kinase-like protein Xa21
Swissprot	Q9SD62.1	1.1e-79	Putative receptor-like protein kinase At3g47110
trEMBL	A0A8N4F2Z2	2.2e-98	putative receptor-like protein kinase At3g47110

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT3G47570.1	42.04	0.0	722		Leucine-rich repeat protein kinase family protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	bit score
Asa5G05481	AT3G47570.1	992	544	11	3	972	28	1010	42.04	722
Asa5G05481	AT5G20480.1	985	532	12	1	963	32	1000	42.13	690
Asa5G05481	AT3G47090.1	990	553	11	3	972	28	1009	41.31	677

Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g509112.t1
Allium fistulosum	AfisC4G06481
Allium sativum	Asa5G05481.1
Arabidopsis thaliana
Oryza sativa

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF08263.9	LRRNT_2	Family	4	37	35.1	1.1e-08
PF13855.3	LRR_8	Repeat	526	568	27.9	1.3e-06
PF00069.22	Pkinase	Domain	675	883	136.5	9.4e-40

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005515	F	protein binding
GO:0004672	F	protein kinase activity
GO:0004713	F	protein tyrosine kinase activity
GO:0005524	F	ATP binding
GO:0006468	P	protein phosphorylation

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K13428	EFR; LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase EFR	EC:2.7.11.1	Plant-pathogen interaction	ko04626

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network