result

Gene information

Detail information of Asa8G03058

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
Asa8G03058	chr8	829487274	829492053	-

Sequences

CDS

>Asa8G03058.1
ATGCATGGAAGTGCATGTGAAAATTGGAAGAGGAGGTTGCAGCAGCACATGTGGTCTGTGCCTGCTCCCGTACCATCGCCGTTAGTTTTGCCTTTTACTTCGATTTCGTCATCTTCTATTTCTTTGATTCAGAGCTCTACCGATTCCTTTCTGAAGGACGGACGGAAGATTCGGGTTGGTGATTGTGCACTTTTTCAAGCTGGCAACGCTCCACCTTTCATTGGAATAATAAGGTGGTTCACTACAAGCAAGGAAGAGGACTGTCTTAAATTATGTGTAAATTGGCTTTACAGACCTTCTGACATCAAACTTGCAAAAGGAATATTACTCGAAGCAGCACCAAACGAATTGTTTTACTCATTTCACAAAGACGTCATATCCGCTGCTTCCCTGCTTCATCCTTGTAGAGTTTCTTTCCTTCGTAAGGGCGTTGAGCTTCCATCAGGAATATCATCGTTTGTTTGCAGACGTGTGTACGATATTGCAAATAAGTGTTTATGGTGGTTAACTGACCAGGATTATATCAATGAACGACAAGAAGAAGTAGATCAATTATTGGACAAAACACGACAAGAAATGCATGCATCAGTTCAGTCAGGAGGTCGTTCACCAAAATCATTGAACAGCCCTACATTAACCCAGCAGCAAAAATCTAGTACAGAAAATGCTCAAAAAAGTAAGAAGAGAGAAAGAGGAGGTAATCAAGGAATGGAATCTATTAAGCGAGAACGTCCTAATAAGCCAGAAGATGGAGAGTTAACTAGTTCTAGACTCGAGAACATGATAAAATCCAAGTTTTCTAAAATAACCGAAAAGGGTGTTCTAGTGACAATCGAAAGTGTTGACAAACTAGTCCATCTAATGCAACTTGATAAGAACGAAAGAAAAATTGATTTGGCTGGAAGGCTATTGCTTGCAGATGTGATTTCAGCCACTGAGAGAATTGAATGCCTTTCTAGATTTGTTCAGCTTAGGGGTGTTCCTGTTCTTGATGATTGGCTTCAGGAGGCACACAGTAAAGTAAAAAACAGCGATGGCAGTAGTCCCAAGGAAATCGACAAAGGTGCTGAGGATCTTCTTTTAGCTCTGCTTCGTGCCCTTGATAAATTACCTATAAATCTTAATGCTTTGCAGACTTGTAACATTGGTAAGTCTGTGAATCACCTGCGCAGCCACAAAAATCCTGAGATTCAGAAGAAAGCAAGGAGTCTTGTTGACACGTGGAAGAAAAGAGTCGATGCAGAAATGATTTTACTCAATGATGGAAAATCTTCTTTTCCTGAAGCTACTCATGCTGGAGCCGGGCATATAAAAGCATCCATTACTCATGCATCATCTTCTGCATGTAAAACTCTAGTACATAAGCCTGGCCATGCAGATGCCATAGTGAAGTCTACACCGGTAACAGCAGGATCTTTAAAATTACCATCGTCGCTACACACTTCAGTGTCAATAGGATCGAAGGATTCCCCAGTCAAAGGAACCGCTAGCAGTGGAAATTCAGAATTGCCGTTGGTGTCTGCTAAAGAAGAGAAAAGCACGGGCTCCAGTCAGTCTATGAACAATAGTCAGTCTTCTTGGAAAGAGGACGCTAAGAGTTCTACTGCTGGATCAGTGAATGTTAACAAGCCCTCTCGGCATAGAAGGTCAAGCAATGGATTTTCAGGGAGCCATCCAAAGGATAGTAATGCATTAAAGACAGGCAAAGTCTCTAGTCATAACGTTGATACGCCTGGTCTGGATCATTGCAACAGCCATAGATTAATTGTTAGGCTAGCTAACCGTGGCAAGAGCCCTGCACGCAATTCTAATGGAGGTTCTATTGAAGAGAATTTGATTACAGAAAAACATGATACTGGTGACCTGAAAACAAAAACAAAAGGCGACACTGAACAGACGAACACCATTACTGATGTAAATGTGGACTCATGCCCTAGCAATGGCCTTGCAGCTGTAGCTGACGAAGAGAGCAGGAGTGCTGATGTAACTTGTAAAACTACGAATTCACCATCGGGTATTGGAAAGGGTGCTGCATCTAAATCAAAAAATTCATTTAGCTCCATGAATGCTTTGGTTGAAAGTTGTGCAAAGTATTCTGAAACAAGTACTTCTCCATCGGCTGCTGATGATATTGGAATCAATTTGCTTGCCAATGTGGCTGCTGGAGAAATTTCTACACCTTCCGTATCTCCAGAAACTGCTCCAAACGAGGAATCTCACGCTGCTAATAGCGGGTCTAAATCCAAATTACCGTGCGATGATGATGTGGCCTTAAACTGCATCCATTCCAATGAAAATGCTGAACATGGATCAGCAAAGCAAGAGATTAAGGATAAGCTGCATGATGCAAGGCGTCAGTCAGTAGACAATCCTGTGAAGCATGAGGTAAAGTCAGAAGAGAAGAGAGTTGATGGATATTTGTCCGCCTGTACTAATAACATAAAGGAAAAGTTGGACGATCGAGGAAATCAAGCAGCAATAGATGATAAGAAACCAACTGAACATAAATGTGAAAAAGAAGCGAAGCGTCTGCTGGTGCTGTCCCACCGGACCCAGATCAGTCTACTATTGTACAAAACCAAAAAGAAAACGTTGACATAA

Protein

Gene

>Asa8G03058.1
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020264564.1	3.3e-232	uncharacterized protein LOC109840359 isoform X1
trEMBL	A0A5P1EZC8	1.7e-227	BAH domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT3G48050.1	46.19	5e-162	568	SUO	BAH domain ;TFIIS helical bundle-like domain

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
Asa8G03058	AT3G48050.2	827	346	23	1	743	1	812	46.19	5e-162	568
Asa8G03058	AT3G48050.1	827	346	23	1	743	1	812	46.19	5e-162	568
Asa8G03058	AT3G48060.1	854	372	25	1	769	1	841	44.96	3e-159	559

Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g316687.t1; g81974.t1
Allium fistulosum	AfisC4G01428; AfisC6G03980
Allium sativum	Asa4G01302.1; Asa4G01303.1; Asa8G03057.1; Asa8G03058.1
Arabidopsis thaliana	AT3G48050.1; AT3G48050.2; AT3G48060.1
Oryza sativa	LOC_Os02g50840.1; LOC_Os02g50840.2; LOC_Os02g50850.2

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF01426.15	BAH	Domain	56	163	31.5	1.1e-07
PF08711.8	Med26	Domain	363	412	52.6	3.1e-14

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0003677	F	DNA binding
GO:0005634	C	nucleus
GO:0006351	P	transcription, DNA-templated

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K17552	PPP1R10; protein phosphatase 1 regulatory subunit 10	EC:-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network