result

Gene information

Detail information of g102076

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
g102076	Scaffold_38396:HRSCAF_421482	231445	237720	+

Sequences

CDS

>g102076.t1
ATGACGTGCCACATTCCTTCTATGATGGATGTCGGATATCATGAGGGATGTCGCACGTCATCGACGACATTATTTCATACACAATCTGAAATCAAGAATGCGAAAACAATAACAAACTCCAAACAAAGAACGCAAAAGAAAAGAAGAAGAAGAGAAATAATCATGCTCCATCTCGTACTGTTCTTCTTCCTCTTCTCATCTTCGTCTGCATCAACCATCCTTGAAAAACAAACACTCCTCCAACTCAAACAATCATTCAACAACCCATCCTCTCTTTCCTCATGGTCCAACTCTTCTTCCAACCACTGCAACTGGTTCGGAATCTCATGCAACAACACCACGAACTCCATAATCTCAATCTCTCTTCCTAATCTTTCTCTTACAGGTCAAATTCCGCCTTTCATTTCCACCCTTAAAAGCCTCTCCTTTCTCGATCTTTCGAACAACTCCTTCTCCGGAAACTTCCCAAAAGCATTCTACAACTGTGCAAGCTTAACTTACATTGATATCTCAGAAAACTTATTCATAGGTAATCTCCCAGATGATATTCATCTTCTTCCTAACACGCTTACATCTCTCTATCTCTATAGCAATAACTTCACTGGTGATATTCCAACCTCCATTGGAAAGTTAACTTCTCTACAGACATTGTCTATGGAAGGCAATTTGTTTAATGGGTCGTTTCCGAAAGAGATAGGAAACTTAACCAATCTTAAAATTCTTCAAATGGCTTATAATCCATTTGCACCACAAAGCATTCCAGATGAATTCGGCAACTTGACGAGTTTGAACGTTTTGTGGATGACTGCAATGAATATAACAGGCGAAATACCGAATTTTCAAAGGTTAGTGAATCTGCAGCAGCTGGATTTATCGATAAATTTACTTACAGGTAAAATTCCTGGAGCTATATGGATGCTTGAGAACCTTCAAGAGCTACTTTTATACAAAAATAAGCTAAGTGGTAGTATTGAAATTGATGCACCTATTAAAGCGATTGGTTTGCAAAGCATTGATGTATCGAATAATCAGTTATCAGGCTCAATCCCTGATGAATTTGGAGGTTTGAAGAATTTATCAATACTTCTGTTATACTACAACAATTTTACTGGAGAAATTCCCAGAAGCATTGGATTGCTTCCTTCTCTCAGCGATTTTCGAGCTTTCGGGAATTCTTTAACTGGGATCCTGCCTTTTGATTTTGGAAAGAATGCTCCTTTATGGAATATCGAGGTTAATGATAATTCGATTTGGGGTGTATTGCCTGAAACTTTATGTTCTAGAGGAGCTCTTGCTTCTATAGTTGTGTTCAATAATAATTTTTCAGGAAGTATTCCTGAATCCTTAGGTGAATGTGCTACACTAGATAACCTGATGTTGCAAAACAATAGGTTTTCTGGTGACTTTCCTGGTAAAATTTGGTCTGCTGCAAATTTATCAACTGTTATATTACATGATAATGAATTTTCAGGCCAACTTCCACGGAAAATGCCCTGGAATCTTACTAGAATGGAGATTCAGAACAATAGATTCTCTGGAAAGATCCCTTCTATATCGGAGAATCTTATTGTGTTTCTTGCTGACAACAATCTGTTTTCTGGTGATTTACCCGTTACACTTAACAGACTTTCAATGCTGCAGAGTTTTTCACTAGGCGGTAATATGATTTCGGGTACCATACCAGAAGAAATATCAAGCTTAAAATCTTTAAAAGATTTGAATTTAAGTAGTAACCAGCTAGTTGGAGAAATTCCTTCTTCTATTAGTTTATTACCAGTGCTCAGTTCGCTCGATCTTTCGAGCAACCAACTAACTGGCAAGGTTACGGCGGTAGGAAACAACCTTAAGCTGAATTTTCTGAACTTATCGAGCAACAATTTCTATGGGGAAGTTCCATATGCATTGCAAAACCAAGCTTACGATCGAAGCTTTCTATCGAATGCCAATCTTTGTTCTTGGGATACTTCATTGGGTCTTTCGAGTTGTGGTAAGGTTTTGAAGAGTTCGAGTTCTTTGTCTTCGGGGCTTGTGGCTATGATCATAGTTCTCGGATTTGTTATTTTCTTCGTTGGTTTGTTCTTTGTGTTTTTGGTTGTTAGAGATTATTCAAGGAGGAAGGATGGGTTTGATCACGCATCATGGAAGCTTACTTCTTTTCATTCTTTGAATTTCAACGAGTCTATCATCGTGAAGGGGCTCGTAGAGGATAACGTCATCGGAAGTGGAGGTTCTGGAATGGTTTATAAGGTCATGATTGGTAATCACGCAGATGAAGTGGTCGCTGTGAAAAAAATATGGAACAAAAACAAGACAGATTCGAAGTTGGAGCGAGAATTCATATCGGAAATACAAATACTAAGCTCGATCCGACATGCAAACATAGTAAAACTTCTGTGTTGTATTTCGAGTGACGATTCGAAGTTGCTGGTGTACCAGTACATGAAGAATGGAAGTCTAGATAGATGGTTGCATGCAAAGAGGATGCCCGAGGGCCCACCAATGATAAGGAGCAGGTCGGGCCACGCTGTGGCCTTGGATTGGCCCAGAAGGCTAGGTATTGCCATAGGGGCAGCGAGAGGGCTGAGCTACATGCATCATGATTGCTTGCCGCCTATCGTTCATAGAGATGTGAAGTCAAGCAACATACTGTTGGATTCAGAGTTTCGGGCTAGGGTTGCGGATTTCGGGTTGGCCCGTATGCTTGTTAGGCCCGGGGAGGCTAATTCTGTTACGGCGGTTGCTGGTTCCTTCGGATACATGGCTCCAGAGTGTGCATATGCAGCAAAAGTGAATGAAAAGATGGACGTGTACAGCTTTGGAGTAGTTCTACTGGAGCTTACGACAGGAAGAGAAGCAAGCAATGGAGGTACAGAAGGTAGCCTAGTGGATTGGGCATGGCACCATTTTCAAGTAGGAAACAGAACAATAGATGCAATCGATGATAGTATAAAAGATCCAGTTTATTTGGACGATATCGCTAAAGTTATGAAAGTAGGACTGATATGCACAGGCACATTGCCTTCGACTAGACCTACCATGAAAGAAGTTGTAGAGATGTTGCTAAGCTGTGATCAAACAAACTGGAATGGGGAAAAGATAGTAAATGAGCGCGATAACGCTCCTCTTTTGAAAATTGCTAGAAGCGTCAAAGGCAAAATCAGTTCGAGCAATGAAGGCGATGAAGTTGATTACTGCAAGTTATGA

Protein

>g102076.t1
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Gene

>g102076.t1
ATGACGTGCCACATTCCTTCTATGATGGATGTCGGATATCATGAGGGATGTCGCACGTCATCGACGACATTATTGTAATAAACATTAAAATTGTTTTCTTTCCTTTTTAGACCAATTTCTTTTTTTACCAACTCTAATCTCTTGTCAATTTTCTATTGGTTAAAAACAAACTTTATTAATTTTTTGCCAAAAGACGGCCGCAAGTCAGTTTTATCTTTCCAAATTCATTTCTCGGCCCATCAATTAATATTATTGCTTAATATTAATTATAAGCTTTTCTAGCTTATTAAATTCATATGAAATCATAAACTTTTGGAAAATGTCCCCAAAAATAGCTAAAAATCAAAATTTATATATTCTTTCTTCGGTAAAAATTTCAGGAATAGTTAAAACCCCAAAAACACTATTTCCTCTTTAGAAAATTTAAAAAATATTCACATTAACTTGGAAAGCTATTAAATTAAAAAATCAATTCCAAAATATGTTTTACACAACGTACCAAAAAATCAATTCCAAAAATGTTTTACACAACATACCAAAAAATCAAATCGATTGAAGATTGAAAACTTAAGTTTTGCTTTTATAACCTACCATAATAATTCCATAAAGTTTTCGTAACTCATTATTTTATCCAAACAATGATCAAACATCCATAACATGGCAAAACAATCAAGATCAATTCGGAAATTAGCCATAACCAAATTCAAACACAAAAATAGAGATGATTTATTATTCATCTTAGATTGGATGATGGGATTGAGATTTGATGGAGTTTAGCTTTCCTAAGCTTTGCCCTTTGAATCTGCTTTGGTTTTCCTTCTTTCTTCCTTGAGTATGGATGGCTTCTTTACTTTCTTTTGATTGTTTTGTGAATGTAAAATGAGAATGAATGAGAGAGGGAGGGTTTAAGAGATGAAATAAGGTTCTATTCGTAGTTTGCTCCTCTTATTTATTCATTTCTATTTTAAGGTTTAAAACAATCTTATTAATTGATTAGTTAATGCCTGACCCAATTAATTATCAAACTCATCCTCCTTGTTTCACTATATTATTCTATTTAATCTATCCAAATAAATCTCGTGAATAATGTTAAACTAAAATTAGGGTGTTACAATCTTTACACACGCATATATCATATTTAAGACATGTAACAATAATAATTTTGATTTGAATATAAAATTATGCTCATGTTTAAAAATTTCTATGATATTATGAACCAAATTTCACTTATGATACTAATATTATCAGTTATGTATAAAAGTTTTATACATATATCTAGCTTTCTAACTTGAATATTAGATTATACTTGGTTATAAAATAACTTTTAATACACCCGACTCAAATTTTGTTTATATGGTATTGATATATATCGTCATCGATGAATGTATGTGCATAAGTATGTGTGTGCATCAGTTCTGACAAAAAAATACACACACACATGCATATGTATGAGTGTGTGTGTTTATATGTATGTGTGTATGTGTGCACACACACATGTATATATACACATATACATGTAAGCAATTTTGAAATGAATATAAAAATATACCCAGCTTTAAAATGACTTTTGATACATTTAATCAAATTTTCATTTATCATATCGATATTTATCAAACTTGATACATACGTATGTGTACGTACGTACGTACATACATACATATGTGTATCTGTGGATATTAGTTTTAATACATGTATATAAGGGCTCTTATGTATGCATATAACTACCGCGATACATGCGCTTATCGATTTTAAATTATAATTAATAGAAAAAATTGATTTTTTTTTGTGGAATATGATGACGGATTTTAATATACCTTTTCAAATGTAAAAATATCTTCTTAACATAATAAGTGGATCTTTTTCGAATTAAGCATTGTCATAATTATCAAACTATCAAAAGGATTCTTATGTATGCATATAACTATTATGATAATAAGTGGCTCTGTTTCAAATTAAACATTGTCATAATCAACAAACTAACAAAAGAGTTCGTATGTATGCATATAGCCGTAATGATACATATATTTATCGATTTTGATGTATAATTAATGAAAAAATAATAATTTTTTGTGGAACATGACGGCGGATTTTTATTTATCTTTTCAAATGTAAAATATCTTCTTAAGACAATAAGTGGACATGTTTTAAATTAGACACTGTAATGATCATCAATCTATCAAAATGATTATTATCTATGCATATAACTATAATGATATACGAATTTATTGATTTTGATTTATACTTAATGATTTTTTTTTTTGGTGAAACATGTCCGAGGAATTTAATTTATTTTTTAAGATGTAAAAAATATATTTTCAACGTCATATGATCCATTTCAAATTAAACATTGTCATAATTATCAAACCATTAAAAGGGTATTAAAGTACTTTTATTAAATATATGAGGCCTCAATTTATAAATGCATAACAACATGATCTAAAAAATAAATAAATTATAAAATGTGCCTCTTCTATCAAAAGACACATGATTGTAAGGATAAAATGACTATTTCTAATCAAATCTCTTTAAATCTCTTTAATGCGTTGAAAAAGGCCGAACAAGATAGTTATTATCTTGGTTATTTTAGGAGCGCCGAATGCATTTGCACTCTTTTTTATCCAATTTCAAATAATAGTGTACTTACCACTGGCACAAAAATGGATAAGAAGATAAATTTATACTGCAGTTGGCAATACACCATCAAATTTATACAAACCATGAGTAAATGGAGTACAGCGCTCCTTTTTTCCACACAAATTGCATTCTATTTAAAATACGACCTTCCTCGGTATGACGAAAAAAATATAAGTGGTATTAAATTTAGTCGCCTGTCACTTTTCTTCTGGAAATCAAATCTAGTTCTCCAGCCAACCAAACCATCTATGGTTTTATCTTTTCTTTTACTACTTTGACCATCATTGTCAAACAACACATTATAATTCGCGTTCCCACCGTTTTTCAGTCATACACAATCTGAAATCAAGAATGCGAAAACAATAACAAACTCCAAACAAAGAACGCAAAAGAAAAGAAGAAGAAGAGAAATAATCATGCTCCATCTCGTACTGTTCTTCTTCCTCTTCTCATCTTCGTCTGCATCAACCATCCTTGAAAAACAAACACTCCTCCAACTCAAACAATCATTCAACAACCCATCCTCTCTTTCCTCATGGTCCAACTCTTCTTCCAACCACTGCAACTGGTTCGGAATCTCATGCAACAACACCACGAACTCCATAATCTCAATCTCTCTTCCTAATCTTTCTCTTACAGGTCAAATTCCGCCTTTCATTTCCACCCTTAAAAGCCTCTCCTTTCTCGATCTTTCGAACAACTCCTTCTCCGGAAACTTCCCAAAAGCATTCTACAACTGTGCAAGCTTAACTTACATTGATATCTCAGAAAACTTATTCATAGGTAATCTCCCAGATGATATTCATCTTCTTCCTAACACGCTTACATCTCTCTATCTCTATAGCAATAACTTCACTGGTGATATTCCAACCTCCATTGGAAAGTTAACTTCTCTACAGACATTGTCTATGGAAGGCAATTTGTTTAATGGGTCGTTTCCGAAAGAGATAGGAAACTTAACCAATCTTAAAATTCTTCAAATGGCTTATAATCCATTTGCACCACAAAGCATTCCAGATGAATTCGGCAACTTGACGAGTTTGAACGTTTTGTGGATGACTGCAATGAATATAACAGGCGAAATACCGAATTTTCAAAGGTTAGTGAATCTGCAGCAGCTGGATTTATCGATAAATTTACTTACAGGTAAAATTCCTGGAGCTATATGGATGCTTGAGAACCTTCAAGAGCTACTTTTATACAAAAATAAGCTAAGTGGTAGTATTGAAATTGATGCACCTATTAAAGCGATTGGTTTGCAAAGCATTGATGTATCGAATAATCAGTTATCAGGCTCAATCCCTGATGAATTTGGAGGTTTGAAGAATTTATCAATACTTCTGTTATACTACAACAATTTTACTGGAGAAATTCCCAGAAGCATTGGATTGCTTCCTTCTCTCAGCGATTTTCGAGCTTTCGGGAATTCTTTAACTGGGATCCTGCCTTTTGATTTTGGAAAGAATGCTCCTTTATGGAATATCGAGGTTAATGATAATTCGATTTGGGGTGTATTGCCTGAAACTTTATGTTCTAGAGGAGCTCTTGCTTCTATAGTTGTGTTCAATAATAATTTTTCAGGAAGTATTCCTGAATCCTTAGGTGAATGTGCTACACTAGATAACCTGATGTTGCAAAACAATAGGTTTTCTGGTGACTTTCCTGGTAAAATTTGGTCTGCTGCAAATTTATCAACTGTTATATTACATGATAATGAATTTTCAGGCCAACTTCCACGGAAAATGCCCTGGAATCTTACTAGAATGGAGATTCAGAACAATAGATTCTCTGGAAAGATCCCTTCTATATCGGAGAATCTTATTGTGTTTCTTGCTGACAACAATCTGTTTTCTGGTGATTTACCCGTTACACTTAACAGACTTTCAATGCTGCAGAGTTTTTCACTAGGCGGTAATATGATTTCGGGTACCATACCAGAAGAAATATCAAGCTTAAAATCTTTAAAAGATTTGAATTTAAGTAGTAACCAGCTAGTTGGAGAAATTCCTTCTTCTATTAGTTTATTACCAGTGCTCAGTTCGCTCGATCTTTCGAGCAACCAACTAACTGGCAAGGTTACGGCGGTAGGAAACAACCTTAAGCTGAATTTTCTGAACTTATCGAGCAACAATTTCTATGGGGAAGTTCCATATGCATTGCAAAACCAAGCTTACGATCGAAGCTTTCTATCGAATGCCAATCTTTGTTCTTGGGATACTTCATTGGGTCTTTCGAGTTGTGGTAAGGTTTTGAAGAGTTCGAGTTCTTTGTCTTCGGGGCTTGTGGCTATGATCATAGTTCTCGGATTTGTTATTTTCTTCGTTGGTTTGTTCTTTGTGTTTTTGGTTGTTAGAGATTATTCAAGG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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020266819.1	2.0e-159	LOW QUALITY PROTEIN: receptor-like protein kinase 5
Swissprot	Q9SGP2.1	8.5e-70	Protein HAESA-LIKE1
trEMBL	A0A8B9ADK6	2.8e-142	receptor-like protein kinase HSL1

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT5G25930.1	47.79	0.0	887		Protein kinase family protein with leucine-rich repeat domain

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	bit score
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Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g102076.t1; g313533.t1
Allium fistulosum	AfisC2G07354; AfisC3G00415; AfisC3G08739; AfisC5G01344; AfisC5G01353; AfisS28G00004
Allium sativum	Asa0G04030.1; Asa0G05713.1; Asa2G07234.1
Arabidopsis thaliana	AT5G25930.1
Oryza sativa	LOC_Os01g53920.1; LOC_Os02g06070.1; LOC_Os02g06220.1; LOC_Os02g12910.1; LOC_Os02g13430.1; LOC_Os02g13510.1; LOC_Os05g44770.1; LOC_Os06g36270.1; LOC_Os06g36270.2; LOC_Os06g36270.3; LOC_Os06g36270.4; LOC_Os06g36270.5; LOC_Os06g36320.1

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF08263.9	LRRNT_2	Family	75	111	43.3	2.9e-11
PF00560.30	LRR_1	Repeat	335	356	9.3	1.7
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Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
-	-	-

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network