result

Gene information

Detail information of g105514

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
g105514	CHR1	131260220	131270502	+

Sequences

CDS

Protein

Gene

>g105514.t1
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020260221.1	3.6e-161	trihelix transcription factor GT-1-like
Swissprot	Q9FX53.1	3.6e-121	Trihelix DNA-binding protein GT-1
trEMBL	A0A5P1EYD5	2.6e-161	Myb-like domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT1G13450.1	58.14	4e-129	457	GT-1	Homeodomain-like superfamily protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
g105514	AT1G13450.1	387	127	6	4	356	21	406	58.14	4e-129	457
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g105514	AT1G13450.2	385	113	6	4	356	21	361	50.91	7e-106	380

Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g105514.t1
Allium fistulosum	AfisC1G04578
Allium sativum	Asa7G07614.1
Arabidopsis thaliana	AT1G13450.1; AT3G25990.1
Oryza sativa	LOC_Os04g40930.1

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF13837.3	Myb_DNA-bind_4	Domain	47	131	75.9	2.1e-21

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
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GO:0005622	C	intracellular
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GO:0080090	P	regulation of primary metabolic process
GO:0097159	F	organic cyclic compound binding
GO:1901363	F	heterocyclic compound binding
GO:1903506	P	regulation of nucleic acid-templated transcription
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GO:2001141	P	regulation of RNA biosynthetic process
GO:0140110

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network