result

Gene information

Detail information of g113741

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
g113741	Scaffold_39724:HRSCAF_422810	337907	349849	+

Sequences

CDS

Protein

Gene

>g113741.t1
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Functional annotation

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nr	XP_020261976.1	5.9e-232	LOW QUALITY PROTEIN: probable serine/threonine-protein kinase At1g54610
Swissprot	F4I114.1	1.4e-161	Probable serine/threonine-protein kinase At1g09600
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Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT1G53050.1	52.45	2e-175	613		Protein kinase superfamily protein

>>>Show top 3 blast result

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Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g113741.t1
Allium fistulosum	AfisC1G04233
Allium sativum	Asa7G04737.1
Arabidopsis thaliana
Oryza sativa

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00069.22	Pkinase	Domain	150	434	234.5	1.2e-69

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
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KEGG pathway

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K08819	CDK12_13; cyclin-dependent kinase 12/13	EC:2.7.11.22 2.7.11.23	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network