result

Gene information

Detail information of g114261

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
g114261	Scaffold_39791:HRSCAF_422877	36641	50057	+

Sequences

CDS

Protein

Gene

>g114261.t1
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_010940651.1	3.3e-45	auxin-responsive protein IAA10
Swissprot	A2XB18.2	5.6e-34	Indoleacetic acid-induced protein 10
trEMBL	A0A6I9SAW8	2.4e-45	Auxin-responsive protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT2G33310.1	47.28	2e-37	152	IAA13	auxin-induced protein 13

>>>Show top 3 blast result

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g114261	AT2G33310.3	184	81	5	89	268	60	231	47.28	2e-37	152
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g114261	AT2G33310.2	185	81	5	89	268	60	232	47.03	3e-37	152

Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g114261.t1
Allium fistulosum	AfisC7G03952
Allium sativum	Asa3G01959.1
Arabidopsis thaliana	AT1G04550.1; AT1G04550.2; AT2G33310.1; AT2G33310.2; AT2G33310.3
Oryza sativa	LOC_Os02g57250.1; LOC_Os02g57250.2

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF02309.13	AUX_IAA	Family	62	268	177.3	4.2e-52

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
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KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K14484	IAA; auxin-responsive protein IAA	EC:-	Plant hormone signal transduction	ko04075

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network